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本发明公开了一种鱼油中EPA、DHA及总w-3酸含量测定的色谱方法,包括以下步骤:(1)酯化处理;(2)样品溶液配制;(3)标准品溶液配制;(4)色谱条件设定;(5)进样顺序;(6)通过待测样品与标准品的保留时间和峰面积关系进行对比,确定样品中的含量;在含有w-3脂肪酸的鱼油试样处理过程中,对不饱和脂肪酸皂化反应完成后,直接用三氟化硼甲醇溶液进行成酯反应;之后直接用含有BHT的异辛烷溶液提取不饱和。