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本发明涉及一种多通道信号采集系统,属于数字信号处理技术领域。该系统包括:1个时钟模块,2个双通道高速数据采集模块,8个NAND存储模块,1个转存模块,1个二次底板模块,1个主控模块和1个客户端模块,能够以4路900MHz的采样率对模拟信号进行实时采集存储,具有3TB的存储容量。本发明采用NAND存储体作为存储介质,具有设备体积小、功耗低的优点,并且通过时钟使能信号、采样触发信号与采样时钟的同步化处。