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鸡B亚群禽白血病抗性分子标记tvbsup3667-3668insAG/sup及其分子诊断方法.pdf

  • 上传人:Ameli****keyy
  • 文档编号:9122248
  • 上传时间:2021-02-08
  • 格式:PDF
  • 页数:8
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  • 摘要
    申请专利号:

    CN201511005988.1

    申请日:

    20151229

    公开号:

    CN105506088B

    公开日:

    20180918

    当前法律状态:

    有效性:

    有效

    法律详情:

    IPC分类号:

    C12Q1/6888,C12N15/11

    主分类号:

    C12Q1/6888,C12N15/11

    申请人:

    华南农业大学

    发明人:

    谢青梅,陈伟国,蔺文成,舒鼎铭,李昕键

    地址:

    510642 广东省广州市天河区五山路483号

    优先权:

    CN201511005988A

    专利代理机构:

    广州粤高专利商标代理有限公司

    代理人:

    林丽明

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    内容摘要

    本发明属于抗性品种选育技术领域,具体公开了一种鸡B亚群禽白血病抗性分子标记tvb3667‑3668insAG及其分子诊断方法。本发明首次分析了中国鸡种tvb受体基因的遗传变异,发现中国鸡种中tvb受体基因第3667与3668位存在AG插入突变,发明人从体外、体内实验两个层面证实了该自然突变引起宿主对ALV‑B的感染产生遗传抗性,另外发明人以此建立抗B亚群禽白血病遗传标记的分子诊断方法,该方法可应用于筛选ALV‑B遗传抗性鸡品种(系)的育种素材,从而开展ALV‑B遗传抗性鸡品种(系)的选育。

    权利要求书

    1.鸡B亚群禽白血病病毒抗性分子标记,其特征在于,所述分子标记的序列是引物P4-F和引物P4-R从TVB受体基因,Genebank登陆号为NC_006109.3上扩增的序列,并且所述扩增的序列的第633与634位之间插入AG;其中,引物P4-F的核苷酸序列为:CTCCACGTCTCGGCAGCAC;引物P4-R的核苷酸序列为:CTCTCCATCATCCCCTGCAAG。 2.权利要求1所述的分子标记在制备诊断B亚群禽白血病病毒抗性鸡的试剂中的应用。 3.引物P4-F和引物P4-R在制备诊断B亚群禽白血病病毒抗性鸡的试剂中的应用,其中,引物P4-F的核苷酸序列为:CTCCACGTCTCGGCAGCAC,引物P4-R的核苷酸序列为:CTCTCCATCATCCCCTGCAAG。

    说明书

    技术领域

    本发明涉及抗性品种选育技术领域,更具体地,涉及鸡B亚群禽白血病抗性分子标记tvb3667-3668insAG及其分子诊断方法。

    背景技术

    禽白血病是由禽白血病病毒(Avian Leukosis Virus,ALV)引起的一种免疫抑制性肿瘤性传染病,该病能引起多种具有传染性的良性和恶性肿瘤。感染鸡的禽白血病病毒包括ALV A-E和J共6个亚群。B亚群禽白血病病毒(ALV-B)是我国禽白血病的主要病原之一,能使感染鸡群发生免疫抑制、生产性能下降及特征性肿瘤而死亡,给世界养禽业造成巨大的经济损失。目前,该病尚无商品化疫苗和有效的治疗方法,主要通过淘汰阳性鸡来净化种鸡群和加强生物安全措施进行预防。然而,现有措施并不能控制AVL-B在中国的发生与流行。近年的流行病学调查结果显示,AVL-B在我国商品肉鸡、蛋鸡、地方品系鸡和野生鸟类中普遍存在,已成为威胁我国养鸡业(尤其是种鸡业)持续健康发展的重大疾病之一。因此,急需研发更适合我国实情的禽白血病防控新策略。国外已有研究证实,从宿主遗传抗性方面研究禽白血病的遗传抗病育种已成为防控该病的有效策略。

    发掘禽白血病遗传抗性功能基因或基因位点,并应用于筛选禽白血病遗传抗性特异种质以培育禽白血病抗性鸡品种(系)是实现禽白血病遗传抗病育种的关键。

    发明内容

    本发明为了克服现有技术的上述不足,提供一种鸡B亚群禽白血病抗性分子标记。

    本发明的另一个目的是提供一种诊断B亚群禽白血病抗性鸡的方法。

    为了实现上述目的,本发明是通过以下方案予以实现的:

    一种鸡B亚群禽白血病抗性分子标记,所述分子标记为tvb受体基因第3667与3668的AG插入突变。该位点简称为tvb3667-3668insAG突变位点。

    本发明首次分析了中国鸡种tvb受体基因的遗传变异,发现中国鸡种中tvb受体基因第3667与3668位存在AG插入突变,发明人从体外、体内实验两个层面证实了该自然突变引起宿主对ALV-B的感染产生遗传抗性。具体原因在于tvb受体基因第3667与3668位存在AG插入突变位于tvb受体基因第4外显子,从而导致tvb受体基因发生移位编码,推测其可能导致tvb受体基因表达一个不适宜作为病毒受体的缺陷蛋白,从而引起宿主对ALV-B的感染产生遗传抗性。

    因此,本发明保护如上所述分子标记在诊断B亚群禽白血病抗性鸡中的应用。

    依据tvb受体基因第3667与3668的AG插入突变,本发明建立了一种诊断B亚群禽白血病抗性鸡的方法,具体包括如下步骤:

    S1.提取待测鸡血液DNA,以SEQ ID NO:7~8所示P4引物扩增包含tvb3667-3668insAG突变位点的tvb受体基因片段,测序后判断待测鸡的基因型;

    S2.如待测鸡的基因型为tvbinsAG/insAG,则为B亚群禽白血病抗性鸡,如待测鸡的基因型为tvbS/insAG或tvbS/S,则为B亚群禽白血病易感性鸡。

    与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:

    本发明首次发现在中国鸡种中tvb受体基因第3667与3668位存在AG插入突变,而且本发明首次验证该突变引起宿主对ALV-B的感染产生遗传抗性。因此,将该突变位点作为鉴定鸡B亚群禽白血病抗性的分子标记是非常准确的。以此突变位点建立的抗B亚群禽白血病遗传标记的分子诊断方法,可应用于筛选ALV-B遗传抗性鸡品种(系)的育种素材,从而开展ALV-B遗传抗性鸡品种(系)的选育。

    附图说明

    图1为本发明的研究思路。

    图2为RCASBP(B)病毒感染tvb3667-3668insAG位点不同基因型CEF细胞。

    具体实施方式

    下面结合说明书附图和具体实施例对本发明作出进一步地详细阐述,所述实施例只用于解释本发明,并非用于限定本发明的范围。下述实施例中所使用的试验方法如无特殊说明,均为常规方法;所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,为可从商业途径得到的试剂和材料。

    实施例1tvb受体基因的遗传变异分析

    根据tvb受体基因已知DNA序列(GenBank登录号:NC_006109.3),设计5对引物扩增tvb基因全长序列5425bp,引物序列、位置及PCR扩增片段大小如表1所示。

    表1 为tvb受体基因全长序列PCR扩增信息

    提取中国鸡种血液样品的基因组DNA,用该5对引物扩增tvb受体基因全长序列。PCR反应体系组成:模板1µL,10×buffer 2.5µL,dNTPs 2 µL,上下游引物各 1 µL,KOD-FX 0.25 µL,无菌水补至25µL。PCR反应程序:94℃预变性3min,1个循环;94℃ 45s,58~65℃(不同引物退火温度) 90s,72℃ 60s,35个循环;72℃后延伸10min。PCR产物在2%琼脂糖凝胶电泳检测时可观察到P1~P5引物各自扩增的特异性条带,将PCR扩增产物进行克隆测序,分析tvb受体基因的遗传变异。发明人随机分析了多个中国鸡品种(系)tvb受体基因的遗传变异,发现中国鸡种tvb受体基因第3667与3668核苷酸位置中存在AG插入突变(简称tvb3667-3668insAG)。

    实施例2 tvb3667-3668insAG突变致宿主抗ALV-B感染的功能验证。

    1、体外细胞的功能验证:构建RCASBP(B)EGFP表达质粒,转染DF-I细胞7天后,收集细胞上清液(上清液含携带EGFP荧光蛋白的RCASBP(B)病毒,即ALV-B病毒,可随后感染DF-I和CEF细胞),测定病毒感染单位(IU)后,分装保存于-80℃。RCASBP(B)病毒感染tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型CEF,包括野生型tvb S/S CEF(对ALV-B易感)、杂合突变型tvbS/insAGCEF以及纯合突变型tvbinsAG/insAG CEF,感染后1、2、4、7 天,利用流式细胞技术检测不同时间点tvb3667-3668insAG突变不同基因型CEF感染RCASBP(B)病毒后的阳性细胞率,确定tvb3667-3668insAG突变不同基因型CEF体外感染RCASBP(B)EGFP病毒的趋势。体外细胞实验结果表明:野生型tvbS/S CEF和杂合突变型tvbS/insAGCEF对ALV-B易感,而纯合突变型tvbinsAG/insAGCEF抗ALV-B的感染,证实tvb受体基因自然突变tvb3667-3668insAG导致宿主抗ALV-B的感染,见图2。

    2、体内攻毒试验的功能验证:携带tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型的小鸡随机分组,饲养于隔离器,1日龄和5日龄分别腹腔注射等量ALV-B野毒。体内攻ALV-B野毒1个月后,采集tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型鸡的血样,利用TRIZOL试剂盒抽提血样总RNA。RT-PCR扩增ALV-B的env基因编码序列,设计ALV-B-env的RT-PCR扩增上游引物和下游引物:

    env-F:5’- CCTGGAAAGGTGAGCAAG-3’;

    env-R:5’- TGGAGGGAGAATCGTGAA-3’;

    RT-PCR扩增片段长度为966bp。利用PrimeScriptROne Step RT-PCR Kit Ver. 2试剂盒进行RT-PCR扩增,PCR反应程序:50℃反转录30 min;94℃ 30s,56℃ 60s,72℃ 60s,30个循环;72℃后延伸10min。PCR产物在2%琼脂糖凝胶电泳检测,如观察到966bp的目的条带,则该样品发生病毒血症(ALV-B阳性),如无目的条带的扩增,则该样品没有发生病毒血症(ALV-B阴性)。体内攻毒试验结果表明:tvb3667-3668insAG突变位点野生型tvbS/S小鸡(16只)攻ALV-B野毒后均为ALV-B阳性,杂合突变型tvbS/insAG小鸡(26只)攻ALV-B野毒后也均为ALV-B阳性,而纯合突变型tvbinsAG/insAG小鸡(18只)攻ALV-B野毒后均为ALV-B阴性,见表2。

    表2 为tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型1日龄小鸡

    攻ALV-B野毒1个月后 ALV-B阳性率

    备注:ALV-B为B亚群禽白血病病毒(下同)

    实施例3 建立ALV-B遗传抗性鸡的鉴定标准

    利用表1中的P4引物PCR扩增包含tvb3667-3668insAG突变位点的tvb受体基因区域,根据P4引物PCR扩增产物测序结果,制定判定B亚群禽白血病遗传抗性鸡的方法标准(见表3)。

    表3 B亚群禽白血病遗传抗性鸡的鉴定标准

    备注:如果被检测的鸡带有A,则这只鸡判定为对ALV-B的感染产生遗传抗性。

    建立的B亚群禽白血病遗传抗性鸡的鉴定标准为:1、假如某只鸡在tvb3667-3668insAG突变位点的基因型为tvbinsAG/insAG,则这只鸡对ALV-B感染产生遗传抗性。

    实施例4 ALV-B遗传抗性鸡的筛选与运用

    用建立的B亚群禽白血病遗传抗性鸡鉴定方法评估10个地方鸡种和8个商业肉鸡品系共989个样品抗ALV-B的遗传改良潜力,结果见表4。表4结果表明康乐鸡、东乡绿壳蛋鸡、宁都黄鸡和济宁百日鸡等地方鸡种以及C01、C03和C08等商业肉鸡品系具有良好的抗ALV-B遗传改良潜力,可从这些品种(系)中筛选出培育抗ALV-B感染的育种素材,并运用于ALV-B遗传抗性鸡品种(系)的选育,以防控B亚群禽白血病。

    表4 中国鸡种tvb3667-3668insAG突变位点的基因型频率

    备注:CB01- CB08等代表8个商业肉鸡品系。

    表4的结果表明,tvb受体基因第3667与3668核苷酸位置中存在AG插入突变只存在部分鸡品种(系)中,而且,即使是同一鸡品种(系),也不是所有的鸡都是发生突变的。例如检测的52只康乐鸡,其中26只是没有突变的,剩下的26中,有一些是纯合突变,而一些是杂合突变。

    关 键  词:
    亚群禽 白血病 抗性 分子 标记 tvbsup3667 3668 insAG sup 及其 诊断 方法
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