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1、(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201610583466.8 (22)申请日 2016.07.22 (71)申请人 郑州大学 地址 450001 河南省郑州市高新区科学大 道100号 (72)发明人 张恩秦上尚徐帅民王铭铭 崔得运伯远莉周萌萌化永刚 王平王上王亚娜白鹏燕 刘宏民 (74)专利代理机构 郑州联科专利事务所(普通 合伙) 41104 代理人 时立新 (51)Int.Cl. C07D 295/21(2006.01) C07D 255/02(2006.01) C07D 257/02(2006.01) A。
2、61P 31/04(2006.01) (54)发明名称 金属-内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲 酸盐衍生物及其制备方法 (57)摘要 本发明属于药物化学领域, 公开了金属- 内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物 及其制备方法。 该化合物具有通式1, 2或3所示结 构:通式1通式2 通式3。 R为钠、 甲基、 正己烷基、 正 癸烷基或正十二烷基。 该抑制剂与碳青霉烯类抗 生素 (如美罗培南) 联用能发挥金属-内酰胺酶 的抑制活性, 从而使碳青霉烯耐药的菌株恢复对 碳青霉烯类抗生素的敏感性, 对产NDM-1酶的碳 青霉烯耐药株作用显著, 且红细胞溶血试验和细 胞毒实验证实该类化合物毒性较低, 该。
3、系列化合 物有望作为潜在金属-内酰胺酶抑制剂的候选 药物。 权利要求书3页 说明书11页 附图2页 CN 106220588 A 2016.12.14 CN 106220588 A 1.金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物, 其特征在于, 该衍生物为六 元环状胺基二硫代甲酸盐, 结构式如下: R为钠、 甲基、 正己烷基或正癸烷基。 2.如权利要求1所述的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物, 其特征 在于, 具体选如下化合物: (1) 1a: R = 钠 (2) 1b: R = 甲基 (3) 1c: R = 正己烷基 (4) 1d: R = 正癸烷基。 3.金属 -内酰。
4、胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物, 其特征在于, 该衍生物为九 元环状胺基二硫代甲酸盐, 结构式如下: R为钠、 甲基、 正己烷基或正十二烷基。 4.如权利要求3所述的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物, 其特征 在于, 具体选如下化合物: (1) 2a: R= 钠 (2) 2b: R= 甲基 (3) 2c: R= 正己烷基 (4) 2d: R= 正十二烷基 。 5.金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物, 其特征在于, 该衍生物为十 二元环状胺基二硫代甲酸盐, 结构式如下: R为钠、 甲基、 正己烷基、 正癸烷基。 权利要求书 1/3 页 2 CN 1062205。
5、88 A 2 6.如权利要求5所述的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物, 其特征 在于, 具体选如下化合物: (1) 3a: R= 钠 (2) 3b: R = 甲基 (3) 3c: R= 正己烷基 (4) 3d: R= 正癸烷基 。 7.制备如权利要求2、 4或6所述的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生 物的方法, 其特征在于, 通过如下方法实现: (a) 室温下, 以醇为溶剂, 哌嗪与二硫化碳在无机碱条件下反应得到化合物1a; 溶剂为 甲醇, 乙醇, 异丙醇; 无机碱为氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠, 磷酸钠; (b) 室温下, 以醇为溶剂, 1,4,7-三氮杂环壬。
6、烷与二硫化碳在无机碱条件下反应得到化 合物2a; 溶剂为甲醇, 乙醇, 异丙醇; 无机碱为氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠, 磷酸钠; (c) 室温下, 以醇为溶剂, 1,4,7,10-四氮杂环十二烷与二硫化碳在无机碱条件下反应 得到化合物3a; 溶剂为甲醇、 乙醇、 异丙醇; 无机碱为氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠, 磷酸钠。 8.制备如权利要求2、 4或6所述的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生 物的方法, 其特征在于, 通过如下方法实现; 权利要求书 2/3 页 3 CN 106220588 A 3 (d) 室温下, 溶剂中, 哌嗪与二硫化碳, 卤代烷在无机碱条件下反应得到化合。
7、物1b-1d; 溶剂为丙酮, 甲醇, 乙醇, 卤代烷为与R对应的溴代烷、 碘代烷或氯代烷, 无机碱为磷酸钠, 氢 氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠; (e) 室温下, 溶剂中, 1,4,7-三氮杂环壬烷与二硫化碳, 卤代烷在无机碱条件下反应得 到化合物2b-2d; 溶剂为丙酮, 甲醇, 乙醇, 卤代烷为与R对应的的溴代烷、 碘代烷或氯代烷, 无机碱为磷酸钠, 氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠; (f) 室温下, 溶剂中, 1,4,7,10-四氮杂环十二烷与二硫化碳, 卤代烷在无机碱条件下反 应得到化合物3b-4d; 溶剂为丙酮, 甲醇, 乙醇, 卤代烷为与R对应的溴代烷、 碘代烷或氯代 烷, 无机碱。
8、为磷酸钠, 氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠。 9.如权利要求1-6其中之一所述的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生 物的应用, 其特征在于, 其与碳青霉烯类抗生素联用, 用于金属 -内酰胺酶抑制剂。 权利要求书 3/3 页 4 CN 106220588 A 4 金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基二硫代甲酸盐衍生物及其制 备方法 技术领域 0001 本发明属于药物化学领域, 涉及潜在应用价值的金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基 二硫代甲酸盐衍生物及其制备方法。 背景技术 0002 自抗生素用于临床治疗细菌感染以来, 细菌耐药性问题日益严重。 导致细菌耐药 性产生的原因有多种, 其中可水平传播。
9、的药物水解酶是细菌获得耐药性产生的重要原因。 2009年在印度新德里发现了第一株产NDM-1型金属 -内酰胺酶的超级细菌, 该细菌仅对多 黏菌素等少数抗菌药物敏感, 耐药谱广, 治疗困难(The Lancet Infectious Diseases 2010,10,597.)。 产NDM-1酶菌株自发现以来, 目前已在全球40多个国家出现流行, 严重威胁 临床抗感染治疗。 因此研发新的抗菌药物迫在眉睫, 但是, 先导化合物的寻找和临床治疗药 物的修饰并不能一蹴而就。 所以, 寻找耐药菌株产生水解抗生素的酶抑制剂开始成为研究 热点。 0003 金属 -内酰胺酶属于碳青霉烯酶的一种, 碳青霉烯酶按。
10、其活性位点差异可分为丝 氨酸类 -内酰胺酶和金属 -内酰胺酶两大类; 而按照Almber分类又可以将其分为A、 B、 C和D 四大类。 其中A和D类属于丝氨酸类 -内酰胺酶, 而B类属于金属 -内酰胺酶。 目前进入临床 研究阶段的碳青霉烯酶抑制剂的只有针对丝氨酸酶类的而金属 -内酰胺酶抑制剂尚未见 报道。 0004 2014年, Gerard D .Wright等人报道从真菌中得到的一种天然的化合物 aspergillomarasmine A(AMA), 它可以快速、 有效的抑制NMD-1和IMP型金属 -内酰胺酶的 活性(Nature 2014,510,503.)。 与碳青霉烯类抗生素美罗培。
11、南联合用药的实验结果证明 AMA能够使产金属酶的菌株恢复对碳青霉烯类抗生素的敏感性。 2015年, Sabiha Y.Essack 等人, 报道了两种锌离子螯合剂NOTA和DOTA, 此两种螯合剂可以使产金属酶的碳青霉烯耐 药株恢复对美罗培南的敏感性(Journal of Antimicrobial Chemotherapy 2015,70, 1594.)。 2015年, 西北大学杨科武课题组报道了一系列巯基乙酸硫酯氨基酸衍生物, 其对于 金属 -内酰胺酶L1的IC50最小可以达到18nM, 但是其体外活性实验表明该类化合物恢复耐 药株对美罗培南敏感性的效果并不佳(Acs Medicinal 。
12、Chemistry Letters 2015,6, 660.)。 发明内容 0005 本发明目的在于提供系列氮杂环类衍生物金属 -内酰胺酶抑制剂环状胺基 二硫代甲酸盐衍生物, 该类化合物可以使产金属 -内酰胺酶耐药株恢复对美罗培南的敏感 性。 另一目的在于提供其制备方法。 0006 为实现本发明目的, 技术方案如下: 0007 该化合物具有以下结构通式1, 2或3: 说明书 1/11 页 5 CN 106220588 A 5 0008 0009 R为钠、 甲基、 正己烷基、 正癸烷基。 具体选如下化合物: 0010 (1)1a: R钠 0011 (2)1b: R甲基 0012 (3)1c: R。
13、正己烷基 0013 (4)1d: R正癸烷基 0014 0015 R为钠、 甲基、 正己烷基、 正十二烷基。 具体选如下化合物: 0016 (1)2a: R钠 0017 (2)2b: R甲基 0018 (3)2c: R正己烷基 0019 (4)2d: R正十二烷基 0020 0021 R为钠、 甲基、 正己烷基、 正癸烷基。 具体选如下化合物: 0022 (1)3a: R钠 0023 (2)3b: R甲基 0024 (3)3c: R正己烷基 0025 (4)3d: R正癸烷基 0026 合成本发明金属 -内酰胺酶抑制剂(1至3系列)路线如下: 说明书 2/11 页 6 CN 106220588。
14、 A 6 0027 0028 (a)室温下, 以醇为溶剂, 哌嗪与二硫化碳在无机碱条件下反应得到化合物1a; 溶 剂为甲醇、 乙醇、 异丙醇等。 无机碱可以是氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠, 磷酸钠等。 哌嗪与二 硫化碳、 无机碱摩尔比为: 1:2.0-5.0: 2.0-5.0。 0029 (b)室温下, 以醇为溶剂, 1, 4, 7-三氮杂环壬烷与二硫化碳在无机碱条件下反应得 到化合物2a; 溶剂为甲醇、 乙醇、 异丙醇等。 无机碱可以是氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠, 磷酸 钠等。 1, 4, 7-三氮杂环壬烷与二硫化碳、 无机碱摩尔比为: 1:3.0-6.0: 3.0-6.0。 0030。
15、 (c)室温下, 以醇为溶剂, 1, 4, 7, 10-四氮杂环十二烷与二硫化碳在无机碱条件下 反应得到化合物3a; 溶剂为甲醇、 乙醇、 异丙醇等。 无机碱可以是氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢 钠, 磷酸钠等。 1, 4, 7, 10-四氮杂环十二烷与二硫化碳、 无机碱摩尔比为: 1:4.0-8.0: 4.0- 8.0。 说明书 3/11 页 7 CN 106220588 A 7 0031 0032 R为甲基、 正己烷基、 正癸烷基或正十二烷基。 0033 (d)室温下, 溶剂中, 哌嗪与二硫化碳, 卤代烷在无机碱条件下反应得到化合物1b- 1d; 溶剂为丙酮, 甲醇, 乙醇等, 卤代烷为与R。
16、对应的溴代烷、 碘代烷和氯代烷, 无机碱可以是 磷酸钠, 氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠等。 哌嗪、 二硫化碳、 卤代烷、 无机碱摩尔比为: 1: 2.0- 5.0: 2.0-5.0: 2.0-5.0。 0034 (e)室温下, 溶剂中, 1, 4, 7-三氮杂环壬烷与二硫化碳, 卤代烷在无机碱条件下反 应得到化合物2b-2d; 溶剂为丙酮, 甲醇, 乙醇等, 卤代烷为与R对应的的溴代烷、 碘代烷和氯 代烷, 无机碱可以是磷酸钠, 氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠等。 1, 4, 7-三氮杂环壬烷、 二硫化 碳、 卤代烷、 无机碱摩尔比为: 1: 3.0-6.0: 3.0-6.0: 3.0-6.。
17、0。 0035 (f)室温下, 溶剂中, 1, 4, 7, 10-四氮杂环十二烷与二硫化碳, 卤代烷在无机碱条件 下反应得到化合物3b-4d; 溶剂为丙酮, 甲醇, 乙醇等, 卤代烷为与R对应的溴代烷、 碘代烷和 氯代烷, 无机碱可以是磷酸钠, 氢氧化钠, 碳酸钠, 碳酸氢钠等。 1, 4, 7, 10-四氮杂环十二烷、 二硫化碳、 卤代烷、 无机碱摩尔比为: 1: 4.0-8.0: 4.0-8.0: 4.0-8.0。 0036 本发明成功合成了一系氮杂环类衍生物, 该类化合物可以使产金属 -内酰胺酶耐 药株恢复对美罗培南的敏感性, 能将美罗培南的抑菌活性提高128倍。 且红细胞溶血试验和 细。
18、胞毒实验证实该类化合物毒性较低, 对于目前耐药情况愈发严重的情况具有临床潜在应 用价值, 开发前景良好。 附图说明 0037 图1为本发明化合物3a在体外对于红细胞溶血性的实验结果。 0038 图2为本发明化合物3a在体外对于Hela细胞毒性的实验结果。 说明书 4/11 页 8 CN 106220588 A 8 0039 图3为本发明化合物3a在不同浓度下作用于Hela细胞24h后于荧光显微镜下的成 像结果.(a c)为阴性对照(不加药组); (d f)为化合物3a(1000 g/mL); (g i)为化合物3a (500 g/mL); 和(j l)为阳性对照组0.1Triton X-100。
19、, 图中比例尺为100nm。 具体实施方式 0040 下面结合具体实施例, 进一步阐述本发明。 这些实施例仅用于说明本发明而不用 于限制本发明要求保护的范围。 0041 合成化合物表征使用的仪器: NMR谱使用瑞典Bruker DPX-400型超导核磁共振仪 测定, TMS为内标; 高分辨质谱使用Waters-Micromass公司Q-Tof质谱仪测定。 0042 实施例1化合物1a的制备 0043 室温下, 取化合物无水哌啶(100mg, 1.16mmol)和氢氧化钠(93mg, 2.32mmol)置于 10mL单口瓶内, 加入2mL乙醇, 室温搅拌, 体系未全溶; 加入二硫化碳(169 L。
20、,2.79mmol), 体 系变为金白色浑浊, 约半个小时停止反应。 减压蒸馏除去溶剂, 加入适量乙酸乙酯, 勺子刮 下黏附在瓶壁上的固体, 抽滤, 再次用乙酸乙酯冲洗滤饼, 真空干燥得到白色固体325mg, 收 率99。 0044 m.p.:300; 1H NMR(400MHz,D2O) 4.38(s,1H).13C NMR(100MHz,D2O) 209.13, 50.21. 0045 实施例2化合物2a的制备 0046 室温下, 取化合物1, 4, 7-三氮杂环壬烷于溶剂中, 同实施例1化合物1a的制备, 得 到白色晶状无36mg, 收率15。 0047 m.p.:174-176; 1H。
21、 NMR(400MHz,CDCl3) 4.78 3.85(m,12H),2.64(s,9H).13C NMR(100MHz,CDCl3) 201.42,29.71,20.49.HR-MS(ESI)Calcd for C12H21N3S6M+Na+: 421.9957,found:421.9957. 0048 实施例3化合物3a的制备 0049 室温下, 取化合物1, 4, 7, 10-四氮杂环十二烷于溶剂中, 同实施例1化合物1a的制 备, 得到白色固体327mg, 收率99 0050 m.p.:278-280 1H NMR(400MHz,D2O) 4.70.13C NMR(100MHz,D2。
22、O) 55.01. 0051 实施例4化合物1b的制备 0052 室温下, 取无水哌啶(50mg, 0.58mmol)和十二水磷酸钠(265mg, 0.696mmol)置于 25mL单口瓶内, 加入2mL丙酮, 二硫化碳(210 L,3.48mmol), 该混合体系于室温下搅拌, 体系 白色浑浊; 30min后, 加入碘甲烷(83 L,1.34mmol), 继续室温下搅拌, 约5h后反应结束。 加入 少量水淬灭反应。 抽滤, 适量乙酸乙酯冲洗, 静止分层, 收集有机相, 水反洗(10mL1), 饱和 食盐水萃洗(10mL1), 收集有机相, 无水硫酸钠静置干燥后浓缩, 柱层析纯化(PE:EA1。
23、0: 1), 最终得到白色固体约50mg, 收率30。 0053 m.p.:188-190; 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.30(s,8H),2.70(s,6H),1.27(s,1H) . 13C NMR(100MHz,CDCl3) 199.14,29.71,20.05.HR-MS(ESI)Calcd for C8H14N2S4M+Na+: 288.9938,found:288.9936. 0054 实施例5化合物1c的制备 0055 同实施例4化合物1b的制备, 卤代烷为溴代正己烷。 得到白色晶状固体16mg, 收率 说明书 5/11 页 9 CN 106220588 A 9。
24、 6.7。 0056 m.p.:75-77; 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.66 3.77(m,8H),3.37 3.30(m,4H),1.72 (dd,J15.1,7.6Hz,4H),1.45(dd,J10.2,4.6Hz,4H),1.38 1.30(m,8H),0.92(dd,J 9.0,4.7Hz,6H).13C NMR(100MHz,CDCl3) 198.46,48.45,37.36,31.36,29.71,28.68, 28.47,22.54,14.04.HR-MS(ESI)Calcd for C18H34N2S4M+Na+:429.1503,found: 429.1。
25、505. 0057 实施例6化合物1d的制备 0058 同实施例4化合物1b的制备, 卤代烷为溴代正十二烷。 得到白色晶状固体218mg, 收 率65.3。 0059 m.p.:56-57; 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.63 3.89(m,8H),3.31(t,J7.4Hz,4H), 1.77 1.65(m,4H),1.40(dd,J14.5,6.8Hz,4H),1.26(s,24H),0.88(t,J6.8Hz,6H). 13C NMR(101MHz,CDCl3) 197.44,47.36,36.34,30.87,28.53,28.48,28.29,28.17,27.99,。
26、 27.48,21.67,13.11.HR-MS(ESI)Calcd for C26H50N2S4M+Na+:541.2755,found: 541.2756. 0060 实施例7化合物2b的制备 0061 同实施例4化合物1b的制备, 原料为1, 4, 7-三氮杂环壬烷, 卤代烷为碘甲烷。 得到 白色晶状无36mg, 收率15。 0062 m.p.:51-52; 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.31(d,J76.4Hz,12H),3.25(t,J 7.5Hz,6H),1.75 1.61(m,6H),1.49 1.24(m,18H),0.90(t,J6.9Hz,9H). 13C 。
27、NMR(101MHz, CDCl3) 200.75,54.83,37.64,31.41,28.77,28.37,22.55,14.05.HR-MS(ESI)Calcd for C27H51N3S6M+Na+:632.2305,found:632.2303. 0063 实施例8化合物2c的制备 0064 同实施例7化合物2b的制备, 卤代烷为溴代正己烷。 得到白色晶状无36mg, 收率 15。 得到白色晶状无50mg, 收率10。 0065 m.p.:63-64; 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.31(d,J74.9Hz,12H),3.25(t,J 7.4Hz,6H),1.78 1。
28、.61(m,6H),1.43 1.23(m,54H),0.88(t,J6.8Hz,9H). 13C NMR(101MHz, CDCl3) 200.73,54.87,37.66,31.94,29.70,29.67,29.64,29.56,29.38,29.26,29.12, 28.42,26.22,22.71,14.15. 0066 实施例9化合物2d的制备 0067 同实施例7化合物2b的制备, 卤代烷为溴代正十二烷。 得到白色固体46mg, 收率 9.1。 0068 m.p.:56-57; 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.63 3.89(m,8H),3.31(t,J7.4Hz,。
29、4H), 1.77 1.65(m,4H),1.40(dd,J14.5,6.8Hz,4H),1.26(s,24H),0.88(t,J6.8Hz,6H). 13C NMR(101MHz,CDCl3) 197.44,47.36,36.34,30.87,28.53,28.48,28.29,28.17,27.99, 27.48,21.67,13.11.HR-MS(ESI)Calcd for C26H50N2S4M+Na+:541.2755,found: 541.2756. 0069 实施例10化合物3b的制备 0070 同实施例4化合物1b的制备, 原料为1,4,7,10-四氮杂环十二烷, 卤代烷为碘甲。
30、烷。 得到白色固体105mg, 收率36。 说明书 6/11 页 10 CN 106220588 A 10 0071 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.61 3.84(m,16H),2.68(s,12H).13C NMR(101MHz,CDCl3) 199.18,29.71,20.04.HR-MS(ESI)Calcd for C27H51N3S6M+Na+:632.2305,found: 632.2303. 0072 实施例11化合物3c的制备 0073 同实施例10化合物3b的制备, 卤代烷为溴代正己烷。 得到白色固体55mg, 收率 38。 0074 m.p.:128-130;。
31、 1H NMR(400MHz,CDCl3) 5.81 3.40(m,16H),3.26(t,J7.4Hz, 8H),1.72 1.62(m,8H),1.56(s,3H),1.46 1.35(m,8H),1.36 1.22(m,20H),0.88(t,J 6.9Hz,12H). 13C NMR(101MHz,CDCl3) 36.54,30.36,27.65,27.44,21.53,13.02. 0075 实施例12化合物3d的制备 0076 同实施例10化合物3b的制备, 卤代烷为溴代正葵烷。 得到白色固体65mg, 收率 20。 0077 1H NMR(400MHz,CDCl3) 4.49(s。
32、,16H),3.39(t,J6.7Hz,3H),3.25(t,J7.4Hz, 8H),1.66(dd,J14.8,7.5Hz,8H),1.40(dd,J12.8,6.2Hz,8H),1.34 1.20(m,76H),0.88 (t,J6.7Hz,18H).13C NMR(101MHz,CDCl3) 69.96,36.54,30.90,28.77,28.58,28.55, 28.49,28.32,28.22,28.01,27.49,25.19,21.67,13.11. 0078 应用例1本发明化合物体外抗菌活性测试: 0079 实验方法: 微量肉汤稀释法: 0080 (1)抗菌药物贮存液制备: 。
33、制备抗菌药物贮备液的浓度为5120 g/mL, 溶解度低的 抗菌药物可稍低于上述浓度。 所需抗菌药物溶液量或粉剂量可公式进行计算。 配制好的抗 菌药物贮存液应贮存于-20以下环境, 保存期不超过6个月。 0081 (2)待测菌的制备: 用接种环挑取过夜培养的MH(A)培养皿上的单菌落于MH(B)培 养基中, 校准为0.5麦氏比浊标准, 约含菌数1108CFU/mL, 然后稀释100倍, 即得到约含菌 数1.0106CFU/mL的菌液, 备用。 0082 (3)分别将抗菌药物(美罗培南)贮备液母液(5120 g/mL)稀释80倍, 得到浓度为64 g/mL的抗菌药物溶液。 取无菌的96孔板, 第。
34、一孔加入200 L的抗菌药物, 第二至十孔分别加 入100 L的MH肉汤培养基, 从第一孔吸取100 L加入第二孔, 混匀, 再吸取100 L至第三孔, 依 次类推, 第十孔吸取100 L弃去。 此时各孔药物浓度依次为: 32、 16、 8、 4、 2、 1、 0.5、 0.25、 0.125、 0.0625、 0.03125 g/mL, 第十二孔加入200 LMH(B)培养基(阴性对照)。 0083 (4)然后将稀释好的菌液分装于EP管中, 计算需要固定待测化合物的浓度, 将其加 入菌液中, 使待测化合物的终浓度为128或64 g/mL。 自稀释好美罗培南的96孔板的第1孔至 第10孔分别加。
35、入菌液和本发明待测化合物的混合溶液。 将加完药的96孔板放置37培养箱 进行培养, 16-18h观察菌液生长情况。 同时用标准株做质控。 实验结果如下表: 0084 表一: 目标化合物3a和NOTA对含有NDM-1和IMP-4的菌株的MIC( g/mL)及其与美罗 培南(MEM)联合用药的结果 说明书 7/11 页 11 CN 106220588 A 11 0085 0086 0087 由表一可见, 化合物3a和对照化合物NOTA一样, 对于大部分临床分离得到携带 NDM-1和IMP-4型金属内酰胺酶的细菌均能恢复美罗培南的敏感, MIC值显著下降。 在含NDM- 1基因的大肠埃希菌SMX5中。
36、化合物3a可以将美罗培南的MIC提高128倍。 同样的在含有IMP-4 基因的大肠埃希菌2013091407中, 同样可以将美罗培南的活性提高128倍。 应用例2本发明 化合物体外红细胞溶血性实验 0088 (1)实验材料: 10mL EP管, 96孔板, 新鲜脱脂羊血。 0089 (2)PBS缓冲液: 500mL规格, 氯化钠4g, 氯化钾100mg, 二水合磷酸二氢钠1.49g, 无 水磷酸二氢钾100mg, 去离子水定容至490mL, 调节PH7.2-7.4之间, 灭菌, 用10mL灭过菌的超 纯水溶解900mg葡萄糖后加入PBS溶液中。 说明书 8/11 页 12 CN 1062205。
37、88 A 12 0090 (3)5红细胞悬浮液的制备: 新鲜的脱纤维羊血冷冻与冰箱里, 配置好的PBS缓冲 液放置与37水浴锅中, 即用即取。 0091 (4)取两支10mL EP管置于试管架, 将37PBS取出水浴锅和冷藏的新鲜羊血一起 喷酒精, 放入超净台。 用移液枪分别吸取5700微升PBS加入两支EP管中, 再分别吸取300微升 羊血, 缓慢加入到PBS溶液中, 盖盖子, 上下缓慢颠倒混匀, 放入离心机1500转离心10min, 取 出EP管, 小心吸取上清, 移除上清。 再重新分别加入57mL PBS溶液, 上下缓慢颠倒混匀, 放 入离心1500转离心10min。 如此反复操作, 直。
38、至离心后上清液不再浑浊。 最后一次离心过后, 撇去上清液, 红细胞沉积物留置待用。 0092 (5)取几支10mL EP管, 放置试管架上, 于每支EP管中加入5700 L的PBS(37), 然 后依次加入300 L的红细胞沉积物。 上下缓慢颠倒混匀, 如此, 便配置好5的红细胞悬液。 0093 (6)样品溶液的配置: 用少量的DMSO溶解(DMSO终浓度不能大于0.5), 并且用相 同体积的DMSO做阴性对照。 溶解后的DMSO用PBS稀释(例如, 第一孔浓度定为1000 g/mL, 那 么第一孔加入的50 L中药物的含量就是2mg, 配置成2mg/50 L的溶液), 此时这支EP管内的 药。
39、物为初始药物。 然后平行取九支1.5mL EP管置于试管架中, 分别加入200 L的PBS(编号2 号、 3号、 4号10号)。 所有药物都如此平行操作。 最后, 由初始药物EP管中吸取200 L的药 品溶液加入2号EP管中, 反复吹洗后吸取200 L到3号EP管中, 反复吹洗重复操作, 直到10号 EP管。 如此, 稀释好药物。 0094 (7)铺板: 取96孔板, 写好实验编号, 药品代码, 日期。 将移液枪调至150 L, 将配置 好的5红细胞悬液上下轻缓颠倒混匀, 依次吸取铺入96孔板中(610)。 然后将配置好的 药物对应加入96孔板中, 一个药物三个复孔。 加完后放置37恒温箱内孵。
40、育1h。 0095 (8)后处理: 将96孔板从恒温箱内取出, 置于-4离心机内离心(3500rpm, 5min)。 离心完毕, 每块板对应都取一块新的96孔板。 标注和离心后的板子对照。 然后对应地吸取 100 L上清液(孔孔对应)。 吸取完毕后, 与酶标仪中测取OD值, 分析数据, 得到HC50。 实验结果 图1。 0096 由图1可知, 化合物3a在1000 g/mL时依旧对红细胞没有太大的损伤, 由此可以证 明其对于哺乳动物的红细胞损伤很小。 0097 应用例3本发明化合物体外细胞毒性测试: 0098 (1)实验材料: DMEM培养基, 细胞计数板, 96孔板, CCK-8, 酶标仪。。
41、 0099 (2)培养基的配置: 取无菌分装瓶, FBS和DMEM培养基1:10的比例配置, 于4冰箱 内储存待用。 0100 (3)铺板: 将培养中状态良好的Hela细胞自培养箱中取出, 于生物安全柜中操作。 倒掉上清培养基, 用2mL PBS洗细胞一次, 除去残留的培养基。 取1mL胰蛋白酶沿壁打入培养 皿中, 于37培养箱, 体积百分比0.5的CO2中孵育1-2min。 取出消化后的培养皿, 加入1mL 培养基终止消化。 将终止消化后的细胞混悬液转移至10mL EP管中, 800rpm 3min离心。 取出 EP管, 缓缓倒掉上清, 加入2-4mL培养基, 反复吹打50次。 从中取10 。
42、L细胞混悬液打入细胞计 数板中, 于20显微镜下计数。 计算好需要细胞的数目, 配置为5000个/孔的细胞混悬液。 没 孔100 L依次加入96孔板中, 于恒温培养箱中孵育24h。 0101 (4)加药: 将待测药物在4mL EP管中梯度稀释好后, 取出已贴壁生长的96孔板, 弃 掉上清, 将稀释好的待测药物每个浓度三个副孔, 每孔200 L加入板中, 操作完成后将96孔 说明书 9/11 页 13 CN 106220588 A 13 板放入恒温培养箱中。 24h后, CCK-8每孔7 L依次加入板中, 放入恒温培养箱中培养4h后于 酶标仪中, 450nm波长处读取OD值, 计算抑制率, 回归。
43、其IC50。 实验结果如图2。 0102 由图2可知, 化合物3a在1000 g/mL时对Hela细胞的抑制率在20左右, 远高于其 有效剂量, 由此可以初步证明, 在体外实验过程中, 发现化合物3a具有较小的毒性。 0103 应用例4本发明化合物体外活死细胞双染测试: 0104 (1)实验材料: DMEM培养基, 细胞计数板, 96孔板, CCK-8, 钙黄绿素-AM, 碘化丙啶 (PI), PBS缓冲液, 荧光显微镜。 0105 (2)培养基的配置: 取无菌分装瓶, FBS和DMEM培养基1:10的重量比配置, 于4冰 箱内储存待用。 0106 (3)荧光染料的配置: 将分装好的钙黄绿素-。
44、AM和碘化丙啶(PI)用PBS稀释, 即用即 稀释。 0107 (4)铺板: 将培养中状态良好的Hela细胞自培养箱中取出, 于生物安全柜中操作。 倒掉上清培养基, 用2mL PBS洗细胞一次, 除去残留的培养基。 取1mL胰蛋白酶沿壁打入培养 皿中, 于37培养箱, 体积百分比0.5的CO2中孵育1-2min。 取出消化后的培养皿, 加入1mL 培养基终止消化。 将终止消化后的细胞混悬液转移至10mL EP管中, 800rpm 3min离心。 取出 EP管, 缓缓倒掉上清, 加入2-4mL培养基, 反复吹打50次。 从中取10 L细胞混悬液打入细胞计 数板中, 于20显微镜下计数。 计算好需。
45、要细胞的数目, 配置为30000个/孔的细胞混悬液。 每孔1mL依次加入12孔板中, 于恒温培养箱中孵育24h。 0108 (5)加药与染色: 将待测药物在4mL EP管中梯度稀释好后, 取出已贴壁生长的12孔 板, 弃掉上清, 将稀释好的待测药物每孔700 L加入板中, 操作完成后将12孔板放入恒温培 养箱中。 24h后, 取出, 分别收集每个孔的上清, 做好标记, 3500rpm 5min离心上清, 弃掉上清 收集死细胞, 接着用PBS洗一次, 弃掉PBS。 将12孔板用PBS每孔各洗一次。 用配置好的染料每 孔700 L先吹打收集该孔的死细胞, 然后将其混合液加入到12孔板的孔中。 操作。
46、完成后, 于 恒温培养箱孵育15min。 接着, 荧光显微镜下拍照。 化合物3a在不同浓度下作用于Hela细胞 24h后于荧光显微镜下的成像结果如图3。 0109 由图3可以看出, 化合物3a于1000 g/mL作用于Hela细胞后, 对于细胞维持正常形 态的生长几乎没有影响。 0110 应用例5本发明化合物体外红NDM-1酶活性的测定 0111 反应在96孔板中进行, 终体积为200 L。 分别设置不含美罗培南和不含NDM-1酶的 实验对照组。 0112 (1)反应体系中各物质的终浓度分别为: NDM-1酶和美罗培南(MEM)都用10mM HEPES(PH7.5)溶液稀释; NDM-1酶终活。
47、力约3.5U, 美罗培南终浓度为125mM。 待测药物起始 浓度为10mg/mL, 待测药物用DMSO梯度稀释使浓度从10mg/mL逐步稀释到0.15625mg/mL 0113 (2)其中96孔板中, 每孔加入NDM-1酶溶液98 L, 待测药物溶液2 L, 每组待测药物 平行做三个副孔。 用作为阴性对照组, 每组四个平行。 在30条件下孵育15min, 再加入美罗 培南100 L, 使化合物终浓度为100 g/mL到1.5625 g/mL, 捶打均匀启动反应。 0114 (3)将96孔板置入酶标仪中, 测定其相应孔中于300nm处的吸光值; 每隔60s测定一 次, 连续测定60个循环。 分别。
48、计算各抑制浓度下的酶抑制率, 用Graphpad Prism5分析各抑 制剂的IC50。 说明书 10/11 页 14 CN 106220588 A 14 0115 运用上述模型监测待测样品酶活性的抑制率, 其中阴性对照组为不含抑制剂, 可 以反应体系中酶的最大活力。 空白对照组为不含抑制剂也不含酶, 所测得的结果为体系本 底值。 因此待测样品抑制率的计算公式如下: 0116 IR()(1-VS/VN)100 0117 VS代表待测样品孔的酶反应速率 0118 VN代表阴性对照孔的平均酶反应速率 0119 本发明化合物3a对金属beta内酰胺酶NDM-1的抑制率实验结果如下: 0120 0121 a表明化合物在10 g/mL条件下对于NDM-1酶的抑制率。 0122 从结果可以看出化合物3a对于NDM-1酶的IC50结果较好, 在10 g/mL的条件下对于 NDM-1的抑制率就可以达到52, IC50为17.3 M。 说明书 11/11 页 15 CN 106220588 A 15 图1 图2 说明书附图 1/2 页 16 CN 106220588 A 16 图3 说明书附图 2/2 页 17 CN 106220588 A 17 。