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新型寡核苷酸缀合物及其应用.pdf

  • 上传人:le****a
  • 文档编号:5255089
  • 上传时间:2018-12-30
  • 格式:PDF
  • 页数:53
  • 大小:2.99MB
  • 摘要
    申请专利号:

    CN201280069918.0

    申请日:

    2012.12.14

    公开号:

    CN104244987A

    公开日:

    2014.12.24

    当前法律状态:

    驳回

    有效性:

    无权

    法律详情:

    发明专利申请公布后的驳回IPC(主分类):A61K 47/48申请公布日:20141224|||实质审查的生效IPC(主分类):A61K 47/48申请日:20121214|||公开

    IPC分类号:

    A61K47/48; C12N15/11; A61K9/16; A61K48/00

    主分类号:

    A61K47/48

    申请人:

    株式会社百奥尼

    发明人:

    蔡济旭; 韩宝兰; 金韩娜; 朴翰浯; 尹坪伍; 金淳基; 郑光柱; 权泰宇; 崔锺德; 李三用; 郑恩贞

    地址:

    韩国大田市

    优先权:

    2011.12.15 KR 10-2011-0135162; 2012.01.05 KR 10-2012-0001710

    专利代理机构:

    北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006

    代理人:

    徐金国

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    内容摘要

    本发明提供一种用于治疗疾病(特别是癌症)的双链RNA结构体及其制备方法,一种利用所述RNA结构体以靶向特异性方式递送双螺旋寡RNA的技术,所述双链RNA结构包括共价结合到双螺旋寡RNA以提高双螺旋寡RNA的递送的聚合物化合物,并且进一步包括结合的靶向特异性配体。由结合有配体的双螺旋寡RNA组成的纳米颗粒能够将双螺旋寡RNA有效递送至靶标,从而即使以相对较低的浓度施用双螺旋寡RNA时,也可显示双螺旋寡RNA的活性。此外,可防止双螺旋寡RNA被非特异性递送到其他器官和细胞中。因此,结合有配体的双链RNA结构体可用于治疗多种疾病,特别是癌症,并且还可被有效地用于新型的双螺旋寡RNA递送体系。特别地,结合有配体的双链RNA结构体可被有效地用于治疗包括癌症和感染性疾病的疾病。此外,本发明涉及一种杂化缀合物,一种制备所述杂化缀合物和由所述缀合物组成的纳米颗粒的方法,所述杂化缀合物包括通过简单的共价键与反义寡核苷酸(ASO)的两端结合以提高ASO的体内稳定性的亲水性材料和疏水性材料。根据本发明的ASO-聚合物缀合物可提高ASO的体内稳定性,能够有效递送治疗性ASO进入细胞。此外,即使以相对较低的浓度施用ASO-聚合物缀合物时,也可显示ASO的活性。

    权利要求书

    权利要求书
    1.  一种治疗药物-聚合物结构体,所述治疗药物-聚合物结构体具有下式1的结构并包括与之结合的配体:
    式1
    L-A-X-R-Y-B
    其中A是亲水性材料;B是疏水性材料;X和Y各自彼此独立地为简单的共价键或连接分子介导的共价键;R是治疗药物;以及L是具有通过受体介导的内吞作用(RME)来提高靶细胞的内化的特性的受体特异性配体。

    2.  如权利要求1所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述治疗药物是双螺旋寡RNA或抗癌药物。

    3.  如权利要求1所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述配体选自靶特异性抗体、适体、肽和受体特异性化学物质,所述配体特异性结合靶标并执行受体介导的内吞作用(RME)。

    4.  如权利要求3所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述受体特异性化学物质选自叶酸、N-乙酰半乳糖胺(NAG)和甘露糖。

    5.  如权利要求2所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述双螺旋寡RNA由19-31个核苷酸组成。

    6.  如权利要求2所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述双螺旋寡RNA包括修饰,所述修饰包括在一个或更多个核苷酸的糖部分的2’碳位置的-OH基被-CH3(甲基)、-OCH3、-NH2、-F(氟)、-O-2-甲氧乙基、-O-丙基、-O-2-甲硫基乙基、-O-3-氨基丙基、-O-3-二甲基氨基丙基、-O-N-甲基乙酰氨基或-O-二甲基羟氨基乙基取代;核苷酸的糖部分的氧被硫取代;将核苷酸之间的键修饰为选自由硫代磷酸酯键、磷酸硼键和甲基膦酸酯键之一或两种或更多种的组合;或修饰为PNA(肽核酸)或LNA(锁核酸)的形式。

    7.  如权利要求1所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述疏水性材料具有250-1,000的分子量。

    8.  如权利要求7所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述疏水性材料选自由类固醇衍生物、甘油酯衍生物、甘油醚、聚丙二醇、C12-C50不饱和烃或饱和烃、二酰基磷脂酰胆碱、脂肪酸、磷脂和脂多胺构成的组。

    9.  如权利要求8所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述类固醇衍生物选自由胆固醇、胆甾烷醇、胆酸、胆甾烯基甲酸酯、胆甾烷基甲酸酯和胆甾烷基胺构成的组。

    10.  如权利要求8所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述甘油酯衍生物选自甘油单酯、甘油二脂和甘油三酯。

    11.  如权利要求1所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述亲水性材料具有200-10,000的分子量。

    12.  如权利要求11所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述亲水性材料选自由聚乙二醇、聚乙烯吡咯烷酮和聚恶唑啉构成的组。

    13.  如权利要求1所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述共价键是不可降解的键或可降解的键。

    14.  如权利要求13所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述不可降解的键是酰胺键或磷酸键。

    15.  如权利要求13所述的治疗药物-聚合物结构体,其中所述可降解的键选自由二硫键、可酸降解的键、酯键、酐键、可生物降解的键或酶促降解的键构成的组。

    16.  一种制备配体缀合的双螺旋寡RNA结构体的方法,所述方法包括以下步骤:
    (1)在结合有官能团-亲水性材料的固相支持物上合成单链RNA;
    (2)将疏水性材料共价结合到结合有所述官能团-亲水性材料的单链RNA的5’端;
    (4)将官能团-RNA-聚合物结构体和单独合成的互补的单链RNA与固相支持物分离;
    (5)通过官能团将配体结合到亲水性材料的末端;以及
    (6)将结合有配体的RNA-聚合物结构体与互补的单链RNA退火以形成双链RNA结构体。

    17.  一种制备双螺旋寡RNA结构体的方法,所述方法包括以下步骤:
    (1)在固相支持物上合成单链RNA;
    (2)将亲水性材料共价结合到单链RNA的5’端;
    (3)将配体结合到与所述单链RNA结合的亲水性材料;
    (4)将结合有配体的RNA-亲水性聚合物结构体和单独合成的互补的RNA-疏水性聚合物结构体与固相支持物分离;以及
    (5)将结合有配体的RNA-亲水性聚合物结构体与互补的RNA-疏水性聚合物结构体退火以形成双链结构,
    其中所述制备方法在步骤(1)至(4)之间包括合成与步骤(1)的单链RNA互补的单链RNA,然后将疏水性材料共价结合所合成的单链RNA以合成单链RNA-疏水性聚合物结构体的步骤。

    18.  一种制备结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的方法,所述方法包括以下步骤:
    (1)在结合有官能团的固相支持物上合成单链RNA;
    (2)将亲水性材料共价结合到步骤(1)中所获得的材料;
    (3)将配体共价结合到步骤(2)中所获得的材料;
    (4)将步骤(3)中所获得的材料与固相支持物分离;
    (5)通过结合到3’端的官能团,将疏水性材料共价结合到从步骤(4)所得的材料;以及
    (6)将从步骤(5)所得的材料与互补的单链RNA退火以形成双链RNA结构体。

    19.  一种纳米颗粒,包括如权利要求1至15中任一项所述的治疗药物-聚合物结构体。

    20.  一种药物组合物,包括如权利要求1至15中任一项所述的治疗药物-聚合物结构体。

    21.  一种药物组合物,包括如权利要求19所述的纳米颗粒。

    22.  一种反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,由下式5表示:
    式5
    A-X-R-Y-B
    其中A和B的一个是亲水性材料,另一个是疏水性材料,X和Y各自彼此独立地为简单的共价键或连接分子介导的共价键,R是ASO。

    23.  如权利要求22所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述ASO由10-50个核苷酸组成。

    24.  如权利要求23所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述寡核苷酸包括修饰,所述修饰包括在一个或更多个核苷酸的糖部分的2’碳位置的-OH基被-CH3(甲基)、-OCH3、-NH2、-F(氟)、-O-2-甲氧乙基、-O-丙基、-O-2-甲硫基乙基、-O-3-氨基丙基、-O-3-二甲基氨基丙基、-O-N-甲基乙酰氨基或-O-二甲基羟氨基乙基取代;核苷酸的糖部分的氧被硫取代;将核苷酸之间的键修饰为选自由硫代磷酸酯键、磷酸硼键和甲基膦酸酯键之一或两种或更多种的组合;或修饰为PNA(肽核酸)或LNA(锁核酸)的形式。

    25.  如权利要求22所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述亲水性材料具有200-10,000的分子量。

    26.  如权利要求25所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述亲水性材料选自由聚乙二醇、聚乙烯吡咯烷酮和聚恶唑啉构成的组。

    27.  如权利要求22所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述疏水性材料具有250-1,000的分子量。

    28.  如权利要求27所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述疏水性材料是C12-C50烃或胆固醇。

    29.  如权利要求22所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述共价键是不可降解的键或可降解的键。

    30.  如权利要求29所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述不可降解的键是酰胺键或磷酸键。

    31.  如权利要求29所述的反义寡核苷酸(ASO)-聚合物缀合物,其中所述可降解的键选自由二硫键、可酸降解的键、酯键、酐键、可生物降解的键或酶促降解的键构成的组。

    32.  一种ASO-聚合物缀合物,包括结合到如权利要求22至31中任一项所述的ASO-聚合物缀合物的亲水性材料的配体。

    33.  一种制备ASO-聚合物缀合物的方法,所述方法包括以下步骤:
    (a)将亲水性材料共价结合到固相支持物上;
    (b)在包括亲水性材料的固相支持物上合成ASO;
    (c)将疏水性材料共价结合到固相支持物上的ASO的5’端;以及
    (d)从固相支持物分离并纯化所得的ASO-聚合物缀合物。

    34.  一种制备ASO-聚合物缀合物的方法,所述方法包括以下步骤:
    (a)在结合有官能团的载体上合成ASO;
    (b)将亲水性材料共价结合到所述ASO的5’端;
    (c)将结合所述亲水性材料的ASO缀合物与所述载体分离;以及
    (d)将疏水性材料共价结合到从所述载体分离的所述ASO的3’端。

    35.  一种制备包括与之连接的配体的ASO-聚合物缀合物的方法,所述方法包括以下步骤:
    (a)将亲水性材料结合连接有官能团的固相支持物;
    (b)在结合有官能团-亲水性材料的固相支持物上合成ASO;
    (c)将疏水性材料共价结合到ASO的5’端;
    (d)将步骤(c)中获得的ASO-聚合物缀合物与固相支持物分离;以及
    (e)将配体结合到从固相支持物分离的ASO-聚合物缀合物的亲水性材料。

    36.  一种制备包括与之连接的配体的ASO-聚合物缀合物的方法,所述方法包括以下步骤:
    (a)在连接有官能团的固相支持物上合成ASO;
    (b)将亲水性材料共价结合到ASO的末端;
    (c)将配体共价结合到ASO-亲水性材料缀合物;
    (d)将连接有官能团的ASO-亲水性材料-配体缀合物与固相支持物分离;以及
    (e)将疏水性材料共价结合到从固相支持物分离的缀合物的ASO的3’端。

    37.  一种纳米颗粒,包括如权利要求22至31中任一项所述的ASO-聚合物缀合物。

    38.  一种纳米颗粒,包括如权利要求32的结合有配体的ASO-聚合物缀合物。

    39.  一种药物组合物,包括药学上有效量的如权利要求22至31中任一项所述的ASO-聚合物缀合物。

    40.  一种药物组合物,包括药学上有效量的如权利要求37所述的纳米颗粒。

    41.  一种药物组合物,包括药学上有效量的如权利要求32所述的结合有配体的ASO-聚合物缀合物。

    42.  一种药物组合物,包括药学上有效量的如权利要求38所述的纳米颗粒。

    说明书

    说明书新型寡核苷酸缀合物及其应用
    技术领域
    本发明涉及一种用于治疗癌症和感染性疾病的新型寡核苷酸结构体,该结构体中结合有提高单链寡核苷酸或双链寡核苷酸递送的亲水性材料和疏水性材料,本发明还涉及该新型寡核苷酸结构体的应用。
    本发明的第一方面涉及一种包括与包含在该结构体中的亲水性材料结合的靶特异性配体的双螺旋寡RNA结构体,一种由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒,一种包括所述RNA结构体的药物组合物,一种包括由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的药物组合物,一种制备所述结构体的方法,一种制备由所述RNA结构体组成的纳米颗粒的方法和一种递送结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的技术。
    本发明的第二方面涉及一种反义寡核苷酸(以下简称“ASO”)缀合物,所述ASO缀合物包括通过简单的共价键或连接分子介导的共价键结合到ASO的两端以提高ASO的细胞内递送效率的亲水性材料和疏水性材料,一种制备所述缀合物的方法以及一种递送由ASO缀合物组成的纳米颗粒的技术。
    背景技术
    自从发现了RNA干扰(以下简称“RNAi”)的作用,人们发现RNAi在多种哺乳动物细胞上序列特异性地作用于mRNA(Silence of the transcripts:RNA interference in medicine.J Mol Med(2005)83:764–773)。当长的双链RNA被递送到细胞中时,所递送的RNA被核酸内切酶dicer加工为21-23个碱基对(bp)的小分子干扰RNA(以下简称“siRNA”)。siRNA结合RISC(RNA诱导的沉默复合体)并通过反义链识别和降解靶mRNA的过程以序列特异的方式抑制靶基因的表达(NUCLEIC-ACID THERAPEUTICS:BASIC PRINCIPLES AND RECENT APPLICATIONS.Nature Reviews Drug Discovery.2002.1,503-514)。
    Bertrand等人报道了与针对相同靶基因的反义寡核苷酸(ASO)相比,siRNA对mRNA的体内和体外表达具有优异的抑制作用,并且效果持久(Comparison of antisense oligonucleotides and siRNAs in cell culture and in vivo.Biochem.Biophys.Res.Commun.2002.296:1000-1004)。此外,由于siRNA与靶mRNA互补地结合从而以序列特异性的方式来调控靶基因的表达,因此与传统的基于抗体的药物或化学物质(小分子药物)相比,siRNA可有利地用在广泛的应用范围中(Progress Towards in Vivo Use of siRNAs.Molecular Therapy.200613(4):664-670)。
    siRNA具有优异的效果并且可有利地用在广泛的应用范围中,但为了将siRNA开发为细胞治疗剂,需要提高siRNA的稳定性和细胞内递送效率,以便将siRNA有效地递送到靶细胞中(Harnessing in vivo siRNA delivery for drug discovery and therapeutic development.Drug Discov.Today.2006Jan;11(1-2):67-73)。
    为了满足这些要求,已使用了抗核酸酶类似物或诸如病毒载体、脂质体或纳米颗粒这样的载体。
    诸如腺病毒或逆转录病毒的病毒载体具有高转染效率,但是伴随有免疫原性和致癌性的风险。然而,与病毒载体相比,包括纳米颗粒的非病毒载体被评价为具有较低的细胞内递送效率,但具有以下优点,包括:体内安全性高、靶特异性递送、RNAi寡核苷酸高效摄入并内化进入细胞或组织、低细胞毒性和免疫刺激。因此,这些非病毒载体被认为是有效抑制靶基因表达的最有前景的递送方法(Nonviral delivery of synthetic siRNAs in vivo.J.Clin Invest.2007December3;117(12):3623–3632)。
    已开发了具有各种纳米颗粒的递送体系用于肿瘤特异性递送。这种纳米颗粒体系通常被设计为表面包被有亲水性材料以增加血液中的循环时间,并带有正电荷以增加内吞作用(Active targeting schemes for nanoparticle systems in cancer therapeutics.Advanced Drug Delivery Reviews60(2008)1615–1626)。同时,与正常组织不同,肿瘤组织非常坚硬且具有扩散限制,由于该扩散限制对肿瘤所需的营养物以及诸如氧气和二氧化碳之类的废物的迁移具有不利影响,因而通过血管新生在周围区域形成血管来克服该扩散限制。通过血管新生在肿瘤组织中形成的血管具有渗漏的且有缺陷的血管,根据肿瘤的类型 不同,该血管包括尺寸从约100nm至2μm范围内的间隙。
    因此,与正常组织的结构化的毛细血管相比,纳米颗粒更容易穿过具有渗漏的且有缺陷的血管的肿瘤组织的毛细血管内皮细胞,这样纳米颗粒在血液中循环时很容易地被递送。此外,肿瘤组织无淋巴引流,因而药物在其中积累。这种机制被称为增强的渗透和滞留(EPR)效应。由于这种效应,纳米颗粒易于特异性地被递送到肿瘤组织中,而这种机制被称为被动靶向(Nanoparticles for drug delivery in cancer treatment.Urol Oncol.2008Jan-Feb;26(1):57-64)。
    为了克服体内分布、靶向的非特异性以及包括抗癌药物的治疗药物的水溶性缺乏,已进行了各种研究来优化载有治疗药物的纳米颗粒的尺寸或对表面进行修饰以增加它们在血液中的循环时间。特别地,针对包括聚合物-药物缀合物的聚合物纳米颗粒,已进行了各种研究来通过将抗癌药物与水溶性的、可生物降解的材料(诸如白蛋白、聚-L-谷氨酸(PGA)或N-(2-羟丙基)-甲基丙烯酰胺共聚物)连接而提高抗癌药物的肿瘤特异性递送(Therapeutic Nanoparticles for Drug Delivery in Cancer.Clin Cancer Res2008;14:1310-1316)。此外,已进行了各种研究来将两亲性材料与抗癌药物连接,以形成由抗癌药物的疏水性核和亲水性壳组成的聚合物胶束(Development of the polymer micelle carrier system for doxorubicin.J Control Release2001;74:295-302)。
    因此,当疏水性材料被额外地结合到诸如抗癌药物的治疗药物以增加核的内聚力时,即使在低浓度下也可以形成胶束,并且由于壳的亲水性材料而可以形成稳定性增加的聚合物胶束。通过可生物降解的键在两端结合有疏水性材料和亲水性材料的治疗药物可形成改良的聚合物胶束,从而能够将治疗药物稳定地递送到目标癌组织中。
    近来,作为递送双链寡RNA结构体的技术,开发了基于结合到核酸末端的材料特性而形成的自组装纳米颗粒SAMiRNA技术(韩国专利公开No.2009-0042297)。SAMiRNA是由双链寡RNA结构体组成的自组装纳米颗粒,所述双链寡RNA结构体结合有提高双链寡RNA的递送的亲水性材料和疏水性材料,用于形成SAMiRNA的技术可以是用于提高双链寡RNA的细胞内递送的技术。
    研究发现,当将标记有荧光标签的SAMiRNA施用到肿瘤异种移植小鼠模型的尾部静脉时,纳米颗粒通过上述被动靶向被特异性地递送到肿瘤中(参见图2)。
    同时,主动靶向利用其中结合有靶向部分的纳米颗粒。据报道,靶向部分导致纳米颗粒在靶组织中优先积累或提高纳米颗粒内化进入靶细胞(Does a targeting ligand influence nanoparticle tumor localization or uptake Trends Biotechnol.2008Oct;26(10):552-8.Epub2008Aug21)。
    主动靶向是指采用诸如抗体或配体的靶向部分与纳米颗粒结合来提高纳米颗粒向靶细胞的递送。近年来,已进行了各种研究以采用与siRNA结合的各种靶向部分将siRNA定位到所需组织。
    例如,研究发现,结合有α-生育酚的siRNA在体内被有效地、稳定地递送并通过RNA干扰来抑制靶基因的表达(Kazutaka Nishina et al.,The American Society of Gene therapy,2008,16(4):734-740)。此外,研究表明,与主要用于递送siRNA的细胞穿透肽(CCP)相比,结合有胆固醇的siRNA被更有效地递送到肝组织中(US-20060014289;Moschos S.A.et al.,Bioconjug.Chem.18:1450-1459)。据报道,引起递送效果的原因不仅是肿瘤组织的特异性,还有被所结合的靶向部分定向的细胞的特异性。
    主动靶向利用能够结合对靶细胞表面特异性的或在靶细胞表面上过表达的碳水化合物、受体或抗原的材料(Nanotechnology in cancer therapeutics:bioconjugated nanoparticles for drug delivery.Mol Cancer Ther2006;5(8):1909-1917)。因此,结合有主动靶向部分的纳米颗粒在血液中循环时通过被动靶向在肿瘤组织中积累,并且通过靶向部分促进纳米颗粒向靶细胞的递送,从而提高了被递送到细胞中的药物的治疗效果。作为靶向部分,主要采用配体或抗体。靶向部分与它在细胞表面上的受体以高亲和力和特异性结合并通过受体介导的内吞作用(RME)促进纳米颗粒的内化(Kinetic analysis of receptor-mediated endocytosis(RME)of proteins and peptides:use of RME as a drug delivery system.J Control Release1996;39:191-200)。
    由该配体或抗体靶向的细胞表面受体或抗原的特征在于它对靶细胞是特异性的或在靶细胞中过表达,以便于靶向配体的进入,从而提高内吞作用率。此外,受体或抗原将其中结合有配体的纳米颗粒递送到细胞中,并循环回到 细胞表面(Receptor-mediated endocytosis:An overview of a dynamic process.J.Biosci.,Oct.1984,6(4),pp.535-542.)。肿瘤靶向部分是这样的材料,其特异性地结合在靶细胞系中特异性地表达的受体(如表皮生长因子或低密度脂蛋白受体),或结合已知在各种肿瘤细胞的表面上过表达的肿瘤特异性受体(如叶酸受体)(Nanotechnology in cancer therapeutics:bioconjugated nanoparticles for drug delivery.Mol Cancer Ther2006,5(8):1909-1917)。
    如果靶向部分(特别是通过受体介导的内吞作用(RME)来提高内化的受体特异性配体)与SAMiRNA结合,则可有效地促进SAMiRNA递送到靶细胞(特别是肿瘤细胞)中,因此SAMiRNA即使在相对低的浓度和剂量下也可被递送到靶细胞中,这样双链寡RNA可显示出较高的活性,并且可抑制双链寡RNA向其他器官和细胞非特异性递送。
    此外,SAMiRNA形成技术不仅可应用于双链寡RNA,而且也可应用于单链寡核苷酸,特别是用于治疗目的的单链反义寡核苷酸(ASO)。
    ASO技术是通过采用单链RNA或DNA改变mRNA的代谢来控制信息从基因到蛋白质的传递的技术。换句话说,ASO技术是采用选定的与蛋白质互补地并特异性地杂交的核苷酸序列来优先抑制目的蛋白质表达的技术。由于ASO以序列特异性的方式与靶基因结合,因而不会影响除了靶基因之外的基因的表达。因此,ASO技术可作为有用的工具来分析特异性蛋白质的体内作用,并且还可用于针对特定疾病的基因治疗(FASEBJ.9,1288-1296,1995)。
    近年来,开发了一种新型的单链反义寡核苷酸——antagomir,并已将其用于抑制细胞中microRNA的功能。已知antagomir或microRNA抑制剂(miRNA抑制剂)是互补地结合靶microRNA以抑制microRNA功能的化学合成的短RNA。antagomir优选地具有诸如2’甲氧基或硫代磷酸酯这样的修饰的化学结构,以防止antagomir的降解。目前,抑制与包括癌症、心脏和肺纤维化在内的多种疾病相关的miRNA功能的antagomir是已知的("Silencing of microRNAs in vivo with'antagomirs'"Nature,Dec.2005,438(7068):685-689;"MicroRNAs as Therapeutic Targets"New England J.Medicine,2006,354(11):1194-1195;Meister G.et al.,"Sequence-specific inhibition of microRNA-and siRNA-induced RNA silencing"RNA,Mar.2004,10(3):544-550)。
    反义DNA与靶mRNA结合以形成RNA/DNA双链,所述RNA/DNA双链在体内被RNase H(一种特异性地降解其中形成有RNA/DNA杂化双链的mRNA的核糖核酸酶)降解。反义RNA形成RNA/RNA双链,并且靶mRNA的降解是由RNase L诱导的。RNase L是优先降解双链RNA周围的单链RNA的核糖核酸酶(Pharmacol.Toxicol.32,329-376,1992)。
    然而,包括miRNA抑制剂antagomir的ASO应被有效地递送到靶细胞中以达到所需效果,并且ASO在血液中可被核糖核酸酶降解。因此,为了将ASO用于治疗目的,ASO缀合物应被有效地递送通过细胞膜,并应确保ASO在体内的稳定性(Shigeru Kawakami and Mitsuru Hashida,Drug Metab.Pharmacokinet.22(3):142-151,2007)。
    因此,为了体内稳定性,大多数ASO呈通过提供核酸酶抗性的各种修饰而获得的寡聚脱氧核苷酸(ODN)的形式。所述修饰可以是在一个或多个核苷酸的糖部分的2’碳位置的-OH基被-CH3(甲基)、-OCH3、-NH2、-F(氟)、-O-2-甲氧乙基、-O-丙基、-O-2-甲硫基乙基、-O-3-氨基丙基、-O-3-二甲基氨基丙基、-O-N-甲基乙酰氨基或-O-二甲基羟氨基乙基取代;核苷酸的糖部分的氧被硫取代;将核苷酸之间的键修饰为硫代磷酸酯键、磷酸硼键或甲基膦酸酯键;或以上一种或多种修饰的组合;或修饰为PNA(肽核酸)或LNA(锁核酸)的形式(参见Crooke et al.,Ann.Rev.Med.Vol.55:pp61-652004,US5,660,985,US5,958,691,US6,531,584,US5,808,023,US6,326,358,US6,175,001Braasch D.A.et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.14:1139-1143,2003;Chiu Y.L.et al.,RNA,9:1034-1048,2003;Amarzguioui M.et al.,Nucleic Acid Res.31:589-595,2003)。
    为了将ASO递送到靶细胞中,发展了利用诸如腺病毒或逆转录病毒之类的病毒的基因递送技术和利用诸如脂质体、阳离子型脂质或阳离子型聚合物之类的非病毒载体的基因递送技术。然而,病毒载体在安全性方面存在问题,这是因为不能确保这些载体在整合到宿主染色体之后不会造成宿主基因的正常功能的异常,或不会激活癌基因。此外,如果病毒基因即使以低水平持续表达而导致自身免疫性疾病或如果病毒载体引起改性病毒感染,ASO也不能被有效地递送。
    为克服这些问题,已研究了将基因融合到非病毒载体脂质体的方法或采 用阳离子型脂质或阳离子型聚合物的方法来克服上述缺点。虽然这些非病毒载体不及病毒载体有效,但是它们具有以下优点:它们在体内安全、副作用较少并且可以以低成本生产(Lehrman S.Nature.401(6753):517-518,1999)。
    为了有效地实现采用非病毒载体稳定递送包括ASO的ODN分子,需要一种有效的防止酶促降解或非酶促降解的方法。因此,提出了通过化学修饰ASO来使得ASO对核酸酶稳定并增加ASO的细胞内吸收的方法(Shigery Kawakami and Mitsuru Hashida.Drug Metab.Parmacokinet.22(3):142-151,2007)。
    同时,包括PEG(聚乙二醇)的聚合物通过它们之间的相互作用自发形成具有胶束结构的复合物,这些复合物被称为聚合物复合胶束(Kataoka K.et al.Macromolecules,29:8556-8557,1996)。这些聚合物复合胶束的优点在于相比于诸如微球体或纳米颗粒的其他药物递送体系,它们具有非常小的尺寸同时其分布非常均匀,并且它们是自发形成的,使得容易控制制剂的质量并确保再现性。
    近年来,为了增加ASO的细胞内递送效率,发展了通过简单的共价键或连接分子介导的共价键将亲水性材料(如生物相容性聚合物PEG)与ASO结合来确保ASO的稳定性并使ASO有效渗透通过细胞膜的技术(韩国专利登记No.0466254)。然而,仅通过化学修饰和聚乙二醇化难以实现提高ASO的体内稳定性并确保ASO有效递送到靶组织中。
    如上所述,发展了通过将疏水性材料和亲水性材料引入siRNA而获得的纳米颗粒来提高siRNA的细胞内递送的SAMiRNA技术,但是尚未报道将该技术应用到ASO的递送。因此,需要开发一种ASO递送体系及其制备方法,通过将各种化学修饰引入ASO并将各种聚合物与ASO缀合以保护ASO不受酶的影响,从而使ASO的稳定性增加并有效渗透通过细胞膜。
    发明内容
    根据本发明的第一方面:
    本发明的一个目的在于提供一种治疗药物结构体、一种由所述治疗药物结构体组成的纳米颗粒及其制备方法,所述治疗药物结构体包括亲水性材料和疏水性材料,所述亲水性材料和疏水性材料是通过简单的共价键或连接分 子介导的共价键结合治疗药物的两末端以提高治疗药物的细胞内递送效率的生物相容性的聚合物化合物,所述治疗药物结构体进一步包括与亲水性材料结合的配体。
    本发明的另一个目的在于提供一种双螺旋寡RNA结构体,其包括通过简单的键或连接分子介导的共价键结合双螺旋寡RNA的两末端以提高双螺旋寡RNA的细胞内递送效率的生物相容性的亲水性聚合物材料和疏水性聚合物材料,所述双螺旋寡RNA结构体进一步包括与亲水性材料结合的受体特异性配体,所述受体特异性配体具有通过受体介导的内吞作用(RME)来提高靶细胞(特别是肿瘤细胞)的内化的特性;一种由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒;和一种药物组合物,所述药物组合物包括结合有配体的双螺旋寡RNA结构体或者包括由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒。
    本发明的再另一目的是提供一种制备结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的方法和制备包括由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的方法,和一种采用结合有配体的双螺旋寡RNA结构体来递送双螺旋寡RNA的技术。
    当靶特异性配体与双螺旋寡RNA结构体结合时,由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒可被有效地递送到靶细胞中。因此,即使当以相对较低的浓度施用结合有配体的双螺旋寡RNA结构体时,也可在靶细胞中展现双螺旋寡RNA的活性。此外,由于结合的配体可防止双螺旋寡RNA被非特异性地递送到其他器官和细胞中,因而结合有配体的双螺旋寡RNA结构体可用于治疗多种疾病且还可被有效地用于新型的双螺旋寡RNA递送体系。特别地,结合有配体的双螺旋寡RNA结构体可被有效地用于治疗包括癌症和感染性疾病的疾病。
    根据本发明的第二方面:
    本发明的一个目的在于提供一种ASO-聚合物缀合物及其制备方法,所述ASO-聚合物缀合物包括通过简单的共价键或连接分子介导的共价键结合ASO的两端以提高ASO的细胞内递送效率的生物相容性的亲水性聚合物材料和疏水性聚合物材料。
    本发明的另一个目的是提供一种利用由ASO-聚合物缀合物组成的纳米 颗粒来递送ASO的技术和一种药物组合物,所述药物组合物包括ASO-聚合物缀合物或者包括由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒。
    根据本发明的ASO-聚合物缀合物和由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒可提高ASO的体内稳定性,使得能够有效地将治疗药物ASO递送到细胞中。此外,即使在没有转染剂的情况下,相比于末端未修饰的ASO,它们也可在相对低的浓度下展现ASO的活性。因此,ASO-聚合物缀合物和由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒可用于治疗包括癌症和感染性疾病的多种疾病,并且还可在基础生物工程研究和医药工业中被非常有效地用于新型的ASO递送体系。
    附图说明
    图1是由结合有配体的双螺旋寡RNA结构组成的纳米颗粒(SAMiRNA)的示意图。
    图2示出了SAMiRNA的肿瘤特异性递送。图2(A)是示出在将Cy5.5标记的SAMiRNA以5mg/kg体重的剂量施用到肿瘤移植的小鼠的尾部静脉一次之后,SAMiRNA随时间的生物分布的照片(由红色虚线标示的部分是肿瘤移植部分)。图2(B)是在施用SAMiRNA之后48小时收集的各组织的活体外(ex vivo)照片。
    图3示出了1,3,4,6-四乙酰基-NAG(化合物A)的NMR分析结果。1H NMR(300MHz,DMSO-D6);δ7.89ppm(1H,d,J=9.3Hz),5.64ppm(1H,d,J=8.7Hz),5.27ppm(1H,d,J=3.3Hz),5.07ppm(1H,dd,J=11.7,3.6Hz),4.22ppm(1H,t,J=6.3Hz),4.14-3.96ppm(2H,m),2.12ppm(3H,s),2.04ppm(3H,s),1.99ppm(3H,s),1.91(3H,s),1.78ppm(3H,s)。
    图4示出了3,4,6-三乙酰基-1-六(乙二醇)-N-乙酰半乳糖胺(NAG)(化合物B)的NMR分析结果。1H NMR(300MHz,DMSO-D6);δ7.71ppm(1H,d,J=9.3Hz),5.21ppm(1H,d,J=3.0Hz),4.97ppm(1H,dd,J=11.1,3.0Hz),4.56ppm(1H,d,J=8.7Hz),3.88ppm(1H,q,J=8.7Hz),3.83-3.74ppm(1H,m),3.62-3.39ppm(25H,m),2.10ppm(3H,s),2.01ppm(3H,s),1.89ppm(3H,s),1.77ppm(3H,s)。
    图5示出了1-六(乙二醇)-NAG-亚磷酰胺(化合物C)的NMR分析结果。 (A)1H NMR(300MHz,DMSO-D6);δ7.78ppm(1H,d,J=9.3Hz),5.21ppm(1H,d,J=3.0Hz),4.97ppm(1H,dd,J=11.1,3.6Hz),4.56ppm(1H,d,J=8.1Hz),3.88ppm(1H,d,J=9.0Hz),3.81-3.41ppm(30H,m),2.89ppm(2H,t,J=5.7Hz),2.11ppm(3H,s),2.00ppm(3H,s),1.89ppm(3H,s),1.77ppm(3H,s),1.20-1.12ppm(12H,m),(B)31P NMR数据(121MHz,DMSO-D6);δ147.32ppm。
    图6示出了制备单链RNA的过程。
    图7示出了制备包括结合到双螺旋寡RNA的5’端的PEG的双螺旋寡RNA结构体的过程和所述RNA结构体的分析结果。图7(A)示出了利用PEG-亚磷酰胺将PEG结合到双螺旋寡RNA的过程,图7(B)示出了5’端未修饰的单链RNA(21聚体)的MALDI-TOF MS分析结果(SEQ ID NO:1;MW6662.1),图7(C)示出了在5’端结合有PEG的单链RNA(21聚体)的MALDI-TOF MS分析结果(SEQ ID NO:1;MW6662.1)。
    图8示出了制备单-NAG-PEG-RNA结构体的过程和该结构体的分析结果。图8(A)示出了利用N-乙酰半乳糖胺-亚磷酰胺将N-乙酰半乳糖胺(NAG)结合到PEG-RNA的过程,图8(B)示出了NAG-PEG-RNA结构体(蓝色,MW9171.2)的MALDI-TOF MS分析结果,该结构体包括与PER-RNA(绿色,MW8624.1)结合的N-乙酰半乳糖胺,并示出了中央峰移动了N-乙酰半乳糖胺的分子量(MW547)。
    图9示出了制备三-NAG-PEG-RNA结构体的过程和该结构体的分析结果。图9(A)示出了采用树枝状聚合物亚磷酰胺和NAG-亚磷酰胺将N-乙酰半乳糖胺结合到PEG-RNA的过程,图9(B)示出了PEG-RNA结构体(绿色,MW8624.1)的MALDI-TOF MS分析结果,以及包括结合有N-乙酰半乳糖胺的单-NAG-PEG结构体(蓝色,MW9171.2)和三-NAG-PEG-RNA结构体(红色,MW10630)的MALDI-TOF MS分析结果。
    图10示出了制备5’叶酸-PEG-RNA结构体的过程和该结构体的分析结果。图10(A)示出了通过NHS-叶酸将叶酸结合到PEG-RNA的过程,图10(B)示出了PEG-RNA(绿色,MW8624.1)和叶酸-PEG-RNA结构体(蓝色,MW9277.8)的MALDI-TOF MS分析结果,并示出了中央峰移动了叶酸的分子量(MW615)。
    图11示出了5’C24-RNA结构体的分析结果。图11(A)示出了与SEQ ID NO:1互补的单链RNA(MW7349.5)的MALDI-TOF MS分析结果,图11(B)示出了与SEQ ID NO:1互补的5’C24-RNA结构体(MW7830.2)的MALDI-TOF MS分析结果。
    图12示出了通过胺基-CPG制备3’CPG-胺基-PEG-RNA结构体的过程。
    图13示出了通过胺基-CPG制备3’CPG-胺基-PEG-RNA-C24结构体的过程。
    图14示出了制备3’叶酸-PEG-RNA结构体的过程和该结构体的分析结果。图14(A)示出了通过NHS-叶酸将叶酸结合到3’胺基-PEG-RNA结构体的过程;图14(B)示出了3’叶酸-PEG-RNA结构体(SEQ ID NO:1;MW9277.7)的MALDI-TOF MS分析结果。
    图15示出了由5’叶酸-RNA-聚合物结构体组成的纳米颗粒(叶酸-SAMiRNA)的物理性质的分析结果。图15(A)是示出叶酸-SAMiRNA的尺寸和多分散指数(PDI)的图表,图15(B)是示出叶酸-SAMiRNA的临界胶束浓度的图表。
    图16示出了叶酸-SAMiRNA对过表达叶酸受体的细胞系中的靶基因的表达的抑制效果。在用叶酸-SAMiRNA和SAMiRNA处理之后48小时通过qPCR测量过表达叶酸受体的肿瘤细胞系KB中的靶基因mRNA的水平。在图16中,培养基中不含叶酸:无叶酸的条件;培养基中含叶酸:包含过量(1mM)叶酸的条件;Con:用由包括序列SEQ ID NO:2(对照序列)的双螺旋寡RNA-聚合物结构体组成的纳米颗粒SAMiRNA-Con处理的试验组;SAM:用由包括序列SEQ ID NO:1(存活蛋白序列)的双螺旋寡RNA-聚合物结构体组成的纳米颗粒SAMiRNA-Sur处理的试验组;叶酸-SAM:用由包括序列SEQ ID NO:1(存活蛋白序列)并结合有叶酸配体的叶酸-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒叶酸-SAMiRNA-Sur处理的试验组。
    图17示出了叶酸-SAMiRNA对肿瘤组织中的靶基因表达的抑制效果。在将SAMiRNA和叶酸-SAMiRNA各以5mg/kg体重的剂量施用到具有由过表达叶酸受体的KB肿瘤细胞系组成的肿瘤的小鼠尾部静脉一次之后48小时或72小时,通过qPCR测量肿瘤组织中的靶基因(存活蛋白)的mRNA水平。在图17中,PBS:阴性对照;SAMiRNA:施用由包括序列SEQ ID NO: 1(存活蛋白序列)并且未结合叶酸配体的双螺旋寡RNA-聚合物结构体组成的纳米颗粒SAMiRNA-Sur的组;叶酸-SAMiRNA:施用结合有叶酸配体的SEQ ID NO:1(存活蛋白序列)的纳米颗粒叶酸-SAMiRNA-Sur的组。
    图18是包括ASO-聚合物缀合物的纳米颗粒的示意图。
    图19示出了根据本发明的ASO和ASO-聚合物缀合物各自的MALDI-TOF MS谱。四种核苷酸在两末端(5’端和3’端)处用2-OCH3(甲氧基)修饰,“m”表示OCH3(甲氧基)基团。图19(A)示出了ASO(M.W.5967.9Da)的MALDI-TOF数据,图19(B)示出了ASO-聚合物缀合物(M.W.8448Da)的MALDI-TOF数据。
    图20示出了由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的物理性质的分析结果。图20(A)是示出由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的尺寸和多分散指数(PDI)的图表;图20(B)是示出由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的临界胶束浓度的图表。
    图21示出了在不同处理浓度(10nM、50nM和100nM)下,mRNA表达水平的分析结果,以检验ASO和ASO-聚合物缀合物对肿瘤细胞中的靶基因表达的抑制效果。加扰:序列SEQ ID NO:4(对照序列)的ASO;存活蛋白:序列SEQ ID NO:3(存活蛋白序列)的ASO;ASO:未结合材料的ASO;ASO-聚合物缀合物:呈3’PEG-ASO-5’脂质形式的ASO-聚合物缀合物。
    用于实施本发明的最佳实施方式
    1.本发明的第一方面
    在本发明的第一方面中,术语“反义链”是指在RISC(RNA诱导的沉默复合体)中表现出RNAi活性以结合并降解靶mRNA的链,术语“有义链”是指具有与反义链互补的序列的链。
    如在此使用的,术语“互补的”或“互补结合”是指两序列彼此结合以形成双链结构。不仅包括两序列之间的完全匹配,还包括两序列之间的错配。
    本发明提供一种具有下式1的结构并且结合有配体的治疗药物-聚合物结构体:
    式1
    L-A-X-R-Y-B
    其中A是亲水性材料;B是疏水性材料;X和Y各自独立地为简单的共价键或连接分子介导的共价键;R是治疗药物;L是具有通过受体介导的内吞作用(RME)来提高靶细胞的内化特性的受体特异性配体。
    在这里,治疗药物可选自抗癌药物、双螺旋寡RNA、抗病毒药物、甾体类抗炎药(SAID)、非甾体类抗炎药(NSAID)、抗生素、抗真菌剂、维生素、激素、视黄酸、前列腺素、前列腺环素、抗代谢剂、微生物(micotics)、胆碱激动剂、肾上腺素拮抗剂、抗惊厥药、抗焦虑药、镇静剂、抗抑郁药、麻醉剂、镇痛剂、合成代谢类固醇、雌激素、黄体酮、粘多糖、多核苷酸、免疫抑制剂和免疫刺激剂。
    在本发明中,治疗药物优选为双螺旋寡RNA或抗癌药物。如果治疗药物是双螺旋寡RNA,则亲水性材料可结合到双螺旋寡RNA的3’端或5’端。
    在本发明的结合有配体的治疗药物-聚合物结构体中,配体可额外地结合到与双螺旋寡RNA或抗癌药物结合的亲水性材料的特定位置(特别是末端)。配体可选自靶受体特异性抗体、能够以高亲和力和特异性结合到靶分子的单链核酸(DNA、RNA或修饰的核酸)、肽或化学物质,所述化学物质包括叶酸(在此使用的术语“叶酸”是指在自然界或人体中有活性的叶酸)、N-乙酰半乳糖胺(NAG)和甘露糖,配体具有通过RME与受体特异性地结合以提高靶细胞的内化的特性。在这里,配体是以靶受体特异性方式执行递送的物质,且并不仅仅限于上述抗体、适体、肽和化学物质。
    双螺旋寡RNA优选由19-31个核苷酸组成。本发明中使用的双螺旋寡RNA可以是针对任何用于或可用于基因治疗或基因研究的基因的任何双螺旋寡RNA。
    疏水性材料通过疏水相互作用形成由双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒。在疏水性材料中,碳链或胆固醇非常适合用于制备本发明的结构体,因为在合成双螺旋寡RNA的步骤中,碳链或胆固醇可以很容易地结合。
    疏水性材料优选具有250-1,000的分子量。特别地,本发明中使用的疏水性材料可以是类固醇衍生物、甘油酯衍生物、甘油醚、聚丙二醇、C12-C50不饱和烃或饱和烃、二酰基磷脂酰胆碱、脂肪酸、磷脂、脂多胺或类似材料,但并不限于此,对本领域技术人员显而易见的是,可以使用适于本发明的目的的任何疏水性材料。
    特别地,类固醇衍生物可选自由胆固醇、胆甾烷醇、胆酸、胆甾烯基甲酸酯、胆甾烷基甲酸酯和胆甾烷基胺构成的组,甘油酯衍生物可选自甘油单酯、甘油二脂和甘油三酯,其中甘油酯的脂肪酸可以是C12-C50不饱和脂肪酸或饱和脂肪酸。
    此外,亲水性材料优选地为具有200-10,000的分子量的阳离子聚合物或非离子型聚合物,更优选地为具有1,000-2,000的分子量的非离子型聚合物。例如,本发明中使用的亲水性材料优选为诸如聚乙二醇、聚乙烯吡咯烷酮或聚恶唑啉的非离子型亲水性聚合物化合物,但不限于此。
    必要时,可对亲水性材料进行修饰以具有结合到配体所需的官能团。在亲水性材料中,特别是聚乙二醇(PEG)可具有多种分子量和官能团,具有良好的生物相容性,不诱导免疫反应,提高双螺旋寡RNA的体内稳定性,并提高RNA的递送效率,因此非常适于制备本发明的双螺旋寡RNA结构体。
    对介导共价键的连接分子没有特别限制,只要在亲水性材料(或疏水性材料)与双螺旋寡RNA的末端之间形成共价键,并提供在必要时可在特定环境中被降解的键。因此,连接分子可包括在制备所述结构的过程中将亲水性材料(或疏水性材料)结合到双螺旋寡RNA的任何化合物。
    此外,共价键可以是不可降解的键或可降解的键。在这里,不可降解的键包括但不限于酰胺键或磷酸键,可降解的键包括但不限于二硫键、可酸降解的键、酯键、酐键、可生物降解的键或酶促降解的键。
    本发明提供一种由下式2表示的缀合有配体的双螺旋寡RNA结构体,所述结构体包括结合到双螺旋寡RNA的有义链的3’端的亲水性材料、结合到亲水性材料的配体和结合到有义链的5’端的疏水性材料:
    式2
    B-X-5’S  3’–Y–A-L
           AS
    其中A是亲水性材料;B是疏水性材料;X和Y各自独立地为简单的共价键或连接分子介导的共价键;S是双螺旋寡RNA的有义链;AS是双螺旋寡RNA的反义链;L是具有通过受体介导的内吞作用(RME)来提高靶细胞的内化特性的受体特异性配体。
    一种制备由式2表示的缀合有配体的双螺旋寡RNA结构体的方法包括 以下步骤:
    (1)在结合有官能团-亲水性材料的固相支持物上合成单链RNA;
    (2)将疏水性材料共价结合到结合有官能团-亲水性材料的单链RNA的5’端;
    (4)将官能团-RNA-聚合物结构体和单独合成的互补的单链RNA与固相支持物分离;
    (5)通过官能团将配体结合到亲水性材料的末端;以及
    (6)将结合有配体的RNA-聚合物结构体与互补的单链RNA退火以形成双链RNA结构。
    在本发明的更优选的实施方式中,所述方法可包括以下步骤:(1)将亲水性材料结合到结合有官能团的固相支持物(CPG)上;(2)在结合有官能团-亲水性材料的固相支持物(CPG)上合成单链RNA;(3)将疏水性材料共价结合到单链RNA的5’端;(4)将官能团-RNA-聚合物结构体和单独合成的互补单链RNA与固相支持物(CPG)分离;(5)通过官能团将配体结合到亲水性材料的末端以制备结合有配体的RNA-聚合物结构体;以及(6)将结合有配体的RNA-聚合物结构体与互补的单链RNA退火,以形成结合有配体的双螺旋寡RNA结构体。在步骤(6)之后,可通过高效液相色谱法(HPLC)将RNA-聚合物结构体和互补的单链RNA从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF质谱仪测量分子量以确定是否制备了所需的RNA-聚合物结构体和RNA。在上述制备方法中,合成与在步骤(3)中合成的单链RNA互补的单链RNA的步骤可在步骤(1)之前执行或在步骤(1)至(6)的任何一个步骤中执行。
    在另一个实施方式中,本发明提供了一种下式3表示的结合有配体的双螺旋寡RNA结构体,所述结构体包括结合到双螺旋寡RNA的有义链的5’端的亲水性材料、结合到亲水性材料的配体和结合到有义链的3’端的疏水性材料:
    式3
    L-A–X-5’S  3’–Y–B
          3’AS  5’
    一种制备由式3表示的结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的方法包括以下步骤:
    (1)在结合有官能团的固相支持物上合成单链RNA;
    (2)将亲水性材料共价结合到步骤(1)中所获得的材料;
    (3)将配体共价结合到步骤(2)中所获得的材料;
    (4)将步骤(3)中所获得的材料与固相支持物分离;
    (5)通过结合到3’端的官能团将疏水性材料共价结合到从步骤(4)所得的材料;以及
    (6)将从步骤(5)所得的材料与互补的单链RNA退火,以形成双链RNA结构体。
    在更优选的实施方式中,所述制备方法可包括以下步骤:(1)在结合有官能团的固相支持物(CPG)上合成单链RNA;(2)将亲水性材料共价结合到单链RNA的5’端;(3)将配体结合到与单链RNA结合的亲水性材料上以合成官能团-RNA-亲水性材料聚合物结构体;(4)将官能团-RNA-亲水性材料聚合物结构体与固相支持物(CPG)分离;(5)经由官能团将疏水性材料结合到RNA上以合成结合有配体的RNA-聚合物结构体;以及(6)将所制备的RNA-聚合物结构体与互补的单链RNA退火,以制备双螺旋寡RNA-聚合物结构体。
    在步骤(5)之后,可通过高效液相色谱法(HPLC)将RNA从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF质谱仪测量分子量以确定是否制备了所需的RNA-聚合物结构体和RNA。在上述制备方法中,合成与步骤(1)中合成的单链RNA互补的单链RNA的步骤可在步骤(1)之前执行或在步骤(1)至(6)的任何一个步骤中执行。
    在另一个实施方式中,本发明提供了一种下式4表示的结合有配体的双螺旋寡RNA结构体,所述结构体包括结合到双螺旋RNA的有义链和反义链的5’端的亲水性材料或疏水性材料:
    式4
    L-A–X-5’S  3’
           3’AS  5’–Y–B
    其中A是亲水性材料;B是疏水性材料;X和Y各自独立地为简单的共价键或连接分子介导的共价键;S是双螺旋寡RNA的有义链;AS是双螺旋寡RNA的反义链;L是具有通过受体介导的内吞作用(RME)来提高靶细胞的内化特性的受体特异性配体。
    一种制备由式4表示的双螺旋寡RNA结构体的方法包括以下步骤:
    (1)在固相支持物上合成单链RNA;
    (2)将亲水性材料共价结合到单链RNA的5’端;
    (3)将配体结合到与单链RNA结合的亲水性材料;
    (4)将结合有配体的RNA-亲水性聚合物结构体和单独合成的互补的RNA-疏水性聚合物结构体与固相支持物分离;以及
    (5)将结合有配体的RNA-亲水性聚合物结构体与互补的RNA-疏水性聚合物结构体退火,以形成双链结构。
    在步骤(1)至(4)之间,所述制备方法包括合成与步骤(1)的单链RNA互补的单链RNA,然后将疏水性材料结合到合成的单链RNA,以合成单链RNA-疏水性聚合物结构体的步骤。
    本发明还提供一种包括结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的纳米颗粒和一种包括结合有配体的治疗药物-聚合物结构体的纳米颗粒。
    纳米颗粒是通过本发明的结合有配体的双螺旋寡RNA结构体之间的相互作用而形成的。具体地,纳米颗粒形成为具有以下结构:疏水性材料位于纳米颗粒的中心,双螺旋寡RNA被外部的亲水性材料保护,配体位于纳米颗粒的表面上(参见图1)。纳米颗粒通过配体将双螺旋寡RNA递送进入细胞,从而以提高的效率将RNA递送到细胞中。这种纳米颗粒可用于治疗疾病。包括所述结构的纳米颗粒的结构合成和特征、细胞内递送效率和效果将在以下实施例中进一步详细描述。
    本发明还提供一种利用由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体或结合有配体的治疗药物-聚合物结构体组成的纳米颗粒的基因治疗方法。
    具体地,本发明提供一种治疗方法,包括以下步骤:制备由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒,并将纳米颗粒导入动物体内。
    本发明还提供一种包括药学上有效量的由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的药物组合物。
    对于给药,除了上述活性成分,本发明的组合物可包括至少一种药学上可接受的载体。本发明中可使用的药学上可接受的载体应当是与本发明的活性成分相容的,可以是生理盐水、无菌水、林格氏液、缓冲盐水、葡萄糖溶液、麦芽糊精溶液、甘油、乙醇或以上两种或更多种的混合物。此外,必要 时,本发明的组合物可包括其他常规的添加剂,包括抗氧化剂、缓冲剂和抑菌剂。此外,本发明的组合物可借助于稀释剂、分散剂、表面活性剂、粘合剂和润滑剂而被配制成诸如水溶液、悬浮液或乳液这样的可注射的形式。特别地,本发明的组合物优选提供为冻干制剂。为了制备冻干制剂,可采用本领域已知的任何传统方法,还可添加用于冷冻干燥的稳定剂。
    此外,本发明的组合物可根据疾病的种类或按照本领域已知方法或Remington′s pharmaceutical Science(Mack出版公司,伊斯顿,宾夕法尼亚州)中公开的方法的组分而被配制成合适的剂型。
    本发明的药物组合物的剂量可由本领域的技术人员根据患者的病情和疾病的严重程度来确定。此外,本发明的组合物可被配制成以下形式:粉剂、片剂、胶囊、液体、注射液、软膏剂和糖浆剂,并且可以单位剂型或多剂型提供,例如密封的安瓿或药瓶。
    本发明的药物组合物可口服或非肠道给药。根据本发明的药物组合物可通过各种途径给药,包括但不限于口服、静脉注射、肌肉注射、动脉注射、髓内给药、硬膜内给药、心内注射、经皮给药、皮下注射、腹膜内给药、胃肠道给药、舌下给药和局部途径。
    针对这种临床给药,可采用本领域已知的技术将本发明的药物组合物配制成合适的形式。本发明的组合物的剂量可随各种因素而变化,诸如患者的体重、年龄、性别、健康状况和饮食、给药时间和给药方法、排泄率和疾病的严重程度,并且可由本领域的普通技术人员很容易地确定。
    2.本发明的第二方面
    在第二方面中,本发明提供一种由下式5表示的ASO-聚合物缀合物:
    式5
    A-X-R-Y-B
    其中A和B之一是亲水性材料,另一个是疏水性材料,X和Y各自独立地为简单的共价键或连接分子介导的共价键,R是ASO。
    如在此使用的,术语“ASO”是指不仅包括传统的用于抑制mRNA表达的反义寡核苷酸,而且包括抑制microRNA功能的antagomir。
    式5中的亲水性材料可连接有靶特异性配体。靶特异性配体具有通过受 体介导的内吞作用(RME)提高靶特异性内化的特性,靶特异性配体可选自靶特异性抗体或适体、肽(如受体特异性配体)和化学物质(如叶酸、N-乙酰半乳糖胺(NAG)和甘露糖)。在这里,靶向部分是以靶特异性方式执行递送的材料,并不仅仅限于上述抗体、适体、肽和化学物质。
    在本发明的缀合物中,ASO优选地包括10-50个寡核苷酸,更优选地包括13-25个寡核苷酸。
    为了提高体内稳定性,ASO包括通过提供核酸酶抗性的各种修饰获得的寡聚脱氧核苷酸(ODN)。修饰可以选自以下一种取代或者两种或更多种取代的组合:在一个或更多个核苷酸的糖部分的2’碳位置的-OH基被-CH3(甲基)、-OCH3、-NH2、-F(氟)、-O-2-甲氧乙基、-O-丙基、-O-2-甲硫基乙基、-O-3-氨基丙基、-O-3-二甲基氨基丙基、-O-N-甲基乙酰氨基或-O-二甲基羟氨基乙基取代;核苷酸的糖部分的氧被硫取代;将核苷酸之间的键修饰为硫代磷酸酯键、磷酸硼键或甲基膦酸酯键。或者,可修饰为PNA(肽核酸)或LNA(锁核酸)的形式。
    可用在本发明中的ASO没有特别限制,可以是针对用于或可用于基因治疗或基因研究的任何基因的ASO。
    对本领域技术人员显而易见的是,本发明中使用的ASO不仅包括与靶mRNA完全匹配的ASO,而且包括与靶mRNA错配的ASO,抑制mRNA的翻译。
    亲水性材料优选具有200-10,000的分子量,更优选具有1,000-2,000的分子量。此外,亲水性材料优选为阳离子型聚合物化合物或非离子型聚合物化合物。
    例如,本发明中使用的亲水性聚合物化合物优选地为诸如PEG(聚乙二醇)、聚乙烯吡咯烷酮或聚恶唑啉的非离子型亲水性聚合物化合物,但不限于此。
    必要时,可对亲水性材料进行修饰以具有结合到其他材料所需的官能团。在亲水性材料中,特别是聚乙二醇(PEG)可具有多种分子量和官能团,具有良好的生物相容性,不诱导免疫反应,提高ASO的体内稳定性,并提高ASO的递送效率,因此非常适于制备本发明的缀合物。
    此外,疏水性材料优选具有250-1,000的分子量。特别地,本发明中使 用的疏水性材料可优选为类固醇衍生物、甘油酯衍生物、甘油醚、聚丙二醇、C12-C50不饱和烃或饱和烃、二酰基磷脂酰胆碱、脂肪酸、磷脂、脂多胺或类似材料,但并不限于此,对本领域技术人员显而易见的是,可以使用适于本发明的目的的任何疏水性材料。
    特别地,类固醇衍生物可选自由胆固醇、胆甾烷醇、胆酸、胆甾烯基甲酸酯、胆甾烷基甲酸酯和胆甾烷基胺构成的组,甘油酯衍生物可选自甘油单酯、甘油二脂和甘油三酯,其中甘油酯的脂肪酸可以是C12-C50不饱和脂肪酸或饱和脂肪酸。
    疏水性材料通过疏水作用形成纳米颗粒。在疏水性材料中,特别地,碳链或胆固醇非常适合用于制备本发明的缀合物,因为在制备ASO的步骤中碳链或胆固醇可以很容易地结合。
    此外,式1中由X或Y表示的共价键可以是不可降解的键或可降解的键。在这里,不可降解的键包括但不限于酰胺键或磷酸键,可降解的键包括但不限于二硫键、可酸降解的键、酯键、酐键、可生物降解的键或酶促降解的键。
    根据本发明的ASO-聚合物缀合物可具有这样的结构:亲水性材料与ASO的5’端和3’端之一结合,疏水性材料与另一端结合。
    一种制备在ASO的3’端结合有亲水性材料的ASO-聚合物缀合物的方法,
    其特征在于,可包括以下步骤:
    (a)将亲水性材料共价结合到固相支持物上;
    (b)在包括亲水性材料的固相支持物上合成ASO;
    (c)将疏水性材料共价结合到固相支持物上的ASO的5’端;以及
    (d)从固相支持物分离并纯化所得的ASO-聚合物缀合物。
    在更优选的实施方式中,制备ASO-聚合物缀合物的方法包括以下步骤:将亲水性材料共价结合到固相支持物(可控孔度玻璃(CPG))上;通过解封、偶联、封端和氧化在共价结合有亲水性材料的固相支持物(CPG)上合成ASO;以及将疏水性材料共价结合到固相支持物上的ASO的5’端。在完成ASO-聚合物缀合物的制备之后,通过在60℃的水浴中用28%(v/v)氨处理ASO-聚合物缀合物,使ASO-聚合物缀合物与固相支持物(CPG)分离,可通过高效液相色谱法(HPLC)将ASO-聚合物缀合物从反应物中分离并纯化,然后通过 MALDI-TOF质谱仪测量分子量以确定是否制备了所需的ASO-聚合物缀合物。
    在另一方面,一种制备在ASO的5’端结合有亲水性材料的ASO-聚合物缀合物的方法,
    其特征在于,包括以下步骤:
    (a)在结合有官能团的固相支持物上合成ASO;
    (b)将亲水性材料共价结合到ASO的5’端;
    (c)将结合亲水性材料的ASO缀合物与固相支持物分离;以及
    (d)将疏水性材料共价结合到从固相支持物分离的ASO的3’端。
    在更优选的实施方式中,制备方法包括以下步骤:在结合有官能团的固相支持物(CPG)上合成ASO;将亲水性材料共价结合到ASO的5’端;在60℃的水浴中用28%(v/v)氨处理所得的固相支持物,以将连接官能团的ASO-亲水性聚合物与固相支持物(CPG)分离;以及将疏水性材料经由官能团连接到ASO,以形成在ASO的两端连接有亲水性材料和疏水性材料的ASO-聚合物缀合物。当完成了ASO-聚合物缀合物的制备时,可通过高效液相色谱法(HPLC)将ASO-聚合物缀合物从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF质谱仪测量分子量以确定是否制备了所需的ASO-聚合物缀合物。
    同时,ASO-聚合物缀合物可进一步包括结合到亲水性材料的配体。
    将配体结合到亲水性材料的方法是根据与配体连接的官能团的种类来确定的。例如,以亚磷酰胺作为官能团的配体-亚磷酰胺可以按照与ASO合成过程相同的方式结合到亲水性材料,连接有N-羟基丁二酰亚胺(NHS)的配体可通过N-羟基丁二酰亚胺(NHS)酯键结合到亲水性材料。
    一种制备ASO-聚合物缀合物,所述ASO-聚合物缀合物包括与其连接的配体,并且在ASO的3’端结合有亲水性材料,
    其特征在于,所述方法包括以下步骤:
    (a)将亲水性材料结合到连接有官能团的固相支持物上;
    (b)在结合有官能团-亲水性材料的固相支持物上合成ASO;
    (c)将疏水性材料共价结合到ASO的5’端;
    (d)将步骤(c)中获得的ASO-聚合物缀合物与固相支持物分离;以及
    (e)将配体结合到从固相支持物分离的ASO-聚合物缀合物的亲水性材 料。
    在更优选的实施方式中,制备方法包括以下步骤:将亲水性聚合物结合到连接有官能团的固相支持物上;在结合有官能团-亲水性材料的固相支持物(CPG)上合成ASO;将疏水性材料共价结合到ASO的端基;将所得的官能团-ASO-聚合物缀合物与固相支持物(CPG)分离;以及通过官能团将配体连接到亲水性聚合物的末端,从而制备结合有配体的ASO-聚合物缀合物。当完成了结合有配体的ASO-聚合物缀合物的制备时,可通过高效液相色谱法(HPLC)将ASO-聚合物缀合物从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF质谱仪测量分子量以确定是否制备了所需的结合有配体的ASO-聚合物缀合物。
    在另一方面,一种制备ASO-聚合物缀合物,所述ASO-聚合物缀合物连接有配体,并且在ASO的5’端结合有亲水性材料,
    其特征在于,所述方法包括以下步骤:
    (a)在连接有官能团的固相支持物上合成ASO;
    (b)将亲水性材料共价结合到ASO的末端;
    (c)将配体共价结合到ASO-亲水性材料缀合物;
    (d)将连接有官能团的ASO-亲水性材料-配体缀合物与固相支持物分离;以及
    (e)将疏水性材料共价结合到从固相支持物分离的缀合物的ASO的3’端。
    在更优选的实施方式中,制备方法包括以下步骤:在连接有官能团的固相支持物(CPG)上合成ASO;将亲水性材料共价结合到ASO的末端;将配体共价结合到ASO-亲水性聚合物;将连接官能团的ASO-亲水性聚合物-配体缀合物与固相支持物(CPG);以及通过官能团将疏水性材料连接到分离的缀合物,从而合成了在亲水性聚合物的相对端连接有疏水性材料的结合有配体的ASO-聚合物缀合物。当完成了结合有配体的ASO-聚合物缀合物的制备时,可通过高效液相色谱法(HPLC)将ASO-聚合物缀合物从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF质谱仪测量分子量以确定是否制备了所需的结合有配体的ASO-聚合物缀合物。
    因此,本发明中合成的ASO-聚合物缀合物包括疏水性材料和亲水性材料,因而本质上是两亲的。亲水性部分在体内通过与水分子相互作用(如氢 键)而倾向于向外,疏水性材料通过疏水性相互作用而倾向于向内,从而形成了热力学稳定的纳米颗粒。换句话说,纳米颗粒形成为疏水性材料位于纳米颗粒的中心,而亲水性材料位于ASO的外侧以保护ASO(参见图18)。如上所述形成的纳米颗粒提高了ASO的细胞内递送并且可用于治疗疾病。所述缀合物的合成及其特征、细胞内递送效率和效果将在以下实施例中进一步详细描述。
    此外,本发明提供一种基因治疗方法,包括以下步骤:制备由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒;通过纳米颗粒在体外递送ASO。所述基因治疗方法并不仅仅限于体外应用。
    本发明还提供一种包括药学上有效量的ASO-聚合物缀合物或由结合有配体的ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的药物组合物。
    对于给药,除了上述活性成分,本发明的组合物可包括至少一种药学上可接受的载体。本发明中可使用的药学上可接受的载体应当是与本发明的活性成分相容的,可以是生理盐水、无菌水、林格氏液、缓冲盐水、葡萄糖溶液、麦芽糊精溶液、甘油、乙醇或以上两种或更多种的混合物。此外,必要时,本发明的组合物可包括其他常规的添加剂,包括抗氧化剂、缓冲剂和抑菌剂。此外,本发明的组合物可借助于稀释剂、分散剂、表面活性剂、粘合剂和润滑剂而被配制成诸如水溶液、悬浮液或乳液这样的可注射的形式。特别地,本发明的组合物优选提供为冻干制剂。为了制备冻干制剂,可采用本领域已知的任何传统方法,还可添加用于冷冻干燥的稳定剂。
    此外,本发明的组合物可根据疾病的种类或按照本领域已知方法或Remington′s pharmaceutical Science(Mack出版公司,伊斯顿,宾夕法尼亚州)中公开的方法的组分而被配制成合适的剂型。
    本发明的药物组合物的剂量可由本领域的技术人员根据患者的病情和疾病的严重程度来确定。此外,本发明的组合物可被配制成以下形式:粉剂、片剂、胶囊、液体、注射液、软膏剂和糖浆剂,并且可以单位剂型或多剂型提供,例如密封的安瓿或药瓶。为了进行如上所述的临床给药,本发明的药物组合物可利用公知技术制备为适合的剂型。
    本发明的药物组合物可口服或非肠道给药。根据本发明的药物组合物可通过各种途径给药,包括但不限于口服、静脉注射、肌肉注射、动脉注射、 髓内给药、硬膜内给药、心内注射、经皮给药、皮下注射、腹膜内给药、胃肠道给药、舌下给药和局部途径。本发明的组合物的剂量可随各种因素而变化,诸如患者的体重、年龄、性别、健康状况和饮食、给药时间和给药方法、排泄率和疾病的严重程度,并且可由本领域的普通技术人员很容易地确定。
    实施例
    以下,将参照实施例更详细地描述本发明。对于本领域的普通技术人员将显而易见的是,这些实施例仅是解释性的目的,而不被理解为限制本发明的范围。
    实施例1:可被结合的配体材料的制备
    为了制备结合有配体的双螺旋寡RNA结构体,制备可被结合到双螺旋寡RNA结构体的配体材料。
    实施例1-1:1-六(乙二醇)-N-乙酰半乳糖胺-亚磷酰胺试剂(化合物A、B和C)的制备
    为了将N-乙酰半乳糖胺(NAG)结合到双螺旋寡RNA结构体,按以下反应流程1所示制备1-六(乙二醇)-NAG-亚磷酰胺。
    反应流程1

    实施例1-1-1:1,3,4,6-四乙酰基-NAG(化合物A)的制备
    将起始材料半乳糖胺盐酸盐(Sigma Aldrich,美国)(2g,9.27mmol)、乙腈(Samjeon,韩国)(31ml)和三乙胺(Sigma Aldrich,美国)(15.42ml,111.24mmol)彼此混合并回流1小时。将混合物缓慢冷却至室温并利用冰水冷却至0℃,然后向其中滴加醋酸酐(Sigma Aldrich,美国)(8.76ml,92.70mmol),滴加时间为10分钟。然后,除去冰水,在室温下搅拌剩余材料24小时。反应完成后,将碳酸氢钠溶液(Samjeon,韩国)缓慢加入反应产物中,直到pH达到中性。pH达到中性之后,在室温下搅拌反应液2小时,过滤产生的固体。依次用乙酸乙酯(Samjeon,韩国)(100ml×2)、蒸馏水(100ml×2)和乙酸乙酯(100ml×1)洗涤滤液。真空干燥所述固体,得到1,3,4,6-四乙酰基-N-乙酰半乳糖胺(1.82g,52.3%)(参见图3)。
    实施例1-1-2:3,4,6-三乙酰基-1-六(乙二醇)-NAG(化合物B)的制备
    将实施例1-1-1中制备的1,3,4,6-四乙酰基-N-乙酰半乳糖胺(1.81g,4.82mmol)、三氯化铁(Sigma Aldrich,美国)(1.02g,6.27mmol)和二氯甲烷(Samjeon,韩国)(48ml)彼此混合并在室温下搅拌10分钟。然后,向混合物中加入六(乙二醇)(Sigma Aldrich,美国)(1.58ml,4.82mmol),接着回流2小时。反应完成后,反应液经硅藻土(Sigma Aldrich,美国)过滤,并用二氯甲烷(50ml×2)洗涤滤液。滤液经减压浓缩并加入到乙酸乙酯(100ml)和蒸馏水(100ml)中,收集水层。用二氯甲烷(100ml×3)萃取所收集的水层,并收集有机层,用无水硫酸镁(Samjeon,韩国)干燥并过滤。滤液经减压浓缩并在真空中干燥,从而得到3,4,6-三乙酰基-1-六(乙二醇)-N-乙酰半乳糖胺(2.24g,74.9%)(参见图4)。
    实施例1-1-3:1-六(乙二醇)-NAG-亚磷酰胺(化合物C)的制备
    将实施例1-1-2中得到的化合物(2.22g,3.71mmol)、二氯甲烷(37ml)和三乙胺(0.94ml,6.75mmol)彼此混合并在室温下搅拌10分钟。然后,向混合物中加入2-氰乙基-N,N-二异丙基氯代亚磷酰胺(Sigma Aldrich,美国)(0.75ml,3.38mmol)并搅拌45分钟。反应完成后,将反应液减压浓缩,并向其中加入乙酸乙酯(100ml)和蒸馏水(100ml)。收集有机层,用无水硫酸镁干燥并过滤。滤液经减压浓缩并通过柱色谱法纯化,从而得到1-六(乙二醇)-N-乙酰 半乳糖胺-亚磷酰胺(1.14g,42.2%)(参见图5)。
    实施例1-2:NHS-叶酸的制备
    为了将叶酸结合到双螺旋寡RNA结构体,按以下反应流程2所示制备NHS-叶酸:
    反应流程2

    将起始材料叶酸(Sigma Aldrich,美国)(3g,6.8mmol)、二甲基亚砜(Sigma Aldrich,美国)(60ml)、N-羟基丁二酰亚胺(Sigma Aldrich,美国)(0.86g,7.5mmol)和1,3-二环己基碳二亚胺(Sigma Aldrich,美国)(1.54g,7.5mmol)彼此混合并在室温下搅拌18小时。反应完成后,将反应混合物滴加到950ml的3:5的乙酸乙酯:正己烷(Samjeon,韩国)混合物中,滴加时间为10分钟,过滤生成的固体NHS-叶酸(Robert J.Lee and Philip S.Low(1994)J.Biological Chemistry.269:3198-3204)。
    实施例1-3:肽的制备
    由于肽类化合物包括α-氨基酸,于是进行具有这种结构的肽衍生物与PEG的胺官能团之间的结合反应。在该结合反应中,PEG中存在的胺官能团与肽类衍生物的肽的羧酸在结合反应过程中相互作用,为此,在结合反应之前需要用保护基取代肽类化合物的胺官能团的步骤。肽类化合物的胺基被保护基9-芴甲氧羰基(Fmoc)或叔丁氧羰基(t-BOC)取代,以除去它与肽的羧酸的反应性,从而制备能够结合到PEG的肽类化合物。
    实施例2:在5’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的制备
    实施例1中制备的配体材料可被构造为亚磷酰胺的形式(如实施例1-1的NAG-亚磷酰胺),以便可通过一般的寡核苷酸合成工序(包括解封、偶联、封端和氧化)结合到PEG的末端。或者,可被构造为NHS-配体的形式(如实施例1-2的NHS-叶酸),以便可通过酯键结合到结合了胺的PEG,从而合成在RNA的5’端结合有配体的PEG-RNA结构体。合成的5’端结合有配体的PEG-RNA结构体与结合有疏水基团的互补的5’C24-RNA结构体退火,从而合成在5’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体。
    实施例2-1:双螺旋寡RNA的制备
    在以下实施例中,采用针对存活蛋白(Survivin)的双螺旋寡RNA以抑制存活蛋白。存活蛋白是一种在目前所检测的大多数肿瘤或突变细胞系中普遍表达的蛋白质,预期将成为抗癌治疗的重要靶标(Survivin:a new target for anti-cancer therapy.Cancer Treat Rev.2009Nov;35(7):553-62)。根据本发明的存活蛋白双螺旋寡RNA包括SEQ ID NO:1的有义链及其互补的反义链,而将包括SEQ ID NO:2的有义链及其互补的反义链的双链寡聚核苷酸作为对照。本实施例中采用的双螺旋寡RNA包括以下核苷酸序列。
    (SEQ ID NO:1)5′-AAG GAG AUC AAC AUU UUC A-3′
    (SEQ ID NO:2)5′-CUU ACG CUG AGU ACU UCG A-3′
    为了合成双螺旋寡RNA,通过利用叔丁基二甲基硅基保护的β-氰乙基亚磷酰胺由RNA骨架的磷酸二酯键连接核苷酸来合成单链RNA(Polymer support oligonucleotide synthesis X VIII:use ofβ-cyanoethyl-N,N-dialkylamino-/N-morpholino phosphoramidite of deoxynucleosides for the synthesis of DNA fragments simplifying deprotection and isolation of the final product.Nucleic Acids Res.1984Jun11;12(11):4539-57)。
    在合成过程中,在连接有核苷酸的载体上重复包括解封、偶联、封端和氧化的循环,由此获得所需的RNA序列。利用RNA合成仪(384合成仪,BIONEER,韩国)进行合成单链RNA的工序(参见图6)。
    实施例2-2:5’PEG-RNA结构体的制备
    按照一般的RNA合成工序,将实施例2-1中合成的RNA与PEG亚磷酰 胺试剂反应,由此制备5’PEG-RNA结构体(参见图7)。
    实施例2-3:在5’端结合有配体的PEG-RNA的合成
    实施例2-3-1:利用N-乙酰半乳糖胺(NAG)亚磷酰胺制备NAG-PEG-RNA结构体
    按照一般的RNA合成工序,将实施例2-2中合成的5’PEG-RNA结构体与(实施例1-1中合成的)NAG亚磷酰胺试剂反应,通过磷酸二酯键将N-乙酰半乳糖胺(NAG)结合到PEG-RNA结构体。N-乙酰半乳糖胺配体可利用树枝状聚合物连接分子将N-乙酰半乳糖胺的一个或更多个分子提供至PEG。
    实施例2-3-1-1:单-NAG-PEG-RNA结构体的制备
    按照一般的RNA合成工序,将实施例2-2中合成的PEG-RNA结构与(实施例1-1中合成的)NAG亚磷酰胺试剂反应,通过磷酸二酯键将N-乙酰半乳糖胺(NAG)结合到PEG-RNA结构体,由此合成5’单-NAG-PEG RNA结构体(参见图8)。
    实施例2-3-1-2:三-NAG-PEG-RNA结构体的制备
    将实施例2-2中合成的PEG-RNA结构体与树枝状聚合物亚磷酰胺试剂(TreblerPhosphoramidte,Glen research,美国)反应,然后按照一般的RNA合成工序与(实施例1-1中合成的)NAG亚磷酰胺试剂反应,经由磷酸二酯键将三个NAG结合到PEG-RNA结构体,由此合成5’三-NAG-PEG-RNA结构体(参见图9)。
    实施例2-3-2:叶酸-PEG-RNA结构体的制备
    按照一般的RNA合成工序,将实施例2-2中合成的PEG-RNA结构体与胺基亚磷酰胺试剂反应,经由磷酸二酯键将胺基结合到PEG-RNA结构体,由此合成胺基-PEG-RNA结构体。合成的胺基-PEG-RNA结构体经由酯键与(实施例1-2中合成的)NHS-叶酸连接来合成5’叶酸-PEG-RNA结构体(参见图10)。
    实施例2-3-3:通过胺基修饰和肽类化合物的肽-PEG-RNA结构体制备
    利用BOP(苯并三氮唑-1-基-氧-三(二甲基氨基)磷鎓六氟磷酸盐)(Sigma Aldrich,美国)和HOBT(1-羟基苯并三唑)(Sigma Aldrich,美国)进行实施例1-3中制备的被保护的肽类化合物的羧基与实施例2-3-2中制备的胺基-PEG-RNA结构体的PEG的胺基之间的结合反应。结合反应之后, 用哌啶(Sigma Aldrich,美国)处理反应产物以除去保护基,由此制备5’肽-PEG-双螺旋寡RNA结构体。
    实施例2-4:5’C24-RNA结构体的制备
    通过实施例2-1的RNA合成方法来合成与实施例2-3的5’配体-PEG-双链寡RNA的RNA序列互补的RNA结构体,然后按照一般的RNA合成工序,用包含二硫键的C24二十四烷试剂处理,通过磷酸二酯键将C24结合到RNA结构体,由此合成5’C24-RNA结构体(参见图11)。
    实施例2-5:回收和退火
    在60℃的水浴中用28%(v/v)氨水处理实施例2-1、2-2、2-3和2-4中合成的每个单链RNA,将合成的RNA和RNA结构体与CPG分离,接着脱保护。在70℃的烘箱中用10:3:4(v/v/v)的N-甲基吡咯烷酮、三乙胺和三乙胺三氟化氢的混合物处理脱保护的5’配体-PEG-双链RNA结构体和5’C24-双链寡RNA结构体,以除去2’TBDMS(叔丁基二甲基硅基)。
    通过高效液相色谱法(HPLC)将RNA与反应物分离以分离RNA,然后通过MALDI-TOF MS(SHIMADZU,日本)测量RNA的分子量,以确定RNA是否与所需的核苷酸序列和双螺旋寡RNA结构体一致。
    接下来,为了制备结合有配体的双螺旋寡RNA结构体,将结合有配体的PEG-RNA有义RNA和反义RNA以相同的量彼此混合,并将混合物加入到1X退火缓冲液(30mM HEPES、100mM醋酸钾、2mM醋酸镁,pH7.0-7.5)中,并使其在90℃的恒温水浴中反应3分钟,然后使其在37℃下反应,由此制备所需的各链的5’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体。对所制备的5’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体进行电泳确认链的退火。
    实施例3:3’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的制备
    利用PEG亚磷酰胺试剂将胺基-CPG合成为3’胺基-PEG-RNA,然后经由酯键与诸如实施例1-2的NHS-叶酸的NHS-配体连接,由此合成在3’端结合有配体的PEG-双链寡RNA结构体。将合成的3’端结合有配体的PEG-双螺旋寡RNA结构体与疏水性材料C24连接,形成3’端结合有配体的PEG-RNA-C24。将PEG-RNA-C24与互补的RNA退火,合成3’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体。
    实施例3-1:3’胺基-PEG-RNA结构体的制备
    按照一般的RNA合成工序,用聚乙二醇亚磷酰胺试剂处理胺基-CPG以合成3’CPG-胺基-PEG。根据实施例2-1的RNA合成工序,将3’CPG-胺基-PEG合成为具有所需RNA序列的3’CPG-胺基-PEG-RNA结构体(参见图12)。
    实施例3-2:3’胺基-PEG RNA-C24结构体的制备
    按照一般的RNA合成工序,用包含二硫键的C24二十四烷试剂处理实施例3-1中合成的3’CPG-胺基-PEG-RNA结构体,经由磷酸二酯键将C24结合到RNA,由此合成3’胺基-PEG RNA-C24结构体(参见图13)。
    实施例3-3:3’端结合有配体的PEG-RNA-C24结构的制备
    在60℃的水浴中用28%氨水处理实施例3-2中合成的3’胺基-PEG-RNA-C24结构体,以将合成的3’胺基-PEG-双链寡RNA结构体和3’胺基-PEG-RNA-C24结构体与CPG分离,接着脱保护。在70℃的烘箱中用10:3:4(v/v/v)的N-甲基吡咯烷酮、三乙胺和三乙胺三氟化氢的混合物处理脱保护的3’胺基-PEG-RNA-C24结构体,除去2’TBDMS(叔丁基二甲基硅基)。分离的3’胺基-PEG-RNA-C24结构体经由酯键与诸如NHS-配体的配体材料连接,由此合成3’端结合有配体的PEG-RNA-C24结构体。
    实施例3-3-1:3’叶酸-PEG-RNA结构体的制备
    将实施例3-2中合成的胺基-PEG-RNA-C24结构体经由酯键与(实施例1-2中合成的)NHS-配体连接,合成3’叶酸-PEG-RNA-C24结构体(参见图14)。
    实施例3-4:互补的RNA结构体的制备
    按照实施例2-1的RNA合成方法合成与实施例3-3的3’配体-PEG-RNA-C24结构体的序列互补的单链RNA。在60℃的水浴中用28%氨水处理所合成的单链RNA,以将所合成的RNA与CPG分离,接着脱保护。在70℃的烘箱中用10:3:4(v/v/v)的N-甲基吡咯烷酮、三乙胺和三乙胺三氟化氢的混合物处理脱保护的RNA,除去2’TBDMS(叔丁基二甲基硅基)。
    实施例3-5:退火
    通过高效液相色谱法(HPLC;LC-20A Prominence,SHIMADZU,日本)将RNA和3’配体-PEG-RNA-C24结构体反应产物与反应物分离,通过MALDI TOF-MS(SHIMADZU,日本)测量被分离材料的分子量,以确定它们是否 与所需的核苷酸序列和3’配体-PEG-RNA-C24结构体一致。
    接下来,为了制备结合有配体的双螺旋寡RNA结构体,将结合有配体的PEG-RNA有义RNA和反义RNA以相同的量彼此混合,并将混合物加入到1X退火缓冲液(30mM HEPES、100mM醋酸钾、2mM醋酸镁,pH7.0-7.5)中,并使其在90℃的恒温水浴中反应3分钟,然后使其在37℃下反应,由此制备所需的在各链的3’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体。将所制备的3’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体进行电泳确认链的退火。
    实施例4:由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的形成
    通过结合到双螺旋寡RNA的末端的疏水性材料之间的疏水性相互作用,将实施例2和3中合成的5’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体和3’端结合有配体的双螺旋寡RNA结构体形成由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒(即,胶束)(参见图1)。对由实施例2中合成的5’叶酸-配体-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒进行尺寸和临界胶束浓度(CMC)测量以及透射电子显微镜分析,以确认纳米颗粒的形成。
    实施例4-1:由5’叶酸-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒的颗粒尺寸的测
    通过zeta-电位测量法测量纳米颗粒的尺寸。具体地,将5’叶酸-双链寡RNA结构体溶解在1.5ml的DPBS(Dulbecco磷酸盐缓冲)中达50μg/ml的浓度,然后用超声发生器(Wiseclean,DAIHAN,韩国)(700W;幅度:20%)使其均质化。利用粒度仪(Nano-ZS,MALVERN,英国)在以下条件下测量均质的纳米颗粒的尺寸:折射率:1.459,吸收指数:0.001,溶剂PBS(磷酸盐缓冲盐水)的温度:25℃,该温度下的粘度:1.0200,折射率:1.335。每次测量由20个读数组成并且重复三次。
    研究发现,由结合有叶酸的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒(叶酸-SAMiRNA)具有约100-200nm的尺寸。多分散指数(PDI)值越低表示颗粒分布越均匀。测得叶酸-SAMiRNA的PDI值小于0.4,表明形成的纳米颗粒具有相对均匀的尺寸。研究发现,由这些结构组成的纳米颗粒的尺寸适于通过内吞作用被摄入细胞(Nanotoxicology:nanoparticles reconstruct lipids.Nat Nanotechnol.2009Feb;4(2):84-5)(参见图15(A))。
    实施例4-2:由双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的临界胶束浓度的测量
    分子中包含亲油基团和亲水基团的两亲性材料可作为表面活性剂。当表面活性剂溶解在水性溶液中时,疏水部分向内以避免与水接触,而亲水部分向外,由此形成胶束。将首先形成胶束时的浓度定义为临界胶束浓度(CMC)。利用荧光染料测量CMC的方法是基于在形成胶束前后荧光染料的荧光强度曲线图的斜率的急剧变化。
    为了测量由结合有叶酸的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的临界胶束浓度,制备0.04mM DPH(1,6-二苯基-1,3,5-己三烯,Sigma Aldrich,美国)作为荧光染料。利用DPBS将1nmole/μl实施例2中合成的5’叶酸-双链寡RNA结构体连续地稀释为0.0977μg/ml至50μg/ml,由此制备各为180μl的5’叶酸-双链寡RNA结构体样品。为了制备样品,各自加入20μl的含0.04mM DPH的甲醇和单独的甲醇作为对照并充分搅拌。然后,利用超声发生器(Wiseclean,DAIHAN,韩国)以与实施例4-1中所述相同的方式(700W;幅度:20%)进行均质化。使每个均质化的样品在避光条件下室温反应24小时,测量荧光强度(激发:355nm,发射:428nm,最高读数)。由于测得的荧光强度是用于确定相对荧光强度,因此计算在相同浓度下的相对荧光强度([含DPH的样品的荧光强度]-[仅含甲醇的样品的荧光强度])并作为5’叶酸-双链寡RNA结构体的浓度(X轴)的对数值的函数而图形化地显示在Y轴上(参见图15(B))。
    在不同浓度下测得的荧光强度随浓度的增加而增加,荧光强度急剧增加处的浓度为CMC浓度。因此将荧光强度不增加的低浓度区域和荧光强度增加的高浓度区域分成几个点以绘制趋势线,两条趋势线彼此交叉处的X轴的值被确定为CMC浓度(参见图15(B))。测得的叶酸-双链寡RNA结构体的CMC非常低(1.33μg/ml),这表明叶酸-SAMiRNA可在非常低的浓度下很容易地形成胶束。
    实施例4-3:通过透射电子显微镜(TEM)对双螺旋寡RNA结构体的观察
    通过透射电子显微镜(TEM)观察由叶酸-双链寡RNA结构体形成的纳米颗粒的形态。
    具体地,将叶酸-双链寡RNA结构体在DPBS(Dulbecco磷酸盐缓冲)中溶解至100ng/ml的终浓度,然后用超声发生器(Wiseclean,DAIHAN, 韩国)(700W;幅度:20%)使其均质化。通过利用具有高电子密度的材料负染色来观察由叶酸-双链寡RNA结构体形成的纳米颗粒。通过透射电子显微镜(TEM)观察到的纳米颗粒具有与实施例4-1测得的纳米颗粒类似的尺寸,这表明很容易形成纳米颗粒。
    实施例5:结合有配体的双链RNA结构体的体外递送
    为了检验由实施例2中合成的5’叶酸-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒在体外是否显示出双螺旋寡RNA的改善效果,在存在或不存在叶酸、不转染的情况下培养过表达叶酸受体的KB细胞系。结果发现,结合的配体提高了SAMiRNA的细胞内递送效率,而且SAMiRNA表现出对靶基因表达的抑制效果。
    实施例5-1:肿瘤细胞系的培养
    在37℃和5%(v/v)CO2条件下,在无叶酸的、添加了10%(v/v)的FBS、100单位/ml青霉素和100μg/ml链霉素的RPMI-1640培养基(Gibco,美国)中培养从美国菌种保藏中心(ATCC)购买的人口腔上皮癌细胞系(KB)。
    实施例5-2:具有叶酸-SAMiRNA的肿瘤细胞系的转染
    在实施例5-1所述的条件下,在六孔板上,将实施例5-1中培养的肿瘤细胞(1.3×105细胞/孔)于无叶酸的RPMI-1640培养基中培养18小时,然后除去培养基,向每孔中加入相同量的Opti-MEM培养基。
    按照实施例4-1所述的相同方法,将由包括抑制靶基因存活蛋白的表达的序列SEQ ID NO:1的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒(SAMiRNA-Sur)、由包括对照序列SEQ ID NO:2的双螺旋寡RNA-聚合物结构体组成的纳米颗粒(SAMiRNA-Con)和由包括序列SEQ ID NO:1的结合叶酸配体的双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒(叶酸-SAMiRNA-Sur)在DPBS中溶解达50μg/ml的浓度,并通过超声发生器使其均质化,由此得到由每一种所述结构组成的均质的纳米颗粒。
    为了在Opti-MEM培养基中形成叶酸过量的条件,向培养基中额外加入叶酸以形成包含1mM叶酸的条件和不额外加入叶酸的条件。然后用200nM的各样品处理细胞并在37℃和5%(v/v)CO2的条件下培养48小时。
    实施例5-3:存活蛋白基因的mRNA的相对定量分析
    从实施例5-2的转染细胞系提取总RNA并合成cDNA,然后按照韩国专利公开No.2009-0042297的方法,通过实时PCR定量存活蛋白的相对表达水平。
    SAMiRNA-Con是用由包括对照序列SEQ ID NO:2的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒处理的试验组,SAMiRNA-Sur是用由包括序列SEQ ID NO:1(存活蛋白序列)的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒处理的试验组。叶酸-SAMiRNA-Sur是用由包括序列SEQ ID NO:1(存活蛋白序列)的叶酸-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒处理的试验组。
    对靶mRNA表达的抑制程度是各自用SAMiRNA-Sur和叶酸-SAMiRNA-Sur处理的试验组中的靶基因的表达水平相对于用SAMiRNA-Con处理的试验组中的靶基因的表达水平,并且由相对定量来确定(参见图16)。
    当培养基中存在过量的叶酸时,可以看出KB细胞系中的叶酸受体被过量的叶酸饱和,因此通过结合到SAMiRNA的叶酸配体来促进细胞内的内化的效果被掩盖,表明叶酸配体影响SAMiRNA的细胞内递送效率,在抑制靶基因的mRNA表达方面起关键作用。
    在用SAMiRNA-Sur处理组的情况下,存在和不存在叶酸对靶基因表达的抑制无显著差异,但在用叶酸-SAMiRNA-Sur处理组的情况下,不存在叶酸时比存在叶酸时对靶基因表达的抑制高约两倍。换句话说,当存在过量的叶酸时,没有观察到由于结合了叶酸配体而在靶基因表达抑制效果方面的变化,但当不存在叶酸时,观察到由于结合了叶酸配体,靶基因表达抑制效果增加。
    因此,可以看出由结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒显示出细胞内递送效率提高和对在过表达配体受体的细胞中的靶基因的抑制效果增加。
    实施例6:结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的体内递送
    为了检验由实施例2中合成的5’叶酸-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒(叶酸-SAMiRNA)在体内条件下是否提高双链寡RNA结构体的效果,将所述纳米颗粒施用给具有由过表达叶酸受体的KB细胞系组成的肿瘤的小鼠, 并检验在肿瘤组织中递送的叶酸-SAMiRNA和SAMiRNA对靶基因表达的抑制效果。
    实施例6-1:KB异种移植模型的制备
    以1×106个细胞的密度将实施例5-1中培养的KB细胞系皮下注入各5周龄的裸鼠(BALB/C nu)。注射后,每隔2天测量肿瘤的长轴和短轴的长度来观察肿瘤的生长,结果表明,注射后2周肿瘤生长到约150-200mm3的体积。
    实施例6-2:结合有配体的双螺旋寡RNA结构体及该结合有配体的双螺旋寡RNA结构体的给药
    对于给药至实施例6-1中制备的KB异种移植模型,将实施例2中合成的包括序列SEQ ID NO:1的5’叶酸-双链寡RNA结构体和未结合有配体的双链RNA结构体按照与实施例4-1所述相同的方式均质化,由此得到由双螺旋寡RNA结构体组成的均质的纳米颗粒。将均质的纳米颗粒以5mg/kg体重的剂量施用到KB异种移植模型(n=4)的尾部静脉一次,并在给药之后48小时或72小时收集肿瘤组织。从收集的肿瘤组织提取总RNA并合成cDNA,然后按照韩国专利公开No.2009-0042297中所述的方法,通过实时PCR定量存活蛋白mRNA的相对表达水平(参见图17)。
    在图17中,PBS是仅施用了溶剂而作为阴性对照的试验组,SAMiRNA是施用了由未结合有配体的双螺旋寡RNA结构体组成的纳米颗粒的试验组,Folate-SAMiRNA是施用了由5’叶酸-双链寡RNA结构体组成的纳米颗粒的试验组。
    SAMiRNA对靶基因表达的抑制效果在给药之后72小时比在给药之后48小时高。在施用结合有配体的结构体(Folate-SAMiRNA)的组中,在给药之后48小时对靶基因表达的抑制为160%,在给药之后72小时对靶基因表达的抑制为120%。
    因此,可以看出,结合有叶酸配体的双链RNA结构被快速递送至过表达叶酸受体的体内靶肿瘤组织中,从而提高了双螺旋寡RNA的效果,并且即使随着时间的推移,所述效果也得以保持。
    实施例7:ASO-聚合物缀合物的制备
    在本发明的实施例中,使用存活蛋白ASO来抑制存活(Biol.Proced.Online2004;6(1):250-256)。存活蛋白是一种在目前所检测的大多数肿瘤或突变细胞系中普遍表达的蛋白质,预期将成为抗癌治疗的重要靶标(Abbrosini G.et al.Nat.Med.3(8):917-921,1997)。
    在以下实施例中使用的ASO是SEQ ID NO:3的存活蛋白特异性序列和SEQ ID NO:4的对照序列。
    (SEQ ID NO:3)存活蛋白ASO(ISIS23722),5-TGTGCTATTCTGTGAATT-3
    (SEQ ID NO:4)加扰对照(ISIS28598),5-TAAGCTGTTCTATGTGTT-3
    ASO序列是通过利用氰乙基亚磷酰胺来连接形成DNA骨架的磷酸二酯键的方法而合成的(Shina et al.Nucleic Acids Research,12:4539-4557,1984)。
    在ASO合成过程中,在连接有核苷酸的固相支持物(CPG)上重复包括解封、偶联、封端和氧化的循环,由此获得所需的DNA序列。
    具体地,在第一步的解封步骤中,用3%三氯乙酸(TCA)处理连接有核苷酸的CPG,除去DMT(4,4′-二甲氧基三苯甲基)。在下一步的偶联步骤中,通过上一步中在CPG上形成的5’-羟基与具有所需序列的核苷亚磷酰胺单体之间的结合反应将核苷酸链彼此连接。在第三步的封端步骤中,对在偶联步骤中未反应的5’-羟基进行封端,以消除在下一循环的偶联步骤中形成具有不需要的核苷酸序列的核苷酸链。在封端步骤中,用乙酸酐和N-甲基咪唑处理未反应的5’-羟基,将未反应的5’-羟基乙酰化。在最后一步的氧化步骤中,将在偶联步骤中形成的5’-羟基与亚磷酰胺之间的亚磷酸三酯键转化为磷酸二酯键。在该氧化步骤中,用0.02M氧化液(0.02M-I2,在THF/吡啶/H2O中)处理亚磷酸三酯键,以将亚磷酸盐转化为磷酸盐。利用DNA合成仪(384合成仪,BIONEER,韩国)进行合成ASO的一系列工序。
    在合成ASO-聚合物缀合物(3’PEG-ASO-5’脂质)的工序中,由在3’端具有亲水性材料PEG的3’PEG-CPG载体通过解封、偶联、封端和氧化合成ASO,并且将包含二硫键的C24疏水性材料二十四烷连接到5’端,由此制备了所需的ASO-聚合物缀合物(参见韩国专利公开No.2009-0042297)。
    此外,为了制备3’配体-PEG-ASO-5’脂质,利用PEG亚磷酰胺试剂通过包括解封、偶联、封端和氧化的工序将PEG连接到连接有诸如胺基之类的官 能团的CPG,并将包含二硫键的C24疏水性材料二十四烷连接到5’端,由此制备所需的配体可连接的3’-官能团-PEG-ASO-5’-脂质。合成完成之后,在60℃的水浴中用28%(v/v)氨处理反应产物,将配体可连接的ASO-聚合物缀合物与CPG分离。然后,将配体通过官能团连接缀合物,由此制备ASO-聚合物缀合物(3’配体-ASO-5’脂质)。
    同时,为了合成ASO-聚合物缀合物(3’脂质-ASO-5’PEG),通过包括解封、偶联、封端和氧化的工序在具有诸如胺基之类的官能团的CPG上合成ASO,利用PEG亚磷酰胺将PEG连接到5’端,由此制备官能团-ASO-亲水性聚合物缀合物。完成官能团-ASO-亲水性聚合物缀合物的合成之后,在60℃的水浴中用28%(v/v)氨处理反应产物,将官能团-ASO-亲水性聚合物缀合物与CPG分离,然后将疏水性材料经由官能团连接缀合物,由此制备其中连接有所需亲水性材料和疏水性材料的ASO-聚合物缀合物。然后,通过高效液相色谱法(HPLC)(LC-20A Prominence,SHIMADZU,日本)将ASO-聚合物缀合物从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF MS(SHIMADZU,日本)测量ASO和ASO聚合物缀合物的分子量以确定是否获得了要合成的核苷酸序列。
    实施例8:由硫代磷酸酯修饰的ASO-聚合物缀合物的合成
    在该实施例中使用的ASO是通过用硫代磷酸酯基团取代DNA骨架的磷酸基得到的,以得到S-oligo并通过硫代磷酸酯键连接S-oligo。
    具体地,通过包括解封、偶联、封端和氧化的工序合成包括S-oligo的ASO,其中氧化步骤是用0.1M硫化剂代替0.02M氧化液进行处理来执行。通过该ASO合成工序,合成了具有序列SEQ ID NOS:3和SEQ ID NOS:4的硫代磷酸酯修饰的ASO(Shina et al.Nucleic Acids Research,12:4539-4557,1984)。该实施例中采用的其余合成工序与实施例7中采用的那些合成工序相似。
    为了合成两端(5’端和3’端)的4个核苷酸用2-OCH3(甲氧基)修饰的ASO,利用2′-OCH3-DNA-氰乙基亚磷酰胺[rA(Bz),rC(Ac),rG(ibu),rU]将DNA骨架用硫代磷酸酯取代而合成修饰区域呈2’-OCH3-DNA形式的核苷酸,然后如上所述,通过经由硫代磷酸酯键连接S-oligo来合成DNA骨架。
    为了制备硫代磷酸酯修饰的ASO-聚合物缀合物,通过本领域已知的包括解封、偶联、封端和氧化的循环(参见韩国专利公开No.2009-0042297)在3’PEG-CPG载体上合成硫代磷酸酯修饰的ASO缀合物,然后将包含二硫键的C24疏水性材料二十四烷连接到5’端,由此制备所需的硫代磷酸酯修饰的ASO-聚合物缀合物。
    此外,为了将配体连接到硫代磷酸酯修饰的ASO-聚合物缀合物的亲水性材料的末端,将配体可连接的官能团与3’CPG连接,然后将亲水性材料结合到CPG,并进行上述反应,由此制备配体可连接的ASO-聚合物缀合物。
    完成ASO-聚合物缀合物的合成之后,在60℃的水浴中用28%(v/v)氨处理反应产物,使ASO和ASO-聚合物缀合物与CPG分离。然后,通过高效液相色谱法(HPLC)(LC-20A Prominence,SHIMADZU,日本)将ASO-聚合物缀合物从反应物中分离并纯化,然后通过MALDI-TOF MS(SHIMADZU,日本)测量ASO和ASO聚合物缀合物的分子量以确定是否获得了要合成的核苷酸序列(参见图19)。
    实施例9:在模拟体内条件的条件下对ASO-聚合物缀合物的稳定性的评估
    为了检验实施例7和8中合成并分离的ASO-聚合物缀合物的稳定性是否比未连接聚合物的原始ASO有所提高,进行了以下实验。具体地,在模拟体内条件的含30%和50%(v/v)FBS(胎牛血清)的培养基中培养未连接聚合物的ASO和ASO-聚合物缀合物,培养时间为0天、3天、5天、7天和10天,然后通过电泳法或聚合酶链反应(PCR)对ASO-聚合物缀合物和原始ASO的降解进行比较分析。
    结果,无论FBS的浓度高低,即使随着时间的推移PEG与ASO分离,ASO-聚合物缀合物都是稳定的,然而未连接聚合物的ASO的稳定性在3天之后开始减少。
    实施例10:由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的物理特性的分析
    ASO-聚合物缀合物通过连接到ASO末端的疏水性材料之间的相互作用而形成由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒(参见图18)。通过zeta-电位测量法测量由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的尺寸和临界胶束浓度 (CMC)。
    实施例10-1:由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的测量
    通过zeta-电位测量法来测量由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的尺寸,所述ASO-聚合物缀合物是由实施例8制备的并包括序列SEQ ID NO:3。具体地,将50μg的ASO-聚合物缀合物溶解于1ml DPBS(Dulbecco磷酸盐缓冲)中,然后用超声发生器(Wiseclean,DAIHAN,韩国)(700W;幅度:20%)使其均质化。通过zeta-电位测量装置(Nano-ZS,MALVERN,英国)在以下条件下测量均质的纳米颗粒的尺寸:折射率:1.454,吸收指数:0.001,作为溶剂的水的温度:25℃。每次测量包括20个尺寸读数并且重复三次。
    可以观察到,由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒具有100-200nm的尺寸和小于0.4的多分散指数(PDI)(参见图20(A))。多分散指数(PDI)值越低表示颗粒分布越均匀。因此,可以看出,由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒具有适于通过内吞作用被摄入细胞的相对均匀的尺寸(Kenneth A.Dawson et al.nature nanotechnology4:84-85,2009)。
    实施例10-2:由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的临界胶束浓度的测量
    分子中包含亲油基团和亲水基团的两亲性材料可作为表面活性剂。当表面活性剂溶解在水溶液中时,疏水部分向内以避免与水接触,而亲水部分向外,由此形成胶束。首先形成胶束时的浓度被定义为临界胶束浓度(CMC)。利用荧光染料测量CMC的方法是基于在形成胶束前后,荧光染料的荧光强度曲线图的斜率的急剧变化。
    为了测量由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒的临界胶束浓度,制备0.04mM DPH(1,6-二苯基-1,3,5-己三烯,Sigma,美国)作为荧光染料。利用DPBS将1nmole/μl包括序列SEQ ID NO:3的ASO-聚合物缀合物连续地稀释为0.0977μg/ml至50μg/ml,由此制备各为180μl的ASO-聚合物缀合物样品。为了制备样品,各自加入20μl的含0.04mM DPH的甲醇和单独的甲醇作为对照并充分搅拌。然后,利用超声发生器(Wiseclean,DAIHAN,韩国)以与实施例10-1中所述相同的方式(700W;幅度:20%)进行均质化。使每个均质化的样品在避光条件下室温反应24小时,测量荧光强度(激发:355nm,发射:428nm,最高读数)。由于测得的荧光强度是用于确定相对 荧光强度,因此计算在相同浓度下的相对荧光强度([含DPH的样品的荧光强度]-[仅含甲醇的样品的荧光强度]),并作为ASO-聚合物缀合物的浓度(X轴)的对数值的函数而图形化地显示在Y轴上(参见图20(B))。
    在不同浓度下测得的荧光强度随浓度的增加而增加,荧光强度急剧增加处的浓度为CMC浓度。因此将荧光强度不增加的低浓度区域和荧光强度增加的高浓度区域分成几个点以绘制趋势线,两条趋势线彼此交叉处的X轴的值被确定为CMC浓度。测得的ASO-聚合物缀合物的CMC非常低(1.56μg/ml),这表明由ASO-聚合物缀合物形成的纳米颗粒即使在非常低的浓度下也可很容易地形成胶束。
    实施例11:通过ASO-聚合物缀合物和转染剂抑制靶基因在肿瘤细胞系中的表达
    将不具有聚合物缀合物的ASO和实施例8中制备的ASO-聚合物缀合物各自转染作为肿瘤细胞系的人结肠癌细胞系(SW480),分析被转染的肿瘤细胞系中存活蛋白的表达模式。
    实施例11-1:肿瘤细胞系的培养
    在37℃和5%(v/v)二氧化碳(CO2)条件下,在添加了10%(v/v)的FBS、100单位/ml青霉素和100μg/ml链霉素的生长培养基(Leibovitz′s L-15培养基,GIBCO/Invitorgen;美国)中培养从美国菌种保藏中心(ATCC)获得的人结肠癌细胞系(SW480)。
    实施例11-2:用ASO-聚合物缀合物转染肿瘤细胞系
    将不具有聚合物缀合物的ASO和实施例8中制备的ASO-聚合物缀合物各自转染作为肿瘤细胞系的人结肠癌细胞系(SW480),分析被转染的肿瘤细胞系中存活蛋白的表达模式。
    在实施例11-1所述的条件下,在六孔板上以1.3×105个细胞的密度将实施例11-1中培养的肿瘤细胞系于生长培养基(Leibovitzs L-15培养基,GIBCO/Invitorgen;美国)中培养18小时,然后除去培养基,向每孔中加入800μl的Opti-MEM(改良伊格尔氏最小必需培养基(modification of Eagle's Minimum Essential Media),GIBCO/Invitorgen;美国)培养基。
    同时,将2μl的LipofectamineTM2000和198μl的Opti-MEM培养基彼此 混合并使其在室温条件下反应5分钟。用25pmole/μl的实施例7和8中制备的各ASO-聚合物缀合物处理反应产物至终浓度为10nM、50nM和100nM,然后使其在室温条件下反应20分钟,由此制备转染液。
    接下来,向包含肿瘤细胞系和Opti-MEM培养基的每孔中各加入200μl的转染液,然后培养细胞6小时,接着除去Opti-MEM培养基。接下来,向每孔中加入2.5ml的生长培养基(Leibovitzs L-15培养基,GIBCO/Invitorgen;美国),然后在37℃和5%(v/v)二氧化碳(CO2)条件下培养细胞24小时。
    实施例11-3:存活蛋白基因的mRNA的相对定量分析
    从实施例11-2的转染细胞系提取总RNA并合成cDNA,然后按照韩国专利公开No.2009-0042297所述的方法,通过实时PCR相对定量存活蛋白基因的mRNA水平(参见图21)。
    为了分析未缀合有聚合物的ASO和ASO-聚合物缀合物的靶基因表达抑制效果,将ASO和ASO-聚合物缀合物各自与转染剂一起转染细胞,然后分析存活蛋白基因在细胞中的mRNA表达水平。结果发现,ASO-聚合物缀合物对存活蛋白基因表达的抑制类似于未缀合有聚合物的ASO,这表明缀合的聚合物不干扰ASO的作用机制。
    实施例12:ASO-聚合物缀合物单独对靶基因在肿瘤细胞系中的表达的抑制
    将实施例7和8中制备的ASO-聚合物缀合物各自转染作为肿瘤细胞系的人结肠癌细胞系(SW480),分析转染的肿瘤细胞系中存活蛋白的表达模式。
    实施例12-1:肿瘤细胞系的培养
    在37℃和5%(v/v)二氧化碳(CO2)条件下,在添加了10%(v/v)的FBS、100单位/ml青霉素和100μg/ml链霉素的生长培养基(Leibovitz′s L-15培养基,GIBCO/Invitorgen;美国)中培养从美国菌种保藏中心(ATCC)获得的人结肠癌细胞系(SW480)。
    实施例12-2:用ASO-聚合物缀合物转染肿瘤细胞系
    在实施例5-1所述的条件下,在六孔板上以1.3×105个细胞的密度将实施例12-1中培养的肿瘤细胞系于生长培养基(Leibovitzs L-15培养基,GIBCO/Invitorgen;美国)中培养18小时,然后除去培养基,向每孔中加入800μl的Opti-MEM培养基。
    将100μl的Opti-MEM培养基和5μl、10μl或100μl(500nM、1μM或10μM)的实施例1和2中制备的各ASO-聚合物缀合物(1nmole/μl)彼此混合并利用超声发生器(Wiseclean,DAIHAN,韩国)以与实施例4-1中所述的相同方式(700W;幅度:20%)进行均质化,由此制备包含由ASO-疏水性材料缀合物形成的均质的纳米颗粒的转染液。
    接下来,向包含肿瘤细胞系和Opti-MEM的每孔中各加入100μl转染液,然后培养细胞24小时,之后加入1ml含FBS的生长培养基(Leibovitzs L-15培养基,GIBCO/Invitorgen;美国)。然后在37℃和5%(v/v)二氧化碳(CO2)条件下额外培养细胞24小时。因此,在用ASO-聚合物缀合物处理后培养细胞总共48小时。
    实施例12-3:存活蛋白基因的mRNA的相对定量分析
    从实施例12-2的转染细胞系提取总RNA并合成cDNA,然后根据韩国专利公开No.2009-0042297所述的方法,通过实时PCR相对定量存活蛋白基因的mRNA水平。
    比较未缀合有聚合物的ASO和ASO-聚合物缀合物在不含转染剂的条件下对存活蛋白基因的mRNA表达的抑制。结果可以看出,在不含转染剂的条件下,与未缀合的ASO相比,ASO-聚合物缀合物在相对较低的浓度下抑制靶基因的表达。
    因此,可以看出,本发明中合成的ASO-聚合物缀合物或由ASO-聚合物缀合物组成的纳米颗粒即使在不含转染剂的条件下也能被递送进入细胞,因此所述ASO抑制靶基因的表达。
    工业实用性
    如上所述,根据本发明的新型寡核苷酸结构体和包括该结构的药物组合物能够以非常有效并且有用的方式用于治疗癌症和感染性疾病。

    关 键  词:
    新型 寡核苷酸 缀合物 及其 应用
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