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合成反式-羟基砜的生物转化方法.pdf

  • 上传人:凯文
  • 文档编号:8645177
  • 上传时间:2020-10-19
  • 格式:PDF
  • 页数:15
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  • 摘要
    申请专利号:

    CN95196145.4

    申请日:

    19950908

    公开号:

    CN1057796C

    公开日:

    20001025

    当前法律状态:

    有效性:

    失效

    法律详情:

    IPC分类号:

    C12P17/00,C12P11/00,C07D495/04

    主分类号:

    C12P17/00,C12P11/00,C07D495/04

    申请人:

    麦克公司

    发明人:

    M·M·沙特朗,L·凯兹,S·A·金

    地址:

    美国新泽西州

    优先权:

    08/305,110

    专利代理机构:

    中国专利代理(香港)有限公司

    代理人:

    马崇德;温宏艳

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    内容摘要

    本发明公开了合成反式-羟基砜中间体的新的微生物转化方法,上述中间体是局部碳酸酐酶抑制剂(TCAI)的前体。TCAI对治疗青光眼和眼高压症有效。该生物转化方法是在微生物深红酵母或piliminae红酵母存在下进行的,并且生成显示出非对映异构体过量值大于95%的反式-羟基砜。

    权利要求书

    1.制备通式II化合物的方法:其中A为碳,R为a)C的直链或支链烷基;b)C烯基;c)C炔基;d)氢;或e)C烷氧基-C烷基,该方法包括的步骤有,在含可吸收性氮源,碳源及底物化合物III的营养性介质中在需氧条件下培养微生物深红酵母ATCC74283;或piliminae红酵母ATCC32762直至显著量的化合物II生成,并分离生成的化合物,其中R为a)C直链或支链烷基;b)C烯基;c)C炔基;d)氢;或e)C烷氧基-C烷基。 2.权利要求1的方法,其中C直链或支链烷基是正丙基或异丁基,C烯基是烯丙基,C炔基是炔丙基。 3.权利要求1的方法,其中微生物为深红酵母ATCC74283,底物溶于1%-15%(v/v)的乙醇、甲醇或DMSO,底物的量为1g/L至3g/L。 4.权利要求3的方法,其中底物溶于1%至3%(v/v)的DMSO,底物的量为1g/L至3g/L。 5.权利要求1的方法,其中温度为20至50℃,pH为4.5至8.0。 6.权利要求1的方法,其中温度为30℃至35℃,pH为5.5至6.5。 7.权利要求1的制备通式II化合物的方法:其中A为碳,R为a)C直链或支链烷基;b)C烯基;c)C炔基;d)氢;或e)C烷氧基-C烷基该方法包括在含可吸收性氮源、碳源及底物化合物III的营养性介质中培养深红酵母ATCC74283,在通式III中,R为a)C直链或支链烷基;b)C烯基;c)C炔基;d)氢;或e)C烷氧基-C烷基,培养在需氧条件下进行,直至生成显著量的化合物II,分离生成的化合物II,培养时使底物溶在体积百分比浓度1%至15%乙醇、甲醇或DMSO中,底物的含量为1g/L至3g/L,培养温度为20℃至50℃,pH为4.5至8.0。 8.权利要求7的方法,其中C直链或支链烷基是正丙基或异丁基,C烯基是烯丙基,C炔基是炔丙基。 9.权利要求7的方法,其中底物溶解在1%至3%(v/v)的DMSO中,底物的量为1g/L至3g/L,温度为30℃至35℃,pH为5.5至6.5。

    说明书

    

    发明背景

    青光眼是与眼内压升高以致功能异常有关的眼疾,可引起不可逆的 视力丧失。若不治疗,青光眼甚至可导致失明。现在许多眼科医生相信, 眼高压症,即无视觉神经损伤或以青光眼性视野缺陷为特征的眼内压高 的病症是青光眼的最早表现。

    通式I的化合物:

    它们的各个非对映异构体,各个对映异构体或它们的混合物,或眼科 可以接受的它们的盐,为美国专利4,797,413和5,157,129中的已知化合 物。

    其中:A为碳或氮;

    Z为NHR或-OR;

    R为C1-6直链或支链烷基;

    R1为

    a)C1-5直链或支链烷基,尤其为正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其为烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其为炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基;以及

    X为-SO2-或-C(O)-;

    这些化合物已知是用于眼高压症局部治疗的有效的碳酸酐酶抑制剂 (TCAI’s)。这些化合物的合成包括将砜-酮还原成上面提到的化合物 的前体反式羟基砜。不过制备它们的合成方法却生成非对映异构体或外 消旋产物,因而必须分离或拆分,要得到最活泼的对映异构体同时就要 至少损失50%产品。

    本发明提供一种新的微生物方法,将砜-酮中间体生物转化为反式- 羟基砜中间体。

    发明概述

    本发明涉及使用新的微生物转化方法合成具有下面的结构式的反式 -羟基砜:

    其中A和R1的定义同上。该反式-羟基砜是目标物、即上面通式I的 碳酸酐酶抑制剂的前体。这些目标物对于眼高压症和青光眼的局部治疗 有效。该方法包括将砜-酮底物在微生物深红酵母(ATCC74283)或 piliminae红酵母(ATCC32762)存在下发酵,最好在染红酵母存在下发 酵。生物转化在需氧条件下完成,以含有氮营养素的碳水化合物水溶液 作为发酵介质,介质的pH为4.5至8.0,最好为6.0,生物转化的时间 应充分以便生成结构式为通式II的化合物。

    生成的反式-羟基砜类似物显示的非对映异构体过量值在95%以 上。该新方法中的关键步骤(即控制羟基砜的非对映异构体过量)是控 制生物转化反应介质中的残留砜-酮浓度。

    这样,本发明的目标是提供合成反式-羟基砜中间体的微生物方法。

    本发明的详细描述

    本发明涉及合成下面结构式的化合物:

    反式-羟基砜-II

    其中A为碳或氮,R1为

    a)C1-5的直链或支链烷基,尤其是正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其是烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其是炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基,

    它们是下面通式I化合物,各非对映异构体,各对映异构体或它们的混 合物,或眼科可以接受的它们的盐的前体,

    其中:

    A为碳或氮;

    Z为NHR或-OR;

    R为C1-6直链或支链烷基;

    R1为

    a)C1-5直链或支链烷基,尤其是正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其是烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其是炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基;以及

    X为-SO2-或-C(O)-;

    本发明的新方法包括在底物化合物III的存在下用微生物piliminae红 酵母或深红酵母进行发酵,最好用深红酵母进行发酵:

                        砜-酮-III

    其中R2为

    a)C1-5直链或支链烷基,尤其是正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其是烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其是炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基

    发酵在营养素的介质中在需氧条件下进行,直至有显著量的化合物II 生成,使用常规方法分离生成的化合物。结构式I的化合物用于治疗青光 眼。

    本发明的优选的实施方案包括在含有可吸收的氮源和碳源及底物化 合物III的营养素介质中培养微生物深红酵母,ATCC74283,其中通式 II的化合物是通式I化合物,它的各个非对映异构体、各个对映异构体或 它们的混合物,或眼科可以接受的它们的盐的前体,在通式II中,

    A为碳或氮,R1为

    a)C1-5直链或支链烷基,尤其是正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其是烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其是炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基

    在通式I中:

    A为碳或氮;

    Z为NHR或-OR;

    R为C1-6直链或支链烷基;

    R1为

    a)C1-5直链或支链烷基,尤其是正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其是烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其是炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基;以及

    X为-SO2-或-C(O)-;

    在通式III中,R2为

    a)C1-5直链或支链烷基,尤其是正丙基或异丁基;

    b)C3-5烯基,尤其是烯丙基;

    c)C3-5炔基,尤其是炔丙基;

    d)氢;或

    e)C1-4烷氧基-C1-4烷基,

    培养在需氧条件下进行,直至生成显著量的化合物II,分离生成的化 合物II,培养时将底物溶在以体积百分数大约1%至15%乙醇、甲醇或 DMSO中,底物的含量为大约1g/L至3g/L,培养温度为大约20℃至 50℃,pH为大约4.5至80。

    底物化合物III可以按照以下的非限制性方法制备:

    3(R)-羟基己酸甲酯

    3-酮己酸甲酯(44.7g,310mmol)用甲醇(75mL)和0.2N HCl(2mL)稀 释。加入Et2NH2+Ru2Cl5(BINAP)2(200mg),反应混合物在100磅/平方英 寸的氢气压下于60℃加热2小时。加入甲苯(100mL),将混合物浓缩, 得75g油状物。

    3(R)-甲苯磺酰氧基己酸甲酯

    3(R)-羟基己酸甲酯(310mmol)粗品溶在吡啶(100mL)中,加入对甲苯 磺酰氯(59g,310mmol)。反应混合物先于5℃搅拌24小时,再于15℃ 搅拌16小时。缓慢加水(5mL)破坏过量的试剂,加水时间超过1小时。 混合物倾入20%甲苯/己烷(600mL)中,并用水洗涤(3×250mL)。有机层 浓缩,得83g油状产物,纯度为95%。

    3(S)-(2-噻吩硫代)己酸甲酯

    在-20℃将正丁基锂(1.64M,97.6mL,160mmol)加到噻吩(15.1g, 180mmol)与四氢呋喃(100mL)的混合物中。搅拌30分钟后分次加入硫 (5.23g)。1小时后加脱氧的甲酰胺(100mL),接着加3(R)-甲苯磺酰氧基 己酸甲酯(40g,33.3mmol)。反应混合物室温搅拌24小时,然后用乙酸乙 酯(100mL)和水(50mL)稀释。分离的水层用乙酸乙酯(100mL)反萃取。合 并有机层,浓缩后得到黄色油状产物23.9g。按3-酮己酸甲酯计算,总 收率为74%。

    5,6-二氢-6(S)-(丙基)-4H-噻吩并〔2,3b〕噻喃-4-酮

    3(S)-(2-噻吩硫代)己酸甲酯(125g,513mmol)与乙酸(150mL)和浓盐酸 (150mL)混合后于100℃加热96小时。混合物用甲苯(2×300mL)萃取。 合并有机层,洗涤,浓缩,得暗棕色油状物,该油状物溶于甲苯(1200mL) 中。混合物冷却至0℃,加三氟乙酸酐(126g,600mmol)。45分钟后混 合物用水(2×200mL)洗,浓缩,得151g油状物,不经纯化,直接用于下 步反应。

    5,6-二氢-6(S)-(丙基)-4H-噻吩并〔2,3b〕噻喃-4-酮-7,7-二氧化物。

    5,6-二氢-6(S)-(3-丙基)-4H-噻吩并〔2,3b〕噻喃-4-酮(4.25g,20mmol) 溶于乙酸乙酯(80mL)中。加入钨酸钠(660mg,2mmol),30%过氧化氢 (8.2mL,80mmol)和10滴硫酸。24小时后反应混合物用乙酸乙酯(100mL) 稀释,用10%Na2SO3溶液洗涤,用饱和的NaHCO3溶液洗涤。有机层 浓缩,用乙醇研磨,得到4.5g产物(95%)。

    微生物

    生物纯的piliminae红酵母样品从夏威夷pilimanae果蝇幼虫中分离 得到,现在按照布达佩斯条约可以从ATCC的永久培养物中心得到, 12301 Parklawn Drive,马里兰的Rockville,登记号为ATCC32762。生 物纯的深红酵母样品目前可以从ATCC的永久培养物中心得到,12301 Parklawn Drive,马里兰州Rockville,登记号为ATCC74283。授予专 利权后,对于公众使用微生物的任何限制都将永远取消。深红酵母ATCC 74283从污染的酸乳酪中分离得到。

    本发明一般使用的分析方法当然是非限制性的,现描述如下:

    分析方法

    生物量测定:

    用光密度和细胞干重测定生物量。用Hewlett Packard 8451A型二级 管阵列分光光度计在660nm波长测定光密度。细胞干重用HA型 Millipore滤膜测定,滤孔为0.45μm。

    葡萄糖

    葡萄糖用液相色谱监测,液相色谱上装有Macintosh经典计算机用于 控制和收集数据,装有折射率检测器Al-2 Dynamax自动进样器,分析 型HP泵,压力组件和Biorad Aminex HPX87H离子排阻柱(300×78mm), 于60℃加热。洗脱剂为0.005M硫酸,流速为0.7mL/分

    肉汤萃取

    全部肉汤用等体积乙酸乙酯萃取。混合物在振荡器上振荡5分钟后 在Beckman TJ-6离心机上于2000rpm离心10分钟。得到的上层清液干 燥,再用甲醇混悬,作薄层色谱分析或HPLC分析。

    薄层色谱

    使用Kiesel预涂的硅胶60薄层色谱板F254。流动相由94%二氯甲 烷、5%甲醇和1%氢氧化铵组成。样品点在板上,吹干。板的一边浸 到流动相中,直至溶剂爬到离板上沿1英寸处。

    高效液相色谱

    HPLC用Rainin系统在室温下完成,配备有Macintosh经典计算机以 便控制和获得数据,Dynamax吸收检测器UV-M,Al-2 Dynamax自动进 样器,两个分析型HP泵,装有Zorbax RX-C8柱(4.6×250nm)的压力系 统。使用2种洗脱剂,甲醇和水(0.1%v/vH3PO4),组合流速为1.5mL/ 分,UV检测波长为254nm.由30/70的甲醇/酸化水(v/v)在15分钟内变 至70/30的甲醇/酸化水(v/v)的梯度洗脱。在70/30(v/v)保持5分钟,然后 至30/70(v/v)平衡5分钟。这样,分别在9.5分时分离收集顺式-羟基砜, 10分时分离收集反式-羟基砜,12.8分时分离收集砜-酮。

                           实施例1

    培养方法

    在筛分或振荡烧瓶培养的过程中生成反式-羟基砜,深红酵母ATCC 74283细胞最初由Sabouraud葡萄糖(Difco)斜面培养液或后来由冷冻甘 油悬浮液(1mL)接种到含50mL Sabouraud葡萄糖肉汤的250mL Erlenmever烧瓶中。Sabouraud葡萄糖肉汤是可以买到的商品,由10g/L Difco新胨(neopeptone)和20g/L Bacto葡萄糖构成。烧瓶在28℃培育24 小时,同时在每分钟220转速度下搅动,以便得到作用接种物必须的充 分的生物量。将接种物转移(5%/25mL)到含500mL Sabouraud葡萄糖肉 汤的2升Erlenmeyer烧瓶中。然后将培养物在28℃培育42小时,同时 在每分钟180转速下搅动。细胞离心分离,用pH6.0的MES缓冲液洗 涤,加砜-酮之前再悬浮到pH6.0的MES缓冲液中。

    在23升的发酵罐中进行生物反应器的培养,发酵罐用含深红酵母 ATCC74283的Sabouraud葡萄糖肉汤的2升烧瓶接种并象前面描述的 那样培养42小时。发酵罐参数如下:温度28℃,搅拌速度每分钟200 转(最低设定速度),通入空气的速度为10L/分,反压力为0.6磅/平方 英寸(0.0422千克/厘米2)。通过搅拌,控制溶解的氧气压在40%的 最小值。当吸氧速度降到5mmoles/升/小时以下时,在无菌条件下收获 细胞。

    反应参数

    最佳生物转化参数是这样一些参数,其中使用3-〔N-吗啉代〕丙磺 酸(MOPS)或2-〔N-吗啉代〕乙磺酸(MES)缓冲液(0.5M),温度为大约 20℃至40℃,pH范围为大约4.5至8.0,产生的生物转化速率为大约 0.011g/g CDW/小时至大约0.150g/g CDW/小时。温度范围为大约20℃ 至大约50℃,最好是大约30℃至大约35℃。为溶解砜-酮底物使用的 溶剂为乙醇、甲醇或DMSO,最好是DMSO,用量分别为1%至15% v/v,最好是1%至3%。底物的量为大约1至3g/L,最好是1.5g/L,这 样反式-羟基砜的回收率可达66%,非对映异构体过量可达95%;令细 胞老化大约16小时至60小时,最好为大约40小时至60小时,对应于 氧的吸收速度降到低于5mmoles/L/小时。

    反式-羟基砜II(5,6-二氢-4(S)-羟基-6(S)-丙基-4H-噻吩并-〔2,3-b〕噻 喃,7,7-二氧化物)的生物转化和分离

    含深红酵母细胞的肉汤(10或50mL)用Beckman TJ-6离心机在每分 钟4000转的速度下离心10分钟后倾出上清液。沉积的小丸再悬浮到pH 6.0的0.5M 2-〔N-吗啉代〕乙磺酸(MES)缓冲溶液中再离心。洗涤过的 细胞再悬浮到50mL MES缓冲溶液中。需要时将细胞稀释,以便更好地 分析生物转化反应速率。将相当于1g/L纯砜-酮的粗砜-酮底物(纯度为 56%)的乙醇溶液(3%v/v)加到装有洗涤过的细胞的烧瓶中。该烧瓶在 32.5℃的水浴中培育并继续振摇。用氯仿(按1∶1,v/v)或乙酸乙酯(按1∶1, v/v)萃取肉汤以便收获产品,萃取液干燥,并再悬浮到甲醇中。同时用 薄层色谱和高效液相色谱(HPLC)分析萃取液。反式-羟基砜、顺式-羟基 砜和砜酮的HPLC保留时间分别为9.5、10.0和12.8。反式-羟基砜的 1HNMR(250MHz,CDCl3)如下:

    δ7.58(d,J=5.1Hz,1H),7.08(d,J=5.1Hz,1H),4.94(t,J=3.6Hz,1H), 3.66(m,1H),2.6-2.1(m,3H),1.7-1.5(m,,3H),1.01(t,J=7.01,3H)。

    使用生物反应器培养细胞时,当吸氧速度低于5mmoles/L/小时便可 收获细胞,离心分离和用pH6.0的0.5M MES缓冲液洗涤。将收获的细 胞再悬浮到pH6.0的0.5M MES缓冲液中,然后再放回到发酵罐中。为 完成生物转化,发酵罐的参数调至:温度32.5℃,搅拌速度为每分钟 400转,通空气的量为6L/分,反压力为0.6磅/平方英寸(0.0422千克/ 厘米2)。砜-酮(1.5g/L)溶于DMSO并加到发酵罐中(3%,v/v)。定时取 样以便用HPLC监测生物转化活性。收获时应达到1.14g/L/hr或0.126g/g CDW/hr的生物转化速率,反式-羟基砜的终产率为1.04g/L-1,非对映异 构体过量值为96.4%。肉汤用乙酸乙酯(按0.5∶1,v/v)萃取,溶剂相用旋 转蒸发器浓缩。

                               实施例2 反式-羟基砜(5,6-二氢-4(S)-羟基-6(S)-甲基-4H-噻吩并〔2,3b〕噻 喃,7,7-二氧化物的生物转化

    将4℃保存在Sabouraud葡萄糖琼脂斜面上的接种ATCC74283细胞 在含50ml Sabouraud葡萄糖肉汤的250ml Erlenmever烧瓶中培育。于 28℃振摇下培育20小时后,将溶于乙醇中的砜-酮(33.3mg/ml)加到烧瓶 中(每个烧瓶1ml)。将培养物调回原来的条件再培育24小时。使用1 体积的氯仿萃取残留的砜-酮和生成的羟基砜。TLC和HPLC分析指示 砜-酮完全转化为反式-羟基砜。用NMR分析证实反式-羟基砜的结构:

    δ7.6(d,1H,C2-H),7.1(d,1H,C3-H),4.9(m,1H,C4-H),3.8(m,1H,C6-H), 3.5-3.0(brs,1H,OH),2.6(m,1H,C5-H),2.4(m,1H,C5-H),1.5(d,3H,C6- CH3)。

                              实施例3

    通过实施例,制备通式I的化合物〔5,6-二氢-6-(S)-丙基-4(S)-1-乙氨 基-4H-噻吩并〔2.3-b〕噻喃-2-磺酰氨-7,7-二氧化物〕表述如下:

    步骤1:方法

    在装有电磁搅拌器、热电偶探针和氮气导管的100mL园底烧瓶中将 反式-羟基砜(7.32g,29.7mmol)悬浮于乙腈(38mL)中。溶液冷至0℃,分 次加入硫酸(5ml,88.7mmol)。然后反应混合物室温搅拌。化合物冷至 0-5℃。在500mL的烧瓶中装有水(34mL)和乙腈(43mL),然后将混合物 冷至0-5℃,并充分搅拌。再将反应混合物小心地加入,使淬火温度保 持在5℃以下。加入饱和碳酸钾溶液(30mL)直至水层pH在7-8之间或 直至不再有二氧化碳逸出。有机层浓缩成粗油状物(14.1g),测定的含量 为42.5%(重量)。产率为5.99g(73%)。

    步骤2:方法

    在装有电磁搅拌和热电偶探针的100mL园底烧瓶中装入氯磺酸 (13.14mL)并冷至0-5℃。用30分钟将乙酰氨基砜(6.57g)滴加到烧瓶中, 以便保持内温度在15℃以下。黑色的反应混合物先在33℃加热16小 时,然后在50℃加热5小时。当HPLC表明存留的乙酰氨基砜(相当 于磺酸和磺酰氯)少于0.5%时,混合物冷至室温。滴加亚硫酰氯 (13.14mL)。加完后,黑色的混合物加热至45℃。16小时后磺酸的峰面 积小于0.5%。混合物冷至0-5℃。在1升的烧瓶中装水(325mL)。并冷 至0℃。将氯化的反应混合物滴加到充分搅拌的淬火溶液中,滴加时间 不得少于30分钟,以便保持内温低于5℃。混合物搅拌45分钟后过滤。 湿滤饼用冷水(10mL)洗涤并在氮气流下干燥。往装有电磁搅拌和热电偶 探针的250mL烧瓶中装浓氨水(24mL)和四氢呋喃(43mL)。混合物冷至大 约-10℃。在内温低于0℃下往里分次加粗磺酰氯的湿固体,加样时间 超过1小时。2小时后存留的磺酰氯少于18%。用盐酸水溶液(大约 50mL)中和过量的氨。水层用四氢呋喃洗涤2次。合并四氢呋喃层并浓 缩。残留物再悬浮到四氢呋喃中,并小心地加水。形成的结晶为棕色, 水溶液保持黄色。混合物过滤,结晶真空干燥。乙酰氨基磺酰氨的产量 为5.58g(66%)。

    步骤3:方法

    在250mL烧瓶中乙酰氨基磺酰氨(4.21g,11.5mmol)用四氢呋喃 (2×100mL)蒸馏进行干燥。烧瓶装有电磁搅拌,热电偶探针和氮气导管。 乙酰氨基磺酰氨与22.5mL四氢呋喃的悬浮液然后冷至0-5℃。往里滴 加甲硼烷-四氢呋喃(51mL,51mmol),内温保持在5℃以下,滴加时间45 分钟。氢气完全逸出后(20分钟),溶液升温至30-35℃。反应完全后 (3小时),混合物冷至室温。在装有电磁搅拌、热电偶探针和氮气导 管的250mL园底烧瓶中装硫酸(60mL)并冷至0-5℃。反应混合物小 心地计量并加到充分搅拌的酸溶液中,内温保持在20℃以下。加完之 后混合物在室温搅拌直至氢气释放完。然后将烧瓶装好,在1大气压下 蒸馏使混合物浓缩至蒸馏的内温高于97℃。蒸馏完毕后,混合物冷至 20℃。混合物用碳酸氢钾水溶液中和并用乙酸乙酯(100ml)萃取。有机 层浓缩得3.45g 5,6-二氢-6-(S)-丙基-4(S)-1-乙氨基-4H-噻吩并〔2,3-b〕 噻喃-2-磺酰氨7,7-二氧化物。

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    合成 反式 羟基 生物转化 方法
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