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一种基因组重排木霉菌及其制备及其应用.pdf

  • 上传人:汲墨****o
  • 文档编号:9101323
  • 上传时间:2021-02-06
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  • 摘要
    申请专利号:

    CN200810050619.8

    申请日:

    20080418

    公开号:

    CN101260371B

    公开日:

    20101201

    当前法律状态:

    有效性:

    失效

    法律详情:

    IPC分类号:

    C12N1/15,C12N13/00,C12N15/01,C12N15/04,C12N9/42,C12R1/885

    主分类号:

    C12N1/15,C12N13/00,C12N15/01,C12N15/04,C12N9/42,C12R1/885

    申请人:

    吉林农业大学

    发明人:

    王丕武,张发福,付永平

    地址:

    130118 吉林省长春市新城大街2888号

    优先权:

    CN200810050619A

    专利代理机构:

    吉林长春新纪元专利代理有限责任公司

    代理人:

    魏征骥

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    内容摘要

    本发明涉及一种基因组重排木霉菌及其制备及其应用。其在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的保藏号为CGMCC No.2360。该菌株可用于固体发酵生产纤维素酶,对其固态发酵过程为:接种量为5%~15%浓度,水料比为1.0~3.0,发酵培养基中包括1.5%~2%质量浓度的碳源和1.5%~2%质量浓度的氮源,发酵曲的初始pH值为4.5~7.0左右,发酵于26℃~31℃条件下进行需氧发酵培养,发酵72h~84h。在降解玉米秸秆的过程中,可叶片的薄壁组织降解,使叶片分层并将细胞内组分释放出来,只剩下表皮部分。

    权利要求书

    1.一种基因组重排木霉菌(Trichoderma sp.),其在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的保藏号为CGMCC No.2360。 2.如权利要求1所述的基因组重排木霉菌在固态发酵产纤维素酶中的应用。 3.根据权利要求2所述的基因组重排木霉菌在固态发酵产纤维素酶中的应用,其发酵过程为:接种量为5%~15%浓度,水料比为1.0~3.0,发酵培养基中包括1.5%~2%质量浓度的碳源和1.5%~2%质量浓度的氮源,发酵曲的初始pH值为4.5~7.0,发酵于26℃~31℃条件下进行需氧发酵培养,发酵72h~84h。 4.权利要求1所述的基因组重排木霉菌在降解玉米秸秆中的应用。

    说明书

    

    技术领域

    本发明属于微生物领域,具体涉及一种产纤维素酶高及降解玉米秸秆效果好的木霉菌基因组重排菌株、重排菌株的制备方法、固体发酵产酶的条件优化及该菌株降解玉米秸秆。

    背景技术

    纤维素(cellulose)是自然界中存在最广泛的一类碳水化合物。同时,它也是地球上最丰富、最廉价的再生资源,纤维素是植物细胞壁的主要成分,约占植物干重的三分之一至二分之一,广泛而大量地存在于自然界中,是地球上最为丰富的可再生的生物聚合物之一。有资料表明,全世界每年的植物体生成量达1500亿吨千物质,其中纤维素及半纤维素的总量为850亿吨。

    经过长期的研究,人们发现能够降解和利用变性纤维素(如磷酸膨胀纤维素),纤维素衍生物(如梭甲基纤维素)的微生物种类繁多,在真细菌、放线菌、部分酵母和高等真菌等很多主要的微生物类群中都有发现。但是,能合成组分齐全的纤维素酶体系,并向外分泌,水解天然纤维素材料的种类则相对有限,许多种细菌、放线菌以及担子菌可在天然纤维素材料上生成,有很强的分解纤维素的能力,但胞外纤维素酶活往往很低,而多数纤维素降解真菌,特别是霉菌产生的纤维素酶都能分泌于体外。目前多数纤维素酶的研究都集中在胞外酶活较高的木霉属(Tri choderma)的几个种:粉状侧孢(Sporitrichumpalverulentum),腐皮镰孢(Fusarium solani),绳状青霉(Pencillium funiculosum),曲霉属(AspergiLLus),青霉属(PeniciLLium)和枝顶孢霉(Acremonium)等霉菌和木腐菌菌株上。其中尤以木霉属的产量居多,木霉(Trichoderma sp.)属于半知菌亚门、丝孢纲、丝孢目、粘孢菌类,是一类普遍存在的丝状真菌。霉菌是线状的,对纤维素纤维的降解集中在纤维的端部,并不断生长,由内向外消化纤维素,使其逐渐被分解破坏。里氏木霉(Trichoderma reesei)、康氏木霉(Trichoderma koningii)和绿色木霉(Trichodermaviride)等是木霉属中产纤维素酶活性较高的菌种,特别是绿色木霉(Trichodernia viriLe)及其近缘的菌株,能产生三类纤维素酶,所产生的纤维素酶能分泌到菌体外,一般不聚集形成多酶复合体,但相互发生强烈的协同作用,破坏植物细胞壁,将植物纤维素分解为葡萄糖。

    Genome shuffling技术是在传统诱变基础上,通过细胞融合技术,对诱变后的微生物细胞进行基因组重组,从而使具有正向突变的菌株将其优点结合在一起,进而提高微生物细胞的正向突变频率及正向突变速度。随着DNA改组等定向进化技术的发展,在90年代初美国加州的Maxgen公司Stemmer等人提出的Genome shuffling技术的概念,这种技术是分子定向进化在全基因组水平上的延伸.它将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,因此,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合.进行基因组重排首先需要有一个含有各种不同正突变的基因组库(例如:通过经典的诱变育种得到目的性状发生改进的不同的正突变菌株就构成了所需的基因组库).随后通过原生质体融合将这些正突变菌株的全基因组进行随机重组,并筛选目的性状得到进一步改进的菌株来进行下一轮基因组重排,这样,通过循环多轮的随机重组可以快速、高效地选育出表型得到较大改进的杂交菌种.其具体操作过程是通过对出发菌株进行诱变,然后在模拟DNA重组的条件下对原生质体进行递推式多次融合(recursive protoplast),最后筛选出具有多重正向进化标记的目标菌株。具体做法如下:在采用递推式原生质体融合对目标菌株进行融合的过程中,诱变,首先要进行原生质体的制备,然后模拟DNA改组的反应温度条件对原生质体进行融合,然后在非选择条件下再生;再生原生质体菌丝混合就构成了F1;F1长成菌落,长出的菌落再被制备成为原生质体,同时用同样的方法再进行融合再生,这一过程重复三、四次得到后代菌落;与对照相比,融合后代有效率达到60%、17%、2.5%,较之未融合前增加了40-105倍。这一过程中操作的方法与原生质体融合技术基本相同。例如,在Ying-Xin Zhang等人的研究中,以四株营养缺陷型的弗氏链霉菌为模型进行链霉菌之间的重组,实验表明采用的原生质体融合是实现基因组重组的十分有效的办法,重组有效率超过20%。检测四株经多营养缺陷型的链霉菌的原生质体重组的后代发现,重组中含有两个标记的重组后代为3%,含有三个标记的为0.04%,四个标记为0.00005%。在这一过程中,我们可以看到,后代中带有多重正向进化标记重组子出现的几率是采用原始诱变育种方法的40-105倍。这一结果将为多基因重组提供有效依据,使得我们可以通过DNA改组,获得含有多个亲本遗传信息的更有意义的子代。采用表型的筛选法,可以直接对已知或未知的代谢途径进行快速优化、构建新的代谢途径用于合成新化合物或降解毒害物质,极大地促进了代谢工程的进一步发展和应用。其优化范围从单个蛋白,整个代谢途径或前体供应途径,到整个基因组。Genome shuffling可以利用重组DNA技术对细胞的多种不同基因组进行定点改造和修饰,增加多基因重组的几率,可以得到各种改造后的细胞组成多样性的基因组库,然后通过循环的基因组重排,筛选集多个改造基因于一体的细胞,这样可以极大地加快工程菌株的构建进程,减少对菌株进行多个基因改造和组合的困难,并明确重组优化的原因或本质。基因组重排已经被证明是一种有效的、新颖的全细胞的进化方式,可以快速提高工业微生物的表型。这是在传统育种、原生质体融合育种以及基因工程育种的基础上对微生物育种技术的一次革命性的改进。

    原始菌株—绿色木霉和康宁木霉购自中科院微生物研究所,可以发酵产纤维素酶,但是这两种木霉菌产酶能力有限,还不能达到工业生产的要求,通过传统的诱变方法提高产酶能力的幅度不大,而基因工程的方法又不能克隆齐全的纤维素酶系。

    发明内容:

    本发明提供一种基因组重排木霉菌及其制备及其应用。通过基因组重排技术手段,以解决原始菌株—绿色木霉产酶能力有限、不能达到工业生产要求的问题。

    在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的保藏号为CGMCC No.2360。保藏日期2008.1.24,分类命名:木霉。

    本发明所提供一种上述基因组重排木霉菌的制备方法:包括下列步骤:

    (一)将原始菌株绿色木霉AS3.3711和康宁木霉,分别采用PDA培养基进行纯化,并进行形态学观察,挑取生长较旺盛的菌落进行刚果红培养基平板及固体发酵培养,测定纤维素酶活;

    (二)基因组重排:

    (1)原生质体制备与再生:将纯化后生长最旺盛产酶最高的绿色木霉AS3.3711和康宁木霉的孢子在水中稀释至呈浅绿色,为(1~5)×107个孢子·ml-1,将孢子悬浮液1ml加入到盛有100ml液体菌丝培养基的三角瓶中,瓶放到摇床中,振荡培养,条件为:28-30℃,200r/min,20-24h,在无菌条件下,将无菌条件下培养的菌丝经4层无菌擦镜纸过滤,用无菌水冲洗两次,再用高渗缓冲液清洗两次,称重后加入到50mL离心管中,将新配制好的酶液加入到50ml离心管中,加入量为菌丝重的2倍,29-32℃下振荡培养180r/min,2-5h,用4层无菌擦镜纸过滤除去菌丝碎片,收集滤液置于离心管中,3000r/min离心10min收集原生质体,重新用该高渗缓冲液反复洗涤2~3次,用血球计数法确定原生质体溶液的浓度,并调至107个/ml;

    (2)原生质体初级诱变

    将步骤(1)制备的原生质体分别采用紫外线UV和甲基磺酸乙酯EMS两种诱变方法进行诱变处理,涂布到再生培养基上再生,然后将再生菌株通过刚果红培养基平板和固体发酵试验,分别筛选得到经紫外线诱变的产纤维素酶比原始菌株增加1%以上的多株突变菌株--Tv-UV及Tk-UV和经甲基磺酸乙酯诱变的产纤维素酶比原始菌株增加1%以上的多株突变菌株—Tv-EMS及Tk-EMS;

    (3)多母本递进式原生质体融合即基因组重排

    将步骤(2)得到的紫外线-UV和甲基磺酸乙酯-EMS诱变菌株按照步骤(1)分别制备原生质,并把各原生质体等体积混合后均分为两组,一组置于功率15W的紫外灯下处理5-20min,另一组置于60℃水浴中处理30-120min完全灭活后,混合后3000rpm离心5min,弃上清,加入30℃预热的PEG融合液1ml,30℃保温20min,4000rpm离心,用液体高渗缓冲液离心洗涤3次,并作适当稀释,取200ul涂布于再生培养基上,29℃培养5-7天观察长出菌落。将菌落接种到刚果红培养基平板培养测透明圈,挑取透明圈与菌落比较大的进行固体发酵测定纤维素酶活。得到产酶量比原始菌株高2%的以上的突变菌株—T-F1;

    将4个T-F1菌株继续步骤(3)进行下一轮的原生质体制备、灭活、融合与刚果红培养基平板固体发酵试验筛选,测定纤维素酶活,得到产酶量比T-F1突变菌株高2%以上的突变菌株--T-F2;

    对上述获得的F2菌株进行稳定性试验、产酶量性质分析,获得一株产纤维素酶最高的突变菌株T-F22,即本发明所述的基因组重排木霉菌菌株。

    本发明中平板筛选方法中包括:

    纤维素刚果红培养基:K2HPO4 0.50g,MgSO4,0.25g,纤维素粉1.88g,刚果红0.20g,琼脂14.00g,明胶2.00g,加1%的微晶纤维素,蒸馏水1000ml,PH 7.0。121℃灭菌20min,冷却至50℃,倒平板。将重组菌点接种到纤维素刚果红培养基平板中央,29℃培养3-5d,测透明圈与菌落直径并算出二者的比值;

    .固体发酵产酶试验:麸皮5.0g,K2HPO4 0.05g,硫酸铵0.125g,Tween-800.1ml蒸馏水12.5ml,pH 5.5。28℃,150rpm进行需氧发酵培养,发酵84h,取样测纤维素酶活。

    本发明所使用的方法:以羧甲基纤维素钠为底物,利用3,5-二硝基水杨酸法(DNS)测定葡萄糖含量,从而测定纤维素酶活。

    本发明涉及一种固态发酵产纤维素酶的方法:先将菌种活化,然后接种到种子培养基中扩大培养,再按接种量为5%~15%浓度,水料比为1.0~3.0,发酵培养基中包括碳源为1%秸秆+1%麸皮质量浓度1.5%~2%和氮源为硫酸铵质量浓度1.5%~2%,发酵曲的初始pH值为4.5~7.0左右,发酵于26℃~31℃,发酵72h~84h。

    本发明在对基因组重排木霉菌T-F22在固态发酵培养基的优化过程中,碳源为2%秸秆、2%麸皮、1%秸秆+1%麸皮、1%秸秆+0.5%麸皮+0.5%CMC-Na;氮源为硫酸铵、硝酸铵、蛋白胨、脲、酵母膏。进一步优选实施方案中,碳源为1%秸秆+1%麸皮;氮源为硫酸铵;本发明最佳实施方案中碳源为1%秸秆+1%麸皮;氮源为硫酸铵。

    进一步,本发明采用响应面分析方法,对本发明菌株木霉菌T-F22发酵培养基优化实验,确定培养基中成分最佳浓度。

    本发明基因组重排木霉菌T-F22接种量为2%~20%浓度。进一步优选实施方案中接种量为5%~15%浓度;本发明最佳实施方案中接种量为10%。

    本发明基因组重排木霉菌T-F22初始pH值为4.5~7.0左右。进一步优选实施方案中初始pH值为5.0~6.0左右;本发明最佳实施方案中初始pH值为5.5。

    本发明基因组重排木霉菌T-F22发酵温度26℃~31℃。进一步优选实施方案中发酵温度27℃~30℃;本发明最佳实施方案中发酵温度为28℃。

    本发明基因组重排木霉菌T-F22发酵时间24h~108h,进一步优选实施方案中发酵时间72h~84h;本发明最佳实施方案中发酵时间为84h。

    本发明所提供一种基因组重排木霉菌高效降解玉米秸秆的应用。

    本发明提供的基因组重排木霉菌T-F22菌株的特征如下:

    分类命名为:木霉亚种。特征描述为:菌落在PDA平板上生长较快,菌丝层比较薄,呈丛束状,初期为白色,平坦,中期产生分生孢子呈大小不同零星状,外部被白色菌丝包裹,后期大小不同零星状产孢区部分呈深绿色。该菌种具有较高纤维素酶酶活,经固态发酵条件优化,优化后的条件为:接种量为10%浓度,发酵培养基中包括1%秸秆粉+1%麸皮的碳源和2%体积浓度的氮源,发酵曲的初始pH值为5.5左右,发酵于28℃~29℃,发酵72h~84h,其酶活是绿色木霉AS3.3711的1.5-2倍。在降解玉米秸秆的过程中,可将叶片的薄壁组织降解,使叶片分层并将细胞内组分释放出来,只剩下表皮部分。

    本发明对每一轮突变菌株进行表型筛选(纤维素酶产量),获得多个亲本突变株后进行基因组重排(genome shuffling),使菌株的正突变特性高度组合,选育高产纤维素酶的优良菌株。解决了原始菌株—绿色木霉产酶能力有限的问题,能满足工业生产的要求。

    附图说明

    图1为重排木霉菌T-F22经10次传代培养产酶量变化。

    图2为重排木霉菌T-F22与原始菌株的形态比较。

    图3为突变株与原始菌株的产酶能力的比较。

    图4为重排木霉菌T-F22与原始菌株全细胞SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳比较。

    图5为优化发酵条件响应面法立体分析图。

    图6为重排木霉菌T-F22降解玉米秸秆产还原糖含量曲线。

    图7为重排木霉菌T-F22与原始菌株降解玉米秸秆效果。

    如图1所示,其中重排木霉菌T-F22固体培养基发酵84h,测定纤维素酶活。横坐标表示重排木霉菌T-F22培养的次代数,纵坐标表示每代发酵产酶。

    如图2所示,A为绿色木霉AS3.3711菌落形态,B为重排菌株T-F22菌落形态,C为康宁木霉菌落形态。

    如图3所示,突变株与原始菌株固体培养基发酵84h,测定纤维素酶活。Tv表示原始菌株绿色木霉AS3.3711;Tk表示原始菌株康宁木霉;Tv-UV表示经紫外诱变的绿色木霉菌株;Tk-UV表示经紫外诱变的康宁木霉菌株;Tv-EMS表示经甲基磺酸乙酯诱变的绿色木霉菌株;Tk-EMS表示经甲基磺酸乙酯诱变的康宁木霉菌株;T-F11-14表示第一轮改组菌株;T-F21-23表示第二轮改组菌株。

    如图4所示,重排木霉菌T-F22与原始菌株绿色木霉AS3.3711和康宁木霉进行全细胞SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳比较,M表示蛋白质marker;A表示重排木霉菌T-F22;B表示绿色木霉AS3.3711;C表示康宁木霉。绿色木霉AS3.3711和康宁木霉是同属木霉属,有很多相似条带,重排木霉菌T-F22多数条带与康宁木霉相同,也有3-4条特征带只与绿色木霉AS3.3711相同,还有些条带与绿色木霉AS3.3711亮度上也有差异。

    如图5所示,从响应面立体分析图中可知,当吐温-80为0.3g和微晶纤维素为3.0g时,纤维素酶产量达到最大值127.496IU/ml。

    如图6所示,重排木霉菌T-F22降解玉米秸秆产还原糖含量曲线,还原糖含量随培养天数的变化而波动,在第5天出现最低点。

    如图7所示,A表示降解前的玉米秸秆;B表示绿色木霉AS3.3711降解后玉米秸秆;C重排木霉菌T-F22降解后玉米秸秆。

    具体实施方式

    下述实施例中所用方法如无特别说明均为常规方法。

    实施例1、基因组重排技术选育木霉菌株

    (一)原始菌株的纯化和形态学研究及产酶特性分析

    将原始菌株绿色木霉AS3.3711和康宁木霉,分别采用PDA培养基进行纯化,并进行形态学观察,挑取生长较旺盛的菌落进行刚果红培养基平板及固体发酵培养,测定纤维素酶活。

    纤维素刚果红培养基:K2HPO4 0.50g,MgSO4,0.25g,纤维素粉1.88g,刚果红0.20g,琼脂14.00g,明胶2.00g,加1%的微晶纤维素,蒸馏水1000ml,PH 7.0。121℃灭菌20min,冷却至50℃,倒平板。将重组菌点接种到纤维素刚果红培养基平板中央,29℃培养3-5d,测透明圈与菌落直径并算出二者的比值;

    .固体发酵产酶试验:麸皮5.0g,K2HPO4 0.05g,硫酸铵0.125g,Tween-800.1ml蒸馏水12.5ml,pH 5.5。28℃,150rpm进行需氧发酵培养,发酵84h,取样测纤维素酶活。

    本发明所使用的方法:以羧甲基纤维素钠为底物,利用3,5-二硝基水杨酸法(DNS)测定葡萄糖含量,从而测定纤维素酶活。

    (二)基因组重排

    (1).原生质体制备与再生

    将纯化后生长最旺盛产酶最高的绿色木霉AS3.3711和康宁木霉的孢子在水中稀释至呈浅绿色,为(1~5)×107个孢子·ml-1。将孢子悬浮液1mL加入到盛有100mL液体菌丝培养基的三角瓶中,瓶放到摇床中,振荡培养,条件为:28-30℃,200r/min,20-24h,在无菌条件下,将无菌条件下培养的菌丝经4层无菌擦镜纸过滤,用无菌水冲洗两次,再用高渗缓液清洗两次,该高渗缓冲液为:0.6M的山梨糖醇,0.01MTris-HCl PH值7.5,10mMCaCl2;称重后加入到50mL离心管中,将新配制好的酶液加入到50mL离心管中,该酶液为:0.5%溶壁酶+0.3%蜗牛酶+0.3%纤维素酶,加入量为菌丝重的2倍,29-32℃下振荡培养180r/min,2-5h,用4层无菌擦镜纸过滤除去菌丝碎片,收集滤液置于离心管中,3000r/min离心10min收集原生质体,重新用高渗缓冲液反复洗涤2~3次,用血球计数法确定原生质体溶液的浓度,并调至107个/ml。

    (2).原生质体初级诱变

    紫外线UV诱变:将步骤(1)制备好的原生质体调整浓度为107cfu/ml,取10ml原生质体置于灭过菌的带磁力棒的培养皿(直径90mm)中,培养皿放置在磁力搅拌器载物台上,开启搅拌器,在预热20min的紫外灯下(距离为30cm)边照射边搅拌,并计时。分别于2min,5min,10min,15min和20min各取2ml原生质体溶液,进行倍数稀释后涂布于再生培养基上再生,29℃,培养箱避光培养,5天后观察结果。将再生平板上长出的菌落点接种到纤维素刚果红平板上,29℃,培养箱避光培养3d,挑取透明圈与菌落直径比值较大的进行固体发酵,3d测定纤维素酶产量。获得两株产酶量较高的菌株--Tv-UV1和Tk-UV1。

    其中再生培养基为:葡萄糖20.0g,蔗糖200g,琼脂4.0g,(NH4)2SO4 1.4g,KH2PO4 2.0g,K3PO4 4.0g,MgSO4·7H2O 0.3g,NaCl 17.5g,CaCl2 0.3g,吐温-80 0.1g,再加入矿质元素(mg/L).FeSO4·7H2O 5.0mg,MnSO4 1.6mg,ZnSO4·7H2O 1.4mg,CoCl·2H2O2.0mg,定容至1000ml。

    甲基磺酸乙酯(EMS)诱变:将步骤A制备好的原生质体调整浓度为107cfu/ml,取10ml原生质体,向其中加入甲基磺酸乙酯使终浓度为1.0mol/L,分别于2min,5min,10min,15min和20min各取2ml原生质体溶液,3000r/min离心10min收集原生质体,重新用高渗缓冲液反复洗涤2~3次,倍数稀释后涂布于原生质体再平板上,29℃,培养箱避光培养,5天后观察结果。按紫外线诱变后筛选方法进行筛选,获得两株产酶量较高的菌株--Tv-EMS2和Tk-EMS2。

    (3).多母本递进式原生质体融合即基因组重排

    将步骤(2)得到的4株紫外线-UV和甲基磺酸乙酯-EMS诱变菌株按照步骤(1)分别制备原生质,并把各原生质体等体积混合后均分为两组,一组置于功率15W的紫外灯下处理5-20min,另一组置于60℃水浴中处理30-120min完全灭活后,混合后3000rpm离心5min,弃上清,加入30℃预热的PEG融合液1ml,该PEG制备方法是:70g PEG-4000溶于100mLddH2O中,1.034×105Pa灭菌20min,4℃保存,30℃保温20min,4000rpm离心,用液体高渗缓冲液离心洗涤3次,并作适当稀释,取2ml涂布于再生培养基上,29℃培养7天观察长出菌落。将菌落接种到刚果红培养基平板培养测透明圈,挑取透明圈与菌落比较大的进行固体发酵测定纤维素酶活。获得4株产酶量较高的菌株T-F11 T-F12 T-F13T-F14;将所得的4株F1菌株按同样策略进行培养,原生质体制备,融合,再生后将菌落接种到刚果红培养基平板培养测透明圈,挑取透明圈与菌落比较大的进行固体发酵测定纤维素酶活,获得3株产酶量较高的F2菌株T-F21,T-F22,T-F23。

    (三)突变菌株的遗传稳定性试验

    将第二轮重排菌株分别进行PDA培养基传代10次,对每一代菌株进行固体发酵产酶实验,测定纤维素酶活(图1)。基因组重排木霉菌T-F22经10次传代培养,每一代菌株固体发酵产酶量没有发生显著变化,说明突变菌株具有很好的遗传稳定性。

    实施例2:突变株与原始菌株的比较

    (1)突变株与原始菌株的形态的比较

    将重排菌株T-F22与原始菌株绿色木霉AS3.3711和康宁木霉点接种到PDA上(图2),由图可知,T-F22的生长速度介于原始菌株绿色木霉AS3.3711和康宁木霉生长速度中间,且形态上处于零星分布,与原始菌株不同,大部分颜色与绿色木霉3.3711相似,零星的成熟部分与康宁木霉形态相似。

    (2)突变株与原始菌株的产酶能力的比较

    将经紫外线(Tv-UV1和Tk-UV1),甲基磺酸乙酯(Tv-EMS2和Tk-EMS2)诱变的和第一轮重排,第二轮重排菌株与原始菌株分别经固体发酵,进行纤维素酶活测定(图3)。比较产纤维素酶能力,经紫外线,甲基磺酸乙酯诱变的菌株产酶量较原始菌株区别不显著;而重排菌株(T-F11-14,T-F21-23)产酶能力较原始菌株有明显提高。第二轮重排菌株提高更显著。

    (3)第二轮重排菌株与原始菌株全细胞SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳比较

    将第二轮重排菌株与原始菌株进行全细胞SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(图4)。由图可见,重排菌株T-F22与原始菌株绿色木霉AS3.3711和康宁木霉大多数蛋白电泳条带在相同位置,也有个别条带或与绿色木霉AS3.3711相同位置,或与康宁木霉相同位置。

    实施例3:固态发酵产纤维素酶的方法

    先将菌种活化,然后接种到种子培养基中扩大培养,再按接种量为5%~15%浓度,水料比为1.0~3.0,发酵培养基中包括碳源为1%秸秆+1%麸皮质量浓度1.5%~2%和氮源为硫酸铵质量浓度1.5%~2%,发酵曲的初始pH值为4.5~7.0左右,发酵于26℃~31℃,发酵72h~84h。

    在对基因组重排木霉菌T-F22在固态发酵培养基的优化过程中,碳源为2%秸秆、2%麸皮、1%秸秆+1%麸皮、1%秸秆+0.5%麸皮+0.5%CMC-Na;氮源为硫酸铵、硝酸铵、蛋白胨、脲、酵母膏。进一步优选实施方案中,碳源为1%秸秆+1%麸皮;氮源为硫酸铵;本发明最佳实施方案中碳源为1%秸秆+1%麸皮;氮源为硫酸铵。

    进一步,本发明采用响应面分析方法,对本发明菌株木霉菌T-F22发酵培养基优化实验,确定培养基中成分最佳浓度。

    基因组重排木霉菌T-F22接种量为2%~20%浓度。进一步优选实施方案中接种量为5%~15%浓度;本发明最佳实施方案中接种量为10%。

    基因组重排木霉菌T-F22初始pH值为4.5~7.0左右。进一步优选实施方案中初始pH值为5.0~6.0左右;本发明最佳实施方案中初始pH值为5.5。

    基因组重排木霉菌T-F22发酵温度26℃~31℃。进一步优选实施方案中发酵温度27℃~30℃;本发明最佳实施方案中发酵温度为28℃。

    基因组重排木霉菌T-F22发酵时间24h~108h,进一步优选实施方案中发酵时间72h~84h;本发明最佳实施方案中发酵时间为84h。

    培养基条件的优化

    在纤维素酶固体发酵中,培养基成分是重要的影响因素,特别是一些产酶促进剂对纤维素酶的产量起到很大的作用。因此,我们采用Placket-Burman设计(本领域常用的一种统计优化试验设计法)方法对%1秸秆+1%麸皮、硫酸铵、大豆粉、吐温-80、微晶纤维素、磷酸二氢钾、氯化钙、硫酸镁等营养物质进行优化,从而获得产酶高的发酵培养基。

    (1)二水平试验  对基因组重排菌株T-F22,采用Placket-Burman设计(表1)

    表1.Placket-Burman设计

    对%1秸秆+1%麸皮、硫酸铵、大豆粉、吐温-80、微晶纤维素、磷酸二氢钾、氯化钙、硫酸镁等营养物质进行优化,考察各因素的主效应和交互效应的一级作用(表2)。利用SAS软件进行分析,结果表明吐温-80、微晶纤维素对基因组重排菌株T-F22产酶有显著影响。

    表2 Plackett-Burman实验设计回归分析结果

    (2)最陡爬坡试验  由回归分析结果可知,%1秸秆+1%麸皮、(NH4)2SO4、大豆粉、CaCl2、Mg2SO4·7H2O对产酶影响不显著,按照SAS给定的最优水平配比。而吐温-80和微晶纤维素的浓度对基因组重组菌T-F22产纤维素酶影响显著,且X4和X5的系数均为正数,说明同时升高吐温-80和微晶纤维素的浓度对基因组重组菌T-F22产纤维素酶有积极的影响。

    以吐温-80(X1)每次增加0.1g和微晶纤维素(X2)每次增加1g基本步长(Δ),则最陡爬坡试验设计及结果见表3。从表3可以看出,处理3的吐温-80和微晶纤维素的浓度已在最优点附近,可以此浓度为中心点采用中心组合设计来对培养基作进一步的优化(表3)。

    表3最陡爬坡试验设计及其结果

    (3)中心组合设计和响应面分析  根据爬坡试验得到的中心点,对吐温-80和微晶纤维素进行中心组合设计(表4和表5)。分析结果表明(表6),模型极显著(P<0.1),并且有很好的确定系数,RSq=0.9157这表明基因组重排木霉T-F22产纤维素酶量91.57%的可靠性可由模型来预测。并通过SAS9.0软件对实验数据进行回归拟合,得二次方程为:

    Y1=127.48+0.374637*X1+0.090538*X2-2.340004*X1*X1-2.275*X1*X2

    -2.065003*X2*X2

    由于方程的二次系数为负值,方程所代表的抛物面开口向下,因而该方程有极大值。给出了模型的二维响应面(图5),证实了拟合面具有最大值。

    表4中心组合设计各因子及其编码值

    表5中心组合设计及其结果

    注:各因子代码中心化X1=(X1-0.1)/0.1 x2=(X2-3)/1

    表6中心组合设计(CCD)回归分析结果

    用Mathematica对方程进行求导,可以得到模型的最大值,即最大纤维素酶产量。当吐温-80为0.328g和微晶纤维素为2.91g时,纤维素酶产量达到127.496IU/ml。为了进一步验证实验结果,在优化的培养基条件下进行重复实验3次,得到纤维素酶平均产量为127.01IU/ml,这证明实验值和实际值之间具有良好的拟合性,优化模型可靠。

    实施例4:基因组重排木霉菌T-F22降解玉米秸秆

    利用基因组重排木霉菌T-F22降解玉米秸秆,液体产酶培养基:蛋白胨3.0g,酵母膏0.5g,麸皮5.0g,硫酸铵2.0g,磷酸二氢钾4.0g,氯化钙0.3g,硫酸镁0.3g,Tween-800.2ml,蒸馏水定容1000ml。200ml培养基中加入2.0g玉米秸秆,并加入2ml经种子培养基预培养的重排木霉菌T-F22,28℃,150rpm培养,每隔24h测定还原糖含量(图6),并设定对照。结果表明,培养基还原糖含量有变化,开始还原糖含量减少,说明菌体生长消耗还原糖;一段时间还原糖含量趋于不变,说明木霉菌T-F22降解玉米秸秆产生还原糖与菌体生长消耗还原糖的量持平,后几天还原糖含量有所增加,说明菌体生长减慢,并伴有菌体自溶,需糖量减少,降解玉米秸秆产生还原糖增加,培养基的总还原糖量增加。9天后产看降解效果(图7),木霉菌T-F22降解后玉米秸秆,边缘呈透明状,相间部分呈锯齿型。而原菌株绿色木霉AS3.3711降解后玉米秸秆无如此大的变化,木霉菌T-F22在降解玉米秸秆的过程中,可将叶片的薄壁组织降解,使叶片分层并将细胞内组分释放出来,只剩下表皮部分。

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    一种 基因组 重排 霉菌 及其 制备 应用
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