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一种鸭催乳素基因分型试剂盒.pdf

  • 上传人:伱**
  • 文档编号:8624853
  • 上传时间:2020-10-06
  • 格式:PDF
  • 页数:10
  • 大小:1.59MB
  • 摘要
    申请专利号:

    CN201420546953.3

    申请日:

    20140922

    公开号:

    CN204185487U

    公开日:

    20150304

    当前法律状态:

    有效性:

    失效

    法律详情:

    IPC分类号:

    C12M1/34,C12Q1/68

    主分类号:

    C12M1/34,C12Q1/68

    申请人:

    江苏省家禽科学研究所,江苏腾达源农牧有限公司

    发明人:

    朱文奇,李慧芳,束婧婷,陈文峰,宋卫涛,朱春红,单艳菊,宋迟,徐文娟,陶志云,张静,肖芹

    地址:

    225125 江苏省扬州市邗江区仓颉路58号

    优先权:

    CN201420546953U

    专利代理机构:

    北京东正专利代理事务所(普通合伙)

    代理人:

    张亦华

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    内容摘要

    本实用新型公开了一种鸭催乳素基因分型试剂盒,包括盒体、与盒体铰接的盒盖,盒体包括工具盒和实验盒,实验盒分为储存盒和盛放盒,盛放盒内安装管架;储存盒盒内固定隔离垫,隔离垫上开有孔腔,孔腔内分别放置用于盛放上下游引物混合物P的第一试剂瓶、用于盛放LDR探针混合物L的第二试剂瓶、用于盛放DNA?Tag酶的第三试剂瓶及用于盛放DNA连接酶的第四试剂瓶。本实用新型的有益效果为:通过使用上下游引物混合物P、LDR探针混合物L、DNA?Tag酶及DNA连接酶等试剂,利用LDR方法检测鸭催乳素多位点基因的基因型,实现了通过分子生物学技术检测出影响鸭产蛋性能的基因位点和突变,为育种提供更为完整和准确的理论依据。

    权利要求书

    1.一种鸭催乳素基因分型试剂盒,包括盒体(1)、与盒体铰接的盒盖(2),盒体包括工具盒(3)和实验盒(4),工具盒位于实验盒下方,其特征在于,实验盒分为储存盒(5)和盛放盒(6),盛放盒内安装管架(7);其中,储存盒内固定隔离垫(8),隔离垫上开有孔腔,孔腔内分别放置用于盛放上下游引物混合物P的第一试剂瓶(10)、用于盛放LDR探针混合物L的第二试剂瓶(11)、用于盛放DNA Tag酶的第三试剂瓶(12)及用于盛放DNA连接酶的第四试剂瓶(13)。 2.根据权利要求1所述的鸭催乳素基因分型试剂盒,其特征在于,管架包括底板(14)、隔板(15)及固定在底板上的支杆(16),隔板穿接在支杆上,隔板与支杆转动连接;隔板上开有插管孔(17)。 3.根据权利要求2所述的鸭催乳素基因分型试剂盒,其特征在于,盛放盒的侧板(18)内壁上开有用于限定隔板转动的限位槽(19)。 4.根据权利要求3所述的鸭催乳素基因分型试剂盒,其特征在于,盛放盒的侧板通过安装在盒体上的滑轨(20)与盒体滑动连接。 5.根据权利要求1所述的鸭催乳素基因分型试剂盒,其特征在于,工具盒与盒体滑动连接,且工具盒内放置PCR反应液管(21)。 6.根据权利要求1所述的鸭催乳素基因分型试剂盒,其特征在于,隔离垫上安装与孔腔对应的标签盒(22),标签盒内放置标签。 7.根据权利要求1所述的鸭催乳素基因分型试剂盒,其特征在于,工具盒外侧连接提手(9)。

    说明书

    技术领域

    本实用新型涉及生物技术领域,具体而言,涉及一种鸭催乳素基因分型 试剂盒。

    背景技术

    在高度工业化的现代养禽业中,就巢性已经成为影响禽类产蛋量的重要 因素。催乳素(Prolactin,PRL)是垂体前叶嗜酸细胞分泌的多肽类激素, 在家禽中,催乳素是母禽就巢孵卵行为和调控生殖活动的关键激素,近年来 的研究表明,催乳素基因是控制鸭就巢的关键基因,不同的基因型对鸭的就 巢性状指标会有不同的影响,有些会降低鸭产蛋性能,而有些又会促进产蛋 性能,所以必须利用各种分子生物学技术尽可能多的检测出影响鸭产蛋性能 的基因位点和突变,为育种提供更为完整和准确的理论依据。

    针对上述问题,现有技术一般应用连接酶检测反应(ligase detection  reaction,LDR)进行检测,连接酶检测反应是利用高温连接酶实现对基因多 态性位点的识别,通过多通道荧光定量PCR仪(Multiplex PCR)获得含有 待检测突变位点的基因片段,高温连接酶一旦检测到DNA与互补的两条寡 聚核苷酸接头对应处存在着基因点突变类型的碱基错配,则连接反应就不能 进行,最后通过测序仪电泳读取检测结果,从而得到影响鸭产蛋性能的PRL 基因位点和突变。该检测技术具有特异性高、检测快速、通用性强、适用范 围广、成本低廉等特点,因此该技术广泛被应用。

    但是,目前市场上各种应用于上述检测技术的试剂盒均没有规定成型的 结构,大多均为实验者自己设计,因此应用于该检测技术的试剂盒种类丰富, 有些试剂盒中的某些试剂具有容易氧化、见光分解或低温存放的特点,对保 存条件要求较高,另外在实验检测过程中,试剂在多次使用中容易造成交叉 污染,这样将严重影响实验的准确性,从而导致检测不够精确,另外检测时 耗时耗力,操作繁琐,检测困难。

    因此,目前尚无文献报道检测鸭催乳素基因位点和突变的试剂盒。

    实用新型内容

    为解决现有试剂盒没有规定成型的结构,大多均为实验者自己设计, 因此应用于该检测技术的试剂盒种类丰富,有些试剂盒中的某些试剂具 有容易氧化、见光分解或低温存放的等缺陷,本实用新型的目的在于提 供一种鸭催乳素基因分型试剂盒。

    为达到上述目的,本实用新型实施例中提供了一种鸭催乳素基因分 型试剂盒,包括盒体、与盒体铰接的盒盖,盒体包括工具盒和实验盒, 工具盒位于实验盒下方,实验盒分为储存盒和盛放盒,盛放盒内安装管 架;

    其中,储存盒内固定隔离垫,隔离垫上开有孔腔,孔腔内分别放置 用于盛放上下游引物混合物P的第一试剂瓶、用于盛放LDR探针混合物 L的第二试剂瓶、用于盛放DNA Tag酶的第三试剂瓶及用于盛放DNA 连接酶的第四试剂瓶。

    本技术方案中,本实用新型结构简单,将试剂、工具及管架分开放 置,防止实验中试剂存在交叉污染,另外工具盒用于盛放实验中常需的 工具或实验容器,盛放盒内放置管架,用于将实验中用到的试管放置在 管架上,操作简单,使用方便,另外上下游引物混合物P、LDR探针混 合物L、DNA Tag酶及DNA连接酶可以统一储存,便于携带,通过该试 剂盒可利用基因分子标记来检测鸭催乳素基因位点和突变,使用方便, 每次可进行多个基因的检测,提高了检测效率,检测的准确率提高。

    进一步的,管架包括底板、隔板及固定在底板上的支杆,隔板穿接 在支杆上,隔板与支杆转动连接;隔板上开有插管孔。本技术方案中, 管架用于放置试管,防止试管倾倒导致液体洒出,当试管较多时,便于 区分,管架上可以放置多个试管,清洗后的试管也可以放置在管架上, 防止试管随便放置,导致丢失。

    进一步的,盛放盒的侧板内壁上开有用于限定隔板转动的限位槽。 限位槽用于限定隔板转动,防止隔板倾斜,甚至将试管内的液体洒出等 情况的发生,操作简单,便于实验的进行。

    进一步的,盛放盒的侧板通过安装在盒体上的滑轨与盒体滑动连接。 本技术方案中,侧板通过滑轨滑动到一侧,便于将管架取出,也方便观 察试管内的反应。

    进一步的,工具盒与盒体滑动连接,且工具盒内放置PCR反应液管。 工具盒可以通过滑道、导轨、轨道等形式从盒体内抽出,类似抽屉的结 构,这样可以根据使用情况,选择所需的实验用具,使用方便,PCR反 应液管用于基因分型检测实验时使用,使用方便,操作简单。

    进一步的,隔离垫上安装与孔腔对应的标签盒,标签盒内放置标签。 在隔离垫的标签盒上放置标签,可以很方便的辨别试剂,防止实验时弄 混试剂,保证了试验的正常检测,使用方便,操作简单。

    优选的,工具盒外侧连接提手。实验时,提手更方便的将工具盒拉 开,便于操作。

    本实用新型所述的第一试剂瓶内盛放用于PRL基因PCR扩增的上下 游引物混合物P,其中P详细信息如下:

    上游引物序列5’-CTGCATCTGTGGACATTGCT-3’;

    下游引物序列5’-AGAAGCCGCTTGTTTTGTTC-3’。

    本实用新型所述的第一试剂瓶内盛放用于PRL基因LDR反应的 LDR探针混合物L,其中L表示用于LDR反应的三根探针的混合物,具 体信息如下:

    a探针序列:

    5’P-P-TACTAAATTCAGTAGGTCTTCATGCTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTTT-FAM-3’;

    b探针序列:

    5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTCCAGGAGCGCAG(CT)A CTCCCAG-3’;

    c探针序列:

    5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTCCAGGAGCGCAG(C T)ACTCCCAA-3’。

    本实用新型的有益效果为:该试剂盒结构简单,便于实验操作,另 外通过使用上下游引物混合物P、LDR探针混合物L、DNA Tag酶及DNA 连接酶等试剂,利用LDR方法检测鸭PRL多位点基因的基因型,从而实 现了通过分子生物学技术检测出影响鸭产蛋性能的基因位点和突变,为 育种提供更为完整和准确的理论依据,测试快速、准确,成本低廉,避 免了采用传统方法耗时、耗力和易出错的缺点;另外工具与试剂分开放 置,试剂瓶统一储存在储存盒内,打开即可使用,防止实验中试剂存在 交叉污染,实用性强。

    附图说明

    图1为本实用新型实施例所述的一种鸭催乳素基因分型试剂盒的立体结 构示意图;

    图2为本实用新型实施例所述的一种鸭催乳素基因分型试剂盒的结构示 意图;

    图3为本实用新型实施例所述的一种鸭催乳素基因分型试剂盒的截面 图。

    图中,

    1、盒体;2、盒盖;3、工具盒;4、实验盒;5、储存盒;6、盛放盒; 7、管架;8、隔离垫;9、提手;10、第一试剂瓶;11、第二试剂瓶;12、 第三试剂瓶;13、第四试剂瓶;14、底板;15、隔板;16、支杆;17、插管 孔;18、侧板;19、限位槽;20、滑轨;21、PCR反应液管;22、标签盒。

    具体实施方式

    下面通过具体的实施例并结合附图对本实用新型做进一步的详细描述。

    如图1所示,本实用新型实施例所述的一种鸭催乳素基因分型试剂 盒,包括盒体1、与盒体铰接的盒盖2,盒体包括工具盒3和实验盒4, 工具盒位于实验盒下方,实验盒分为储存盒5和盛放盒6,盛放盒内安装 管架7;

    其中,储存盒内固定隔离垫8,隔离垫上开有孔腔,孔腔内分别放置 用于盛放上下游引物混合物P的第一试剂瓶10、用于盛放LDR探针混合 物L的第二试剂瓶11、用于盛放DNA Tag酶的第三试剂瓶12及用于盛 放DNA连接酶的第四试剂瓶13。

    该试剂盒结构简单,使用方便,试剂、管架及工具分别放置在不同 的盒内,不仅做到了实验所有用品统一储存,而且防止实验时试剂存在 交叉污染的情况发生,另外工具清洗后统一储存,实验中通过使用上下 游引物混合物P、LDR探针混合物L、DNA Tag酶及DNA连接酶等试剂, 利用LDR方法检测PRL基因多位点的基因型,从而实现了通过分子生物 学技术检测出影响鸭产蛋性能的基因位点和突变,为育种提供更为完整 和准确的理论依据,测试精确度提高,仅通过该试剂盒即可完成基因分 型检测,提高了检测效率,省时省力,实用性强。

    如图2所示,本技术方案中,进一步所述的管架包括底板14、隔板 15及固定在底板上的支杆16,隔板穿接在支杆上,隔板与支杆转动连接; 隔板上开有插管孔17。本技术方案中,进一步所述的盛放盒的侧板内壁 上开有用于限定隔板转动的限位槽19。本技术方案中,管架用于实验中 防止试管或放置临时工具,管架上的隔板可通过支杆进行转动,便于观 察和取出试管,使用方便,操作简单,提高了实验效率,提高了实验精 度。

    如图3所示,本技术方案中,进一步所述的盛放盒的侧板通过安装 在盒体上的滑轨20与盒体滑动连接。本技术方案中,盛放盒内放置管架, 为方便取出管架进行清理,侧板可以通过安装在盒体上的滑轨滑动,然 后将盛放盒的侧板滑开,将管架取出,使用更加方便。

    本技术方案中,进一步所述的工具盒与盒体滑动连接,且工具盒内 放置PCR反应液管21。PCR反应液管用于基因分型检测实验时使用,存 放方便,实用性强,无需使用时再次寻找。

    本技术方案中,进一步所述的隔离垫上安装与孔腔对应的标签盒22, 标签盒内放置标签。本技术方案中,优选的所述工具盒外侧连接提手9。 在隔离垫的标签盒上放置标签,可以很方便的辨别试剂,防止实验时弄 混试剂,保证了试验的正常检测,在工具盒外侧连接提手,是为了便于 将工具盒打开,使用方便,操作简单。

    本实用新型所述的第一试剂瓶内盛放用于PRL基因PCR扩增的上下 游引物混合物P,其中P详细信息如下:

    上游引物序列5’-CTGCATCTGTGGACATTGCT-3’;

    下游引物序列5’-AGAAGCCGCTTGTTTTGTTC-3’。

    本实用新型所述的第一试剂瓶内盛放用于PRL基因LDR反应的 LDR探针混合物L,其中L表示用于LDR反应的三根探针的混合物,具 体信息如下:

    a探针序列:

    5’P-P-TACTAAATTCAGTAGGTCTTCATGCTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTTT-FAM-3’;

    b探针序列:

    5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTCCAGGAGCGCAG(CT)A CTCCCAG-3’;

    c探针序列:

    5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTCCAGGAGCGCAG(C T)ACTCCCAA-3’。

    本实用新型提供的试剂盒的使用方法如下:

    1、PCR扩增SNP位点所在片段:

    1)PCR扩增反应体系准备:在200μl的PCR薄壁管中,加入1μl DNA 模板(约50ng/μl)、2μl Bufer、0.6μl Mg2+(3mmol/L)、2μl dNTP(2mmol/L)、 0.3μl Tag酶(5U/μl)、0.4μl Primer 5pmmol/μl、4μl Q-solution、9.7μl ddH2O 共20μL PCR反应体系,充分混匀后短暂离心,最后加入20μl石蜡油。

    2)PCR扩增反应程序设置:在Perkin-Elmer Gene Amp PCR Systems 9600上设置PCR扩增反应程序,程序设置完毕后,将PCR反应管放入 PCR仪进行反应扩增。

    3)反应结束后,取2μl反应产物在3.0%琼脂糖胶,0.5×TBE中电 泳,检测反应是否成功。

    4)剩余反应产物在-20℃的条件下保存。

    2、PCR产物的连接酶检测反应:1)在PCR扩增产物中加入等体积 ddH2O稀释,作为连接反应的模板;2)在200μl的PCR薄壁管中,加 入1μl L,1μl 10×Buffer、1μl PCR产物、0.05μl DNA连接酶2U/μl、 6.95μl ddH2O,10μL连接酶检测反应体系,充分混匀后短暂离心,最后 加入10μl石蜡油;3)在Perkin-Elmer Gene Amp PCR Systems 9600上连 接酶检测反应程序,程序设置完毕后,将PCR反应管放入PCR仪进行连 接反应;4)在每个上样孔中加入10μl Loading Buffer,0.25μl ABI GS-500 ROX荧光标记分子量标准,最后加入0.5μl的LDR产物,充分混匀后上 样,运用ABI377测序仪进行测序胶毛细管电泳;5)应用 GENESCANTM672软件进行数据收集、泳道线校正、迁移片段大小测量 和校正内在分子量标准;应用Genemapper软件进行数据分析和基因分型。

    实验:运用本实用新型提供的试剂盒对100只7周龄的高邮鸭基因 PRL基因T3777C、A3785G SNP位点分型检测。

    1)样品:采集7周龄100只高邮鸭的血液,应用传统的苯酚/氯仿法 提取DNA,并将DNA浓度稀释到50ng/μl。

    2)PCR扩增反应及结果:PCR扩增及检测结果按照试剂盒使用方法 步骤1进行,PRL基因PCR产物大小为99bp,与预计的结果一致。如图 2,实验中主要观察PCR是否成功,对于每个位点是否好无法通过电泳观 察):MARK:100、200、300、400、500、600。

    3)PRL基因PCR扩增产物的连接酶检测反应:PRL基因PCR产物 连接酶反应按照试剂盒使用方法步骤2进行,检测后,经Genemapper数 据分析后PRL基因T3777C SNP位点的分型截图见表1,基因判型标准 为PRL基因连接产物检测出,单峰98bp±0.5bp为CC基因型。说明这批 高邮鸭的PRL基因T3777C全部为CC基因型。PRL基因A3785G SNP 位点的分型截图见表2,基因判型标准为PRL基因连接产物检测出,单 峰102bp±0.5bp为GG基因型。说明这批高邮鸭的PRL基因A3785G全 部为G G基因型。

    本实用新型涉及鸭产蛋相关基因催乳素多位点检测的基因分型试剂 盒,属于分子生物学技术领域,试剂主要特点是由催乳素基因PCR扩增 的上下游引物混合物P、PRL基因LDR反应的探针的混合物L及Tag酶、 DNA连接酶组成;利用本实用新型以LDR方法检测PRL基因的基因型, PCR扩增SNP位点所在片段,PCR产物的连接酶检测反应;PRL基因突 变对鸭的产蛋性能有显著影响,结合就巢性状进行相关分析,研究该基 因对鸭产蛋性能的影响,为鸭产蛋性能的遗传改良提供依据。

    以上所述仅为本实用新型的优选实施例而已,并不用于限制本实用 新型,对于本领域的技术人员来说,本实用新型可以有各种更改和变化。 凡在本实用新型的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进 等,均应包含在本实用新型的保护范围之内。

    关 键  词:
    一种 催乳素 基因 试剂盒
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