基于SSR获取种质药材溯源数据的方法和设备.pdf

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1、(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 202010314308.9 (22)申请日 2020.04.20 (71)申请人 甘肃烽火台数据信息技术有限责任 公司 地址 730000 甘肃省兰州市城关区中国兰 州留学人员创业园兰州市雁东路102 号9层B06-B08 申请人 陈志勤辛云鹏 甘肃省农业科学院生物技术研究所 欧巧明 (72)发明人 陈志勤辛云鹏欧巧明李忠旺 刘新星厚毅清赵瑛 (74)专利代理机构 北京睿博行远知识产权代理 有限公司 11297 代理人 龚家骅 (51)Int.Cl. G06K 17/00(20。

2、06.01) G16B 25/20(2019.01) G16B 50/30(2019.01) C12Q 1/6895(2018.01) (54)发明名称 一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法 和设备 (57)摘要 本发明公开了一种基于SSR获取种质药材溯 源数据的方法和设备， 该方法包括： 从中药指纹 图谱数据库中锁定待鉴定种质药材的基因序列； 基于基因序列获得该种质药材的简单重复序列 SSR数据； 基于SSR数据确定该种质药材的分子身 份证； 根据分子身份证从云存储服务器中获取对 应的溯源数据， 从而可以基于DNA分子标记技术 对种质药材进行准确鉴定， 进而获取到可靠的溯 源数据。 权利。

3、要求书2页 说明书8页 附图3页 CN 111507444 A 2020.08.07 CN 111507444 A 1.一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法， 其特征在于， 所述方法包括： 基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材对应的基因序列， 所述基因序列具体 为基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标签EST序列； 根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR数据； 根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证； 根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种质药材的溯源数据， 所述云存 储服务器中预先存储有所述溯源数据。 2.如权利要求1所述的方法， 其。

4、特征在于， 所述溯源数据具体为所述待鉴定种质药材的 种类、 采收时期、 产地、 栽培方式和加工方式， 根据所述分子身份证从云存储服务器获取所 述待鉴定种质药材的溯源数据， 具体为： 基于所述分子身份证生成条形码； 基于扫描所述条形码向所述云存储服务器发出包含所述分子身份证的获取请求， 以使 所述服务器根据所述获取请求返回身份验证请求； 根据所述身份验证请求向所述云存储服务器发送预先注册的身份信息， 以使所述云存 储服务器根据所述身份信息和所述分子身份证返回包含所述溯源数据的响应信息； 根据所述响应信息获取所述溯源数据。 3.如权利要求1所述的方法， 其特征在于， 根据所述SSR数据确定所述待鉴。

5、定种质药材 的分子身份证， 具体为： 基于聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所述SSR数据的 多样性指数； 根据所述多样性指数对所述SSR数据进行筛选； 基于所述筛选的结果获取预设数量的核心SSR标记； 基于所述核心SSR标记的PCR扩增后的整体带形进行数字编码； 根据所述数字编码确定所述分子身份证。 4.如权利要求3所述的方法， 其特征在于， 根据所述待鉴定种质药材的多样性指数对所 述SSR数据进行筛选， 具体为： 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 5.如。

6、权利要求1所述的方法， 其特征在于， 根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材 的简单重复序列SSR数据， 当所述基因序列为所述基因组序列时， 具体为： 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的基因组序列获取所述SSR数据； 或， 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的近缘物种的基因组序列获取 所述SSR数据。 6.一种基于SSR获取种质药材溯源数据的设备， 其特征在于， 所述设备包括： 第一获取模块， 用于基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材对应的基因序 列， 所述基因序列具体为基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标签EST序列； 第二获取模块， 用于根据所述基因序列获。

7、取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR 数据； 权利要求书 1/2 页 2 CN 111507444 A 2 确定模块， 用于根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证； 第三获取模块， 用于根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种质药材的 溯源数据， 所述云存储服务器中预先存储有所述溯源数据。 7.如权利要求6所述的设备， 其特征在于， 所述溯源数据具体为所述待鉴定种质药材的 种类、 采收时期、 产地、 栽培方式和加工方式， 所述第三获取模块， 具体用于： 基于所述分子身份证生成条形码； 基于扫描所述条形码向所述云存储服务器发出包含所述分子身份证的获取请求， 以使 所述服。

8、务器根据所述获取请求返回身份验证请求； 根据所述身份验证请求向所述云存储服务器发送预先注册的身份信息， 以使所述云存 储服务器根据所述身份信息和所述分子身份证返回包含所述溯源数据的响应信息； 根据所述响应信息获取所述溯源数据。 8.如权利要求6所述的设备， 其特征在于， 所述确定模块， 具体用于： 基于聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所述SSR数据的 多样性指数； 根据所述多样性指数对所述SSR数据进行筛选； 基于所述筛选的结果获取预设数量的核心SSR标记； 基于所述核心SSR标记的PCR扩增后的整体带形进行数字编码； 根据所述数字编码确定所述分子身份证。 9.如权利。

9、要求8所述的设备， 其特征在于， 所述确定模块， 还用于： 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 10.如权利要求6所述的设备， 其特征在于， 当所述基因序列为所述基因组序列时， 所述 第一获取模块， 具体用于： 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的基因组序列获取所述SSR数据； 或， 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的近缘物种的基因组序列获取 所述SSR数据。 权利要求书 2/2 页 3 CN 111507444 A 3 一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法。

10、和设备 技术领域 0001 本申请涉及药材来源品种鉴定技术领域， 更具体地， 涉及一种基于SSR获取种质药 材溯源数据的方法和设备。 背景技术 0002 中药材具有以下特点： (1)复杂性： 中药材成分极为复杂， 其数量多， 来源复杂， 结 构和性质差异大， 相互的作用关系难于清楚； (2)整体性： 中药材虽然成分复杂， 但优质中药 材的成分相互复合、 平衡， 形成一个整体， 使不同药材质形不一； (3)差异性： 中药材由于产 地的自然环境、 炮制工艺不同， 使不同药材呈现不同特征。 0003 中药材的复杂性、 整体性、 差异性决定了其整体质量评价的必要性， 种质药材的传 统鉴别技术主要是通过。

11、眼看、 手摸、 鼻闻、 口尝、 水试、 火试等方法对中药材的药用部分进行 鉴别。 然而对于一些亲缘关系较近的正品及其混淆品， 尤其是种下水平的基原鉴定， 传统方 法无法保证鉴定的准确性。 0004 SSR(Simple Sequence Repeat， 简单重复序列)是以PCR(Polymerase Chain Reaction， 聚合酶链式反应)技术为核心的DNA分子标记技术。 SSR标记具有高度重复性、 丰 富的多态性、 共显性、 高度可靠性等优点， 非常适合作为分子标记用于种质药材的鉴定， 因 此， 需要一种能够基于DNA分子标记技术对种质药材进行准确鉴定， 获取可靠的溯源数据的 方法，。

12、 从而避免现有技术中种质药材的鉴定方式复杂、 主观性强、 无法保证准确性的技术问 题。 发明内容 0005 本发明提供一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法， 用以解决现有技术中种 质药材的鉴定方式复杂、 主观性强、 无法保证准确性的技术问题， 该方法包括： 0006 基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材对应的基因序列， 所述基因序列 具体为基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标签EST序列； 0007 根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR数据； 0008 根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证； 0009 根据所述分子身份证从云存储服务器获取所。

13、述待鉴定种质药材的溯源数据， 所述 云存储服务器中预先存储有所述溯源数据。 0010 优选的， 所述溯源数据具体为所述待鉴定种质药材的种类、 采收时期、 产地、 栽培 方式和加工方式， 根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种质药材的溯源数 据， 具体为： 0011 基于所述分子身份证生成条形码； 0012 基于扫描所述条形码向所述云存储服务器发出包含所述分子身份证的获取请求， 以使所述服务器根据所述获取请求返回身份验证请求； 0013 根据所述身份验证请求向所述云存储服务器发送预先注册的身份信息， 以使所述 说明书 1/8 页 4 CN 111507444 A 4 云存储服务器根据所。

14、述身份信息和所述分子身份证返回包含所述溯源数据的响应信息； 0014 根据所述响应信息获取所述溯源数据。 0015 优选的， 根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证， 具体为： 0016 基于聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所述SSR数 据的多样性指数； 0017 根据所述多样性指数对所述SSR数据进行筛选； 0018 基于所述筛选的结果获取预设数量的核心SSR标记； 0019 基于所述核心SSR标记的PCR扩增后的整体带形进行数字编码； 0020 根据所述数字编码确定所述分子身份证。 0021 优选的， 根据所述待鉴定种质药材的多样性指数对所述SSR数。

15、据进行筛选， 具体 为： 0022 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 0023 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 0024 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 0025 优选的， 根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR数据， 当 所述基因序列为所述基因组序列时， 具体为： 0026 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的基因组序列获取所述SSR数 据； 0027 或， 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的近缘物种的基因组序列 获取所述SSR数据。 0028 相应地， 本申请还提出了一种基于SSR获取种质药材溯源数。

16、据的设备， 所述设备包 括： 0029 第一获取模块， 用于基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材对应的基因 序列， 所述基因序列具体为基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标签EST序列； 0030 第二获取模块， 用于根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复序列 SSR数据； 0031 确定模块， 用于根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证； 0032 第三获取模块， 用于根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种质药 材的溯源数据， 所述云存储服务器中预先存储有所述溯源数据。 0033 优选的， 所述溯源数据具体为所述待鉴定种质药材的种类、 采收时期、 。

17、产地、 栽培 方式和加工方式， 所述第三获取模块， 具体用于： 0034 基于所述分子身份证生成条形码； 0035 基于扫描所述条形码向所述云存储服务器发出包含所述分子身份证的获取请求， 以使所述服务器根据所述获取请求返回身份验证请求； 0036 根据所述身份验证请求向所述云存储服务器发送预先注册的身份信息， 以使所述 云存储服务器根据所述身份信息和所述分子身份证返回包含所述溯源数据的响应信息； 0037 根据所述响应信息获取所述溯源数据。 0038 优选的， 所述确定模块， 具体用于： 0039 基于聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所述SSR数 说明书 2/8 页 。

18、5 CN 111507444 A 5 据的多样性指数； 0040 根据所述多样性指数对所述SSR数据进行筛选； 0041 基于所述筛选的结果获取预设数量的核心SSR标记； 0042 基于所述核心SSR标记的PCR扩增后的整体带形进行数字编码； 0043 根据所述数字编码确定所述分子身份证。 0044 优选的， 所述确定模块， 还用于： 0045 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 0046 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 0047 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 0048 优选的， 根据所述待鉴定种质药材的多样性指数对所述SSR数据进行筛选， 所。

19、述第 一获取模块， 具体用于： 0049 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 0050 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 0051 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 0052 与现有技术对比， 本发明具备以下有益效果： 0053 本发明公开了一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法和设备， 该方法包括： 从 中药指纹图谱数据库中锁定待鉴定种质药材的基因序列， 首先， 基于基因序列获得该种质 药材的简单重复序列SSR数据， 其次基于SSR数据确定该种质药材的分子身份证， 然后根据 分子身份证从云存储服务器中获取对应的溯源数据， 从而可以基于DNA分子标。

20、记技术对种 质药材进行准确鉴定， 进而获取到可靠的溯源数据。 附图说明 0054 为了更清楚地说明本申请实施例中的技术方案， 下面将对实施例描述中所需要使 用的附图作简单地介绍， 显而易见地， 下面描述中的附图仅仅是本申请的一些实施例， 对于 本领域技术人员来讲， 在不付出创造性劳动的前提下， 还可以根据这些附图获得其他的附 图。 0055 图1示出了本发明实施例提出的一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法的流 程示意图； 0056 图2出了本发明另一实施例提出的一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法的 步骤示意图； 0057 图3示出了本发明实施例提出的一种基于SSR获取种质药材溯源数据。

21、的设备结构 示意图。 具体实施方式 0058 如背景技术所述， 现有技术中种质药材的鉴定方式复杂、 主观性强、 无法保证准确 性的技术问题。 0059 为解决上述问题， 本申请实施例提出了一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方 法， 该方法能够基于DNA分子标记技术对种质药材进行准确鉴定， 获取更加可靠的溯源数 据。 说明书 3/8 页 6 CN 111507444 A 6 0060 如图1所示， 一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法， 该方法包括如下步骤： 0061 步骤S101， 基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材对应的基因序列， 所 述基因序列具体为基因组序列、 或转录组序列。

22、、 或表达序列标签EST序列。 0062 具体的， 中药指纹图谱数据库是由数量庞大的中药材及中成药进行多维化学及其 相关生物信息以图像的方式进行表征并加以描述获取形成中药指纹图谱构成； 基因组序列 是包含所有基因组染色体在内的所有的基因序列， 包含用于获取中药材的SSR分子标记； 转 录组序列是可以体现出基因编码区域的信息， 直接地用于基因表达及其药材性状相关的研 究， 可以作为SSR分子标记的来源； 表达序列标签EST(expressed sequence tag， 表达序列 标签)序列是通过对cDNA(comp lementary DNA， 互补DNA)文库克隆进行大规模测序所获得 的5 。

23、或3 端序列， 长度一般为300500bp， 可代表生物体某一时间内某组织中表达的基因， 从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库， 代表在一定的发育 时期或特定的环境条件下特定的组织细胞基因表达的序列； 本步骤是预先从中药指纹图谱 数据库中， 获取出待鉴定种质药材相对应的包含基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标 签等SSR分子标记的基因序列。 0063 为了更加全面的获取所述SSR数据， 在本申请优选实施例中， 根据所述基因序列获 取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR数据， 当所述基因序列为所述基因组序列时， 具 体为： 0064 从所述中药指纹图谱数据库中。

24、所述待鉴定种质药材的基因组序列获取所述SSR数 据； 0065 或， 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的近缘物种的基因组序列 获取所述SSR数据； 0066 具体地， 由于大部分药用植物的基因数据仍未公布， 且SSR侧翼序列在属内种间或 有较近亲缘关系的属间有一定的保守性， 甚至有部分SSR位点在亲缘关系较远的分类群中 也具有保守性， 因此， 也可利用近缘物种的基因数据获取SSR序列； 其中， SSR数据是存在于 真核生物基因组非编码区的一段简单重复序列， 能够对亲缘关系较近的物种进行区分， 弥 补了传统鉴别方法在近缘物种鉴别中的不足， 所以为了更全面的获取SSR数据， 从所述中药。

25、 指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的基因组序列获取所述SSR数据， 或从已公开的所 述待鉴定种质药材的近缘物种的基因组序列获取需要的SSR数据。 0067 需要说明的是， 以上优选实施例的方案仅为本申请所提出的一种具体实现方案， 其他在所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的基因组序列中， 根据需要获取所 需要的SSR数据的方式均属于本申请的保护范围。 0068 步骤S102， 根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR数据。 0069 SSR数据主要从中药指纹图谱数据库中的基因序列中获取， 如步骤S101所述， 基因 序列包括基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标签。

26、EST序列， 可以从基因序列中获取SSR 数据。 0070 步骤S103， 根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证。 0071 具体的， 分子身份证是基于所述指纹图谱的一种新的电泳图谱， 与指纹图谱的区 别在于分子身份证把品种特征数字化后， 采用资源特征分析软件分析得出字符串形式的结 果， 利用SSR分子标记构建DNA指纹图谱可以有效区分表型特征相似的近缘物种， 从而根据 说明书 4/8 页 7 CN 111507444 A 7 所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证。 0072 为了更好的确定所述待鉴定种质药材的分子身份证， 在本申请优选实施例中根据 所述SSR数据确。

27、定所述待鉴定种质药材的分子身份证， 具体为： 0073 基于PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所述SSR数据的多样性指数； 0074 根据所述多样性指数对所述SSR数据进行筛选； 0075 基于所述筛选的结果获取预设数量的核心SSR标记； 0076 基于所述核心SSR标记的PCR扩增后的整体带形进行数字编码； 0077 根据所述数字编码确定所述分子身份证； 0078 具体的， 聚合酶链式反应PCR是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技 术， 它可看作是生物体外的特殊DNA复制， PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加； 非变 性聚丙烯酰胺凝胶电泳是在不加入SDS(Sod。

28、ium dodecyl sulfate， 非变性聚丙烯酰胺凝胶 电泳)和巯基乙醇等变性剂的条件下， 对保持活性的蛋白质进行聚丙烯酰胺凝胶电泳， 常用 于酶的鉴定、 同工酶分析和提纯。 首先根据聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝 胶电泳检测确定SSR数据的多样性指数， 并根据多样性指数对SSR数据筛选， 基于筛选的结 果获取预定数据的核心SSR标记， 以核心SSR标记为基础进行数字编码并确定分子身份证。 0079 需要说明的是， 以上优选实施例的方案仅为本申请所提出的一种具体实现方案， 其他根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证的方式均属于本申请的保护 范围。 0080 。

29、为了更精准的对所述SSR数据进行筛选， 在本申请优选实施例中， 根据所述待鉴定 种质药材的多样性指数对所述SSR数据进行筛选， 具体为： 0081 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 0082 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 0083 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 0084 如上所述， 为了更好的对所述SSR数据进行筛选， 预先设置对应的数量的阈值， 若 所述SSR数据的多样性指数高于阈值， 则将所述SSR数据确定为核心SSR标记， 若SSR数据的 多样性指数低于阈值， 则将说书SSR数据确定为非核心SSR标记。 0085 需要说明的是， 以上。

30、优选实施例的方案仅为本申请所提出的一种具体实现方案， 其他根据所述待鉴定种质药材的多样性指数对所述SSR数据进行筛选的方式均属于本申请 的保护范围。 0086 步骤S104， 根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种质药材的溯源 数据， 所述云存储服务器中预先存储有所述溯源数据。 0087 如上所述， 所述云存储服务器中预先存储大量的数据， 包括所述溯源数据， 根据所 述分子身份证从云存储服务器中获取指定的所述待鉴定的种质药材的溯源数据。 0088 为了更可靠获取所述溯源数据， 在本申请优选实施例中， 所述溯源数据具体为所 述待鉴定种质药材的种类、 采收时期、 产地、 栽培方式和加工方。

31、式， 根据所述分子身份证获 取所述溯源数据， 具体为： 0089 基于所述分子身份证生成条形码； 0090 基于扫描所述条形码向所述云存储服务器发出包含所述分子身份证的获取请求， 以使所述服务器根据所述获取请求返回身份验证请求； 说明书 5/8 页 8 CN 111507444 A 8 0091 根据所述身份验证请求向所述云存储服务器发送预先注册的身份信息， 以使所述 云存储服务器根据所述身份信息和所述分子身份证返回包含所述溯源数据的响应信息； 0092 根据所述响应信息获取所述溯源数据； 0093 具体的， 溯源数据具体可以为待鉴定种质药材的种类、 采收时期、 产地、 栽培方式 和加工方式等。

32、， 基于所述分子身份证可生成条形码， 本领域技术人员也可根据需要生成其 他种类的扫描码， 如二维码； 基于扫描识别条形码向服务器根据请求返回身份证验证信息； 然后根据分身验证请求向云存储服务器发送预先注册的身份信息， 云存储服务器验证通过 后根据正确的身份信息和分子身份证返回包含溯源数据的响应信息； 最后获取到需要的溯 源数据。 0094 需要说明的是， 以上优选实施例的方案仅为本申请所提出的一种具体实现方案， 其他根据分子身份证获取溯源数据的方式均属于本申请的保护范围。 0095 通过应用以上技术方案， 基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材对应的 基因序列， 所述基因序列具体为基因组序。

33、列、 或转录组序列、 或表达序列标签EST序列； 根据 所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复序列SSR数据； 根据所述SSR数据确定所 述待鉴定种质药材的分子身份证； 根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种 质药材的溯源数据， 所述云存储服务器中预先存储有所述溯源数据， 从而能够基于DNA分子 标记技术对种质药材进行准确鉴定， 获取更加可靠的溯源数据。 0096 为了进一步阐述本发明的技术思想， 现结合具体的应用场景， 对本发明的技术方 案进行说明。 0097 本发明另一实施例提出了一种基于SSR获取种质药材溯源数据的方法， 如图2所 示， 通过从包含有大量中药指纹图谱的数据。

34、库内， 获取所需要的种质药材的对应的基因序 列， 根据相应的基因序列确定需要鉴定的种质药材的简单重复序列SSR数据， 依据简单重复 SSR数据锁定需要鉴定的种质药材的分子身份证， 依据分子身份证信息生成相匹配的条形 码， 通过扫描识别条形码的形式获取条形码所对应的分子身份证， 生产发送包含溯源数据 的请求信息到服务器， 根据注册时的验证信息和对应的分子身份证锁定提前存储在云存储 的溯源数据， 最后返回溯源数据信息； 从而更加准确、 高效地对种质药材进行鉴定， 提高种 质药材鉴定的效率。 0098 上述方法具体步骤如下： 0099 步骤S201， 从中药指纹图谱数据库中获取需要鉴定的种质药材的基。

35、因序列。 0100 根据基因序列获取对应的SSR数据， 基因序列包括基因组序列、 转录组序列和表达 序列标签EST序列， 可以从基因组序列、 转录组序列和表达序列标签EST序列中获得SSR数 据， 当从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的基因组序列获取所述SSR数据， 由于大部分药用植物的基因数据仍未公布， 且SSR侧翼序列在属内种间或有较近亲缘关系 的属间有一定的保守性， 甚至有部分SSR位点在亲缘关系较远的分类群中也具有保守性， 因 此， 可从中药指纹图谱数据库获取对应的种质药材的基因序列中获取SSR数据， 也可利用近 缘物种的基因数据获取SSR序列。 0101 步骤S202， 依。

36、据基因序列获取对应的简单重复序列SSR数据。 0102 步骤S203， 依据SSR数据确定对应的分子身份证， 包括以下步骤： 0103 第一步， 基于聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所 说明书 6/8 页 9 CN 111507444 A 9 述SSR数据的多样性指数； 0104 第二步， 根据多样性指数对对应的SSR数据进行筛选； 0105 第三步， 根据筛选结果获取预设的一定数量的核心SSR标记， 具体的， 当筛选多样 性指数的数量大于预设的阈值确定为核心SSR标记， 否则确定为非核心SSR标记； 0106 第四步， 根据确定的核心SSR标记的PCL扩增后的整体带。

37、形进行数字编码； 0107 第五步， 根据编码好的数字编码确定分子身份证。 0108 步骤S204， 根据分子身份证从云存储服务器中获取对应的溯源数据， 云存储服务 器中预先存储有所述溯源数据， 包括以下步骤： 0109 第一步， 基于分子身份证确定生成条形码； 0110 第二步， 使用预先注册的身份信息的客户端扫描条形码； 0111 第三步， 根据扫描生成的包含分子身份证的溯源数据的请求信息到云存储服务 器， 具体的溯源数据具体为代鉴定种质药材的种类、 采收时期、 产地、 栽培方式和加工方式 等； 0112 第四步， 云存储服务器验证身份信息并通过， 返回包含所述溯源数据的响应信息； 011。

38、3 第五步， 根据响应的信息获取对应的溯源数据。 0114 通过应用以上技术方案， 通过提前构建包含大量种质药材的基因序列， 通过相对 应的基因序列确定分子身份证， 基于分子身份证生成条形码， 通过扫描条形码的形式， 从提 前存储大量种植药材溯源数据的云存储中获取对应的溯源数据， 从而达到对种质药材的鉴 定， 可以大大提高种质药材鉴定的准确性， 提高鉴定效率， 简化鉴定的程序及复杂程度。 0115 为了达到以上技术目的， 本申请实施例还提出了一种基于SSR获取种质药材溯源 数据的设备， 如图3所示， 所述设备包括： 0116 第一获取模块301， 用于基于中药指纹图谱数据库获取与待鉴定种质药材。

39、对应的 基因序列， 所述基因序列具体为基因组序列、 或转录组序列、 或表达序列标签EST序列； 0117 第二获取模块302， 用于根据所述基因序列获取所述待鉴定种质药材的简单重复 序列SSR数据； 0118 确定模块303， 用于根据所述SSR数据确定所述待鉴定种质药材的分子身份证； 0119 第三获取模块304， 用于根据所述分子身份证从云存储服务器获取所述待鉴定种 质药材的溯源数据， 所述云存储服务器中预先存储有所述溯源数据。 0120 在具体的应用场景中， 当所述基因序列为所述基因组序列时， 所述第一获取模块 301， 具体用于： 0121 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材。

40、的基因组序列获取所述SSR数 据； 0122 或， 从所述中药指纹图谱数据库中所述待鉴定种质药材的近缘物种的基因组序列 获取所述SSR数据。 0123 在具体的应用场景中， 确定模块303， 具体用于： 0124 判断所述SSR数据的多样性指数是否高于预设阈值； 0125 若是， 将所述SSR数据确定为核心SSR标记； 0126 若否， 将所述SSR数据确定为非核心SSR标记。 0127 在具体的应用场景中， 所述确定模块303， 还用于： 说明书 7/8 页 10 CN 111507444 A 10 0128 基于聚合酶链式反应PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测确定所述SSR数 据的多。

41、样性指数； 0129 根据所述多样性指数对所述SSR数据进行筛选； 0130 基于所述筛选的结果获取预设数量的核心SSR标记； 0131 基于所述核心SSR标记的PCR扩增后的整体带形进行数字编码； 0132 根据所述数字编码确定所述分子身份证。 0133 在具体的应用场景中， 所述溯源数据具体为所述待鉴定种质药材的种类、 采收时 期、 产地、 栽培方式和加工方式， 所述第三获取模块304， 具体用于： 0134 基于所述分子身份证生成条形码； 0135 基于扫描所述条形码向所述云存储服务器发出包含所述分子身份证的获取请求， 以使所述服务器根据所述获取请求返回身份验证请求； 0136 根据所述。

42、身份验证请求向所述云存储服务器发送预先注册的身份信息， 以使所述 云存储服务器根据所述身份信息和所述分子身份证返回包含所述溯源数据的响应信息； 0137 根据所述响应信息获取所述溯源数据。 0138 通过以上的实施方式的描述， 本领域的技术人员可以清楚地了解到本发明可以通 过硬件实现， 也可以借助软件加必要的通用硬件平台的方式来实现。 基于这样的理解， 本发 明的技术方案可以以软件产品的形式体现出来， 该软件产品可以存储在一个非易失性存储 介质(可以是CD-ROM， U盘， 移动硬盘等)中， 包括以若干指令的形式使一台计算机设备(可以 是个人计算机， 服务器， 或者网络设备等)执行本发明各个实。

43、施场景所述的方法。 0139 本领域技术人员可以理解附图只是一个优选实施场景的示意图， 附图中的模块或 流程并不一定是实施本发明所必须的。 0140 本领域技术人员可以理解装置中的模块可以按照实施场景描述分布于实施场景 的装置中， 也可以进行相应变化位于不同于本实施场景的一个或多个装置中。 上述实施场 景的模块可以合并为一个模块， 也可以进一步拆分成多个子模块。 0141 上述本发明序号仅仅为了描述， 不代表实施场景的优劣。 0142 以上公开的仅为本发明的几个具体实施场景， 但是， 本发明并非局限于此， 任何本 领域的技术人员能思之的变化都应落入本发明的保护范围。 说明书 8/8 页 11 CN 111507444 A 11 图1 说明书附图 1/3 页 12 CN 111507444 A 12 图2 说明书附图 2/3 页 13 CN 111507444 A 13 图3 说明书附图 3/3 页 14 CN 111507444 A 14 。