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芸薹属核心SSR引物组合.pdf

  • 上传人:sha****007
  • 文档编号:9033921
  • 上传时间:2021-01-31
  • 格式:PDF
  • 页数:14
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  • 摘要
    申请专利号:

    CN201110050078.0

    申请日:

    20110302

    公开号:

    CN102154277A

    公开日:

    20110817

    当前法律状态:

    有效性:

    失效

    法律详情:

    IPC分类号:

    C12N15/11

    主分类号:

    C12N15/11

    申请人:

    西南大学

    发明人:

    付东辉,魏丽娟,李加纳,高才华

    地址:

    400716 重庆市北碚区天生路216号

    优先权:

    CN201110050078A

    专利代理机构:

    重庆华科专利事务所

    代理人:

    康海燕

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    内容摘要

    本发明公开了芸薹属核心SSR引物组合,属于分子遗传技术领域。该组合包括芸薹属A和C基因组19条染色体的核心SSR引物190对,每条染色体上均匀分布有10对多态性较高、退火温度基本一致、扩增带型清楚的SSR引物。运用该核心SSR引物组合在不增加工作成本的前提下,可将分子标记的效率提高到3-5倍,特别适合芸薹属种质资源的鉴定、遗传多样性分析、缺体等异常染色体单株的鉴定和种子纯度鉴定等方面。具有操作简单,稳定性和重复性好等优点。

    权利要求书

    1.芸薹属核心SSR引物组合,包含19条染色体即A1-A10和C1-C9核心SSR引物,其特征在于,包括以下引物:A1  CB10369      ENA15  CB10097     NIAB096     Ra2E04      BRAS026  Na12C06      CNU397    Ol10D03       CB10597A2  Ol10F04     Ol09A03     NIAB105SR6293     CB10416      Na12A07     CB10093    Ni2C12B  Na14H11C  BRAS083   A3  SR6688 BRMS071    NIAB120 CNU482   CNU409      BRMS176    Ol10B08      SN1919  Ol13D02A       Na12C07      A4  FITO066      SN13034      sNRD71       ENA3    Ol13D02A   CNU254      BRAS003    CB10196      CB10335       CB10493      A5 sNRD03      BRMS034   FITO130     BRAS063   NIAB082   SR9222ENA10  CB10080      SR9477       CB10487      A6 CB10330  CB10143   BRAS014  BRMS227    BRMS221    CB10065      BRMS226    BRMS261    CNU400 EJU5A7 Ra2G08  SR0282R     FITO066      NIAB082     BRMS298    NIAB030     Ol12E03       Ra2A05 CB10211       CB10278      A8  CNU090      BRMS342    BRMS246    BRMS176    BRMS185    EJU4     KBRH143D22    Ra2E12 EJU3       CB10193      A9  EJU2     CB10347      BRMS324    FITO100      Ol12F02       CB10255      Ol10D08      CB10103      BRAS055       MR013A      A10 Ol10A02    NIAB015    BRMS186   SN8502  SN8474  NIAB103     ENA18  BRMS019    CB10109       CB10124C1  CB10587      CB10369      CB10277      FITO094      NIAB091     CB10206      Na10H06     Ol10F11       Ni4B10 Na10H03C2 Ol11H09     CB10316     SR6293  CB10026      CB10530      FITO081      Ol09A06      Ol09A03      Ol12B03       Na12C03C3 Ra2E11  BN12A  CB10036      BRAS120    MR049  Na10C01      BRAS065    MR061B      MR049B       CB10003      C4 SN0464  SS2277  BRMS166    Na10F06      Ol12D02      SN11516      CB10288      CB10493      BRAS072       Ol11E03AC5  CB10124      sORH13       BRMS030    BRMS049    CB10623      Ra2F11  MR129  MR097  CB10229       CB10487      C6  CB10502      CB10234      CB10010      BRMS015    SR12387      CB10526      FITO146      CB10544       SS2486  CB10211      C7 SN0706  sNRH63      Ol10B01     Ra3C04  BRMS050    FITO088      BRMS040    CB10299      CB10534       CB10431C8 CB10139     FITO040     SN11670     SR5795Ol12G04      CB10106      FITO424      SN12352      CB10602       BRAS031    C9  BRAS002    FITO088      SR12384I     CB10288      BRAS050    Ol11H05      FITO016      sNRG42       Ra2F11  Ol11H06。

    说明书

    

    技术领域

    本发明涉及分子遗传技术领域,特别是涉及一种芸薹属核心SSR引物组合。

    背景技术

    分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接反映。DNA由于信息含量大,在同种内具有高度的遗传稳定性,且不受外界环境因素和生物个体发育阶段及器官组织差异的影响。分子标记技术是继形态学标记、生化免疫遗传标记和细胞遗传学标记后的一种新的标记技术,实现了从表型选择到基因型选择的飞跃。随着分子生物学技术的发展,DNA分子标记技术已在玉米、大豆、鸡、猪等动植物育种和生产中有许多应用研究,广泛应用于遗传图谱构建、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆和分子标记辅助选择等方面。自20世纪80年代以来,出现了多种分子标记方法,如RAPD、RFLP、AFLP、简单序列重复(SSR)和SNP等。

    目前由于RAPD重现性较差;AFLP操作较复杂、稳定性较差,除QTL初步定位后在目标区域加密标记有独特的优势外,其它方面的应用逐步淡化出各种研究;RFLP操作过程繁琐,效率低,成本高,除在鉴定转基因是否成功外,在其它方面的研究地位越来越低。然而SSR广泛分布在真核生物整个基因组上,具有多态性高、稳定性强、操作简便、DNA用量少、表现为共显性孟德尔遗传等优点,已经广泛用于各项标记技术中,并且已成为最有应用价值和应用最广泛的分子标记技术。

    芸薹属(Brassica )属于十字花科,是一类具有极高经济价值的作物,其包含有许多重要的蔬菜、油料、饲料作物和调味品,如甘蓝类( B. oleracea) 的结球甘蓝、花椰菜、青花菜、芥蓝和苤蓝;白菜类( B. campestris) 的大白菜、白菜、乌塌菜、菜薹等,它们都在中国有广泛的栽培。自Song等人(1988)开辟了芸薹属植物分子标记研究的新领域以来,经过近20年多的研究,分子标记技术在芸薹属作物中得到了广泛的应用。尽管目前已经开发了数千多个芸薹属作物SSR引物, 然而不是所有的SSR引物都具有同等的应用价值,包括扩增效果、多态性信息含量、多态性水平高低、是否为共显性遗传、多位点拷贝数和是否被定位在遗传图谱上等。当我们利用SSR引物做标记时,通常做法是将目前所有已知的SSR进行筛选,然后从中选择自己所需要的引物,结果会对标记整体效果把握不准,造成较大的浪费,费时费力。

    发明内容

    本发明的目的在于提供一种芸薹属核心SSR引物组合,特别适合芸薹属作物种质资源鉴定、遗传多样性分析、品种纯度检测和缺体等异常染色体组成的鉴定等研究工作。

    本发明的芸薹属19条染色体(A1-A10和C1-C9)核心SSR引物组合,包括以下引物:

    A1  CB10369      ENA15  CB10097     NIAB096     Ra2E04      BRAS026  Na12C06      CNU397    Ol10D03       CB10597

    A2  Ol10F04     Ol09A03     NIAB105SR6293     CB10416      Na12A07

    CB10093    Ni2C12B  Na14H11C  BRAS083

    A3  SR6688 BRMS071    NIAB120 CNU482   CNU409      BRMS176    Ol10B08

    SN1919  Ol13D02A       Na12C07

    A4  FITO066      SN13034      sNRD71       ENA3    Ol13D02A   CNU254

    BRAS003    CB10196      CB10335       CB10493

    A5 sNRD03      BRMS034   FITO130     BRAS063   NIAB082   SR9222ENA10

    CB10080      SR9477       CB10487

    A6 CB10330  CB10143   BRAS014  BRMS227    BRMS221    CB10065

    BRMS226    BRMS261    CNU400 EJU5

    A7 Ra2G08  SR0282R     FITO066      NIAB082     BRMS298    NIAB030

    Ol12E03       Ra2A05 CB10211       CB10278

    A8  CNU090      BRMS342    BRMS246    BRMS176    BRMS185    EJU4

    KBRH143D22    Ra2E12 EJU3       CB10193

    A9  EJU2     CB10347      BRMS324    FITO100      Ol12F02       CB10255

    Ol10D08      CB10103      BRAS055       MR013A

    A10 Ol10A02    NIAB015    BRMS186   SN8502  SN8474  NIAB103     ENA18

    BRMS019    CB10109       CB10124

    C1  CB10587      CB10369      CB10277      FITO094      NIAB091     CB10206

    Na10H06     Ol10F11       Ni4B10 Na10H03

    C2 Ol11H09     CB10316     SR6293  CB10026      CB10530      FITO081

    Ol09A06      Ol09A03      Ol12B03       Na12C03

    C3 Ra2E11  BN12A  CB10036      BRAS120    MR049  Na10C01      BRAS065

    MR061B      MR049B       CB10003

    C4 SN0464  SS2277  BRMS166    Na10F06      Ol12D02      SN11516      CB10288

    CB10493      BRAS072       Ol11E03A

    C5  CB10124      sORH13       BRMS030    BRMS049    CB10623      Ra2F11  MR129

    MR097  CB10229       CB10487

    C6  CB10502      CB10234      CB10010      BRMS015    SR12387      CB10526

    FITO146      CB10544       SS2486  CB10211

    C7 SN0706  sNRH63      Ol10B01     Ra3C04  BRMS050    FITO088      BRMS040

    CB10299      CB10534       CB10431

    C8 CB10139     FITO040     SN11670     SR5795Ol12G04      CB10106

    FITO424      SN12352      CB10602       BRAS031

    C9  BRAS002    FITO088      SR12384I     CB10288      BRAS050    Ol11H05      FITO016      sNRG42       Ra2F11  Ol11H06

    本发明的芸薹属核心SSR引物组合,通过以下技术方案筛选得到:

    1) 从NCBI数据库中下载芸薹属所有的连锁图谱,根据A和C基因组连锁群的类别,对图谱上的标记进行分类,共19小类;

    2 ) SSR核心引物的挑选:选择在3个以上遗传图谱上都存在的、引物之间退火温度变化范围在5℃以内、在连锁群上等距离分布的引物组合,筛选出一套核心SSR引物,平均每条连锁群分布10对;

    3) 多重PCR体系建立和反应引物的优化:按染色体顺序,将每条连锁群上所有选中的SSR引物放在一个PCR反应管中进行PCR扩增,根据每个多重PCR体系扩增带型的清晰程度、片段大小的适宜范围(150-600bp)和多态性标记的数目进行调节,即增加部分扩增效果较好的引物和去掉部分扩增效果较差的引物;

    4)多重PCR产物的检测:利用6%的PAGE胶进行分离,选择带型清楚、多态性的带分布均匀、片段大小在150-600bp、多态性的位点在5-10个的引物组合,最终确定每条连锁群上引物的类型。

    本发明具有如下的优点:

    (1)本发明共挑选出190对核心SSR引物,均匀分布在芸薹属A和C基因组的每条连锁群上。筛选出的SSR引物可以直接使用,改变了通常在使用SSR引物时需要进行大量筛选引物的过程,大大提高了做标记的效率和显著提高SSR引物利用率。

    (2)芸薹属A和C基因组多重PCR体系的成功建立,在成本没有增加的前体下,每个多重PCR体系扩增出的多态性位点可以达到5-10个,是普通PCR效率的3-5倍,可以大幅度降低成本和加快分子标记工作。

    (3)芸薹属A和C基因组多重PCR体系是建立在PCR直接扩增的基础上,继承了普通SSR的一切优点,即不需要酶切,稳定性和重复性好,检测和操作简单等,较普通SSR标记大幅度提高了效率。

    附图说明

    图1为A6连锁群上多重PCR电泳图。20份材料从左到右分别为:浠水油菜白、德清金菜籽、五峰红杆子、榕江苏州油菜、青麻叶、羽衣甘蓝、结球甘蓝、球茎甘蓝、抱子甘蓝、皱叶甘蓝、华双2号、泸油15号、湘油13号、扬油16号、中双4号、中油821、矮架早、宁油10号、花油6号、陇油2号,均为现有油菜品种。

    具体实施方式

    芸薹属各染色体核心引物挑选和多重PCR体系建立

    1.   从NCBI网站下载芸薹属作物36个连锁图谱,整理各图谱各连锁群上的SSR引物及标记信息,包括引物的序列、位于染色体的位置和连锁图谱名称;

    2.  核心SSR引物挑选:挑选在3个以上遗传图谱上都存在的、引物之间退火温度变化范围在5℃以内、在连锁群上等距离分布的引物进行组合,每条连锁群上选取10对核心SSR引物;

    3. 多重PCR体系和程序优化:多重PCR体系为: Buffer (10×) 2.5ul, primer (10umol/L) 2ul, dNTPs (10mM)  0.5uL, Taq DNA polymerase (5U/ul) 0.25ul, DNA template (50-100ng/ul)  2.0 uL,,共25ul反应体积。多重PCR程序为:94℃预变性5min;94℃变性45 s,53℃ 退火45 s,72℃ 延伸1 min,35个循环;72℃延伸30 min,16℃保存10min;

    4.凝胶电泳检测:将PCR产物在6%的变性丙烯酰胺凝胶中进行电泳检测,按照分子克隆实验指南第三版(J.萨姆布鲁克)(2005)的方法进行硝酸银方法进行银染:配胶→灌胶→凝固→取梳子→电泳→固定→第一此水洗→硝酸银染色→第二次水洗→显影→终止反应;

    5.选择带型清楚、多态性的带分布均匀、片段大小在150-600bp、多态性的位点在5-10个的引物组合,最终确定了如前所述的芸薹属A和C基因组核心SSR引物组合。

    6 将建立的多重PCR体系在白菜、甘蓝、甘蓝型油菜、人工合成甘蓝型油菜中进行验证,结果表明,19条染色体的多重PCR体系效果极佳,扩增的片段平均在120-600之间,带型清晰和多态性丰富,多态性信息含量一般在0.55以上。

    附表 190对核心SSR引物信息表

    LinkagegroupPrimerMappositionForwardprimerReverseprimerA1CB103690CATTCACAGGACCAGAGCCAAAGCCAAGACAACCATA1ENA159TAAACGGGAACTACCTCTATGCTCTGCTCTTTCTTCTGACTGA1CB1009721.69ACTTCGGTGGTTCTATTTCTCGACGGTTAATCAAGTTTCTA1NIAB09636.89CAAAAAGAGCGTTACCTCCAGATGAAGCTCTGAAGACCGAA1Ra2E0453.18ACACACAACAAACAGCTCGCAACATCAAACCTCTCGACGGA1BRAS02673.3ATTACAAAAATGCCCTGACTAAGTGATCTTCTCTCCAACAA1Na12C0695.2AACGGATGAAGAACACATTGCTAGGGCCTGTTATTCGATGGA1CNU397106.58TCTTCAAGTCAAAATACTCACATTCAAAACGACAAATACATATGACAGTTTTAA1Ol10D03145GCCAAAGACCTCAAAGATGGAAGCCACGTGAAGAAAGTCCA1CB10597154AAGCGCGCATAACTACACAACACTGCTCCTTTCCCTA2Ol10F040AATTGGCTTGGTAGCTGTCGATAGGAATGGGATGCACAGGA2Ol09A0319.3CTGGTTTTCTCCTTCATCAGCTGTGTAGCTTTTAGTCTTTA2NIAB10540.18GACGAAGGAGCGTATGAAAAAATGCAATCTCAACAAAGGTA2SR629363CCAAACGCTTTTCTTTCTGCCCAATGACGCTCCAAGATTTA2CB1041676.6GCTGTTGCTGTAGGTTTGAGAGCCAGCGTTGATAAGAA2Na12A07112.6TCAAAGCCATAAAGCAGGTGCATCTTCAACACGCATACCGA2CB10093129GACTTGGGAGAGATTAAACAGGCGATGGTGATTTCCTAGAA2Ni2C12B151ACATTCTTGGATCTTGATTCGAAAGGTCAAGTCCTTCCTTCGA2Na14H11C175GGATGTTTTCACAGACCCTGCTTTGCAGGTATGAACACGCA2BRAS083186GATGTTGTTGGGGAGAATGAAAAAGTAGGCAAGTTCAAGCA3SR66880TCGGATTGAACTCATGTTCGTGGAAACTCGGAAATCAAGGA3BRMS07122.84CAAAGCGAGAAAGTGCAGTTGAGAGTCCACGAAACTACTGCAGATTGAAAA3NIAB12044.98AAGAAAACTTATTTGATGGTACGCTAAATCCAAACCAGAATTGAA3CNU48259.21TCAGAGATCCTTGACAAAACCAAGATGAAGCCAAAGCCACAAA3CNU40982.17TTCCGGTCACTTCTAGCTTCATTTTGGTGGTTAGTATGTCGCTATA3BRMS17698.31ATGTCTACAGATGTGGAACCTATGGAGGAAGACTGATTAACTCGTTTTGAA3Ol10B08121AAGCTGTTCGATGAAATGCCACTTGTTTGCATCCATTGCCA3SN1919137.1CTCCGGTCATCTTTCTGCATAAAAATCCTGATCACAGCCGA3Ol13D02A152.5TTCTCCACACCAAGCAACACTACAGGCTTGGTCGTTTTCCA3Na12C07184ACTCAACCCCACAAACCTGAGTTCCCCGGATCCGATTAGA4FITO0660AGCCCATTTACCTGCTGAGAAAGACGATGCTTAGGGTA4SN1303418.41AGCATGTGCAGAGTGCAGACAAAGGAAGGCCGATGAGATTA4sNRD7137.3AAGACATGCACAGCAACAGCCCTCATCCACAACGTCATCTT

    A4ENA353ATCCCTTCTCACAGGTTTACTGTCAAGTTTCTCTCCACACCA4Ol13D02A71.6TTCTCCACACCAAGCAACACTACAGGCTTGGTCGTTTTCCA4CNU25489.92AAGCTTGAGCTTCCAGCCTTCATCAGTGCCGGCCTTGAATAA4BRAS003116TCTCATTCGATCATCACTCATGAACTATCGTCCACAATCTGAA4CB10196129TTGTAGGCAATGATGAGGAGAGAGAAGGGCTCCTTTGA4CB10335151AGACAAGTTGAAGATAGGCTCGATCGGAGACGGAGAGTTA4CB10493170TGACGTGTGAGCAACAGACTGAGTCACAAGCCGAGTA5sNRD030GAAGATTCGAGCTCTTTCGGCGTTTCAGAATCATATTGTATTTTGCTA5BRMS03412.08GATCAAATAACGAACGGAGAGAGAGCCAAGAAAGGACCTAAGATA5FITO13025GTTTGCTATGGGCTTCAGTATTTCATTCGGTTTATTTCGGA5BRAS06338.2GACGCTCATTTCACTTCTCCTAACTAACATCATTTTGCA5NIAB08245.12CATTTCCCCGTGACTATCTGCGTCTTCATCTCAATCTCGCA5SR922260.97CACCGAACAAAACTGAGGGTCGTTTCACTGCGTTCTACCAA5ENA1071.6ATCGTCTCCTCTCATCTCAAATTACATCCTCCACCTTCTTCA5CB1008086.8GCCCTCAACCTGTAAAGTTTGTTGGTGTGTGAATCATAA5SR947795.18CAGCTGGTTATCCTCGGTTTCCTCAGGTGGACAGAGAAGCA5CB10487115.64ATCCGAGGTTAGGTTTGGTCCTTGCTCACCCTTGTAA6CB103300AGGCGAGTTTACGAGGATACCTGCACCAGTCATTTGA6CB1014326.6CATGGGAGGCTGTCTAAATTGCACCCATACGTTTTCA6BRAS01431.3CCCATTGACAACTCTTCTCTTCTGTGTTCGCCCATTATGA6BRMS22746.1ACCATCTCGCTATTTATTTATGAAGGACGATTTGATAGAGGAAAGGAATA6BRMS22160.33AAAGTCCTTGACGTTTGAGGAAGAACAGGTTCTTATGAAGGACCATGCATA6CB1006567.03CGGCAATAATGGACCACTGGCGGCTTTCACGCAGACTTCGA6BRMS22696TAAATATGGTGCAAAAGATGACACACAACCACTCATCTTGTTCCATTATCA6BRMS261105.8CACCTGTCATGTCTTCTTCTGGTTGTCTTTGTTTTCTTCTCATTCGA6CNU400115.03CGAGTTTTTGTGTGTACGTATAGTAATCCAAAGTGCGTAAAGGAAGGA6EJU5133.9GGCACGTACATGGAGGATTCTGTTGGTCGAGCTGTTTCAGA7Ra2G080ATGTCCGGATAACCGAATCCGAAGCTTTTCAATTTTTAAGTTCTCTCA7SR0282R19.8AGGAAGCCCAACAGGACTTTAATTCGATTCTCCATCGTGCA7FITO06634AGCCCATTTACCTGCTGAGAAAGACGATGCTTAGGGTA7NIAB08245.1CATTTCCCCGTGACTATCTGCGTCTTCATCTCAATCTCGCA7BRMS29852.84CCACTGTTTTATGACTCCAGTGCTTTGACCTGGTGAAGTAGTTGTCTCGTA7NIAB03067.34GATCATAAGCCGAAAAAGGTTGTGCTCTCCTCAAGTGAATCAAAA7Ol12E0379.1CTTGAAGAGCTTCCGACACCGACGGCTAACAGTGGTGGAC

    A7Ra2A0592.9GCTAGTTTACGCGGCGGAAACGACATCGGCAAAGAAGA7CB10211111.76CAGCAGAGATCGATGGAGATAGAAGGCTGCCCCTCA7CB10278139.8TGAAGAAGCTGGGACAAGCAATGCAATACAGCACCAA8CNU0900GCAAAGATCGGCGAAGAAGATGCAGACACATTCGAACAAACAA8BRMS34214.13CAACCAAAACGGGCCAATATAGTTATGTTTTCAAATAATCTCCCGTCTAAA8BRMS24626.21ACATGTGCTTTATGAGAGAGAGAGATCTTTGTCACATTAATCCTTCCACTA8BRMS17639.36ATGTCTACAGATGTGGAACCTATGGAGGAAGACTGATTAACTCGTTTTGAA8BRMS18558.58ATCAAACCAGCAGTTCTATACCAATTCTCTTTCTGACCCGAAGAAGACA8EJU463.9CACCTTATCATCTCTCTATCCCCCTCTGTTTCTCTCCTTGTGA8KBRH143D2275GATGTGATACTTTGGCGACGGTGAAGGATAATATGGTCTTGGCCA8Ra2E1286TGTCAGTGTGTCCACTTCGCAAGAGAAACCCAATAAAGTAGAACCA8EJU391.3CCTCTTTTAATTCAAACAAGAAATCATTCGGACAATGGCAGTGATAA8CB10193134.7ATGCCACTTGAACCATTCCCTGAAGCGCATTTGTTAA9EJU20TTCACATCTTCTTCATCTTCCTTGCTATTCGTTCTCAGTCTCA9CB1034719.9ATCTGAACACTTTCGGCAGGAAGCACCATGTCAGCA9BRMS32440.95AACTTAACCGAAACCGAGATAGGTGAATCTCGAAATTCATCGACTTCCTCA9FITO10062GATGAGAGAAGGAAACCCTAAACAGCAGGAGAAGAGAGAGAAA9Ol12F0284GGCCCATTGATATGGAGATGCATTTCTCAATGATGAATAGTA9CB10255100CTGCGCTGCATCTTAGTCTGAAGAGCAATGCAATCTTA9Ol10D08118TCCGAACACTCTAAGTTAGCTCCGAGCTGTATGTCTCCCGTGCA9CB10103160GACGGATGCCTAATAATGATTCCTCAAAACTGCCTGTAAGA9BRAS055170GCACTCTCCTTGGTCTCTTCTTCTCTCATCCACTTCTAA9MR013A182CGCTACTTCCGCTGATACTTTTCAGAATCGCGACTGTAGTCTA10Ol10A020.8ATGAAAACCAATCCAGTGCCGATAGCAGATGGAAGAGCCGA10NIAB01511.66GCTGGTTCCAGCTAATGGTTACTGAATTTATGAGATTCGGATTGGA10BRMS18620ACAAGACACATGGAACTCTTATGCATATTACCAATGACCCCACTATTCAA10SN850228.47CTTACCGATGGATCACCCACTCCGCAAGAAATCAACAACAA10SN847444.86CTCCTGGGGAGGATCCTAAGGAAGGGAAAGGTGCAATCAAA10NIAB10350.5GCCGTTCTGACCAATAAAAATTCAATGATACGGTGACGTGA10ENA1865.7TTAAAATGAAACCCACCCGATGTTGGGCAACATCCATTTAA10BRMS01972.85CCCAAACGCTTTTGACACATGGCACAATCCACTCAGCTTTA10CB10109101.5GTGTAGCCAGCTTGATCCTCTTCTTCTGATGCAGCAGTGA10CB10124109TATGGGAAGGTTTGTGGTTGCCACTCCTCGATTACTCTCACTC1CB105870TTGTGTTTTGCCTTCTGATTTGCGCACAAACAATAA

    C1CB1036916.4CATTCACAGGACCAGAGCCAAAGCCAAGACAACCATC1CB1027727.75ACAAATGCTTGAGTGATATCTTCGTAAACTTGTTCTTGAC1FITO09440TTTATTTCTTTGGACTTGGGCTACCGCATCATACATTCATTC1NIAB09155TGGTTCTGCTATTGCTGTCAGAAGTTTGTGAGCCAGGAAAC1CB1020662.5TACAACGCAAACGTTCCTTTGATGTTCTTGGTGCCTC1Na10H0673.3AGAATGAGACCCAGAAACCGGCCACACTCTCTCTTACTAGGGCC1Ol10F11100.7TTTGGAACGTCCGTAGAAGGCAGCTGACTTCGAAAGGTCCC1Ni4B10115.6GTCCTTGAGAAACTCCACCGCCGATCCCATTTCTAATCCCC1Na10H03128.9GAGCTGGCTCATTCAACTCCCACAATTTCTCAGACAAAACGGC2Ol11H090CCCTTTTCCCCTTCTATTGGGTGCGACTTGGAATTTCTCCC2CB103168.6TGGTGTATATGGGATCGGGTTTGCAGACCATTCTCGC2SR629331.78CCAAACGCTTTTCTTTCTGCCCAATGACGCTCCAAGATTTC2CB1002644TCGTTCTGACCTGTCGTTATGGAAATGGCTGCTCATGTTC2CB1053054.64TCCTCGTCCTTTATTCCTTTTATGGTGATGGGGTGAC2FITO08167AACTAACTCGGGAAACAACCGAATGTCCGTCAGAATACCC2Ol09A0670TGTGTGAAAGCTTGAAACAGTAGGATTTTTTTGTTCACCGC2Ol09A0381.1CTGGTTTTCTCCTTCATCAGCTGTGTAGCTTTTAGTCTTTC2Ol12B0395.49CGACGAGGACAGAAGACAAGAGAGAGCCATGAGAAGCACCC2Na12C03124.35ATCGTTGCCATTAGGAGTGGACCAAATTAACCCTCTTTGCC3Ra2E110GGAGCCAGGAGAGAAGAAGGCCCAAAACTTCCAAGAAAAGCC3BN12A28.53GCCGTTCTAGGGTTTGTGGGAGAGGAAGTGAGAGCGGGAAATCAC3CB1003655.8ATTCATCTCCTGCTCGCTTAGAAACCCAAACCAAAGTAAGAAC3BRAS12089.2AAAAATAAATACAGCGAACCACCTTTAGCAGCTAATCATCC3MR049117.46AATGGGAAGCTCGTCGAAAATTATGCCAACATCCTACGGC3Na10C01137.1TTTTGTCCCACTGGGTTTTCGGAAACTAGGGTTTTCCCTTCC3BRAS065177AGCAATCCCGCCTAAATGGTAGATGCGAGGTCACTGTTGTCCC3MR061B221GAACTCACGGAAGCTACGAGAAGCATACCAAGAGACGCAAAGC3MR049B258AATGGGAAGCTCGTCGAAAATTATGCCAACATCCTACGGC3CB10003276ACGGTGCCGAATCTCAACGAAATGGGTCACAGCCGAGAAC4SN04640CCAAAGCAGGACAATCTCATCCCGGCTCTTGTTTTATGGTTC4SS227711.18GATCTGCGGTAGGAATCGAACGTGCTACATAATAGGGAAAAACCC4BRMS16625.38AAGTCACTACTTCCATTGAGGAACCGATGATTGGTGGTTTGGGTTTC4Na10F0633.86CTCTTCGGTTCGATCCTCGTTTTTAACAGGAACGGTGGCC4Ol12D0243.76CAATCCTGTTCATCATCGCCCAGTCATATGAAGCAGCTCAGG

    C4SN1151656GCGATCTCCTCAGGCATAGTCCACGCAAGCTGAAACATAAC4CB1028894.3GCAATGCATATCGACCTTAACCGCGCTATCAAGAATC4CB10493126.44TGACGTGTGAGCAACAGACTGAGTCACAAGCCGAGTC4BRAS072134.5GCCATCTACACATTTATCCCCACTAACCTTCTTGCTACCGTC4Ol11E03A143GCTCTCCCAGTGAGAATCACGAAAACCAATCCAGTGCCTGC5CB101244.96TATGGGAAGGTTTGTGGTTGCCACTCCTCGATTACTCTCACTC5sORH1321.2CCTGATGTTTTGGTTGTGTCATCACTGTGTTTACTTGCGCCC5BRMS03039TCAGCCTACCAACGAGTCATAAAAGGTCTCATACGATGGGAGTGC5BRMS04949GATCTTCTCTCCAAAACTCTCTAAAGTCCAAGCTAAATTACAAAC5CB1062362.6GAGATCGAAGGTCTCGGTGAGTCGAAACAGTGGTGGC5Ra2F1173.2TGAAACTAGGGTTTCCAGCCCTTCACCATGGTTTTGTCCCC5MR12984.9CGGGTTGTCAATGAATAAGTAAACACCCCCGATACACTAAC5MR09794.7TCCGATCTATTATCCGCAAACATCAACGGAGCAAAGATGATTC5CB10229130TTTGGTCTGAATCTGATACTCCGATTCAACACCTTCAAC5CB10487145ATCCGAGGTTAGGTTTGGTCCTTGCTCACCCTTGTAC6CB105020TTGAAGAGTGGGGATTCAGGTGAGCTTCTTCCTTCCC6CB102348.14TCTGTTGTTTCTCTCGCCCTGATGGACTAGGACCCCC6CB1001020.39TTATCTTTGAATGAGCATCTACCCTGTTCCTTCTACTATC6BRMS01532.54TCGCCAATAGAACCCAAAACTTCATCTCCATTGCTGCATCTGCTC6SR1238740.52GGGTCTGGGTTTTTCTGTGAGATTGGGCCGTGTAATATCGC6CB1052646.1TTCTTCTTTCCACCACCAACTCGGCGGTTAGAGAATC6FITO14667ATTACTGAACGGACGAAAGGAGCAGATGGAAGTTGTTAGC6CB1054474.3TGAGAAGGCTTCGTTGAGTCAAATTCTCGCGTTTGTC6SS248686.65AAATGGGAACGAGGGAAAGTGCCTTTGGGTCATCTGGAATC6CB10211113.6CAGCAGAGATCGATGGAGATAGAAGGCTGCCCCTCC7SN07060TCCGACGGTCAAGATTAAGGGGCTGTGGTGGATCTAGGAAC7sNRH638.15GAATCAGTCACCAGGGGAGACCATCGCGGTAATTAAACCTC7Ol10B0120.5CCTCTTCAGTCGAGGTCTGGAATTTGGAAACAGAGTCGCCC7Ra3C0426.4CTAACCTCAGACGGAGACGGCTTTAAACTCCGACCAACCGC7BRMS05042AACTTTGCTTCCACTGATTTTTTTGCTTAACGCTAAATCCATATC7FITO08861CCATCACTCATCTCACTCTTTATAAATCTCGTTGTCGGAAGTC7BRMS04077TCGGATTTGCATGTTCCTGACTCCGATACACAACCAGCCAACTCC7CB1029984.1TACAGGTTCCTTGCGATGATGGACGAGACAACATGGC7CB1053490.8AGCTGCAACCACAACTCTGGAGCGCAAGAAAAG

    C7CB10431115GGGTTTACTGGGTTCGTTGCAGAAGGGGAAACACTTC8CB101390TCTCAAAAGGATATGCGTGAACAAAACTCATCAGGGTTGTAGC8FITO0409GATTGTTTGTTTCTAACTGTGGTAGGATGTGACTTGGTCTTTCC8SN1167036.24AGTCGGGCTCGTATATCTCGGTTTCGTGGCGGAAATTAGAC8SR579557.37TCAGTCACAAAAAGTCAACTCAAAACGGAGTAGGAGTTGGGAGGC8Ol12G0473.13CGAACATCTTAGGCCGAATCGGTTAACCTGCGGGATATTGC8CB1010685.2GTTGGGAGAAGGTTTGGAGTCTCGGCATTTATGTGTGTTTC8FITO42489AAACTGAGAATCAAGGGTTATGTCAAGAACAAATCAACGAC8SN1235297TCATTGAATTGATTTCCTCACGCAACTGTCAATGGCGAGAGAC8CB10602161.7CGTCTTCGTCGGAAGATAGATGAGGATGTTGACCGAC8BRAS031170.7TAGGTCCAAGCCGAATGCTAATGCGGGAGAAATACAATC9BRAS0020CACTCACAGCCCTCTTCTTCTCCTCCAGCTTCCTTTACCAC9FITO08813CCATCACTCATCTCACTCTTTATAAATCTCGTTGTCGGAAGTC9SR12384I22.47GTCTCGCCGTGGAATGTTATGGTTTCAGCTTTCTCAAAATCAC9CB1028835.42GCAATGCATATCGACCTTAACCGCGCTATCAAGAATC9BRAS05046.2CTTTGTGGTGGGTAGTGGACTTAGCCTCAATACGGTCTTC9Ol11H0546.7GACGGATTCCTTGTAAGTGGGGTGTTTTTAGGGCGAGCTCC9FITO01660GCATCACCATGACGATTCTCCAAAAATGATGGAGGATACAAAAAC9sNRG4268.92TCGTGGGGATTAGTCTGAGCATCCCGAGTGACAAAAATTGC9Ra2F1178.9TGAAACTAGGGTTTCCAGCCCTTCACCATGGTTTTGTCCCC9Ol11H0690.5TCCGAACACTCTAAGTTAGCTCCTTCTTCACTTCACAGGCACG

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