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1、(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利 (10)授权公告号 (45)授权公告日 (21)申请号 201511005988.1 (22)申请日 2015.12.29 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 105506088 A (43)申请公布日 2016.04.20 (73)专利权人 华南农业大学 地址 510642 广东省广州市天河区五山路 483号 (72)发明人 谢青梅陈伟国蔺文成舒鼎铭 李昕键 (74)专利代理机构 广州粤高专利商标代理有限 公司 44102 代理人 林丽明 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/。
2、11(2006.01) (56)对比文件 CZ 20130046 ,2014.08.06, CN 104152445 A,2014.11.19, C.T.LIAO等.single nucleotide polymorphism variants within tva and tvb receptor genes in chinese chickens. POULTRY SCIENCE .2014,第2482-2489页. 谢青梅等.地方鸡种A/B/D/E亚群禽白血病 遗传抗性评估和建议. 第十六次全国家禽学术 讨论会 .2014,第507页. 审查员 罗洋 (54)发明名称 鸡 B 亚 群 禽。
3、 白 血 病 抗 性 分 子 标 记 tvb3667-3668insAG及其分子诊断方法 (57)摘要 本发明属于抗性品种选育技术领域, 具体公 开了一种鸡B亚群禽白 血 病抗性分子标记 tvb3667-3668insAG及其分子诊断方法。 本发明首次 分析了中国鸡种tvb受体基因的遗传变异, 发现 中国鸡种中tvb受体基因第3667与3668位存在AG 插入突变, 发明人从体外、 体内实验两个层面证 实了该自然突变引起宿主对ALV-B的感染产生遗 传抗性, 另外发明人以此建立抗B亚群禽白血病 遗传标记的分子诊断方法, 该方法可应用于筛选 ALV-B遗传抗性鸡品种 (系) 的育种素材, 从而开。
4、 展ALV-B遗传抗性鸡品种 (系) 的选育。 权利要求书1页 说明书5页 附图1页 CN 105506088 B 2018.09.18 CN 105506088 B 1.鸡B亚群禽白血病病毒抗性分子标记, 其特征在于, 所述分子标记的序列是引物P4-F 和引物P4-R从TVB受体基因, Genebank登陆号为NC_006109. 3上扩增的序列, 并且所述扩增 的序列的第633与634位之间插入AG; 其中, 引物P4-F的核苷酸序列为: CTCCACGTCTCGGCAGCAC; 引物P4-R的核苷酸序列为: CTCTCCATCATCCCCTGCAAG。 2.权利要求1所述的分子标记在制备。
5、诊断B亚群禽白血病病毒抗性鸡的试剂中的应用。 3.引物P4-F 和引物P4-R在制备诊断B亚群禽白血病病毒抗性鸡的试剂中的应用, 其 中, 引物P4-F的核苷酸序列为: CTCCACGTCTCGGCAGCAC, 引物P4-R的核苷酸序列为: CTCTCCATCATCCCCTGCAAG。 权利要求书 1/1 页 2 CN 105506088 B 2 鸡B亚群禽白血病抗性分子标记tvb3667-3668insAG及其分子诊断 方法 技术领域 0001 本发明涉及抗性品种选育技术领域, 更具体地, 涉及鸡B亚群禽白血病抗性分子标 记tvb3667-3668insAG及其分子诊断方法。 背景技术 00。
6、02 禽白血病是由禽白血病病毒 (Avian Leukosis Virus, ALV) 引起的一种免疫抑制 性肿瘤性传染病, 该病能引起多种具有传染性的良性和恶性肿瘤。 感染鸡的禽白血病病毒 包括ALV A-E和J共6个亚群。 B亚群禽白血病病毒 (ALV-B) 是我国禽白血病的主要病原之一, 能使感染鸡群发生免疫抑制、 生产性能下降及特征性肿瘤而死亡, 给世界养禽业造成巨大 的经济损失。 目前, 该病尚无商品化疫苗和有效的治疗方法, 主要通过淘汰阳性鸡来净化种 鸡群和加强生物安全措施进行预防。 然而, 现有措施并不能控制AVL-B在中国的发生与流 行。 近年的流行病学调查结果显示, AVL-。
7、B在我国商品肉鸡、 蛋鸡、 地方品系鸡和野生鸟类中 普遍存在, 已成为威胁我国养鸡业 (尤其是种鸡业) 持续健康发展的重大疾病之一。 因此, 急 需研发更适合我国实情的禽白血病防控新策略。 国外已有研究证实, 从宿主遗传抗性方面 研究禽白血病的遗传抗病育种已成为防控该病的有效策略。 0003 发掘禽白血病遗传抗性功能基因或基因位点, 并应用于筛选禽白血病遗传抗性特 异种质以培育禽白血病抗性鸡品种 (系) 是实现禽白血病遗传抗病育种的关键。 发明内容 0004 本发明为了克服现有技术的上述不足, 提供一种鸡B亚群禽白血病抗性分子标记。 0005 本发明的另一个目的是提供一种诊断B亚群禽白血病抗性。
8、鸡的方法。 0006 为了实现上述目的, 本发明是通过以下方案予以实现的: 0007 一种鸡B亚群禽白血病抗性分子标记, 所述分子标记为tvb受体基因第3667与3668 的AG插入突变。 该位点简称为tvb3667-3668insAG突变位点。 0008 本发明首次分析了中国鸡种tvb受体基因的遗传变异, 发现中国鸡种中tvb受体基 因第3667与3668位存在AG插入突变, 发明人从体外、 体内实验两个层面证实了该自然突变 引起宿主对ALV-B的感染产生遗传抗性。 具体原因在于tvb受体基因第3667与3668位存在AG 插入突变位于tvb受体基因第4外显子, 从而导致tvb受体基因发生移。
9、位编码, 推测其可能导 致tvb受体基因表达一个不适宜作为病毒受体的缺陷蛋白, 从而引起宿主对ALV-B的感染产 生遗传抗性。 0009 因此, 本发明保护如上所述分子标记在诊断B亚群禽白血病抗性鸡中的应用。 0010 依据tvb受体基因第3667与3668的AG插入突变, 本发明建立了一种诊断B亚群禽白 血病抗性鸡的方法, 具体包括如下步骤: 0011 S1.提取待测鸡血液DNA, 以SEQ ID NO: 78所示P4引物扩增包含tvb3667-3668insAG突 变位点的tvb受体基因片段, 测序后判断待测鸡的基因型; 说明书 1/5 页 3 CN 105506088 B 3 0012 。
10、S2.如待测鸡的基因型为tvbinsAG/insAG, 则为B亚群禽白血病抗性鸡, 如待测鸡的基 因型为tvbS/insAG或tvbS/S, 则为B亚群禽白血病易感性鸡。 0013 与现有技术相比, 本发明具有如下有益效果: 0014 本发明首次发现在中国鸡种中tvb受体基因第3667与3668位存在AG插入突变, 而 且本发明首次验证该突变引起宿主对ALV-B的感染产生遗传抗性。 因此, 将该突变位点作为 鉴定鸡B亚群禽白血病抗性的分子标记是非常准确的。 以此突变位点建立的抗B亚群禽白血 病遗传标记的分子诊断方法, 可应用于筛选ALV-B遗传抗性鸡品种 (系) 的育种素材, 从而开 展ALV。
11、-B遗传抗性鸡品种 (系) 的选育。 附图说明 0015 图1为本发明的研究思路。 0016 图2为RCASBP(B)病毒感染tvb3667-3668insAG位点不同基因型CEF细胞。 具体实施方式 0017 下面结合说明书附图和具体实施例对本发明作出进一步地详细阐述, 所述实施例 只用于解释本发明, 并非用于限定本发明的范围。 下述实施例中所使用的试验方法如无特 殊说明, 均为常规方法; 所使用的材料、 试剂等, 如无特殊说明, 为可从商业途径得到的试剂 和材料。 0018 实施例1tvb受体基因的遗传变异分析 0019 根据tvb受体基因已知DNA序列(GenBank登录号: NC_00。
12、6109.3), 设计5对引物扩增 tvb基因全长序列5425bp, 引物序列、 位置及PCR扩增片段大小如表1所示。 0020 表1 为tvb受体基因全长序列PCR扩增信息 0021 0022 提取中国鸡种血液样品的基因组DNA, 用该5对引物扩增tvb受体基因全长序列。 PCR反应体系组成: 模板1L, 10buffer 2.5L, dNTPs 2 L, 上下游引物各 1 L, KOD-FX 说明书 2/5 页 4 CN 105506088 B 4 0.25 L, 无菌水补至25L。 PCR反应程序: 94预变性3min, 1个循环; 94 45s, 5865 (不同引物退火温度) 90s。
13、, 72 60s, 35个循环; 72后延伸10min。 PCR产物在2%琼脂糖凝 胶电泳检测时可观察到P1P5引物各自扩增的特异性条带, 将PCR扩增产物进行克隆测序, 分析tvb受体基因的遗传变异。 发明人随机分析了多个中国鸡品种 (系)tvb受体基因的遗传 变异, 发现中国鸡种tvb受体基因第3667与3668核苷酸位置中存在AG插入突变 (简称tvb3667 -3668insAG) 。 0023 实施例2 tvb3667-3668insAG突变致宿主抗ALV-B感染的功能验证。 0024 1、 体外细胞的功能验证: 构建RCASBP(B)EGFP表达质粒, 转染DF-I细胞7天后, 收。
14、集 细胞上清液 (上清液含携带EGFP荧光蛋白的RCASBP(B)病毒, 即ALV-B病毒, 可随后感染DF-I 和CEF细胞) , 测定病毒感染单位 (IU) 后, 分装保存于-80。 RCASBP(B)病毒感染tvb3667 -3668insAG突变位点不同基因型CEF, 包括野生型tvb S/S CEF (对ALV-B易感) 、 杂合突变型tvbS /insAGCEF以及纯合突变型tvbinsAG/insAG CEF, 感染后1、 2、 4、 7 天, 利用流式细胞技术检测不同 时间点tvb 3667-3668insAG突变不同基因型CEF感染RCASBP(B)病毒后的阳性细胞率, 确定。
15、 tvb3667-3668insAG突变不同基因型CEF体外感染RCASBP(B)EGFP病毒的趋势。 体外细胞实验结果 表明: 野生型tvbS/S CEF和杂合突变型tvbS/insAGCEF对ALV-B易感, 而纯合突变型tvbinsAG/ insAGCEF抗ALV-B的感染, 证实tvb受体基因自然突变tvb3667-3668insAG导致宿主抗ALV-B的感 染, 见图2。 0025 2、 体内攻毒试验的功能验证: 携带tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型的小鸡随机 分组, 饲养于隔离器, 1日龄和5日龄分别腹腔注射等量ALV-B野毒。 体内攻ALV-B野毒1个月 后,。
16、 采集tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型鸡的血样, 利用TRIZOL试剂盒抽提血样总RNA。 RT-PCR扩增ALV-B的env基因编码序列, 设计ALV-B-env的RT-PCR扩增上游引物和下游引物: 0026 env-F: 5 - CCTGGAAAGGTGAGCAAG-3 ; 0027 env-R: 5 - TGGAGGGAGAATCGTGAA-3 ; 0028 RT-PCR扩增片段长度为966bp。 利用PrimeScriptROne Step RT-PCR Kit Ver. 2 试剂盒进行RT-PCR扩增, PCR反应程序: 50反转录30 min; 94 30s,。
17、 56 60s, 72 60s, 30个循环; 72后延伸10min。 PCR产物在2%琼脂糖凝胶电泳检测, 如观察到966bp的目的条 带, 则该样品发生病毒血症 (ALV-B阳性) , 如无目的条带的扩增, 则该样品没有发生病毒血 症 (ALV-B阴性) 。 体内攻毒试验结果表明:tvb3667-3668insAG突变位点野生型tvbS/S小鸡 (16只) 攻ALV-B野毒后均为ALV-B阳性, 杂合突变型tvbS/insAG小鸡 (26只) 攻ALV-B野毒后也均为 ALV-B阳性, 而纯合突变型tvbinsAG/insAG小鸡 (18只) 攻ALV-B野毒后均为ALV-B阴性, 见表2。
18、。 0029 表2 为tvb3667-3668insAG突变位点不同基因型1日龄小鸡 0030 攻ALV-B野毒1个月后 ALV-B阳性率 0031 说明书 3/5 页 5 CN 105506088 B 5 0032 备注: ALV-B为B亚群禽白血病病毒 (下同) 0033 实施例3 建立ALV-B遗传抗性鸡的鉴定标准 0034 利用表1中的P4引物PCR扩增包含tvb3667-3668insAG突变位点的tvb受体基因区域, 根 据P4引物PCR扩增产物测序结果, 制定判定B亚群禽白血病遗传抗性鸡的方法标准 (见表3) 。 0035 表3 B亚群禽白血病遗传抗性鸡的鉴定标准 0036 00。
19、37 备注: 如果被检测的鸡带有A, 则这只鸡判定为对ALV-B的感染产生遗传抗性。 0038 建立的B亚群禽白血病遗传抗性鸡的鉴定标准为: 1、 假如某只鸡在tvb3667-3668insAG 突变位点的基因型为tvbinsAG/insAG, 则这只鸡对ALV-B感染产生遗传抗性。 0039 实施例4 ALV-B遗传抗性鸡的筛选与运用 0040 用建立的B亚群禽白血病遗传抗性鸡鉴定方法评估10个地方鸡种和8个商业肉鸡 品系共989个样品抗ALV-B的遗传改良潜力, 结果见表4。 表4结果表明康乐鸡、 东乡绿壳蛋 鸡、 宁都黄鸡和济宁百日鸡等地方鸡种以及C01、 C03和C08等商业肉鸡品系具。
20、有良好的抗 ALV-B遗传改良潜力, 可从这些品种 (系) 中筛选出培育抗ALV-B感染的育种素材, 并运用于 ALV-B遗传抗性鸡品种 (系) 的选育, 以防控B亚群禽白血病。 0041 表4 中国鸡种tvb3667-3668insAG突变位点的基因型频率 说明书 4/5 页 6 CN 105506088 B 6 0042 0043 备注: CB01- CB08等代表8个商业肉鸡品系。 0044 表4的结果表明,tvb受体基因第3667与3668核苷酸位置中存在AG插入突变只存在 部分鸡品种 (系) 中, 而且, 即使是同一鸡品种 (系) , 也不是所有的鸡都是发生突变的。 例如 检测的52只康乐鸡, 其中26只是没有突变的, 剩下的26中, 有一些是纯合突变, 而一些是杂 合突变。 说明书 5/5 页 7 CN 105506088 B 7 图1 图2 说明书附图 1/1 页 8 CN 105506088 B 8 。