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一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列及其克隆方法.pdf

  • 上传人:龙脉
  • 文档编号:9059466
  • 上传时间:2021-02-02
  • 格式:PDF
  • 页数:25
  • 大小:644.76KB
  • 摘要
    申请专利号:

    CN201010218665.1

    申请日:

    20100707

    公开号:

    CN101886086B

    公开日:

    20120822

    当前法律状态:

    有效性:

    失效

    法律详情:

    IPC分类号:

    C12N15/52,C12N15/10,C12N9/00

    主分类号:

    C12N15/52,C12N15/10,C12N9/00

    申请人:

    四川农业大学

    发明人:

    李晚忱,付凤玲,林荆,牟禹,蒋伟

    地址:

    611130 四川省成都市温江区东北路550号

    优先权:

    200910059934.1

    专利代理机构:

    成都九鼎天元知识产权代理有限公司

    代理人:

    刘明芳;吴彦峰

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    内容摘要

    本发明公开了一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列,该序列具有如SEQIDNO.1所述的核苷酸序列。该序列是一种新的TPS基因序列,使人们对TPS基因的研究对象从大肠杆菌和真菌等微生物及少数有限的植物体进一步扩展到垫状卷柏等多种植物体。并且,根据该TPS基因在垫状卷柏植物体内催化合成的海藻糖所表现出的优良的抗旱、耐盐等性能可以预料:如果将其通过转基因技术导入玉米等其他植物的基因中,将可培育出具有相应的优良的抗旱、耐盐等性能的植物新品种。本发明还公开了一种上述来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列的克隆方法。

    权利要求书

    1.一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列,该序列如SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列。2、根据权利要求1所述的序列,其特征在于:所述的核苷酸序列对应的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所述。3、一种权利要求1所述的来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列的克隆方法,包括下述主要步骤:(1)总RNA的提取和纯化:采用各种通用的RNA提取方法和纯化方法,从植物垫状卷柏叶片中提取得到纯化的垫状卷柏叶片总RNA;(2)中间片段的克隆:A、中间片段cDNA第一链的合成以上述步骤(1)纯化的垫状卷柏叶片总RNA作为模板,以oligod (T) 18:5′-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACGGCATGACAGTG(T)18-3′为反转录引物,进行cDNA第一链合成,得到的cDNA第一链,作为下述步骤B中PCR扩增的cDNA模板;B、PCR扩增以前述步骤A所得中间片段的cDNA第一链作为cDNA模板,利用下述上游引物jf1和下游引物jx1,进行PCR扩增:jf1: 5′-TGGTCGTAAGGTTATGTTGGG-3′,jx1: 5′-TGTTCGGGCATTGTTGTCAT-3′;扩增得到垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因cDNA中间片段,通过克隆测序,得到中间片段序列;(3)3′端的克隆:以前述步骤(2)A中得到的cDNA第一链为模板,利用下述上游引物S1和下游引物AP2进行PCR扩增:S1:  5′-GCCATCAGAGAAAGCGGTTACT-3′,AP2: 5′-TACGTACGGCATG ACAGTG-3′;扩增得到完整的3′端,通过克隆测序,得到3′端序列;(4)5′端的克隆:C、合成5′端的cDNA第一链:以上述步骤(1)纯化的垫状卷柏叶片总RNA作为模板,以下述下游引物jx1和上游引物SMARTIIA Oligo为反转录引物,进行反转录:jx1: 5′- TGTTCGGGCATTGTTGTCAT-3′,SMARTIIA Oligo: 5′-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGG-3′;合成得到反转录产物5′端的cDNA第一链;D、第一段PCR扩增:以前述步骤C所得反转录产物5′端的cDNA第一链为cDNA模板,利用下述下游引物A2和同源上游引物C1,进行5′端第一段PCR扩增:A2: 5′-TCTTTTCATTTTGACAGGCGAC-3′,C1:5′-ATCGGATGGCCTGGTGTCTATG-3′;扩增得到的产物为cDNA 5′端第一段,通过克隆测序,得到5′端第一段的序列;E、第二段PCR扩增:以前述步骤C所得反转录产物5′端的cDNA第一链为cDNA模板,利用下述下游引物A5和上游引物P3,进行5′端第二段PCR扩增;A5: 5′-GCGGTCTTCTTGACGCAATCCAATGTAG-3′,P3: 5′-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3′ ;扩增得到的产物为cDNA 5′端第二段,通过克隆测序,得到5′端第二段序列;(5)ORF的克隆和拼接:将上述步骤(2)所得中间片段序列、步骤(3)所得3′端序列、和步骤(4)所得5′端第一段序列和第二段序列进行拼接,得到的cDNA全长作为ORF扩增的cDNA模板;以下述上游引物ORF4和下游引物ORF5进行PCR扩增:ORF 4:5′-CCCAAGCTT(Hind                                               )CCTCGAG(Xho)ATGCCTACTCCGTATTCCAATAC -3′,ORF5: 5′-CGC GGATCC (BamH)ATTAATTATCGACAGCGACAACC-3′;扩增得到的产物为完整开放阅读框,即垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因,通过克隆测序,即得其基因序列。4、根据权利要求3所述的克隆方法,其特征在于:所述的步骤(1)中,采用的RNA提取方法为Trizol法;纯化方法为DNA酶消化法。5、根据权利要求3所述的克隆方法,其特征在于:所述的步骤(2)中进行PCR扩增时,扩增体系为:TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,cDNA模板               1 μL ,2×引物:jx1/jf1       0.5 μL ,ddHO                   8 μL ;扩增程序为:94℃,5min;94 ℃,30 s,55 ℃,45 s,72℃,1 min 30 s;30个循环;72 ℃,8 min;4℃保温。6、根据权利要求3所述的克隆方法,其特征在于:所述的步骤(3)中进行PCR扩增时,扩增体系为:TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,cDNA模板                2 μL ,2×引物:S1/AP2        0.5 μL ,ddHO                      7 μL ;扩增程序为:94℃,3 min;94℃,30 s;55℃,45 s;72℃,1 min 30 s;33个循环;72℃,8 min;12℃保温。7、根据权利要求3所述的克隆方法,其特征在于:所述的步骤(4)中进行第一段PCR扩增时,扩增体系为:TaqPlusPCR Master Mix  12 μL ,cDNA模板                   2 μL ,2×引物:A2/C1           0.5 μL ,ddHO                       5 μL ;扩增程序为:94℃,3 min;94℃,30 s;65℃,45 s;72℃,1 min 30 s ;2个循环;每两个循环递减2℃;94℃,30 s;55℃,45 s;72℃,1 min 30 s ;25个循环;72℃,8 min;12℃保温。8、根据权利要求3所述的克隆方法,其特征在于:所述的步骤(4)中进行第二段PCR扩增时,扩增体系为:TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,cDNA模板                  1.5 μL ,2×引物:A5/P3         0.5 μL ,ddHO                   7.5 μL ;扩增程序为:94℃,30 s;72℃,2 min;5个循环;94℃,30 s;70℃,30 s;72℃,2 min ;5个循环;94℃,30 s;68℃,30 s;72℃,2 min ;25个循环;12℃保温。9、根据权利要求3所述的克隆方法,其特征在于:所述的步骤(5)中进行PCR扩增时,扩增体系为:2×GC BufferⅠ、含Mg       10 μL ,2×引物:ORF4/ORF5           0.5 μL ,cDNA模板                       1 μL ,dNTP Mixture                    3.2 μL ,TaKaRa LA Taq                   0.2 μL ,ddHO                        4.6 μL ;扩增程序为:94℃,5 min;94℃,30 s;57℃,1 min 30 s;72℃,2 min ;10个循环;94℃,30 s;72℃,2 min 30 s ;25个循环;72℃,8 min;12℃保温。

    说明书

    技术领域

    本发明属于植物基因工程技术领域,特别涉及一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列及其克隆方法。

    背景技术

    垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)为卷柏科卷柏属植物,俗称“九死还魂草”。它一般多生长在荒山秃岭及干旱的岩石缝中,极耐干旱,也耐寒。在天气干旱的时候,小枝就卷起来,缩成一团,以保住体内的水分。一旦得到雨水,气温升高,卷缩的小枝会平展开来。有研究表明垫状卷柏这类复苏植物体内含有大量的应激代谢物-海藻糖。

    海藻糖又称酵母糖,是由两个吡喃环葡萄糖分子通过α-1,1糖苷键连结而成的非还原性糖,其理化性质十分稳定,能够在高温、高寒、高盐和干燥失水等恶劣条件下对生物细胞起到保护作用。海藻糖作为渗透调节物质通过渗透调节来维持高的细胞质渗透压,保证在干旱胁迫下细胞的正常生理功能;在缺水情况下,可以保持细胞膜的液体流动相,防止细胞膜通透性增加,出现融合现象;可以替代水分子通过氢键作用参与肽链折叠,维持在缺水情况下蛋白质的空间结构和功能。

    在生物体内,海藻糖的生物合成过程为:先由海藻糖-6-磷酸合成酶(trehalose-6-phosphate synthase,TPS)催化尿苷二磷酸葡萄糖(UDP)和6-磷酸葡萄糖反应生成6-磷酸海藻糖,再在海藻糖-6-磷酸磷酸酯酶 (treha1ose-6-phosphate phosphatase,TPP)的作用下脱磷酸,最终生成海藻糖。其中,海藻糖-6-磷酸合成酶是该合成途径中的一个关键酶;不同生物体内的海藻糖-6-磷酸合成酶具有各自不同的特点,如在编码基因和结构等方面即存在着明显的差异。

    目前人们研究海藻糖的主要策略之一,是通过对海藻糖上述合成途径相关基因的克隆与表达研究,增强其合成途径的代谢,从而实现海藻糖在生物体内的富集。其中海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)成为主要关注对象之一,许多科学家在此方面进行了不懈的努力。但目前,人们对大肠杆菌和真菌等体内TPS基因的研究与利用相对较多,对植物体内TPS基因的开发研究还非常有限。

    发明内容

    本发明的主要目的就是针对现有技术对植物体内海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)基因开发研究的局限性,提供一种来源于植物垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶的基因序列,以期待应用于其它转基因作物中使之具有相应的优良的抗旱耐盐等性能。

    本发明的另一个目的是提供一种上述基因序列的克隆方法。

    为了实现上述发明目的,本发明采用的技术方案如下:

    一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列,该序列具有如SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列。

    其所对应的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所述。

    上述核苷酸序列,可通过包括下述步骤的方法,从植物垫状卷柏叶片中提取总RNA、设计引物、进行PCR扩增、测序等克隆得到:

    (1)总RNA的提取和纯化:

    可采用各种通用的RNA提取方法和纯化方法,从植物垫状卷柏叶片中提取得到纯化的垫状卷柏叶片总RNA;

    常用的RNA提取方法很多,如试剂盒法(Trizol法)、热硼酸法、异硫氰酸胍法、苯酚法、十二烷基硫磺酸钠法、十六烷基三甲基溴化铵法、及各种改进方法等,均可用于垫状卷柏叶片总RNA的提取;本发明中可优选Trizol法。

    纯化主要是为了去除总RNA中的DNA污染,获得纯化的垫状卷柏叶片总RNA,以满足后续对目的基因的表达进行定量检测等需要。常用的RNA纯化方法包括:DNA酶消化法(简称 D法)、酸酚变性法(简称S法)、EDTA法(简称 E法)等;本发明中可优选DNA酶消化法。

    (2)中间片段的克隆:

    A、中间片段cDNA第一链的合成

    以上述步骤(1)纯化的垫状卷柏叶片总RNA作为模板,以oligod (T) 18:5’-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACGGCATGACAGTG(T)18-3’为反转录引物,进行cDNA第一链合成,得到的cDNA第一链,作为下述步骤B中PCR扩增的cDNA模板;

    B、PCR扩增

    以前述步骤A所得中间片段的cDNA第一链作为cDNA模板,利用下述上游引物jf1和下游引物jx1,进行PCR扩增:

    jf1: 5’-TGGTCGTAAGGTTATGTTGGG-3’,

    jx1: 5’-TGTTCGGGCATTGTTGTCAT-3’;

    扩增得到垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因cDNA中间片段,通过克隆测序,得到中间片段序列。

    本步骤中,扩增体系可优选为:

    TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,

    cDNA模板               1 μL ,

    2×引物(jx1/jf1)      0.5 μL ,

    ddH2O                   8 μL 。

    扩增程序可优选为:

    94℃,5min;

    94℃,30 s,55℃,45 s,72℃,1 min 30 s(30个循环);

    72℃,8 min;4℃保温。

    (3)3’端的克隆:

    根据上述步骤(2)得到的中间片段序列,设计并合成用于扩增3’端的特异性上游引物S1和通用性下游引物AP2,分别为:

    S1:  5’-GCCATCAGAGAAAGCGGTTACT-3’,

    AP2: 5’-TACGTACGGCATG ACAGTG-3’;

    以前述步骤(2)A中得到的cDNA第一链为模板,利用上游引物S1和下游引物AP2进行PCR扩增;扩增得到完整的3’端,通过克隆测序,得到3’端序列。

    本步骤中,扩增体系可优选为:

    TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,

    cDNA模板                2 μL ,

    2×引物(S1/AP2)       0.5 μL ,

    ddH2O                    7 μL 。

    扩增程序可优选为:

    94℃,3 min;

    94℃,30 s;55℃,45 s;72℃,1 min 30 s(33个循环)

    72℃,8 min;12℃保温。

    (4)、5’端的克隆:

    C、合成5’端的cDNA第一链

    以上述步骤(1)纯化的垫状卷柏叶片总RNA作为模板,以下述特异性下游引物jx1和5’端接头上游引物SMARTIIA Oligo为反转录引物,进行反转录:

    jx1: 5’- TGTTCGGGCATTGTTGTCAT-3’,

    SMARTIIA Oligo: 5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGG-3’;

    合成得到反转录产物5’端的cDNA第一链;

    D、第一段PCR扩增

    根据上述步骤(2)得到的中间片段序列,设计并合成特异性下游引物A2和同源上游引物C1:

    A2: 5’-TCTTTTCATTTTGACAGGCGAC-3’,

    C1:5’-ATCGGATGGCCTGGTGTCTATG-3’;

    以前述步骤C所得反转录产物5’端的cDNA第一链为cDNA模板,利用特异性下游引物A2和同源上游引物C1,进行5’端第一段PCR扩增;

    扩增得到的产物为cDNA 5’端第一段,通过克隆测序,得到5’端第一段的序列。

    本步骤中,扩增体系可优选为:

    TaqPlusPCR Master Mix  12 μL ,

    cDNA模板                 2 μL ,

    2×引物(A2/C1)         0.5 μL ,

    ddH2O                     5 μL 。

    扩增程序可优选为:

    94℃,3 min;

    94℃,30 s;65℃,45 s;72℃,1 min 30 s (2个循环);

    每两个循环递减2℃;

    94℃,30 s;55℃,45 s;72℃,1 min 30 s (25个循环);

    72℃,8 min;12℃保温。

    E、第二段PCR扩增

    根据前述步骤D所得cDNA 5’端第一段的序列,设计并合成特异性下游引物A5和5’端通用性上游引物P3:

    A5: 5’-GCGGTCTTCTTGACGCAATCCAATGTAG-3’,

    P3: 5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’ ;

    以前述步骤C所得反转录产物5’端的cDNA第一链为cDNA模板,利用特异性下游引物A5和5’端通用性上游引物P3,进行5’端第二段PCR扩增:

    扩增得到的产物为cDNA 5’端第二段,通过克隆测序,得到5’端第二段序列。

    本步骤中,扩增体系可优选为:

    TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,

    cDNA模板                1.5 μL ,

    2×引物(A5/P3)        0.5 μL ,

    ddH2O                    7.5 μL 。

    扩增程序可优选为:

    94℃,30 s;72℃,2 min(5个循环);

    94℃,30 s;70℃,30 s;72℃,2 min (5个循环);

    94℃,30 s;68℃,30 s;72℃,2 min(25个循环);

    12℃保温。

    (5)ORF的克隆和拼接:

    将上述步骤(2)所得中间片段序列、步骤(3)所得3’端序列、和步骤(4)所得5’端第一段序列和第二段序列进行拼接,得到的cDNA全长作为ORF(Open Reading Frame,开放阅读框)扩增的cDNA模板;

    以下述上游引物ORF4和下游引物ORF5进行PCR扩增:

    ORF 4:5’-CCCAAGCTT(Hind Ⅲ)CCTCGAG(XhoⅠ)ATGCCTACTCCGTATTCCAATAC -3’,

    ORF5: 5’-CGC GGATCC (BamH Ⅰ)ATTAATTATCGACAGCGACAACC-3’;

    扩增得到的产物为完整开放阅读框,即垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因,通过克隆测序,即得其基因序列。

    本步骤中,扩增体系可优选为:

    2×GC BufferⅠ(含Mg2+)       10 μL ,

    2×引物(ORF4/ORF5)          0.5 μL ,

    cDNA模板                       1 μL ,

    dNTP Mixture                  3.2 μL ,

    TaKaRa LA Taq                 0.2 μL ,

    ddH2O                           4.6 μL 。

    扩增程序可优选为:

    94℃,5 min;

    94℃,30 s;57℃,1 min 30 s;72℃,2 min (10个循环);

    94℃,30 s;72℃,2 min 30 s (25个循环);

    72℃,8 min;12℃保温。

    与现有技术相比,本发明的有益效果是:

    本发明来源于植物垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)的基因序列是一种新的TPS基因序列,使人们对TPS基因的研究对象从大肠杆菌和真菌等微生物及少数有限的植物体进一步扩展到垫状卷柏等多种植物体。

    并且,根据该TPS基因在垫状卷柏植物体内催化合成的海藻糖所表现出的优良的抗旱、耐盐等性能可以预料:如果将其通过转基因技术导入玉米等其他植物的基因中,将可培育出具有相应的优良的抗旱、耐盐等性能的植物新品种。

    附图说明

    图1为SpTPS1基因中间片段电泳检测结果图,

    图2为SpTPS1基因3’端电泳检测结果图,

    图3为SpTPS1基因5’第一段电泳检测结果图,

    图4为SpTPS1基因5’第二段电泳检测结果图,

    图5为SpTPS1基因电泳检测结果图,

    图6是表达载体pTU+SpTPS1示意图,

    图7是再生植株(转spTPS1基因T1代株系)PCR检测结果图,

    图8是再生植株(转spTPS1基因T1代株系)的Southern杂交检测结果图。

    具体实施方式

    下面结合具体实施方式对本发明的上述发明内容作进一步的详细描述。

    但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于下述实施例。在不脱离本发明上述技术思想情况下,根据本领域普通技术知识和惯用手段,做出各种替换和变更,均应包括在本发明的范围内。

    在下述各实施例中,将垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶简称为SpTPS1。通过各实施例,最终得到来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶核苷酸序列(如SEQ ID NO.1所述)及其所对应的氨基酸序列(如SEQ ID NO.2所述)。

    实施例1

    本实施例为垫状卷柏叶片总RNA的提取和纯化,包括下述步骤:

    (1)取垫状卷柏幼嫩叶片放入液氮预冷过的研钵,立即加入液氮,尽可能的研磨碎样品,趁液氮尚未挥发将样品按每管0.1 g分装入用液氮预冷过的1.5 mL离心管中,立即向每管加入1 mL Trizol(Invitrogen公司),剧烈振荡后,室温放置5 min。

    (2)4℃、12000 r/min离心2 min,将上清液转入新的无RNase的离心管中。

    (3)向每管加入0.1 mL 5 mol/L的NaCl,混合均匀,再向每管加入0.3 mL氯仿,剧烈振荡15 s后,室温放置3 min,4℃、12000 r/min 离心15 min,在尽可能不吸入中间层的情况下,吸出上清液转入另一干净的1.5 mL离心管中。

    (4)向每管加入与所得上清液相等体积的异丙醇,轻轻混匀后,室温放置10 min,4℃、12000 r/min离心10 min,小心倒掉管中液体,保留沉淀,加入1 mL 75%乙醇洗涤沉淀。

    (5)4℃、7500 r/min离心5 min,小心倒掉管中液体,保留沉淀,再加入1 mL 75%乙醇洗涤沉淀,4℃、7500 r/min离心5 min,所得沉淀即为垫状卷柏叶片总RNA,-20℃保存。

    实施例2

    本实施例为SpTPS1基因中间片段的克隆,方法如下:

    以上述实施例1所得纯化的垫状卷柏叶片总RNA作为模板,以oligod (T) 18:5’-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACGGCATGACAGTG(T)18-3’为反转录引物,按照Takara公司的PrimeScriptTM Reverse Transcriptase说明书进行cDNA第一链合成,扩增体系总体积为20 μL;得到中间片段的cDNA第一链。

    先通过比对5个已知的海藻糖-6-磷酸合成酶氨基酸序列:复活卷柏TPS1(Selaginella lepidophylla TPS1 U96736.1);番茄TPS1(Solanum lycopersicum TPS1 E.F151131.1);拟南芥TPS1(Arabidopsis thalianaTPS1 NM106505.4);小立豌藓TPS1(Physcomitrella patens subsp TPS1 XM001778453);甘蔗TPS1(Saccharum hybrid cultivar TPS1 EU761244),确定出中间位置的保守区域,再以复活卷柏TPS1为询问序列在NCBI进行核苷酸比对,结合比对情况,得到一对兼并引物:

    jf1: 5’-TGGTCGTAAGGTTATGTTGGG -3’;

    jx1: 5’-TGTTCGGGCATTGTTGTCAT-3’。

    以前述中间片段的cDNA第一链为cDNA模板,以设计的引物jf1和jx1进行垫状卷柏海藻糖-6-磷酸合成酶基因cDNA中间片段的扩增。

    扩增体系为:TaqPlusPCR Master Mix      10 μL

    cDNA模板                1 μL

    2×引物(jx1/jf1)       0.5 μL

    ddH2O                    8 μL

    扩增程序为:94℃,5min;

    94℃,30 s,55℃,45 s,72℃,1 min 30 s(30个循环);

    72℃,8 min;4℃保温。

    取所得扩增产物10 μL经1%非变性琼脂糖凝胶80 V电泳40 min,EB染色后紫外线检测扩增片段,结果如图1所示。

    扩增得到的产物为SpTPS1基因cDNA中间片段,通过包括下述步骤的方法克隆测序,得到的中间片段序列如SEQ ID NO.3所述:

    ①目的片段的回收与纯化:

    将扩增出来的特异条带用干净刀片在紫外光下快而准确的从琼脂糖中挖出,置于1.5 mL离心管中,用凝胶回收试剂盒(北京天根公司)回收胶中的DNA片段;

    ②连接反应:

    将回收的DNA片段克隆于TaKaRa公司的pMD18-T载体中。连接反应采用连接试剂盒(Takara公司),扩增体系总体积10 μL,16℃连接过夜;

    ③感受态细胞的制备:

    Ⅰ、从LB平板上挑取新活化的E. coli DH5α单菌落,接种于3-5 mL LB液体培养基中,37℃、225 r/min振荡培养12 h左右,直至对数生长后期;将该菌悬液以1:100-1:50的比例接种于100 mL LB液体培养基中,37℃振荡培养2-3 h至OD600=0.35-0.5左右;

    Ⅱ、将培养液转入离心管中,冰上放置10 min,然后于4℃下3000 r/min离心10 min;

    Ⅲ、弃去上清,用预冷的0.05 mol/L的CaCl2 溶液10 mL轻轻悬浮细胞,冰上放置15-30 min后,4℃下3000 r/min离心10 min;

    Ⅳ、弃去上清,加入4 mL预冷含15%甘油的0.05 mol/L的CaCl2 溶液,轻轻悬浮细胞,冰上放置几分钟,即成感受态细胞悬液;

    Ⅴ、将感受态细胞分装成200 μL的小份,贮存于-80℃可保存半年;

    ④质粒DNA的转化:

    Ⅰ、从-80℃冰箱中取出一管大肠杆菌感受态细胞DH5α,置于冰上融化;

    Ⅱ、在无菌条件下加入10 μL连接反应液,轻轻涡旋混匀后,在冰上放置30 min;

    Ⅲ、42℃水浴热击90 s,不要摇动,之后迅速放入冰浴冷却2-3 min;

    Ⅳ、加入700 μL无Amp的LB液体培养基,混匀后,37℃、100 r/min摇床振摇培养,温育45 min;

    Ⅴ、取100 μL已转化的菌液涂于一个LB/Amp的培养平板上,正面朝上放置30 min,待菌液完全被培养基吸收后,用封口膜封住,然后倒转培养皿,37℃避光培养16-24 h;随后筛选阳性菌落;

    ⑤重组菌落的鉴定与保存:

    从外观上看,一般白色且圆的菌落为阳性,准确鉴定还需要以下的步骤:

    Ⅰ、在过夜培养的平板上用灭菌的牙签挑取几个白色菌落,分别点种于盛有含0.1 g/L Amp的LB液体培养基的1.5 mL离心管中,37℃、100 r/min振摇培养过夜;

    Ⅱ、取10 μL的菌悬液于1.5 mL离心管中,加入90 μL ddH2O,煮沸10 min,离心,取上清液2 μL作为模板,用引物jf1/jx1进行PCR扩增,PCR扩增体系和扩增条件均同前,用1% 的非变性琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物;如果产物为目的条带时,此重组菌落为阳性克隆,否则为阴性;同时设不加菌悬液的阴性对照;

    Ⅲ、取已经鉴定的阳性克隆的菌落悬浮液750 μL,加入250 μL的灭菌甘油,混匀后,用液氮速冻,置于-80℃冰箱中保存备用;

    Ⅳ、最后送英骏生物技术公司测序,所得序列在NCBI的Blastn 进行比对分析,验证克隆片段是否正确。

    实施例3

    本实施例为SpTPS1基因3’端的克隆,方法如下:

    根据上述中间片段的测序结果,设计合成1个特异性上游引物:

    S1:  5’-GCCATCAGAGAAAGCGGTTACT-3’,

    另外设计合成1个3’端通用性下游引物:

    AP2: 5’-TACGTACGGCATGACAGTG-3’;

    以前述实施例2得到的中间片段cDNA第一链为模板,利用上游引物S1和下游引物AP2进行PCR扩增;

    扩增体系为:

    TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,

    cDNA模板                  2 μL ,

    2×引物(S1/AP2)       0.5 μL ,

    ddH2O                         7 μL 。

    扩增程序为:

    94℃,3 min;

    94℃,30 s;55℃,45 s;72℃,1 min 30 s(33个循环)

    72℃,8 min;12℃保温。

    取所得扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图2所示。

    扩增得到的产物为SpTPS1基因3’端,通过克隆测序,得到的3’端序列如SEQ ID NO.4所述。

    克隆测序参照前述中间片段的测序方法,将电泳检测后的产物经胶回收试剂盒回收,再将回收的产物克隆到pMD18-T载体上,转化E. coli DH5α感受态细胞,以S1/AP2为引物,经菌液PCR验证后,用质粒小提试剂盒提取质粒(北京天根生化科技有限公司),并将菌液送英骏生物技术公司测序。所得序列在NCBI的Blastn 进行比对分析,验证克隆片段是否正确。

    实施例4

    本实施例为SpTPS1基因5’端的克隆,包括下述步骤:

    (1)、5’端的cDNA第一链合成:

    以上述实施例1所得纯化的垫状卷柏叶片总RNA作为模板,以下述特异性下游引物jx1和5’端接头上游引物SMARTIIA Oligo为反转录引物,采用MMLV Reverse Transcriptase(大连宝生物公司)进行反转录,反转录扩增体系总体积为10 μL:

    jx1: 5’-TGTTCGGGCATTGTTGTCAT-3’,

    SMARTIIA Oligo: 5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGG-3’;

    合成得到反转录产物5’端的cDNA第一链;

    (2)、第一段PCR扩增:

    根据上述步骤(2)得到的中间片段序列,设计并合成特异性下游引物A2:

    A2: 5’-TCTTTTCATTTTGACAGGCGAC-3’,

    再根据设计中间片段的5个已知的6-磷酸海藻糖合成酶序列的比对(同上),在靠近5’端处寻找同源区段,设计并合成同源上游引物C1:

    C1:5’-ATCGGATGGCCTGGTGTCTATG-3’;

    以前述步骤(1)所得反转录产物5’端的cDNA第一链为cDNA模板,利用特异性下游引物A2和同源上游引物C1,进行5’端第一段PCR扩增;

    扩增体系为:

    TaqPlusPCR Master Mix  12 μL ,

    cDNA模板                 2 μL ,

    2×引物(A2/C1)         0.5 μL ,

    ddH2O                     5 μL 。

    扩增程序为:

    94℃,3 min;

    94℃,30 s;65℃,45 s;72℃,1 min 30 s (2个循环);

    每两个循环递减2℃;

    94℃,30 s;55℃,45 s;72℃,1 min 30 s (25个循环);

    72℃,8 min;12℃保温。

    取所得扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图3所示。

    扩增得到的产物为SpTPS1基因5’端第一段,通过克隆测序,得到的5’端第一段序列如SEQ ID NO.5所述。

    克隆测序参照前述中间片段的测序方法,将电泳检测后的产物经胶回收试剂盒回收,再将回收的产物克隆到pMD18-T载体上,转化E. coli DH5α感受态细胞,以A2/C1为引物,经菌液PCR验证后,提取质粒,并将菌液送英骏生物技术公司测序。所得序列在NCBI的Blastn 进行比对分析,验证克隆片段是否正确。

    (3)、第二段PCR扩增:

    根据前述步骤(2)所得cDNA 5’端第一段的序列,设计并合成特异性下游引物A5:

    A5: 5’-GCGGTCTTCTTGACGCAATCCAATGTAG-3’,

    另外根据5’端反转录接头引物设计合成1个5’端通用性上游引物P3:

    P3: 5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’ ;

    以前述步骤(1)所得反转录产物5’端的cDNA第一链为cDNA模板,利用特异性下游引物A5和5’端通用性上游引物P3,进行5’端第二段PCR扩增:

    扩增体系为:

    TaqPlusPCR Master Mix 10 μL ,

    cDNA模板                1.5 μL ,

    2×引物(A5/P3)        0.5 μL ,

    ddH2O                    7.5 μL 。

    扩增程序为:

    94℃,30 s;72℃,2 min(5个循环);

    94℃,30 s;70℃,30 s;72℃,2 min (5个循环);

    94℃,30 s;68℃,30 s;72℃,2 min(25个循环);

    12℃保温。

    取所得扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图4所示。

    扩增得到的产物为SpTPS1基因5’端第二段,通过克隆测序,得到的5’端第二段序列如SEQ ID NO.6所述。

    克隆测序参照前述中间片段的测序方法,将电泳检测后的产物经胶回收试剂盒回收,再将回收的产物克隆到pMD18-T载体上,转化E. coli DH5α感受态细胞,经菌落PCR验证后,送英骏生物技术公司测序。所得序列在NCBI的Blastn进行比对分析,验证克隆片段是否正确。

    实施例5

    本实施例为SpTPS1基因开放阅读框ORF克隆,方法如下:

    将上述实施例2所得中间片段序列、实施例3所得3’端序列、和实施例4所得5’端第一段序列和第二段序列进行拼接,得到cDNA全长(作为ORF扩增的cDNA模板),通过NCBI里ORF finder工具分析开放阅读框,并根据表达载体的酶切位点的需要设计上游引物ORF4和下游引物ORF5如下:

    ORF 4:5’-CCCAAGCTT(Hind Ⅲ)CCTCGAG(XhoⅠ)ATGCCTACTCCGTATTCCAATAC -3’,

    ORF5: 5’-CGC GGATCC (BamH Ⅰ)ATTAATTATCGACAGCGACAACC-3’;

    以拼接得到的cDNA全长作为ORF扩增的cDNA模板,以上游引物ORF4和下游引物ORF5进行PCR扩增:

    扩增体系为:

    2×GC BufferⅠ(含Mg2+)       10 μL ,

    2×引物(ORF4/ORF5)          0.5 μL ,

    cDNA模板                       1 μL ,

    dNTP Mixture                  3.2 μL ,

    TaKaRa LA Taq                 0.2 μL ,

    ddH2O                           4.6 μL 。

    扩增程序为:

    94℃,5 min;

    94℃,30 s;57℃,1 min 30 s;72℃,2 min (10个循环);

    94℃,30 s;72℃,2 min 30 s (25个循环);

    72℃,8 min;12℃保温。

    取所得扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图5所示。

    扩增得到的产物为完整开放阅读框,即垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因,通过克隆测序,即得其基因序列,如SEQ ID NO.1所述;其对应的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所述。

    克隆测序参照前述中间片段的测序方法,将电泳检测后的产物经胶回收试剂盒回收,再将回收的产物克隆到pMD18-T载体上,转化E. coli DH5α感受态细胞,经菌液PCR验证后,送英骏生物技术公司测序。所得序列在NCBI的Blastn进行比对分析。

    实施例6

    由于基因在克隆、表达过程中具有诸多不确定性,最终得到的基因是否具有如预料相应的功能也是不确定的;因此,本实施例中,为了研究所克隆的上述垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SpTPS1)是否具有某些特定的功能,发明人进行了深入研究,以便进一步验证其功能,具体操作如下:

    (1)、构建植物表达载体,农杆菌介导转化玉米获得转基因再生植株

    由单子叶植物组成型启动子Ubiquitin启动垫状卷柏海藻糖合成酶基因SpTPS1,以抗除草剂基因Bar为选择标记,构建表达载体pTU+SpTPS1,如图6所示。图6中:LB,植物表达载体左边界(长度25bp,L25);RB, 植物表达载体右边界(长度25bp,R25);bar,抗除草剂选择标记基因;TEV enhancer,增强子,作用是增强bar基因的表达;2×PS,串联的两个35S启动子,启动bar基因的表达;Ubiquitin,单子叶植物玉米泛素启动子;T-nos,胭脂碱合成酶终止子;aadA,壮观霉素标记,用于表达载体转化大肠杆菌时作为筛选标记。

    以玉米自交系18-599的胚性愈伤组织为受体,农杆菌介导转化pTU+spTPS1,经过除草剂筛选,分化得到再生植株。

    (2)、再生植株的分子鉴定

    对再生植株进行目的基因PCR检测(目的基因的提取方法和检测方法同以上实施例中SpTPS1基因的提取方法和检测方法),得到一株阳性植株并到云南加代繁殖种子,收获38个后代株系。

    转spTPS1基因的38个T1代株系,部分株系PCR检测如图7所示,M为DNA分子量标记DL2000,CK-为阴性对照;CK+为阳性质粒(pTU+spTPS1)对照,D6、C3、A6、E4、B5分别为转spTPS1基因T1代不同株系,各转基因T1代不同株系结果全为阳性。

    选择基因组DNA量足够的E4和A6两个株系,用能均匀将基因组DNA切割成几kb左右大小的限制性内切酶SpeⅠ 和ApaⅠ酶切E4和A6两个株系的基因组DNA,酶电泳分离酶切产物后进行Southern杂交检测,如图8所示, 1为 T1代转基因株系E4(SpeⅠ 酶切),2为未转基因对照,3.为阳性对照(pTU+SpTPS1),4为T1代转基因株系E4(ApaⅠ 酶切),5为 T1代转基因株系A6(ApaⅠ 酶切);结果表明, SpTPS1基因以单拷贝形式整合到了玉米基因组中。

    (3)、转spTPS1基因T2代株系的耐旱性鉴定

    于2010年在新疆和四川等地分别设置鉴定点进行。据各鉴定点的田间调察,转基因植株平均株高1.5 m,比对照降低0.8 m,株型紧凑。对鉴定材料进行干旱处理,高度降低、株型紧凑的转基因植株叶片仍然保持舒展,而非转基因对照叶片严重卷曲、萎焉。转基因植株初步表现出较强的耐旱性。

    序  列  表

    <110> 四川农业大学

    <120> 一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列及其克隆方法

    <160> 6

    <210> 1

    <211> 2790

    <212> DNA

    <213> 来源于垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)的海藻糖-6-磷酸合成酶基因的核苷酸序列

    <400> 1

    atgcctactc cgtattccaa tacgaattcc tcaagcgctc ccttagtgcc tctcaatctc        60

    aatctgccgc cttcgttagc gtcttccaga gtcgagcgcc ttgtccgaga gcggcaactg       120

    aggaggaatg acgaccagcc tgaatcggtg caagaatcgc acgaacaggt acaagatcat       180

    acgcaggagc agccggattc acccttgacg ccggatcgtc agcagcggct gctcgttgta       240

    gcgaatcggt tgccggtttc cgccacgcgc aagggcgacg atcaatggag cttggaagtg       300

    agcgctggcg gcctcgtctc tgcgcttctt ggtgtgaagc agttccaggt agtatggatc       360

    ggccggcccg gtgtctatgt ccaggacgag ctcggcaagc aatcgcttgc caaggcgctt       420

    gaggaaaagg gatttgtggg tgtgttgcta gacgaggaaa cagtggatca atattacaat       480

    ggctactgca acaatgtctt gtggcctctc tttcactaca ttggattgcg tcaagaagac       540

    cgcctggccg cgactcgaag tcttcaatca caattcggcg cctacaagcg tgcaaacagg       600

    ctgtttgcag atgccgtcat taaacactac caagaaggcg atttcgtttg gacacatgat       660

    tatcacctca tggtcctgcc tagctatctc aaggagcacg acccacgaat gaaagtcgga       720

    tggttcctgc acactccatt tccttcatct gaaatatata gaacactgcc tctccgctca       780

    gaattgcttc agggtgtcct tggtgcagat ttggttggtt tccacacgta cgactatgcc       840

    aggcattttg ttagcgcctg tacaaggata ttgggtctgg aagggactcc cgagggagtg       900

    gaagatcaag ggaaaataac gcgtgttgcc gcgtttcctg tcgggataga ttctgaaagg       960

    tgcatccagg ctgttgaaac agatgcagtg aagaagcata tagaagaact cagtgccaga      1020

    tttgctggcc gtaaggtgat gttgggagtg gataggcttg atccaattaa gggcatacca      1080

    caaaagctac tcgcatttga gaagtttttg gaggaaaatc cacattggcg tgacaaggtg      1140

    attctggtcc agattgcggt tcccacaaga caagatgtgc tggaatatca aaagctcgca      1200

    agccaggtgc atgaaatcgt gggtcgcatc aacggtcgtt acggttctct tacgactgta      1260

    cccatccacc atctcgaccg ttcgatgaaa tttcctgagc tctgtgcttt gtacaccatt      1320

    actgatgtgt tgcttgtaac atccttacgg gatggtatga acctcgttag ctacgagttt      1380

    gtcgcctgtc aaaatgaaaa gaagggagct ctcgtattaa gtgagttcgc aggtgctgca      1440

    caatcactag gtgcaggctc aattttggta aacccatgga acattattga aaccgctaat      1500

    gctattggag aagcacttaa catgcccgag gaagaacgtg aagagcgtca tagacttaac      1560

    ttcatgcacg ttacacccca tagtgctcag gtctgggcgg agacattcac cagtgaattg      1620

    aatgactcaa tactggaggc ggagctgcgt actttgcata ttcctccaca actgccatca      1680

    gacaaagtgg ttactaagtt cgccgagtcg aagaatcggc taatgattct gggtttcaat      1740

    tctgcactaa ctgcaccagt ggaagctcca cgtggaagag ctcctgacca gattagagaa      1800

    atgaagattc gcctacatcc aaacttggaa gaagtgttca atgttctttg cagtgatcca      1860

    agaaccacta tagtcattct tagtgggagt gaacgtgctg ttttggatga ggcatttgga      1920

    gagtttgata tgtggttggc agcagagaat ggaatgtttc ttcgtcacac acaaggagag      1980

    tggatgacaa ccatgcctga gcacctaaac atggattggg tagagagtgt acagttggta      2040

    tttgattatt tctgtgagag aacgcctcgt tcgtttgtgg aagcccgtgg aacttcattg      2100

    gtgtggaatt acaagtatgc agatgtggaa tttgggagag tacaagcacg ggatatgcta      2160

    cagcatcttt ggacaggacc gatttccaat gcagctgtgg atgttgttca aggtgggagg      2220

    tctgtagaag ttcgccctgt tggagtctca aagggctctg caattgatcg gattcttggg      2280

    gagattgtac atagcaagca catggttact cctattgatt tcgttatgtg tattggtcat      2340

    ttcttgagca aggatgaaga tatatacaca ttctttgagc cagagctccc atttttagag      2400

    agcggaaatt caagtgcaaa ggttctagac aagagattag gttccaaggg atctggcaaa      2460

    ttaggtggat caaggctcaa atcttatcct ccaatgtctc ctgacagggt ggtgcgcaag      2520

    attgatgatg agcggctgat tgaagacgct ggtagatggg aaggctcgtc agtgcttgat      2580

    ctcaagggtg aaaattattt ctcttgtgct gtggggacta tgaagcgttc attagcacga      2640

    tactgtttga attcttctga cgaagtactt acattcttga gctcacttgc tgcggcttca      2700

    gaatcttttc ctcaaaagag gagcgattcc tttaagagga atggtggatg gcatagccca      2760

    actccaaggg ttgtcgctgt cgataattaa                                       2790

    <210> 2

    <211> 929

    <212> PRT

    <213> 来源于垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)的海藻糖-6-磷酸合成酶基因的氨基酸序列

    <400> 2

    Met Pro Thr Pro Tyr Ser Asn Thr Asn Ser Ser Ser Ala Pro Leu Val

    1               5                   10                  15

    Pro Leu Asn Leu Asn Leu Pro Pro Ser Leu Ala Ser Ser Arg Val Glu

                20                  25                  30

    Arg Leu Val Arg Glu Arg Gln Leu Arg Arg Asn Asp Asp Gln Pro Glu

            35                  40                  45

    Ser Val Gln Glu Ser His Glu Gln Val Gln Asp His Thr Gln Glu Gln

        50                  55                  60

    Pro Asp Ser Pro Leu Thr Pro Asp Arg Gln Gln Arg Leu Leu Val Val

    65                  70                  75                  80

    Ala Asn Arg Leu Pro Val Ser Ala Thr Arg Lys Gly Asp Asp Gln Trp

                    85                  90                  95

    Ser Leu Glu Val Ser Ala Gly Gly Leu Val Ser Ala Leu Leu Gly Val

                100                 105                 110

    Lys Gln Phe Gln Val Val Trp Ile Gly Arg Pro Gly Val Tyr Val Gln

            115                 120                 125

    Asp Glu Leu Gly Lys Gln Ser Leu Ala Lys Ala Leu Glu Glu Lys Gly

        130                 135                 140

    Phe Val Gly Val Leu Leu Asp Glu Glu Thr Val Asp Gln Tyr Tyr Asn

    145                 150                 155                 160

    Gly Tyr Cys Asn Asn Val Leu Trp Pro Leu Phe His Tyr Ile Gly Leu

                    165                 170                 175

    Arg Gln Glu Asp Arg Leu Ala Ala Thr Arg Ser Leu Gln Ser Gln Phe

                180                 185                 190

    Gly Ala Tyr Lys Arg Ala Asn Arg Leu Phe Ala Asp Ala Val Ile Lys

            195                 200                 205

    His Tyr Gln Glu Gly Asp Phe Val Trp Thr His Asp Tyr His Leu Met

        210                 215                 220

    Val Leu Pro Ser Tyr Leu Lys Glu His Asp Pro Arg Met Lys Val Gly

    225                 230                 235                 240

    Trp Phe Leu His Thr Pro Phe Pro Ser Ser Glu Ile Tyr Arg Thr Leu

                    245                 250                 255

    Pro Leu Arg Ser Glu Leu Leu Gln Gly Val Leu Gly Ala Asp Leu Val

                260                 265                 270

    Gly Phe His Thr Tyr Asp Tyr Ala Arg His Phe Val Ser Ala Cys Thr

            275                 280                 285

    Arg Ile Leu Gly Leu Glu Gly Thr Pro Glu Gly Val Glu Asp Gln Gly

        290                 295                 300

    Lys Ile Thr Arg Val Ala Ala Phe Pro Val Gly Ile Asp Ser Glu Arg

    305                 310                 315                 320

    Cys Ile Gln Ala Val Glu Thr Asp Ala Val Lys Lys His Ile Glu Glu

                    325                 330                 335

    Leu Ser Ala Arg Phe Ala Gly Arg Lys Val Met Leu Gly Val Asp Arg

                340                 345                 350

    Leu Asp Pro Ile Lys Gly Ile Pro Gln Lys Leu Leu Ala Phe Glu Lys

            355                 360                 365

    Phe Leu Glu Glu Asn Pro His Trp Arg Asp Lys Val Ile Leu Val Gln

        370                 375                 380

    Ile Ala Val Pro Thr Arg Gln Asp Val Leu Glu Tyr Gln Lys Leu Ala

    385                 390                 395                 400

    Ser Gln Val His Glu Ile Val Gly Arg Ile Asn Gly Arg Tyr Gly Ser

                    405                 410                 415

    Leu Thr Thr Val Pro Ile His His Leu Asp Arg Ser Met Lys Phe Pro

                420                 425                 430

    Glu Leu Cys Ala Leu Tyr Thr Ile Thr Asp Val Leu Leu Val Thr Ser

            435                 440                 445

    Leu Arg Asp Gly Met Asn Leu Val Ser Tyr Glu Phe Val Ala Cys Gln

        450                 455                 460

    Asn Glu Lys Lys Gly Ala Leu Val Leu Ser Glu Phe Ala Gly Ala Ala

    465                 470                 475                 480

    Gln Ser Leu Gly Ala Gly Ser Ile Leu Val Asn Pro Trp Asn Ile Ile

                    485                 490                 495

    Glu Thr Ala Asn Ala Ile Gly Glu Ala Leu Asn Met Pro Glu Glu Glu

                500                 505                 510

    Arg Glu Glu Arg His Arg Leu Asn Phe Met His Val Thr Pro His Ser

            515                 520                 525

    Ala Gln Val Trp Ala Glu Thr Phe Thr Ser Glu Leu Asn Asp Ser Ile

        530                 535                 540

    Leu Glu Ala Glu Leu Arg Thr Leu His Ile Pro Pro Gln Leu Pro Ser

    545                 550                 555                 560

    Asp Lys Val Val Thr Lys Phe Ala Glu Ser Lys Asn Arg Leu Met Ile

                    565                 570                 575

    Leu Gly Phe Asn Ser Ala Leu Thr Ala Pro Val Glu Ala Pro Arg Gly

                580                 585                 590

    Arg Ala Pro Asp Gln Ile Arg Glu Met Lys Ile Arg Leu His Pro Asn

            595                 600                 605

    Leu Glu Glu Val Phe Asn Val Leu Cys Ser Asp Pro Arg Thr Thr Ile

        610                 615                 620

    Val Ile Leu Ser Gly Ser Glu Arg Ala Val Leu Asp Glu Ala Phe Gly

    625                 630                 635                 640

    Glu Phe Asp Met Trp Leu Ala Ala Glu Asn Gly Met Phe Leu Arg His

                    645                 650                 655

    Thr Gln Gly Glu Trp Met Thr Thr Met Pro Glu His Leu Asn Met Asp

                660                 665                 670

    Trp Val Glu Ser Val Gln Leu Val Phe Asp Tyr Phe Cys Glu Arg Thr

            675                 680                 685

    Pro Arg Ser Phe Val Glu Ala Arg Gly Thr Ser Leu Val Trp Asn Tyr

        690                 695                 700

    Lys Tyr Ala Asp Val Glu Phe Gly Arg Val Gln Ala Arg Asp Met Leu

    705                 710                 715                 720

    Gln His Leu Trp Thr Gly Pro Ile Ser Asn Ala Ala Val Asp Val Val

                    725                 730                 735

    Gln Gly Gly Arg Ser Val Glu Val Arg Pro Val Gly Val Ser Lys Gly

                740                 745                 750

    Ser Ala Ile Asp Arg Ile Leu Gly Glu Ile Val His Ser Lys His Met

            755                 760                 765

    Val Thr Pro Ile Asp Phe Val Met Cys Ile Gly His Phe Leu Ser Lys

        770                 775                 780

    Asp Glu Asp Ile Tyr Thr Phe Phe Glu Pro Glu Leu Pro Phe Leu Glu

    785                 790                 795                 800

    Ser Gly Asn Ser Ser Ala Lys Val Leu Asp Lys Arg Leu Gly Ser Lys

                    805                 810                 815

    Gly Ser Gly Lys Leu Gly Gly Ser Arg Leu Lys Ser Tyr Pro Pro Met

                820                 825                 830

    Ser Pro Asp Arg Val Val Arg Lys Ile Asp Asp Glu Arg Leu Ile Glu

            835                 840                 845

    Asp Ala Gly Arg Trp Glu Gly Ser Ser Val Leu Asp Leu Lys Gly Glu

        850                 855                 860

    Asn Tyr Phe Ser Cys Ala Val Gly Thr Met Lys Arg Ser Leu Ala Arg

    865                 870                 875                 880

    Tyr Cys Leu Asn Ser Ser Asp Glu Val Leu Thr Phe Leu Ser Ser Leu

                    885                 890                 895

    Ala Ala Ala Ser Glu Ser Phe Pro Gln Lys Arg Ser Asp Ser Phe Lys

                900                 905                 910

    Arg Asn Gly Gly Trp His Ser Pro Thr Pro Arg Val Val Ala Val Asp

            915                 920                 925

    Asn

    <210> 3

    <211> 979

    <212> DNA

    <213> 来源于垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)的海藻糖-6-磷酸合成酶基因的中间片段核苷酸序列

    <400> 3

    ttggtcgtaa ggttatgttg ggagtggata ggcttgatcc aattaagggc ataccacaaa        60

    agctactcgc atttgagaaa tttttggagg aaaatccaca ttggcgtgac aaggtgattc       120

    ttgtccagat tgcggttccc acaagacaag atgtgctgga atatcaaaag ctcgcaagcc       180

    aggtgcatga gatcgtgggt cgcatcaacg gtcgttacgg ttctcttacg actgtaccca       240

    tccaccatct cgaccgttcg atgaaatttc ttgagctctg tgctttgtac gccattactg       300

    atgtgttgct tgtaacatcc ttacgggatg gtatgaacct cgttagttac gaatttgtcg       360

    cctgtcaaaa tgaaaagaag ggagctctcg tattaagtga gttcgcaggt gctgcacaat       420

    cactaggtgc aggctcaatt ctggtaaacc catggaacat tattgaaacc gctaatgcta       480

    ttggagaagc acttaacatg cccgaggaag aacgtgaaga acgtcataga cttaacttca       540

    tgcacgttac aactcatagt gctcaggtct gggcggagac attcaccagt gaattgaatg       600

    actcaatatt ggaggcggag ctgcgtactt tgcatattcc tccacaactg ccatcagaga       660

    aagcggttac taagtttgcc gagtcgaaga atcggctaat gattctgggt ttcaattctg       720

    cactaactgc accagtggaa gctccacgtg gaagagctcc tgaccagatt agagaaatga       780

    agattcgcct acatccaaac ttgaaagaag tgttcaatgt tctttgcagt gatccaagaa       840

    ccactatagt cattcttagt gggagtgaac gtgctgtatt ggatgaggca tttggagagt       900

    ttgatatgtg gttggcagca gagaatggaa tgttccttcg tcacacacaa ggagagtgga       960

    tgacaacaat gcccgaaca                                                    979

    <210> 4

    <211> 1255

    <212> DNA

    <213> 来源于垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)的海藻糖-6-磷酸合成酶基因的3′端核苷酸序列

    <400> 4

    tgccatcaga gaaagcggtt actaagttcg ccgagtcgaa gaatcggcta atgattctgg        60

    gtttcaattc tgcactaact gcaccagtgg aagctccacg tggaagagct cctgaccaga       120

    ttagagaaat gaagattcgc ctacatccaa acttggaaga agtgttcaat gttctttgca       180

    gtgatccaag aaccactata gtcattctta gtgggagtga acgtgctgtt ttggatgagg       240

    catttggaga gtttgatatg tggttggcag cagagaatgg aatgtttctt cgtcacacac       300

    aaggagagtg gatgacaacc atgcctgagc acctaaacat ggattgggta gagagtgtac       360

    agttggtatt tgattatttc tgtgagagaa cgcctcgttc gtttgtggaa gcccgtgaaa       420

    cttcattggt gtggaattac aagtatgcag atgtggaatt tgggagagta caagcacggg       480

    atatgctaca gcatctttgg acaggaccga tttccaatgc agctgtggat gttgttcaag       540

    gtgggaggtc tgtagaagtt cgccctgttg gagtctcaaa gggctctgca attgatcgga       600

    ttcttgggga gattgtacat agcaagcaca tggttactcc tattgatttc gttatgtgta       660

    ttggtcattt cttgagcaag gatgaagata tatacacatt ctttgagcca gagctcccat       720

    ttttagagag cggaaattca agtgcaaagg ttctagacaa gagattaggt tccaagggat       780

    ctggcaaatt aggtggatca aggctcaaat cttatcctcc aatgtctcct gacagggtgg       840

    tgcgcaagat tgatgatgag cggctgattg aagacgctgg tagatgggaa ggctcgtcag       900

    tgcttgatct caagggtgaa aattatttct cttgtgctgt ggggactatg aagcgttcat       960

    tagcacgata ctgtttgaat tcttctgacg aagtacttac atttttgagc tcacttgctg      1020

    cggcttcaga atcttttcct caaaagagga gcgattcctt taagaggaat ggtggatggc      1080

    atagcccaac tccaagggtt gtcgctgtcg ataattaaaa gaaaggaaag gcgtggtacg      1140

    cttgtggctg aacaccaaga agacaaaggt acacctaaat gtgtaatgtg tgcttattta      1200

    ttcttttatt cgaaaagaag tgtacattca gttgagctaa aaaaaaaaaa aaaaa           1255

    <210> 5

    <211> 1045

    <212> DNA

    <213> 来源于垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)的海藻糖-6-磷酸合成酶基因的5′端第一段核苷酸序列

    <400> 5

    atcggatggc ctggtgtcta tgtccaggac gagctcggca agcaatcgct tgccaaggcg        60

    cttgaggaaa agggatttgt gggtgtgttg ctagacgagg aaacagtgga tcaatattac       120

    aatggctact gcaacaatgt cttgtggcct ctctttcact acattggatt gcgtcaagaa       180

    gaccgcctgg ccgcgactcg aagtcttcaa tcacaattcg gcgcctacaa gcgtgcaaac       240

    aggctgtttg cagatgccgt cattaaacac taccaagaag gcgatttcgt ttggacacat       300

    gattatcacc tcatggtcct gcctagctat ctcaaggagc acgacccacg aatgaaagtc       360

    ggatggttcc tgcacactcc atttccttca tctgaaatat atagaacact gcctctccgc       420

    tcagaattgc ttcagggtgt ccttggtgca gatttggttg gtttccacac gtacgactat       480

    gccaggcatt ttgttagcgc ctgtacaagg atattgggtc tggaagggac tcccgaggga       540

    gtggaagatc aagggaaaat aacgcgtgtt gccgcgtttc ctgtcgggat agattctgaa       600

    aggtgcatcc aggctgttga aacagatgca gtgaagaagc atatagaaga actcagtgcc       660

    agatttgctg gccgtaaggt gatgttggga gtggataggc ttgatccaat taagggcata       720

    ccacaaaagc tactcgcatt tgagaagttt ttggaggaaa atccacattg gcgtgacaag       780

    gtgattctgg tccagattgc ggttcccaca agacaagatg tgctggaata tcaaaagctc       840

    gcaagccagg tgcatgaaat cgtgggtcgc atcaacggtc gttacggttc tcttacgact       900

    gtacccatcc accatctcga ccgttcgatg aaatttcctg agctctgtgc tttgtacgcc       960

    attactgatg tgttgcttgt aacatcctta cgggatggta tgaacctcgt tagctacgag      1020

    tttgtcgcct gtcaaaatga aaaga                                            1045

    <210> 6

    <211> 575

    <212> DNA

    <213> 来源于垫状卷柏(Selaginella pulvinata Maxim)的海藻糖-6-磷酸合成酶基因的5′端第二段核苷酸序列

    <400> 6

    agcagtggta tcaacgcaga gtacgcgggg atatatgagt tttattttag caaactataa        60

    aggtttgcct ctctccactt acctagtaag tggttggttt cccgtgtgtt cgtctgccgt       120

    cttcacatgc ctactccgta ttccaatacg aattcctcaa gcgctccctt agtgcctctc       180

    aatctcaatc tgccgccttc gttagcgtct tccagagtcg agcgccttgt ccgagagcgg       240

    caactgagga ggaatgacga ccagcctgaa tcggtgcaag aatcgcacga acaggtacaa       300

    gatcatacgc aggagcagcc ggattcatcc ttggcgccgg atcgtcagca gcggctgctc       360

    gttgtagcga atcggttgcc ggtttccgcc acgcgcaagg gcgacgatca atggagcttg       420

    gaagtgagcg ctggcggcct cgtctctgcg cttcttggtg tgaagcagtt ccaggtagta       480

    tggatcggct ggcccggtgt ctatgtccag gacgagctcg gcaagcaatc gcttgccaag       540

    gcgcttgagg aaaagggatt tgtgggtgtg ttgca                                  575

    关 键  词:
    一种 来源于 卷柏 海藻 磷酸 合成 基因 序列 及其 克隆 方法
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