技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种用防御素基因检测昆虫自残率的方法。 背景技术
害虫生物防治在农林业可持续发展中发挥着不可替代的重要作用。天敌昆虫的大 量生产更是生物防治中最基础也是最重要的环节。捕食性天敌昆虫蠋蝽(Arma chinensis)可以控制来自鳞翅目、鞘翅目、半翅目、同翅目、膜翅目等多种农林害虫, 尤其是它还可以控制重大外来入侵害虫马铃薯甲虫和美国白蛾,因此蠋蝽是一种应用 前景很好的天敌昆虫商品。
作为商品,大量减少生产成本是人们追求利润最大化的一个途径。在天敌昆虫蠋 蝽生产中就可以应用不同的食物来生产蠋蝽,例如,不同的昆虫猎物、含昆虫成分的 人工饲料和不含昆虫成分的人工饲料,进而减少生产成本。但是应用不同的食物生产 出来的蠋蝽的生物学特性参差不齐,有些释放后能达到很好的控制害虫的作用,有的 则在释放后效果不显著。由于不同食物饲喂的蠋蝽在表型上很难区分,因此这些天敌 昆虫在释放前是很难评估它们的生物学特性的。
种内自残现象是捕食性天敌昆虫大量群体饲养过程中很严重的一个问题。自残率 高的昆虫种群很难在短期内大量扩繁,因此倍增时间大大延长,进而增加饲养成本。 在用人工饲料饲养的蠋蝽种群内,自残率较高。但是对于不同食物来源或不同商家的 商品蠋蝽自残率的检测方法仍旧是在饲养过程中测试其自残率的多少,这种方法费时 费力费钱。不进行生物学测定就很难对商品进行快速的检测。
防御素是蝽类防御竞争对手及躲避天敌的一种重要武器,防御素的大量释放可以 在天敌饲养过程中大大减少天敌昆虫的自残现象,而且在释放天敌到野外或保护地防 治害虫时,可以减少天敌对蠋蝽的危害。
发明内容
本发明的一个目的是提供用于检测类防御素蛋白编码基因表达量的物质的用途。
本发明提供了用于检测类防御素蛋白编码基因表达量的物质在检测昆虫自残率 中的应用;
所述类防御素蛋白(defensin-like protein)的氨基酸序列为序列表中的序列2。
上述应用中,所述昆虫为昆虫个体或昆虫种群;
所述昆虫种群具体为取食不同物质昆虫种群;
所述取食不同物质昆虫种群进一步具体为取食人工饲料的昆虫种群或取食猎物 的昆虫种群;
所述类防御素蛋白编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列 1自5’末端第81-272位核苷酸。
所述昆虫具体为蠋蝽。
上述人工饲料按照如下方法制备:生猪肝60g、大豆粉10g、水100ml、鸡蛋20ml、 干酪素2g、蔗糖8g、VC0.2g、氯化胆碱0.4g、泛酸钙8mg、叶酸0.1mg、烟酰胺0.2mg、 庆大霉素3.9mg;具体饲喂方法见实施例2;
上述猎物为柞蚕(Antheraea pernyi)蛹;具体饲喂方法见实施例2。
上述应用中,所述用于检测类防御素蛋白编码基因表达量的物质为如下1)-3) 中任意一种:
1)引物对A:所述引物对由引物1和引物2组成;所述引物1的核苷酸序列为序 列表中序列3;所述引物2的核苷酸序列为序列表中序列4;
2)含有所述引物对A的RT-PCR试剂;
3)含有所述引物对A或所述RT-PCR试剂的试剂盒。
本发明的另一个目的是提供一种引物对A。
本发明提供的引物对A,由引物1和引物2组成;
所述引物1的核苷酸序列为序列表中序列3;所述引物2的核苷酸序列为序列表 中序列4。
含有上述的引物对A的RT-PCR试剂也是本发明保护的范围;上述RT-PCR试剂具 体由水、RT-PCR扩增缓冲液、镁离子、dNTPs、上述的引物对A、荧光染料(SYBR Green I)和Taq酶组成;
所述引物对A中的各条引物在所述RT-PCR试剂中的终浓度具体为0.2-1μM,所 述引物对A中的各条引物在所述RT-PCR试剂中的终浓度进一步具体为0.25μM。
含有上述的引物对A或上述的RT-PCR试剂的试剂盒也是本发明保护的范围。
上述试剂盒还包括内参引物对B,所述内参引物对B由引物3和引物4组成;所 述引物3的核苷酸序列为序列表中的序列6;所述引物4的核苷酸序列为序列表中的 序列7。
本发明的第三个目的是提供一种检测昆虫自残率的方法。
本发明提供的方法,包括如下步骤:用上述的引物对A或上述的RT-PCR试剂或 上述的试剂盒对待测的昆虫A和B进行RT-PCR扩增;
若所述昆虫A的类防御素蛋白基因的表达量高于所述昆虫B,则所述昆虫A的自 残率低于所述昆虫B。
上述方法中,所述昆虫为昆虫个体或昆虫种群;
所述RT-PCR扩增的模板为昆虫的cDNA;
所述昆虫具体为蠋蝽。
在本发明的实施例中,所述昆虫A为取食猎物的昆虫种群;所述昆虫B为取食人 工饲料的昆虫种群。
本发明的第四个目的是提供一种蛋白或其编码基因。
本发明提供的蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2;
本发明提供的蛋白的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序 列1自5’末端第81-272位核苷酸。
本发明的实验证明,本发明所提供的检测方法可以通过检测类防御素蛋白基因表 达量来检测不同种群的昆虫自残率,特别是不同营养源的蠋蝽的自残率,用本发明的 检测方法检测昆虫的自残率仅需2-3天。而用传统的生物学方法需要30-60天左右。本 发明的检测方法涉及的材料来源广,易购买,操作简单,省时,省力,适合于在昆虫 商品检验检测中推广应用。
附图说明
图1为蠋蝽beta-actin内参扩增曲线
图2为蠋蝽beta-actin内参融解曲线
图3为蠋蝽类防御素蛋白基因扩增曲线
图4为蠋蝽类防御素蛋白基因融解曲线
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1、检测昆虫自残率的类防御素蛋白及其编码基因的发现和专用引物的设 计
研究发现,防御素基因是一种检测昆虫自残率的很好的分子标记,因此本发明通 过检测蠋蝽的类防御素蛋白(defensin-like protein)编码基因的表达来检测蠋蝽的 自残率。
蠋蝽的类防御素蛋白编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序 列1自5’末端第81-272位核苷酸,该蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2。
根据蠋蝽的类防御素蛋白编码基因设计用于扩增该编码基因的引物如下:
上游引物:TGCGCTAGTTCACGTGCCTT(序列3);
下游引物:AGCGGTACTGTCCCTAGGTAAT(序列4)。
实施例2、类防御素蛋白或其编码基因或专用引物在检测蠋蝽自残率中的应用
下述实验中采用的蠋蝽(Arma chinensis,记载在Taxonomic and bionomic notes on Arma chinensis(Fallou)(Hemiptera:Pentatomidae:Asopinae,Zootaxa,3382:41-52,2012, 公众可从中国农业科学院植物保护研究所获得)根据取食物质的不同分为两组,每组 50只:
取食人工饲料组蠋蝽:饲喂人工饲料的蠋蝽(27±1°C,16:8(L:D),75±5%RH) 每天每头成虫饲喂160微升人工饲料,一直到蠋蝽自然死亡;
取食猎物组蠋蝽:饲喂猎物的蠋蝽(27±1°C,16:8(L:D),75±5%RH)每对成 虫饲喂一头猎物,每隔7-15天根据猎物被取食情况更换一次猎物,一直到蠋蝽自然死 亡;
人工饲料为生猪肝60g、大豆粉10g、水100ml、鸡蛋20ml、干酪素2g、蔗糖8g、 VC0.2g、氯化胆碱0.4g、泛酸钙8mg、叶酸0.1mg、烟酰胺0.2mg、庆大霉素3.9mg;
猎物为柞蚕(Antheraea pernyi)蛹(可商购)。
一、蠋蝽cDNA的获得
1、蠋蝽RNA抽提
步骤如下:
将各组蠋蝽样品移入加入适量液氮的研钵中,快速、用力研磨成匀浆,移至 1.5ml离心管中。
加1000μlTrizol到1.5ml离心管中,静置5分钟。
加200μl氯仿,旋涡振荡10秒,静置5分钟,放入离心机中,12,000g4℃ 离心15分钟。
将上清液转移至新的1.5ml离心管中,加入等体积的异丙醇,振荡混匀,-20℃ 放置1小时,室温静置10分钟。
放入离心机中,12,000g,4℃离心10分钟。
弃上清液,将异丙醇除尽,加入1ml75%的无水乙醇,12,000g,4℃离心5分 钟。
弃上清液,待沉淀干燥后加入DEPC处理水,-80℃保存,得到RNA。
2、反转录
采用SuperscriptШReverse Transcriptasekit试剂盒(Invitrogen 18080044)进行反转录:
a)取一灭菌的无RNA酶的eppendorf管,每个样本加入如下表1所示的组分 得到mix1;
表1为反转录加入组分1
组分 体积 来源 Up to5μg total RNA 5μl
Primer(50μM oligio(dt) 0.5μl Invitrogen Random primer 0.5μl Invitrogen 10mM dNTP Mix 1μl Invitrogen DEPC-treated water 5μl Total 12μl
b)把mix165℃温浴5分钟,然后立即放冰上1分钟;
c)在mix1里加入如下表2所示的成分,得到mix2共20μl体系;
表2为反转录加入组分2
d)25℃处理5分钟;
e)50℃处理60分钟;
f)70℃处理15分钟,立即放置到冰上;
g)得到cDNA,且该cDNA可以在-20℃保存半年。
二、RT-PCR扩增
RT-PCR扩增体系中各组分的体积如下表3所示,采用SYBR(R)Green I Nucleic A kit(Invitrogen S7567):
表3为PCR扩增体系中各组分的体积
PCR反应条件如表4所示:
表4为PCR反应条件
循环 循环周期 95℃,2分钟 40次循环 第一步变性:95℃,10秒 第二步退火:60℃,30秒 溶解曲线 60℃-95℃,每5秒增加0.5℃
以蠋蝽beta-actin(ACTB)作为内参基因(序列5),扩增该内参基因的引物如下:
内参上游引物:TGTCCAAGCAGGAGTACGAC(序列6);
内参下游引物:GGTTCCTCTTTGGAGTCCGATT(序列7)。
若取食猎物的蠋蝽组中的类防御素蛋白基因平均表达量高于取食人工饲料的蠋 蝽组,则取食猎物的蠋蝽组自残率低于取食人工饲料的蠋蝽组。
结果如图1-4所示,图1为蠋蝽beta-actin内参扩增曲线;图2为蠋蝽beta-actin 内参融解曲线;图3为蠋蝽类防御素蛋白基因扩增曲线;图4为蠋蝽类防御素蛋白基 因融解曲线;可以看出,扩增曲线平滑,重复性好;溶解曲线呈单一峰,说明没有非 特异性扩增,荧光定量结果准确。
蠋蝽beta-actin(ACTB)内参基因ct值如表5所示:
表5为各组蠋蝽beta-actin(ACTB)内参基因ct值
蠋蝽类防御素蛋白基因定量结果如表6所示:
表6为各组蠋蝽类防御素蛋白基因定量结果
从上述结果中发现,与取食昆虫猎物的蠋蝽相比,取食人工饲料的蠋蝽的类防御 素蛋白基因的表达量极低,检测不到;而在取食昆虫猎物的蠋蝽中该类防御素蛋白基 因明显上调;这证明,取食昆虫猎物的蠋蝽组自残率低于取食人工饲料的蠋蝽组。
通过传统的生物学方法(按照上述两组的方法饲喂,每天记录被伴侣成虫取食的 成虫数量,以被取食后留下的空壳虫体为证,计数,一直到蠋蝽成虫种群全部自然死 亡,计算自残率)检测饲料组蠋蝽和猎物组蠋蝽的自残率,取食昆虫猎物的蠋蝽组和 取食人工饲料的蠋蝽组一生中平均自残率分别为7%和17%;可以看出,该检测结果与 用传统生物学方法检测的结果相一致,证明本发明的方法正确。
结果表明,用本发明的检测方法可以快速检测不同营养源的蠋蝽的类防御素蛋白 基因的表达量的变化,以此来判断活体种群的自残率的差异。
因此本发明的检测类防御素蛋白基因表达的物质可以作为分子标记用于检测取 食不同营养源的蠋蝽种群的自残率;而用于扩增类防御素蛋白基因的引物或者RT-PCR 试剂可以作为检测取食不同营养源的蠋蝽种群的自残率试剂盒的组分;
上述RT-PCR试剂由超纯水、10×PCR扩增buffer、镁离子、dNTPs、上游引物、 SYBR(SYBR Green I荧光染料)、下游引物、Taq酶组成;其中镁离子在RT-PCR试剂 中的终浓度为1.25mM;dNTPs中每一种在RT-PCR试剂中的终浓度为0.25mM;上游引 物和下游引物在在RT-PCR试剂中的终浓度均为0.25μM;Taq酶在RT-PCR试剂中的终 浓度为0.05u/μl。