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从复杂的排泄物样品获得了人来源的细菌的菌株，其显示出在肠中诱导Th17细胞的累积并促进免疫功能。含有这些细菌的药物组合物可用作抗感染剂及作为粘膜疫苗中的佐剂。

1.一种诱导Th17细胞增殖和/或累积的组合物，所述组合物包含作为活性成分的(a)排
泄物样品的氨苄青霉素抗性细菌级分；或(b)一种或多种(a)细菌的培养物上清。
2.一种诱导Th17细胞增殖和/或累积的组合物，所述组合物包含作为活性成分的(a)一
种或多种选自下组的细菌：共生梭菌(Clostridium symbiosum)，哈氏梭菌(Clostridium
hathewayi)，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌(Clostridium bolteae)，瘤胃球菌属菌种
M-1(Ruminococcus sp.M-1)，活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)，布劳特氏菌属菌种犬
口类143(Blautia sp.canine oral taxon 143)，粪厌氧棒状菌(Anaerostipes caccae)，
乳酸发酵梭菌(Clostridium lactatifermentans)，Coprobacillus cateniformis，多枝梭
菌(Clostridium ramosum)，参见梭菌属菌种MLG055(cf.Clostridium sp.MLG055)，无害梭
菌(Clostridium innocuum)，链状真杆菌(Eubacterium desmolans)，圆环梭菌
(Clostridium orbiscindens)，瘤胃球菌属菌种16442(Ruminococcus sp.16442)，人肠道
厌氧棒状菌(Anaerotruncus colihominis)，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种
(Bifidobacterium pseudolongum subsp.Pseudolongum)，和短双歧杆菌
(Bifidobacterium breve)，或(b)一种或多种(a)细菌的培养物上清。
3.一种诱导Th17细胞增殖和/或累积的组合物，所述组合物包含作为活性成分的(a)细
菌，其含有：包含与本文指定为SEQ ID No.1-20的DNA序列具有至少97％的同源性的核苷酸
序列的DNA；以及包含与如下的一种或多种的DNA具有至少97％的同源性的核苷酸序列的
DNA：共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤
胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus
cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃
球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短
双歧杆菌，或(b)一种或多种(a)细菌的培养物上清。
4.一种诱导Th17细胞增殖和/或累积的组合物，所述组合物包含至少两种选自下组的
生物和/或物质：(a)共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属
菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，
Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，
圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌
假长亚种，和短双歧杆菌，或(b)一种或多种(a)细菌的培养物上清。
5.根据权利要求1-4中任一项的组合物，其中所述Th17细胞是转录因子RORgt阳性Th17
细胞或产生IL-17的Th17细胞。
6.根据权利要求1-5中任一项的组合物，其中所述组合物促进保护性免疫应答。
7.一种药物组合物，其包含权利要求1-6中任一项的组合物及药学上可接受的成分。
8.一种疫苗组合物，其包含权利要求1-7中任一项的佐剂组合物和至少一种抗原以及
药学上可接受的成分。
9.一种用于粘膜疫苗接种的遗传修饰的生物，其选自：共生梭菌，哈氏梭菌，
Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌
种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参
见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌
氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短双歧杆菌，其中所述生物包含
表达异种抗原的表达载体。
10.一种用于在个体中诱导Th17细胞增殖和/或累积的方法，其包括对所述个体施用权
利要求1-9中任一项的组合物。
11.根据权利要求10的方法，其中选自Th17细胞的RORgt表达或Th17细胞的IL-17生产
中的一项测量用作个体中Th17细胞增殖或累积的诱导指数。
12.一种方法，其用于在个体中治疗、辅助治疗或预防选自传染性疾病和癌症的疾病、
或降低其严重程度，该方法包括对所述个体施用权利要求1-9中任一项的组合物。
13.一种方法，其用于在个体中治疗、辅助治疗或预防自身免疫性疾病、或降低其严重
程度，该方法包括对所述个体施用选自万古霉素和甲硝唑的抗生素的步骤。
14.一种用于分离Th17诱导菌株的方法，所述方法包括(a)用氨苄青霉素处理动物；(b)
获得至少一种选自来自所述动物的排泄物样品和肠活检的样品；(c)培养来自(b)的样品并
分离纯细菌株。

用于诱导TH17细胞的组合物及方法

技术领域

本文描述的主题涉及诱导T辅助细胞17(Th17)细胞增殖的人来源细菌的组合物，
其包含作为活性成分的人来源细菌，优选为(a)从排泄物样品的氨苄青霉素抗性细菌级分
分离和培养的一种或多种细菌，或(b)一种或多种(a)细菌的培养物上清。本发明还涉及诱
导Th17细胞增殖的方法。包含上述(a)～(b)中任意的组合物称为细菌组合物。此外，本主题
涉及通过将细菌组合物单独或与抗原组合口服施用于对其有需要的个体来治疗或预防对
Th17细胞的诱导有应答的至少一种疾病或病症(例如传染性疾病)的方法。

发明背景

数百种共生微生物生活在哺乳动物的胃肠道中，在那里它们与宿主免疫系统相互
作用。使用无菌(GF)动物的研究已经显示共生微生物影响粘膜疫苗免疫系统的形成
(development)，例如派伊尔氏淋巴集结(Peyer’s patches,PP)和分离的淋巴滤泡(ILF)的
组织发生，抗微生物肽从上皮的分泌，以及粘膜组织中的独特淋巴细胞的累积，包括产生免
疫球蛋白A的浆细胞，上皮内淋巴细胞，产生IL-17的CD4阳性T细胞(Th17)、和产生IL-22的
NK样细胞((非专利文献(NPL)1至7)。因此，肠道细菌的存在增强了粘膜的保护功能，使得宿
主能够对侵入身体的病原微生物产生强大的免疫应答。另一方面，粘膜免疫系统维持对膳
食抗原和无害微生物的无反应性(NPL文献3)。调节共生细菌和免疫系统(肠道生态失调)之
间的对话中的异常可能导致对环境抗原和对共生和病原微生物的过度稳健或不足够稳定
的免疫应答，导致疾病(NPL 8至10)。需要更好的方法来使身体对入侵的致病微生物产生有
效的免疫应答。

现有技术文献

非专利文献

[NPL 1]J.J.Cebra,"Am J Clin Nutr",May,1999,69,1046S

[NPL 2]A.J.Macpherson,N.L.Harris,"Nat Rev Immunol",June 2004,4,478

[NPL 3]J.L.Round,S.K.Mazmanian,"Nat Rev Immunol",May 2009,9,313

[NPL 4]D.Bouskra等,"Nature",November 27,2008,456,507

[NPL 5]K.Atarashi等,"Nature",October 9,2008,455,808

[NPL 6]I.I.Ivanov等,"Cell Host Microbe",October 16,2008,4,337

[NPL 7]S.L.Sanos等,"Nat Immunol",January 2009,10,83

[NPL 8]M.A.Curotto de Lafaille,J.J.Lafaille,"Immunity",May 2009,30,
626

[NPL 9]M.J.Barnes,F.Powrie,"Immunity",September 18,2009,31,401

[NPL 10]W.S.Garrett等,"Cell",October 5,2007,131,33

[NPL 11]I.I.Ivanov,等,"Cell",October 30,2009,139,485

[NPL 12]V.Gaboriau-Routhiau等,"Immunity",October 16,2009,31,677

[NPL 13]N.H.Salzman等,"Nat Immunol",January 2010,11,76.

[NPL 14]J.Quin等,"Nature",March 4,2010,464,59

[NPL 15]T.Korn等,"Annu Rev Immunol",April 2009,27,485

[NPL 16]P.Miossec等,"N Engl N Med",August 27,2009,361,888

[NPL 17]I.I.Ivanov等,"Cell",September 22,2006,126,1121

[NPL 18]Lycke N,“Nature Reviews Immunology”,August 2012,12,605

发明概述

鉴于本领域中的上述问题，制得了本发明的组合物和方法。如本文所述，尽管在人
微生物群中存在的一千多个菌种中的大多数细菌菌种不具有刺激Th17细胞的能力，但通过
用各种抗生素处理改良来自人的排泄物样品、应用方法来体外分离纯菌株，以及开发培养
方法来制备含有适合用作药物和食品成分的菌株的细菌组合物，本发明人已经从人获得了
一些细菌菌种，其具有引起对Th17细胞的稳健诱导的能力。此外，发明人已显示了用体外培
养的菌株来接种动物也产生Th17细胞的稳健累积。

本文描述了获得和培养分离自人的肠道共生细菌的方法，所述细菌诱导，优选为
强力诱导Th17细胞的增殖、累积、或增殖和累积。描述了这样的组合物(也称为细菌组合
物)，其包含作为活性成分的(a)一种或多种(至少一种)本文提供的特定菌种(表1)或含有
DNA的细菌，所述DNA包含与本文提供的序列具有至少97％的同源性(例如97％的同源性、
98％的同源性、99％的同源性、或100％同源性)的核苷酸序列；(b)一种或多种(至少一种)
此类细菌的培养物上清；或(c)(a)和(b)的组合，并且所述组合物诱导T辅助17细胞(Th17细
胞)的增殖和/或累积。

更具体而言：

一个实施方案是诱导Th17细胞的增殖、累积、或增殖和累积二者的组合物(也称为
细菌组合物)，所述组合物包含作为活性成分的(a)至少一种(一种或多种)选自下组的生
物：共生梭菌(Clostridium symbiosum),哈氏梭菌(Clostridium hathewayi),
Clostridium citroniae，鲍氏梭菌(Clostridium bolteae)，瘤胃球菌属菌种M-1
(Ruminococcus sp.M-1)，活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)，布劳特氏菌属菌种犬口
类143(Blautia sp.canine oral taxon 143)，粪厌氧棒状菌(Anaerostipes caccae)，乳
酸发酵梭菌(Clostridium lactatifermentans)，Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌
(Clostridium ramosum)，参见梭菌属菌种MLG055(cf.Clostridium sp.MLG055)，无害梭菌
(Clostridium innocuum)，链状真杆菌(Eubacterium desmolans)，圆环梭菌(Clostridium
orbiscindens)，瘤胃球菌属菌种16442(Ruminococcus sp.16442)，人肠道厌氧棒状菌
(Anaerotruncus colihominis)，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种
(Bifidobacterium pseudolongum subsp.Pseudolongum)，和短双歧杆菌
(Bifidobacterium breve)；(b)至少一种(一种或多种)(a)细菌的培养物上清；或(c)至少
一种(一种或多种)(a)细菌和至少一种(一种或多种)(a)细菌的培养物上清的组合。

一个实施方案是诱导Th17细胞增殖和/或累积的组合物，该组合物包含作为活性
成分的(a)排泄物样品的氨苄青霉素抗性细菌级分；(b)一种或多种(a)细菌的培养物上清；
或(a)和(b)的组合物。

在一些实施方案中，活性成分是如下的一种或多种：共生梭菌，哈氏梭菌，
Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌
种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参
见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌
氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短双歧杆菌；以及本文所述/所
列出的一种或多种细菌的培养物上清。在一些实施方案中，所述活性成分是文所述/所列出
的一种或多种细菌的培养物上清。在一些实施方案中，所述一种或多种细菌或来源于细菌
的一种或多种培养物上清是三种或更多种。在一些实施方案中，所述一种或多种细菌或来
源于细菌的一种或多种培养物上清是五种或更多种。在一些实施方案中，所述一种或多种
细菌或来源于细菌的一种或多种培养物上清是10种或更多种。在一些实施方案中，所述一
种或多种细菌或来源于细菌的一种或多种培养物上清是15种或更多种。在一些实施方案
中，所述一种或多种细菌或来源于细菌的一种或多种培养物上清是20种。

本文所述的细菌组合物包含如下的至少一项：一种本文所述的细菌；至少一种获
取自培养物的培养物上清或该上清中的级分，所述上清中存在(生长有或保持有)所述一种
(或多种)细菌。其可以包含任何前述的组合。术语组合物/细菌组合物意指所有此类组合
物。

诱导Th17细胞增殖和/或累积的组合物中的细菌可以是例如共生梭菌，哈氏梭菌，
Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌
种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参
见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌
氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短双歧杆菌，或任何含有这样的
DNA的细菌(如来源于人的细菌)，所述DNA与本文提供的序列具有至少97％的同源性(例如
97％，98％，99％或100％的同源性)，所述序列例如但不限于指定为SEQ ID No.1-20的核苷
酸序列，其列示于最后一个实施例之后的页上以及序列表中。在具体的实施方案中，细菌含
有包含核苷酸序列的DNA，所述核苷酸序列与指定为SEQ ID No.1-20的一个或多个DNA序列
具有至少97％、至少98％或至少99％的同源性。或者，细菌含有包含核苷酸序列的DNA，所述
核苷酸序列与如下一项或多项的DNA具有至少97％(例如97％，98％，99％，100％)的同源
性：共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤
胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus
cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃
球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短
双歧杆菌。

在一个实施方案中，组合物诱导的Th17细胞是转录因子RORgt阳性的T细胞或产生
IL-17的Th17细胞。在另一个实施方案中，组合物在粘膜表面促进保护性免疫应答。

一个实施方案是药物组合物，其诱导Th17细胞的增殖、累积或增殖和/或累积二
者，并促进免疫功能。所述药物组合物包含本文所述的细菌组合物及药学上可接受的组分，
如载剂、溶剂或稀释剂。在一个具体实施方案中，此种药物组合物包含(a)(1)至少一种(一
种或多种)表1中列出的或本文所述的细菌菌种，(2)至少一种(一种或多种)此类细菌的培
养物上清，或(3)至少一种(一种或多种)表1中列出的或本文所述的细菌菌种与至少一种
(一种或多种)此类细菌的至少一种(一种或多种)培养物上清的组合，及(b)药学上可接受
的组分，如载剂、溶剂或稀释剂。在具体实施方案中，上述(a)是至少一种选自下组的生物或
物质：共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼
瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus
cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃
球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短
双歧杆菌，及一种或多种所述细菌的培养物上清。在一些实施方案中，上述(a)(2)是所述细
菌的至少一种(一种或多种)的培养物上清。在一些实施方案中，所述至少一种生物或物质
是两种或更多种或三种或更多种。在一些实施方案中，所述至少一种生物或物质是四种或
更多种或五种或更多种。在一些实施方案中，所述至少一种生物或物质是10种或更多种。在
一些实施方案中，所述至少一种生物或物质是15种或更多种。在一些实施方案中，所述至少
一种生物或物质是20种。在进一步的实施方案中，上述(a)(1)是含有与本文提供的序列具
有至少97％的同源性(例如97％，98％，99％，或100％的同源性)的DNA的细菌(如来源于人
的细菌)，所述序列例如但不限于本文指定为SEQ ID No.1-20的核苷酸序列，其列示于例如
最后一个实施例之后的页上及序列表中。在药物组合物的具体实施例中，所述细菌含有与
指定为SEQ ID No.1-20的一个或多个DNA序列具有至少97％，至少98％，至少99％或至少
100％的同源性的DNA。

所述药物组合物诱导T辅助细胞(Th17细胞)的增殖和/或累积并促进免疫功能。

还提供了在个体(例如对其有需要的个体，如需要诱导Th17细胞增殖和/或累积的
个体)中诱导Th17细胞增殖、累积或增殖和累积二者的方法。该方法包括对个体施用本文所
述的细菌组合物或包含本文所述的细菌组合物的药物组合物。在该方法中，对个体(也称为
对其有需要的个体，其可以是健康个体或是需要预防、降低或治疗病况或疾病的个体)施用
至少一种选自下组的生物或物质：共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭
菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸
发酵梭菌，Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链
状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长
双歧杆菌假长亚种，和短双歧杆菌；一种或多种所述细菌的培养物上清或所述培养物上清
的一种或多种组分；或前述任意多项的组合。例如，可以将所述细菌组合物施用于需要治
疗、预防疾病或病况(如传染性疾病)或降低其严重程度的个体。

任选地，细菌组合物的施用可以与一种或多种抗生素的疗程进行组合，或在一种
或多种抗生素的疗程之后(preceeded by)进行。

任选地，细菌组合物的施用可以与至少一种益生元物质(prebiotic substance)
的施用进行组合，所述益生元物质相对于其他人共生细菌菌种的生长而言优先地帮助所述
细菌组合物中的菌种生长。在一个实施方案中，所述益生元物质是例如不易消化的寡糖。

在一个进一步的实施方案中，所述细菌组合物可用作佐剂来改进粘膜疫苗制剂的
效力。例如，所述细菌组合物可用作疫苗的佐剂，所述疫苗用于预防或治疗传染性疾病或癌
症。在一些实施方案中，提供了用于预防或治疗的方法，该方法包括将细菌组合物或药物组
合物作为疫苗佐剂施用。所述细菌组合物或药物组合物可以作为佐剂伴随现有的粘膜疫苗
一起施用。

在一个进一步的实施方案中，所述细菌组合物包含作为活性成分的至少一种选自
下组的生物：共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-
1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，
Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，
圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌
假长亚种，和短双歧杆菌，其中所述生物包含含有异源基因的表达载体，其也称为表达异种
蛋白质或肽(如抗原)的载体。

由本文所述组合物的施用引起的Th17细胞增殖或累积的诱导程度的评估可以通
过多种方法来进行，如通过测量施用前后Th17细胞的数目或通过测量Th17活性，如施用后
RORgt、IL-17A、IL-17F、IL-22、IL-23、IL-23R、CD161和CCR6中的至少一种的表达相对于利
用细菌组合物对个体的施用形成集落(或施用建群，administering colonization)前测定
的RORgt、IL-17A、IL-17F、IL-22、IL-23、IL-23R、CD161和CCR6中的至少一种的表达。此类评
估的结果用作个体中Th17细胞的增殖或累积的诱导指数。

在一个实施方案中，施用本文所述的组合物引起对Th17细胞的诱导，所述Th17细
胞是转录因子RORgt阳性的Th17细胞或产生IL-17的Th17细胞。

本文所述的组合物可以通过多种途径来施用，并且在一个实施方案中是口服施用
于对其有需要的个体，如对其有需要的患者。所述组合物可以以数种口服形式施用，如以干
粉末、冻干制剂、或溶解于液体制剂中、于肠溶胶囊中、于囊剂中、或于食物基质如酸乳或饮
料中施用。

还提供了监测受试者对使用本发明的细菌组合物治疗的应答的方法，其包括：(a)
在用本文所述的细菌组合物处理前从患者获得(至少一个；一个或多个)样品，如排泄物样
品或结肠活检样品；(b)在用本文所述的细菌组合物处理后从患者获得(至少一个；一个或
多个)对应的样品；以及(c)确定和比较(a)中获得的样品中至少一个选自下组的细菌菌种
的百分比或绝对计数：共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌
属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，
Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，
圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌
假长亚种，和短双歧杆菌，与(b)中获得的样品中相同的至少一个细菌菌种的百分比或绝对
计数，其中(b)中(用细菌组合物处理后)获得的样品比(a)中(处理前)获得的样品的值更
高，指示受试者已良好地应答于治疗(例如是受试者中增强的免疫应答的阳性指示物)。在
一些实施方案中，该方法还包括(d)基于(c)中的比较而进一步对患者施用细菌组合物或停
止施用细菌组合物。

还提供了获得诱导Th17的细菌组合物的方法，其包括(a)用抗生素氨苄青霉素或
具有相似谱的抗生素(例如氨基青霉素家族成员如阿莫西林、青霉素、或苄基青霉素)来处
理受试者；(b)从受试者获得(至少一个)样品，如排泄物样品或肠活检样品(“排泄物样品的
氨苄青霉素抗性细菌级分”)；(c)培养来自(b)的样品并从所得的菌落分离纯细菌菌株。在
优选实施方案中，(a)中的受试者是先前的无菌动物(ex-germ-free animal)，其利用获取
自人供者的排泄物样品形成集落(colonized with)。在优选实施方案中，(c)的纯细菌菌株
的分离通过盲肠内容物样品的系列稀释来进行，所述盲肠内容物样品在严格厌氧条件下平
板(plating)培养。在另一个实施方案中，该方法包括(a)从受试者获得(至少一个；一个或
多个)样品，如排泄物样品或肠活检；(b)用氨苄青霉素处理(a)样品；(c)培养经氨苄青霉素
处理的(b)的样品并分离纯细菌菌株。

还提供了抑制诱导Th17的细菌组合物以治疗个体中的自身免疫性疾病和炎性疾
病的方法，该方法包括对所述个体施用抗生素，如万古霉素和/或甲硝唑。

发明效果

本文所述的组合物能优良地诱导T辅助17细胞(Th17细胞)的增殖或累积。可以通
过施用主题组合物来促进个体中的免疫力，如通过以食物或饮料形式或作为饮食补充剂摄
入细菌组合物或是通过施用包含所述细菌组合物的药物组合物来进行。例如，主题组合物
可以用于预防或治疗传染性疾病，以及与粘膜疫苗组合用于预防由微生物等引起的疾病。
此外，如果食物或饮料(如健康食物)包含了主题组合物，健康个体可以容易且常规地摄入
所述组合物。因此，可以诱导Th17细胞的增殖和/或累积并由此改进免疫功能。

本文所述的组合物提供强力的、持久的、对患者友好的、且良性的针对传染性疾病
的治疗选择。例如，通常用抗生素来管控传染性疾病，这可能产生抗生素抗药性和/或机会
性感染；全身性疫苗由于其可注射特性而需要大量的纯化，这产生了传播血源性感染的风
险并且对于大规模疫苗接种而言是不可行的；现有的粘膜疫苗不能达到充分的强免疫应答
并且常常不如活减毒制剂稳定。

本文所述的用于与粘膜疫苗抗原组合的组合物还可以具有如下效果：增加针对抗
原的免疫应答，或延长针对抗原的免疫应答的持续时间，或使达到保护所需的抗原施用的
剂量和频率降低(例如减少含抗原的组合物的加强注射的数目)，或提高达到血清转化的患
者的比例，或在其他免疫策略无效的患者(例如年轻或老年群体)中引发最佳免疫应答。

附图简述

图1A是FACS点绘图(dot-plot diagram)，其显示了在CD4+淋巴细胞中的IL-17表
达结果的分析，所述细胞分离自无菌(GF)小鼠(左上小图)，或利用来自溃疡性结肠炎患者
的排泄物形成集落的且未处理的GF小鼠(GF+UC+NT，右上小图)，或利用来自溃疡性结肠炎
患者的排泄物形成集落且用饮用水中的氨苄青霉素处理过的GF小鼠(GF+UC+ABPC，左下小
图)，或利用来自溃疡性结肠炎患者的排泄物形成集落且用饮用水中的甲硝唑处理过的GF
小鼠(GF+UC+MNZ，右下小图)的结肠固有层(colonic lamina propia)。

图1B是图表，其显示了无菌小鼠(GF)、利用来自溃疡性结肠炎患者的排泄物形成
集落且未处理的GF小鼠(NT)、或利用来自溃疡性结肠炎患者的排泄物形成集落且用饮用水
中的氨苄青霉素处理过的GF小鼠(ABPC)或万古霉素处理过的GF小鼠(VCM)或多粘菌素B处
理过的GF小鼠(PL-B)或甲硝唑处理过的GF小鼠(MNZ)的CD4+淋巴细胞中IL-17+细胞比率的
分析结果。

图2显示了盲肠样品中具有相同最接近相关性(closest relative)的OTU的相对
丰度，所述盲肠样品来自利用来自溃疡性结肠炎患者的排泄物形成集落的，且仅给予水(未
处理：NT)或于饮用水中给予氨苄青霉素(+ABPC；1g/L)、或万古霉素(+VCM；500mg/L)、或多
粘菌素B(+PL-B；200mg/L)、或甲硝唑(+MNZ；1g/L)的IQI无菌小鼠；每组n＝5。与Th17细胞数
量负相关的OTU以蓝色或灰色标示，而与Th17细胞数量正相关的OTU以红色标记。

图3A显示了无菌小鼠和利用表1所示的20个菌株形成集落的无菌小鼠的结肠固定
层中CD4+T细胞群体中IL-17+细胞和IFN-g+的百分比。

图3B是图表，其显示了无菌小鼠对比利用表1所示的20个菌株形成集落的无菌小
鼠的结肠固定层(CLP)或小肠固定层(SILP)中的CD4+淋巴细胞中IL-17+细胞的比率的分析
结果。

表1针对分离自利用人患者排泄物形成集落且用氨苄青霉素处理的小鼠的盲肠内
容物的20个细菌菌株的每一个显示了来自RDP(Ribosomal DatabaseProject)数据库的已
知菌种中的最接近相关物，以及与所述最接近相关物的最大相似性。

实施方案描述

近期的研究显示，个体共生细菌控制粘膜疫苗系统中的其特异性的免疫细胞的分
化。例如，小鼠中的肠道共生细菌，分段丝状菌，其诱导粘膜的Th17细胞应答并增强针对具
有病原体的宿主胃肠道感染的抗性(NPL 11至13)。虽然已经鉴定出了鼠细菌共生体的具体
菌种，例如分段丝状菌(其能强力刺激Th17细胞)(NPL 11至13)，但尚未明确人共生细菌的
菌种是否对人免疫系统发挥相当的影响。此外，人肠道容纳超过一千种细菌菌种，其中许多
都尚未进行培养(NPL 14)。推测哪一种(如果有的话)可能对Th17细胞起作用是不可行的。

为了开发用于人用途的具有有益免疫功能的药物、疫苗、饮食补充剂、或食物，需
要鉴定出天然在人中形成集落且具有免疫调节特性的共生微生物。此外，由于尚未对人微
生物组中的许多共生体加以培养，因此需要开发出培养它们的方法，从而使其能通过工业
发酵工艺来生产并随后整合于药物或食品制剂中。

T辅助17(Th17)细胞是CD4+T辅助细胞的一个亚组，其在黏膜表面提供抗微生物免
疫力，这对于防御微生物如细菌和真菌是至关重要的。Th17细胞依赖于TGF-β和IL-6用于进
行分化，并且由种系特异性转录因子RORgt(NPL11、15、和16)所定义。表达RORgt的Th17细胞
大量存在于胃肠道中(NPL 6、17)。记忆CD4+和CD8+T细胞也可以因粘膜疫苗接种而产生。具
体而言，具有局域保护性功能的记忆Th17细胞可以通过粘膜疫苗接种来诱导(NPL 18)。

许多传染性疾病局限于粘膜上，或者感染原需要在感染早期过程中穿过粘膜。因
此，作为免疫的结果不仅需要得到全身免疫应答，还需要得到局部粘膜疫苗接种应答，其可
能增强针对感染的保护。因此，通过粘膜途径施用的疫苗能特别有效地保护抵抗粘膜病原
体。然而，现有的粘膜疫苗在粘膜处促进稳健免疫应答的能力有限，这是由于其对抗原的暴
露不足够长、由于提供的抗原量不足以诱发稳健应答、或是由于抗原的免疫原性或稳定性
不足所致。在一定程度上，由于这些原因，当前使用的大多数疫苗仍然是经肠道外途径施用
的。当宿主对免疫原性抗原的免疫应答过弱时，可能需要通过共同施用佐剂来将其增强。

因此，需要来源于人的具有强力诱导Th17细胞能力的共生细菌组合物，同样需要
制造此类组合物的方法。此类组合物可用于使宿主增加针对入侵身体的病原性微生物的稳
健免疫应答，并从而用作抗感染剂或作为粘膜疫苗的佐剂。

术语“T辅助17细胞(Th17细胞)”意指促进免疫应答并在免疫防疫中起作用的T细
胞。Th17细胞通常是转录因子RORgt阳性的、CD4阳性的T细胞。本发明的Th17细胞还包括转
录因子RORgt阴性但产生IL-17的、CD4阳性的T细胞。

术语“诱导Th17细胞增殖或累积”意指诱导未成熟T细胞分化为Th17细胞的效果，
该分化导致Th17细胞的增殖和/或累积。此外，“诱导Th17细胞增殖或累积”的含义包括体内
效果、体外效果、以及离体效果。包括所有如下效果：通过施用或摄入前述细菌、或所述细菌
的培养物上清或上清组分(一种或多种)来诱导Th17细胞的体内增殖或累积的效果；通过引
发前述细菌或所述细菌的培养物上清或上清组分(一种或多种)作用于培养的Th17细胞，从
而诱导培养的Th17细胞的增殖或累积的效果；以及通过引发前述细菌、所述细菌的培养物
上清或上清组分(一种或多种)、或来源于所述细菌的生理学活性物质作用于这样的Th17细
胞，来诱导所述Th17细胞的增殖或累积的效果，所述Th17细胞收集自活体且意欲随后将其
引入活体，如引入获取所述细胞的生物体或其他生物体。可以按照例如如下来评估诱导
Th17细胞增殖或累积的效果。具体而言，将前述细菌、所述细菌的培养物上清或上清组分
(一种或多种)、或来源于所述细菌的生理学活性物质口服施用于实验动物，如无菌小鼠，然
后分离胃肠道中的CD4阳性细胞，并通过流式细胞术来测量CD4阳性细胞中含有的Th17细胞
比率。

通过本发明的组合物来诱导其增殖或累积的Th17细胞优选为转录因子RORgt阳性
的Th17细胞或产生IL-17的Th17细胞。

在本发明中，“人来源的细菌”意指分离自从人个体获得的排泄物样品或胃肠道活
检的细菌菌种，或其祖先是分离自从人获得的排泄物样品或胃肠道活检的细菌菌种(例如
其是获取自排泄物样品或胃肠道活检的细菌的后代)。例如，所述细菌菌种可以是之前分离
自从人获得的排泄物样品或胃肠道活检的，并且培养了足够的时间以产生后代。然后将所
述后代进一步培养或冷冻。

在本发明中，术语“免疫应答”表示在具有运转的免疫系统的宿主中抗原(如蛋白
抗原)产生的任何反应。免疫应答可以是体液的，其涉及免疫球蛋白或抗体的产生；或是细
胞的，其涉及多种类型的B淋巴细胞和T淋巴细胞、树突细胞、巨噬细胞、抗原呈递细胞等等；
或二者均有涉及。免疫应答还可以涉及多种效应分子如细胞因子的产生或加工。

<具有诱导Th17细胞的增殖或累积的效果的组合物>

本文描述了诱导Th17细胞的增殖、累积或Th17细胞的增殖和累积二者的组合物。
所述组合物包含作为活性成分的如下的一种或多种：(至少一种，一种或多种)选自下组的
微生物(细菌)：共生梭菌(SEQ ID No 16)、哈氏梭菌(SEQ ID No 12)、Clostridium
citroniae(SEQ ID No 20)、鲍氏梭菌(SEQ ID No 19)、瘤胃球菌属菌种M-1(SEQ ID No
14)、活泼瘤胃球菌(SEQ ID No 9)、布劳特氏菌属菌种犬口类143(SEQ ID No 4)、粪厌氧棒
状菌(SEQ ID No 18)、乳酸发酵梭菌(SEQ ID No 3)、Coprobacillus cateniformis(SEQ
ID No 15)、多枝梭菌(SEQ ID No 1)、参见梭菌属菌种MLG055(SEQ ID No 5)、无害梭菌
(SEQ ID No 6)、链状真杆菌(SEQ ID No 11)、圆环梭菌(SEQ ID No 7)、瘤胃球菌属菌种
16442(SEQ ID No 8)、人肠道厌氧棒状菌(SEQ ID No 10)、Bacteroides dorei(SEQ ID No
17)、假长双歧杆菌假长亚种(SEQ ID No 2)、和短双歧杆菌(SEQ ID No 13)；所述细菌的一
种或多种的培养物上清；本文所述的(至少一种，一种或多种)细菌所生长的培养基的组分；
以及(至少一种；一种或多种)含有DNA的细菌，所述DNA包含与任何本文所述细菌菌种(例如
上文列出的那些)的DNA的核苷酸序列具有至少97％的同源性的核苷酸序列。本文所述细菌
用实施例1至3中概述的方法从人排泄物样品分离。

所述细菌组合物或药物组合物可以仅包括任何本文列出的或描述的细菌菌种的
一个菌株(仅一种菌株)；所述细菌的两种或更多种菌株可以一起使用。例如表1中列出的菌
株的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20个可以任何组合一起用
于影响Th17细胞。

如果使用了细菌的多于一种菌株，使用的菌株数量和比率可以有大量的变化。要
使用的数量和比率可以基于多种因素来确定(例如所需的效果，如Th17细胞的增殖或累积
的诱导或抑制；要治疗、预防或降低其严重程度的疾病或病况；受试者的年龄或性别；健康
人中菌株的通常数量)。菌株可以存在于单一组合物中，在这种情况下其可以一同(在单一
组合物中)被消耗或消化；或可存在于多于一个组合物中(例如可以在分开的组合物中)，在
这种情况下其可以单独被消耗或者可以将组合物进行组合从而使得组合(组合物的组合)
被消耗的或消化。可以施用任意数目或组合的证明为有效的菌株(例如任意数目为1-20，如
1-20、1-15、1-10、1-5、1-3、1-2以及其间的任意数目)。在本发明的一些实施方案中，使用了
本发明所述的20个菌株(例如表1中的20个菌株)的部分或全部的组合。例如，可以使用20种
所述菌株的至少1种、2种或更多种、3种、3种或更多种、4种、4种或更多种、5种、5种或更多
种、6种、6种或更多种，或任何其他数目，包括20种。它们可以互相组合使用或与未记载于引
述的文献中的菌株组合使用。

当前述细菌组合物培养于培养基中时，细菌中含有的物质、细菌产生的分泌产物
和代谢物从细菌释放出来。组合物中的活性成分“细菌的培养物上清”的含义包括此类物
质、分泌产物和代谢物。只要培养物上清具有诱导Th17细胞增殖或累积的效果，则所述培养
物上清不作具体限制。培养物上清的实例包括培养物上清的蛋白质级分、培养物上清的多
糖级分、培养物上清的脂质级分、和培养物上清的低分子量代谢物级分。

细菌组合物中的细菌菌株可以以活体形式施用，或其可以以减毒、灭活、或杀灭形
式(例如热杀灭的)施用。

细菌组合物可以以药物组合物、饮食补充剂、或食品或饮料(也可以是动物饲料)
的形式施用，或可以用作动物模型实验的试剂。所述药物组合物、饮食补充剂、食品或饮料、
以及试剂诱导Th17细胞的增殖或累积。本文呈示的实例揭示了所述细菌组合物在施用于动
物时诱导Th17细胞。本发明的组合物可以合适地用作具有促进免疫应答的效果的组合物。

例如，本发明的细菌组合物可以用作预防或治疗传染性疾病(降低其部分或全部
的不良作用)的药物组合物，所述传染性疾病如细菌感染、病毒感染、寄生虫感染、和真菌感
染。新鉴定的组合物的口服施用及其随后的胃肠道形成集落在粘膜表面诱导Th17细胞。这
些Th17细胞在粘膜表面介导针对若干感染原(包括细菌、病毒、真菌和寄生虫)的保护性免
疫应答。

可使用所述组合物来治疗(降低不良作用或预防)的目标感染性疾病更具体的实
例包括细菌感染，其包括但不限于：铜绿假单胞菌(P.aeruginosa)、大肠杆菌(E.coli)、破
伤风梭菌(C.tetani)、淋病奈瑟氏球菌(N.gonorrhoeae)、肉毒梭菌(C.botulinum)、克雷伯
氏菌属菌种(Klebsiella sp.)、沙雷氏菌属菌种(Serratia sp.)、假单胞菌属菌种
(Pseudomanas sp.)、洋葱假单胞菌(P.cepacia)、不动杆菌属菌种(Acinetobacter sp.)、
S.epidermis、粪肠球菌(E.faecalis)、S.pneumonias、金黄色葡萄球菌(S.aureus)、变形链
球菌(S.mutans)、嗜血菌属菌种(Haemophilus sp.)、奈瑟氏球菌属菌种(Neisseria Sp.)、
脑膜炎奈瑟氏球菌(N.meningitides)、拟杆菌属菌种(Bacteroides sp.)、柠檬酸杆菌属菌
种(Citrobacter sp.)、布兰汉氏球菌属菌种(Branhamella sp.)、沙门氏菌属菌种
(Salmonelia sp.)、志贺氏菌属菌种(Shigella sp.)、化脓性链球菌(S.pyogenes)、变形菌
属菌种(Proteus sp.)、梭菌属菌种(Clostridium sp.)、丹毒丝菌属菌种(Erysipelothrix
sp.)、利斯特氏菌属菌种(Listeria sp.)、多杀巴斯德氏菌(Pasteurella multocida)、链
杆菌属菌种(Streptobacillus sp.)、螺菌属菌种(Spirillum sp.)、梭螺菌属菌种
(Fusospirocheta sp.)、苍白密螺旋体(Treponema pallidum)、疏螺旋体属菌种(Borrelia
sp.)、放线菌属(Actinomycetes)、支原体属菌种(Mycoplasma sp.)、衣原体属菌种
(Chlamydia sp.)、立克次氏体属菌种(Rickettsia sp.)、螺旋体属菌种(Spirochaeta)、布
氏疏螺旋体(Borellia burgdorferi)、军团菌属菌种(Legionella sp.)、分枝杆菌属菌种
(Mycobacteria sp)、尿枝原体属菌种(Ureaplasma sp)、链霉菌属菌种(Streptomyces
sp.)、奇可莫拉菌属菌种(Trichomoras sp.)、奇异变形杆菌(P.mirabilis)、霍乱弧菌
(vibrio cholera)、产肠毒素大肠杆菌(enterotoxigenic Escherichia coli)、艰难梭菌
(Clostridium difficile)、伤寒沙门氏菌(Salmonella typhi)、白喉棒杆菌
(C.diphtheria)、麻风分枝杆菌(Mycobacterium leprae)、Mycobacterium lepromatosi；
病毒感染包括但不限于小核糖核酸病毒科(picornaviridae)、杯状病毒科
(caliciviridae)、披膜病毒科(togaviridae)、黄病毒科(flaviviridae)、冠状病毒科
(coronaviridae)、弹状病毒科(rhabdoviridae)、纤丝病毒科(filoviridae)、副粘病毒科
(paramyxoviridae)、正粘病毒科(orthomyxoviridae)、本扬病毒科(bunyaviridae)、沙粒
病毒科(arenaviridae)、呼肠孤病毒科(reoviridae)、逆转录病毒科(retroviridae)、肝脱
氧核糖核酸病毒科(hepadnaviridae)、细小病毒科(parvoviridae)、乳多空病毒科
(papovaviridae)、腺病毒科(adenoviridae)、疱疹病毒科(herpesviridae)、痘病毒科
(poxviridae)、轮状病毒(rotavirus)、副流感病毒(parainfluenza virus)、甲型和乙型流
感病毒(influenza virus A and B)、梅毒(syphilis)、HIV、狂犬病病毒(rabies virus)、
EB病毒(Epstein-Barr virus)、及单纯疱疹病毒(herpes simplex virus)；寄生虫感染包
括但不限于恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)、间日疟原虫(P.vivax)、卵形疟原虫
(P.ovale)、三日疟原虫(P.malaria)、鼠弓形虫(Toxoplasma gondii)、墨西哥利什曼原虫
(Leishmania mexicana)、热带利什曼原虫(L.tropica)、硕大利什曼原虫(L.major)、埃塞
俄比亚利什曼原虫(L.aethiopica)、杜氏利什曼虫(L.donovani)、克氏锥虫(Trypanosoma
cruzi)、布氏锥虫(T.brucei)、曼氏血吸虫(Schistosoma mansoni)、埃及血吸虫
(S.haematobium)、日本血吸虫(S.japonium)、旋毛虫(Trichinella spiralis)、班氏丝虫
(Wuchereria bancrofti)、马来丝虫(Brugia malayli)、溶组织内阿米巴(Entamoeba
histolytica)、蛲虫(Enterobius vermiculoarus)、猪肉绦虫(Taenia solium)、牛带绦虫
(T.saginata)、阴道毛滴虫(Trichomonas vaginatis)、人毛滴虫(T.hominis)、口腔毛滴虫
(T.tenax)、蓝氏贾第鞭毛虫(Giardia lamblia)、微小隐孢子虫(Cryptosporidium
parvum)、卡氏肺孢子虫(Pneumocytis carinii)、牛巴贝虫(Babesia bovis)、分歧巴贝虫
(B.divergens)、田鼠巴贝虫(B.microti)、Isospore belli、L hominis、脆双核阿米巴
(Dientamoeba fragiles)、旋盘尾丝虫(Onchocerca volvulus)、人蛔虫(Ascaris
lumbricoides)、美洲钩虫(Necator americanis)、十二指肠钩口线虫(Ancylostoma
duodenale)、粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis)、菲律宾毛细线虫(Capillaria
philippinensis)、广州管圆线虫(Angiostrongylus cantonensis)、微小膜壳绦虫
(Hymenolepis nana)、阔节裂头绦虫(Diphyllobothrium latum)、细粒棘球绦虫
(Echinococcus granulosus)、多房棘球绦虫(E.multilocularis)、卫氏并殖吸虫
(Paragonimus westermani)、P.caliensis、中华枝睾吸虫(Chlonorchis sinensis)、猫后
睾吸虫(Opisthorchis felineas)、G.Viverini、肝片吸虫(Fasciola hepatica)、疥螨
(Sarcoptes scabiei)、人虱(Pediculus humanus)、阴虱(Phthirius pubis)、及人肤蝇
(Dermatobia hominis)；且真菌感染包括但不限于新型隐球菌(Cryptococcus
neoformans)、皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis)、皮炎阿耶洛霉(Aiellomyces
dermatitidis)、荚膜组织孢浆菌(Histoplasfria capsulatum)、粗球袍子菌
(Coccidioides immitis)、念珠菌属菌种(Candida species)，包括白色念珠菌
(C.albicans)、热带假丝酵母(C.tropicalis)、近平滑假丝酵母(C.parapsilosis)、季也蒙
假丝酵母(C.guilliermondii)和克鲁斯假丝酵母(C.krusei)、曲霉属菌株(Aspergillus
species)，包括烟曲霉(A.fumigatus)、黄曲霉(A.flavus)和黑曲霉(A.niger)，根霉属菌种
(Rhizopus species)，根毛霉属菌种(Rhizomucor species)、小克银汉霉属菌种
(Cunninghammella species)、节壶霉属菌种(Apophysomyces species)，包括
A.saksenaea、A.mucor和A.absidia、申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii)、巴西副球孢
子菌(Paracoccidioides brasiliensis)、假阿利什霉菌(Pseudallescheria boydii)、光
滑球拟酵母(Torulopsis glabrata)，以及皮癣菌属菌种(Dermatophyres species)。

细菌组合物可以作为佐剂与抗原材料组合施用。所述抗原材料可以包含病原体的
蛋白外壳、蛋白核心、或功能性蛋白和肽的一个或多个部分，或完整病原体(活的、杀灭的、
灭活的、或减毒的)，或可包含一个或多个癌表位或癌抗原。抗原材料可在细菌组合物之前
或之后施用，或是共同施用。细菌组合物还可以与现有的粘膜疫苗一起施用，所述粘膜疫苗
如流感疫苗(例如来自MedImmune的FluMist或来自的印度血清研究所(Serum Institute
of India)的NASOVAC)、轮状病毒疫苗(例如来自Merck的RotaTeq或来自GlaxoSmithKline
的Rotarix)、伤寒疫苗(例如来自Crucell的Vivotif，Ty21A)、霍乱疫苗(例如来自Crucell
的Orochol，来自Shantha Biotechnics的Shanchol)、旅行者腹泻疫苗(例如来自Crucell的
Dukoral)，以及与如下的抗原一起施用：活减毒甲型流感病毒H1株，活减毒甲型流感病毒H3
株，乙型流感病毒，活减毒H1N1流感病毒(猪流感)，活减毒轮状病毒，单价和多价脊髓灰质
炎病毒，减毒活伤寒沙门氏菌，缺乏霍乱毒素亚基A的活重组霍乱弧菌，具有或不具有霍乱
毒素亚基B的完全杀灭的霍乱弧菌O1经典和El Tor生物型，癌抗原，癌表位，及其组合。

使用本领域技术人员熟知的遗传工程方法，可以将细菌组合物工程化以表达来自
所选病原体或癌抗原的特异性抗原，并用作例如用于延长暴露于所述抗原并诱导比口服单
独施用可溶性抗原更强的粘膜免疫应答的药物组合物。在一个实施方案中，来自表1的生物
体可以通过掺入表达异种抗原的表达载体来工程化。所述异种抗原可以包括但不限于流感
HA，NA，M2，HIVgp120，结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis)Ag85B和ESAT6，肺炎链
球菌(Streptococcus pneumonia)PspA，PsaA和CbpA，呼吸道合胞体病毒(RSV)F和G蛋白，人
乳头状瘤病毒蛋白，和癌抗原。此外，还可以将Th-17诱导菌株工程化以使其在宿主中具有
有限的复制能力，同时在免疫位点递送足够高的抗原负载，从而避免该菌株的长期集落形
成。

可以抑制本文所述的细菌组合物及其他Th17诱导菌株以用于预防或治疗(降低其
部分或全部的不良作用)自身免疫性疾病和炎症疾病。Th17细胞还可能具有在宿主中促进
慢性自身免疫和炎症反应的有害作用。因此，通过施用损害其生长和/或功能的分子、或直
接杀死Th17诱导菌株来抑制Th17诱导菌株的方法可用于治疗由Th17应答介导的自身免疫
性疾病和炎症疾病。包括但不限于万古霉素和甲硝唑的抗生素可用于抑制Th17诱导菌株。
可通过抑制Th17诱导菌株来治疗的目标疾病包括：炎性肠病(IBD)，溃疡性结肠炎，克罗恩
氏病(Crohn's disease)，口炎性腹泻，自身免疫性关节炎，类风湿性关节炎，I型糖尿病，多
发性硬化，骨关节炎，系统性红斑狼疮，胰岛素依赖性糖尿病，哮喘，牛皮癣，特应性皮炎，移
植物抗宿主病，与器官移植相关的急性或慢性免疫疾病，结节病(sarcoidosis)，动脉粥样
硬化，特应性变态反应(atopic allergy)，食物过敏如花生过敏，树坚果过敏，鸡蛋过敏，牛
奶过敏，大豆过敏，小麦过敏，海产过敏，贝类过敏或芝麻过敏，过敏性鼻炎(花粉变态反
应)，过敏反应，宠物过敏，乳胶过敏，药物过敏，过敏性鼻结膜炎(rhinoconjuctivitis)，嗜
酸性粒细胞性食管炎(eosinophilic esophagitis)和腹泻，及其他。

药物制剂可以由本领域技术人员已知的药物配制方法描述的细菌组合物来配制。
例如，组合物可以以胶囊，片剂，药丸，小囊，液体，粉末，颗粒，细颗粒，薄膜包衣制剂，丸剂，
锭剂，舌下制剂，咀嚼剂，颊含制剂，糊剂，糖浆剂，悬浮剂，酏剂和乳剂来口服使用，或者其
可以以栓剂或灌肠剂使用。

用于粘膜疫苗接种的药物制剂可以配制成口服形式，例如水性或油性溶剂中的溶
液，悬浮液或乳液，或干燥为粉末。此外，根据目的，可以向粘膜疫苗制剂添加缓冲剂，等张
剂，舒缓剂，防腐剂或抗氧化剂。

为了配制这些制备物，细菌组合物可以与药理学上可接受的或对于摄取而言可接
受的载剂适当地组合使用，例如在食品或饮料中，包括如下一种或多种：无菌水，生理盐水，
植物油，溶剂，碱性材料，乳化剂，悬浮剂，表面活性剂，稳定剂，调味剂，芳香剂，赋形剂，载
剂，防腐剂，粘合剂，稀释剂，张力调节剂，舒缓剂，填充剂，崩解剂，缓冲剂，包衣剂，润滑剂，
着色剂，甜味剂，增稠剂，矫味剂，增溶剂，以及其他添加剂。

药物制备物或制剂，特别是用于口服施用的药物制备物可以包含能够有效地将本
发明的细菌组合物递送至结肠的额外组分，以便更有效地诱导结肠中Th17的增殖或累积。
可以使用能够将细菌组合物递送至结肠的多种药物制备物。其实例包括pH敏感组合物，更
具体地是缓冲的小囊制剂或肠溶聚合物，当所述肠溶聚合物通过胃后在pH变为碱性时释放
其内容物。当pH敏感性组合物用于配制药物制备物时，pH敏感性组合物优选为其分解pH阈
值为约6.8至约7.5的聚合物。该数值范围是在胃的末端部pH向碱性侧移动的范围，因此是
适于用于向结肠递送的范围。

用于将细菌组合物递送至结肠的药物制备物的另一个实施方案是通过延迟内容
物(例如细菌组合物)的释放约3至5小时(其对应于小肠运输时间)来确保递送至结肠。在用
于延迟释放的药物制备物的一个实施方案中，使用水凝胶作为壳。水凝胶在与胃肠液接触
时水合并膨胀，导致内容物有效地释放(主要在结肠中释放)。延迟释放剂量单位包括含药
组合物，其具有包衣涂覆或选择性包衣涂覆待施用的药物或活性成分的材料。这种选择性
包衣材料的实例包括体内可降解聚合物，可逐渐水解的聚合物，逐渐水溶性聚合物和/或酶
可降解的聚合物。用于有效地延迟释放的多种包衣材料是可用的，并且其包括例如基于纤
维素的聚合物如羟丙基纤维素，丙烯酸聚合物和共聚物例如甲基丙烯酸聚合物和共聚物，
以及乙烯基聚合物和共聚物例如聚乙烯吡咯烷酮。

能够递送至结肠的组合物的实例还包括特异性粘附至结肠粘膜的生物粘附组合
物(例如美国专利6.368.586的说明书中描述的聚合物)和其中掺入蛋白酶抑制剂的组合
物，用于保护尤其是胃肠道中的生物药物制备物免受蛋白酶的活性所分解。

细菌组合物可以用作食品或饮料，例如保健食品或饮料，旅行者，婴儿，孕妇，运动
员，老年人或其他特定群体的食品或饮料，功能性食品，用于特定保健用途的食品或饮料，
膳食补充剂，用于患者的食品或饮料，或动物饲料。

将细菌组合物添加至无抗生素的动物饲料，使得能够将摄取动物饲料的动物的体
重增加至等于或高于通过摄入含抗生素的动物饲料所达到的水平，还使得可以将胃肠道中
的病原细菌减少至与消耗典型的含抗生素的动物饲料的动物中的那些相等的水平。细菌组
合物可以用作不需要添加抗生素的动物饲料的组分。可以用包含细菌组合物的动物饲料饲
喂各种不同类型的动物和不同年龄的动物，并且可以定期饲喂或饲喂一段具体的时间(例
如在出生时、在断奶期间、或当动物被迁移或运输时)。

细菌组合物的细菌活性成分可以使用发酵技术来制备。在一个实施方案中，细菌
活性成分使用厌氧发酵罐来制备，其可以支持细菌菌株的快速生长。厌氧发酵罐可以是例
如搅拌釜反应器或一次性波生物反应器(disposable wave bioreactor)。培养基例如BL琼
脂，或这些培养基的没有动物组分的类似形式，可用于支持细菌菌种的生长。细菌产物可以
通过诸如离心和过滤的技术从发酵液中纯化和浓缩，并且可以任选地干燥和冻干。

要施用或摄取的细菌组合物的量可以根据经验确定，考虑到诸如要接受其的个体
的年龄，体重，性别，症状，健康状况等因素，以及要施用或摄取的细菌组合物(药物产品，食
品或饮料)的种类。例如，每次施用或摄取的量通常为0.01mg/kg体重至100mg/kg体重，并且
在具体实施方案中为1mg/kg体重至10mg/kg体重。本文还描述了用于促进受试者的免疫(赋
予(或增强)免疫应答)的方法，所述方法的特征在于如上所述对受试者施用或使其摄取所
述细菌组合物。

细菌组合物可以施用于个体一次，或者其可以施用多于一次。如果组合物被施用
多于一次，其可以定期施用(例如，每天一次，每两天一次，每周一次，每两周一次，每月一
次，每6个月一次或每年一次)或根据需要施用或不定期施用。可根据经验确定适当的施用
频率(其可取决于宿主遗传特征，年龄，性别，受试者的健康或疾病状态，以及其他因素)。例
如，可以给患者施用一剂的组合物，并可以在不同的时间测量从患者获得的排泄物样品中
组合物的细菌菌株的水平(例如1天后，2天后，1周后，2周后，1个月后)。当细菌水平降至例
如其最大给药后值的一半时，可以施用第二剂，等等。

包含细菌组合物或其手册的产品(药物产品，食品或饮料，或试剂)可以伴有解释
该产品可用于促进免疫的文件或说明(包括陈述该产品具有促进免疫的效果的说明和陈述
该产物具有促进Th17细胞的增殖或功能的效果的说明)。在此，“对具有注释的产品或其手
册的提供”是指将文件或说明提供于产品的主体，容器，包装等，或者提供注释于手册，包装
插页，小册传单或其他印刷品，其公开了关于产品的信息。

<诱导Th17细胞的增殖或累积的方法>

如上文所述，以及如实施例1-3所示，对个体施用细菌组合物使得可以诱导个体中
Th17细胞的增殖或累积。这提供了诱导个体中Th17细胞增殖或累积的方法，该方法包括：对
个体施用选自下组的至少一项，下组包括：(a)共生梭菌，哈氏梭菌，Clostridium
citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌属菌种犬口类143，
粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus cateniformis，多枝梭菌，参见梭菌属菌种
MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠道厌氧棒状菌，
Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短双歧杆菌；(b)至少一种(一种或多种)本
文所述/所列的细菌的培养物上清；或(a)和(b)的组合。细菌组合物以足以产生诱导所需
Th17细胞的增殖、累积或增殖和累积二者的量施用(提供于)个体。其可以施用于需要治疗
传染性疾病或降低其严重程度的个体。其还可以作为粘膜疫苗制剂的佐剂施用于需要预防
传染性疾病的个体。

需注意，“个体”或“受试者”(例如人)可以是健康状态或患病状态。该方法可以进
一步包括任选的在细菌组合物之前或与其组合施用至少一种(一种或多种)抗生素的步骤。

此外，可使用益生元组合物来相对于其他人共生细菌物种生长促进细菌组合物中
的菌种的生长。在一个实施方案中，所述益生元物质(一种或多种)是不可消化的寡糖。在个
体中诱导Th17的增殖和/或累积的方法可以包括对所述个体施用至少一种益生元或至少一
种抗生素与细菌组合物的组合。本文还涵盖包含细菌组合物和益生元组合物或抗生素组合
物的组合物。

对于治疗组合物与选自细菌组合物，“粘膜疫苗制剂”，“粘膜疫苗抗原”，“抗生
素”，和“益生元组合物”中的至少一种物质的组合使用没有特别限制。例如，“一种物质”和
治疗组合物在任何适当的时间同时或序贯地/分别地口服或肠胃外施用于个体。

可以通过使用如下至少一项的增加或增强作为指数来确定细菌组合物的施用是
否诱导Th17细胞的增殖和/或累积：Th17细胞的数量，胃肠道T细胞群体中Th17细胞的比率，
Th17细胞的功能，或Th17细胞的标志物的表达。具体方法是测量患者样品(如活检或血液样
品)中表达RORgt的Th17细胞的测量计数或百分比，IL-17表达的促进(增强)，或利用施用的
细菌组合物个体的集落形成，作为Th17细胞增殖或累积的诱导指数。检测这种表达的方法
包括用于检测转录水平的基因表达的northern印迹，RT-PCR和斑点印迹；用于检测翻译水
平的基因表达的ELISA，放射免疫测定，免疫印迹，免疫沉淀和流式细胞术。可用于测量这种
指数的样品包括获取自个体的组织和液体(例如血液)，获取于活检中的组织和液体，以及
排泄物样品。

<用于监测受试者对细菌组合物的应答的方法>

还提供了监测受试者(例如人)对使用本文所述的细菌组合物的治疗的应答的方
法，其包括(a)获得(一个或多个，至少一个)样品，如来自用本文所述细菌组合物处理前的
患者的排泄物样品或结肠活检；(b)获得(一个或多个，至少一个)来自用本文所述细菌组合
物处理后的患者的对应样品；和(c)将(a)中获得的样品中的至少一个选自共生梭菌，哈氏
梭菌，Clostridium citroniae，鲍氏梭菌，瘤胃球菌属菌种M-1，活泼瘤胃球菌，布劳特氏菌
属菌种犬口类143，粪厌氧棒状菌，乳酸发酵梭菌，Coprobacillus cateniformis，多枝梭
菌，参见梭菌属菌种MLG055，无害梭菌，链状真杆菌，圆环梭菌，瘤胃球菌属菌种16442，人肠
道厌氧棒状菌，Bacteroides dorei，假长双歧杆菌假长亚种，和短双歧杆菌的细菌的百分
比或绝对计数与(b)中获得的样品中的相同的至少一个细菌菌种的百分比或绝对计数进行
比较，其中(b)中(用细菌组合物处理后)获得的样品比(a)中(处理前)获得的样品的值更
高，指示受试者已良好地应答于治疗(例如是受试者中增强的免疫应答的阳性指示物)。在
一些实施方案中，该方法还包括(d)基于(c)中的比较而进一步对患者施用细菌组合物或停
止施用细菌组合物。在本文所述的监测方法中，多种已知方法可用于确定细菌菌种的百分
比或绝对计数。例如可以使用16S rRNA测序。

<获得诱导Th17的细菌组合物的方法>

对排泄物样品应用的一些修饰可以导致获得诱导Th17的细菌组合物。令人惊讶的
是，向动物施用氨苄青霉素丰富了Th17诱导菌株在样品中的表征。通过在严格厌氧条件下
在实施例2中描述的某些培养基中铺板来从氨苄青霉素处理的动物中培养系列稀释的样
品，导致获得有效的诱导Th17的细菌组合物。因此，提供了获得诱导Th17的细菌组合物的方
法，其包括(a)用抗生素氨苄青霉素或具有类似谱的抗生素例如氨基青霉素家族成员例如
阿莫西林，青霉素或苄基青霉素来处理受试者；(b)获得(一个或多个，至少一个)来自受试
者的样品，例如排泄物样品或肠活检；(c)培养来自(b)的样品并从所得菌落分离纯细菌菌
株。在优选实施方案中，(a)中的受试者是先前的无菌动物，其首先用获取自人供体的排泄
物样品来形成集落，然后用氨苄青霉素处理，之后从动物获得盲肠样品并如实施例2所述培
养。在一个实施方案中，(c)纯细菌菌株的分离是通过盲肠内容物样品的系列稀释并在严格
厌氧条件下铺板培养而进行的。在另一个实施方案中，该方法包括(a)获得(至少一个)来自
受试者的样品，如排泄物样品或肠活检；(b)用氨苄青霉素处理(a)的样品；(c)培养(b)的经
氨苄青霉素处理的样品并分离纯细菌菌株。

<使用诱导Th17的细菌组合物来重新建立接受抗生素处理个体的微生物群的方法
>

细菌组合物可以施用于还接受抗生素处理的个体。发明人已经证明，诸如万古霉
素或甲硝唑的抗生素可以有效地消除或大大减少来自哺乳动物胃肠道的Th17诱导细菌菌
种，并随后降低Th17细胞的水平(实施例1)。不希望受理论束缚，Th17诱导细菌促进免疫应
答的关键作用强烈地表明它们的存在或高水平可以在自身免疫性疾病中发挥关键作用。因
此，经历诸如万古霉素或甲硝唑的抗生素疗程的个体处于丧失Th17诱导细菌的高风险中并
因此经历免疫缺陷，其可以通过使用细菌组合物预防性地“再重新建立(repopulated)”。细
菌组合物可以在抗生素治疗之前，与之同时或之后施用，但优选为与抗生素治疗同时施用
或在抗生素治疗后施用。

下文为描述具体方面的实施例。它们不意在以任何方式进行限制。

实施例

实施例1

将来自处于临床活性状态的溃疡性结肠炎(UC)日本患者的人排泄物(2g)用8ml含
有20％甘油的磷酸盐缓冲盐水(PBS)重悬，于液氮中速冻，并储存于-80℃直至使用。将冻存
的储液解冻，并将其口服接种至IQI无菌(GF)小鼠(250μl/小鼠)。对小鼠在其饮用水中给予
氨苄青霉素(ABPC；1g/L)、万古霉素(VCM；500mg/L)、多粘菌素B(PL-B；200mg/L)、甲硝唑
(MNZ；1g/L)、或仅水(未处理的：NT)，从用UC患者排泄物接种后1天开始直至分析日。将每组
的ex-GF小鼠(每组n＝5)分离地养在乙烯基隔离室中4周。

收集结肠并纵向打开，用PBS洗涤以除去所有腔内容物，并于37℃在含有5mM EDTA
的Hanks平衡盐溶液(HBSS)中振荡20分钟。在用镊子除去上皮细胞、肌肉层和脂肪组织后，
将固有层切成小片并与含有4％胎牛血清(FBS)、0.5mg/mL胶原酶D、0.5mg/mL分散酶和
40mg/mL DNA酶I(均为RocheDiagnostics)的RPMI1640在37℃于振荡水浴中温育1小时。用
含有5mM EDTA的HBSS洗涤消化的组织，将其重悬于5mL的40％Percoll(GE Healthcare)中
并覆盖在15-ml Falcon管中的2.5ml的80％Percoll上。通过在25℃以800g离心20分钟进行
Percoll梯度分离。从Percoll梯度的界面收集固有层淋巴细胞并悬浮于含有10％FBS的
RPMI1640中。为了进行Th1和Th17细胞的分析，在GolgiStop(BD Biosciences)存在下，用
50ng/mL佛波醇12-豆蔻酸酯13-乙酸酯(PMA，Sigma)和750ng/mL离子霉素(Sigma)刺激分离
的淋巴细胞4小时。温育4小时后，在PBS中洗涤细胞，用LIVE/DEAD可固定死细胞染色试剂盒
(Invitrogen)进行标记，并且用PECy7标记的抗CD4Ab(RM4-5,BD Biosciences)和BV605标
记的抗CD3Ab(17A2,BioLegend)将表面CD4和CD3染色。洗涤细胞，固定并用Foxp3染色缓冲
液套组(eBioscience)透明化，并用APC标记的抗IL-17Ab(eBio17B7，eBioscience)和BV421
标记的抗IFN-g Ab(XMG1.2,BioLegend)染色。用LSR Fortessa(BD Biosciences)分析Ab染
色的细胞，并用FlowJo软件(Treestar)分析数据。

在口服接种UC患者排泄物的小鼠中，观察到Th17细胞的显著诱导。令人惊奇的是，
与仅给予水的小鼠(未处理的：NT)相比，在饮用水中给予氨苄青霉素(ABPC)的小鼠中Th17
诱导增强。相比之下，通过用万古霉素(VCM)或甲硝唑(MNZ)处理，Th17诱导显著受损。另一
方面，用多粘菌素B(PL-B)处理不影响Th17细胞数量(图1)。

因此，人的排泄物中存在Th17诱导细菌，并且细菌菌种对氨苄青霉素和多粘菌素B
有抗性，但对万古霉素和甲硝唑敏感。

实施例2

将来自实施例1中所述的每个exGF小鼠的盲肠内容物悬浮于10mL的含有10mM
Tris-HCl和1mM EDTA的Tris-EDTA(pH 8)中，并在37℃与溶菌酶(SIGMA，15mg/mL)温和混合
1小时。加入纯化的无色肽酶(Wako)(终浓度为2000单位/mL)，并在37℃再温育30分钟。然后
向细胞悬浮液中加入十二烷基硫酸钠(终浓度1％)并充分混合。随后向悬浮液加入蛋白酶K
(Merck)(终浓度1mg/mL)并将混合物在55℃温育1小时。经苯酚/氯仿提取、乙醇，和最后的
聚乙二醇沉淀，分离和纯化高分子量的DNA。用Ex Taq(TAKARA)和针对16SrRNA基因的V1-V2
区的(i)修饰的引物8F[5’-CCATCTCATCCCTGCGTGTCTCCGACTCAG(454转接子序列，SEQ ID
NO.:21)+Barcode(10个碱基)+AGRGTTTGATYMTGGCTCAG(SEQ ID NO.:22)-3’]和(ii)修饰的
引物338R[5’-CCTATCCCCTGTGTGCCTTGGCAGTCTCAG(454转接子序列，SEQ ID NO.:23)+
TGCTGCCTCCCGTAGGAGT(SEQ ID NO.:24)-3’]进行了PCR。随后将产生自每个样品的扩增子
(～330bp)用AMPure XP(BECKMAN COULTER)进行纯化。用Quant-iT Picogreen dsDNA测定
试剂盒(Invitrogen)和TBS-380微型荧光计(Turner Biosystems)对DNA的量进行定量。然
后，用扩增的DNA作为模板用于IonPGM测序仪。基于序列相似性(≥96％同一性)将所得的序
列(每个样品产生了3000个读段)分类成OTU。用BLAST将来自每个OTU的代表性序列与核酸
数据库(Ribosomal Database Project)或GenomeDB(NCBI+HMP+Hattori Lab数据库)中的
序列进行比较，以确定最接近的株。

与Th17细胞数目负相关的OTU以蓝色或灰色示于图2中，而与Th17细胞数目正相关
的OTU以红色标记。

来自利用UF患者的排泄物形成集落且给予了氨苄青霉素的小鼠的盲肠内容物的
系列稀释物通过在严格厌氧条件(80％N2 10％H2 10％CO2)下铺板培养于用5％去纤维蛋白
的马血(Nippon Bio-Supp.Center)补充的BL琼脂(Eiken Chemical)、用5％去纤维蛋白的
马血补充的GAM琼脂(Nissui)、用5％去纤维蛋白的马血补充的胰蛋白(Tryptic)大豆琼脂
(Becton Dickinson)、用5％去纤维蛋白的马血补充的加强梭菌琼脂(Oxoid)、Schaedler琼
脂(BectonDickinson)或脑心浸液琼脂(Becton Dickinson)上。在37℃培养2天后，挑取每
个单菌落(总共250个菌落)，并在-80℃贮存于含有10％甘油的Schaedler培养液(Becton
Dickinson)中。为了鉴定分离的菌株，通过菌落PCR用g KOD FX(TOYOBO)和16S rRNA基因特
异性引物对：8F(5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’)(SEQ ID NO.:25)和1492R(5’-
GGYTACCTTGTTACGACTT-3’)(SEQ ID NO.:26)来扩增16S rRNA基因。扩增程序包括：一个循
环，98℃2分钟，然后35个循环，98℃10秒，57℃30秒和68℃90秒。使用AMPure XP从反应混合
物纯化每个扩增的DNA。使用BigDye Terminator V3.1循环测序试剂盒(Applied
Biosystems)和Applied Biosystems 3730xl DNA分析仪(Applied Biosystems)进行序列
分析。将所得序列与RDP数据库中的序列进行比较以确定最接近的亲缘关系。对这些挑取的
菌落的16S rRNA基因序列的BLAST检索揭示，我们成功地分离了20个菌株(表1)。

实施例3

为了研究分离的20个菌株(表1)是否具有诱导Th17细胞的能力，将全部20个菌株
培养和混合以制成混合物，并将所述混合物口服接种至GF小鼠中。用Schaedler或PYG培养
液在厌氧室(Coy Laboratory Products)内在严格厌氧条件下(80％N2,10％H2,10％CO2)于
37℃分别地培养分离的20个菌株，然后以等量的培养基体积混合以制备细菌混合物。将等
份试样的细菌混合物口服接种至小鼠中(0.5ml/小鼠)。4周后，收集结肠和小肠并分析Th17
和Th1细胞。指示的小鼠的结肠固有层和小肠固有层中的CD4+T细胞群体内IL-17+细胞和
IFN-g+的百分比示于图3中。在(接种)利用20个菌株形成集落(建群)的小鼠中，观察到了对
Th17细胞的强诱导。

SEQ ID No.:2H6、1B11、1D10、2E3、1C12、2G4、2H11、1E11、2D9、2F7、1D1、1F8、1C2、
1D4、1E3、1A9、2G11、2E1、1F7、1D2，分别是SEQ ID No.1-20。

工业应用性

如上文所见，本文所述的组合物与方法使得可以通过利用某些来源于人的细菌或
来源于所述细菌的上清液等等来提供优良的且充分表征的用于诱导Th17增殖或累积的组
合物。由于细菌组合物具有促进免疫应答的效果，所述细菌组合物可作为粘膜疫苗的组分
用于例如治疗感染，以及预防感染。此外，健康个体能容易地且常规地摄取所述细菌组合
物，如在食品或饮料(例如保健食品)中摄取，以提高其免疫功能。

本申请是基于美国临时专利申请61/978,182(申请日2014年4月10日)，其内容以
其全文并入本文。

表1

表2

>2H6(SEQ ID NO.:1)

GGGGCGGCTGCTATAATGCAGTCGACGCGAGCACTTGTGCTCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATA
AGTAACCTGCCCTAGACAGGGGGATAACTATTGGAAACGATAGCTAAGACCGCATATGTACGGACACTGCATGGTGA
CCGTATTAAAAGTGCCTCAAAGCACTGGTAGAGGATGGACTTATGGCGCATTAGCTGGTTGGCGGGGTAACGGCCCA
CCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGG
GAGGCAGCAGTAGGGAATTTTCGGCAATGGGGGAAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAAGGAAGAAGGTTTTCGG
ATTGTAAACTTCTGTTATAAAGGAAGAACGGCGGCTACAGGAAATGGTAGCCGAGTGACGGTACTTTATTAGAAAGC
CACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGG
GAGCAGGCGGCAGCAAGGGTCTGTGGTGAAAGCCTGAAGCTTAACTTCAGTAAGCCATAGAAACCAGGCAGCTAGAG
TGCAGGAGAGGATCGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCG
ACGATCTGGCCTGCAACTGACGCTCAGTCCCGAAAGCGTGGGGAGCAAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACGC
CGTAAACGATGAGTACTAAGTGTTGGATGTCAAAGTTCAGTGCTGCAGTTAACGCAATAAGTACTCCGCCTGAGTAG
TACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGC
AACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATACTCATAAAGGCTCCAGAGATGGAGAGATAGCTATATGAGATACAGG
TGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCGTTAGT
TACCATCATTAAGTTGGGGACTCTAGCGAGACTGCCAGTGACAAGCTGGAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCATC
ATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTGCAGAGGGAAGCGAAGCCGCGAGGTGAAGCAAA
ACCCATAAAACCATTCTCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGAA
TCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTGATAACACCCGAA
GCCGGTGGCCTAACCGCAAGGAAGGAGCTTCTAAGGTGGAT

表3

>1B11(SEQ ID NO.:2)

CTGCGGCGTCTACCATGCAGTCGAACGGGATCCCTGGCAGCTTGCTGCCGGGGTGAGAGTGGCGAACGG
GTGAGTAATGCGTGACCGACCTGCCCCATGCACCGGAATAGCTCCTGGAAACGGGTGGTAATGCCGGATGTTCCACA
TGAGCGCATGCGAGTGTGGGAAAGGCTTTTTGCGGCATGGGATGGGGTCGCGTCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA
CGGCCTACCAAGGCGTTGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGCGACCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACT
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGCGGGATGGAGG
CCTTCGGGTTGTAAACCGCTTTTGTTCAAGGGCAAGGCACGGTCTTTGGCCGTGTTGAGTGGATTGTTCGAATAAGC
ACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGC
TCGTAGGCGGTTCGTCGCGTCCGGTGTGAAAGTCCATCGCTTAACGGTGGATCCGCGCCGGGTACGGGCGGGCTTGA
GTGCGGTAGGGGAGACTGGAATTCCCGGTGTAACGGTGGAATGTGTAGATATCGGGAAGAACACCAATGGCGAAGGC
AGGTCTCTGGGCCGTTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACG
CCGTAAACGGTGGATGCTGGATGTGGGGCCCTTTTTCCGGGTCCTGTGTCGGAGCTAACGCGTTAAGCATCCCGCCT
GGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGAAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATT
CGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATGTGCCGGACGCCCGCGGAGACGCGGGTTCCCTTCGGGGCCG
GTTCACAGGTGGTGCATGGTCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTC
GCCGCGTGTTGCCAGCGGGTCATGCCGGGAACTCACGTGGGACCGCCGGGGTTAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGAC
GTCAGATCATCATGCCCCTTACGTCCAGGGCTTCACGCATGCTACAATGGCCGGTACAACGGGGTGCGACACGGTGA
CGTGGGGCGGATCCCTGAAAACCGGTCTCAGTTCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGGTGGAGTCGCTA
GTAATCGCGGATCAGCAACGCCGCGGTGAATGCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGTCATGAAAGTGG
GCAGCACCCGAAGACGGTGGCCTAACCCTTGTGGGGGGAGCCGTCTAAGGTAGTG

表4

>1D10(SEQ ID NO.:3)

CTGCCGGCTCTACCATGCAGTCGAACGAAGATAGTTAGAATGAGAGCTTCGGCAGGATTTTTTTCTATC
TTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGTGTGGGCAACCTGCCCTGTACTGGGGAATAATCATTGGAAACGATGACTAATA
CCGCATGTGGTCCTCGGAAGGCATCTTCTGAGGAAGAAAGGATTTATTCGGTACAGGATGGGCCCGCATCTGATTAG
CTAGTTGGTGAGATAACAGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTG
AGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCC
GCGTGAAGGATGAAGGGTTTCGGCTCGTAAACTTCTATCAATAGGGAAGAAACAAATGACGGTACCTAAATAAGAAG
CCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGG
AGCGTAGGCGGCATGGTAAGCCAGATGTGAAAGCCTTGGGCTTAACCCGAGGATTGCATTTGGAACTATCAAGCTAG
AGTACAGGAGAGGAAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGG
CGGCTTTCTGGACTGAAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCAC
GCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTCGGGGAGGAATCCTCGGTGCCGCAGCTAACGCAATAAGCACTCCACCTGGGG
AGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAA
GCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATCCCGATGACCGTCCTAGAGATAGGACTTCTCTTCGGAGCATCGGT
GACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATC
TTCAGTAGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTGGAGAGACTGCCGTGGATAACACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAA
ATCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCTGGTAACAAAGTGACGCGAGACGGCGACGTT
AAGCAAATCACAAAAACCCAGTCCCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAA
TCGCGAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGAAGC
ACCCGAAGTCGGTGACCTAACCGTAAGGAAGAGCCGCCGAAGTAGGGGAT

表5

>2E3(SEQ ID NO.:4)

CGGCGCTCTACCATGCAGTCGACGAAGCGATTTGAATGAAGTTTTCGGATGGATTTTAAATTGACTGAG
TGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACCTGCCCCATACAGGGGGATAACAGTTAGAAATGACTGCTAATACCGC
ATAAGACCACAGCGCCGCATGGTGCAGGGGTAAAAACTCCGGTGGTATGGGATGGACCCGCGTCTGATTAGCTTGTT
GGCGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGACCGGCCACATTGGGACTGAGACAC
GGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGA
GTGATGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCGGCTA
ACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTAGAC
GGCTGTGCAAGTCTGGAGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCCCGGGACTGCTTTGGAAACTGTACGGCTGGAGTGCTGGA
GAGGCAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTGCT
GGACAGTAACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAAC
GATGAATGCTAGGTGTCGGGGAGCAAAGCTCTTCGGTGCCGCCGCAAACGCAATAAGCATTCCACCTGGGGAGTACG
TTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACG
CGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCCCCTGACCGGCAAGTAATGTCGCCTTTCCTTCGGGACAGGGGAGACAGG
TGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTCAGT
AGCCAGCAGGTGAAGCTGGGCACTCTGTGGAGACTGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCA
TCATGCCCCTTATGACTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGGGAAGCGAGAGGGTGACCTGGAGCA
AATCCCAAAAATAACGTCTCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCG
AATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGCAACGCCCG
AAGCCGGTGACCTAACCGCAAGGAAGGAGCCGTCGAAGTCGTCG

表6

>1C12(SEQ ID NO.:5)

CGGCGCTGCTATACTGCAGTCGAACGAAGCGAAGGTAGCTTGCTATCGGAGCTTAGTGGCGAACGGGTG
AGTAACACGTAGATAACCTGCCTGTATGACCGGGATAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGGATAGGCAGAGAGG
AGGCATCTCTTCTCTGTTAAAGTTGGGATACAACGCAAACAGATGGATCTGCGGTGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTA
ACGGCCCACCAAGGCGATGATGCATAGCCGGCCTGAGAGGGCGAACGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAAC
TCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATTTTCGGCAATGGGGGAAACCCTGACCGAGCAATGCCGCGTGAGTGAAGACG
GCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTTGTAAGGGAAGAACGGCATAGAGAGGGAATGCTCTATGAGTGACGGTACCTTAC
CAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCG
TAAAGGGTG

CGTAGGCGGCTGGATAAGTCTGAGGTAAAAGCCCGTGGCTCAACCACGGTAAGCCTTGGAAACTGTCTG
GCTGGAGTGCAGGAGAGGACAATGGAATTCCATGTGTAGCGGTAAAATGCGTAGATATATGGAGGAACACCAGTGGC
GAAGGCGGTTGTCTGGCCTGTAACTGACGCTGAAGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAATAGGATTAGATACCCTAGTAG
TCCACGCCGTAAACGATGAGAACTAAGTGTTGGGGAAACTCAGTGCTGCAGTTAACGCAATAAGTTCTCCGCCTGGG
GAGTATGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGA
CGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGCCTTGACATGGTATCAAAGGCCCTAGAGATAGGGAGATAGGTATGATACACAC
AGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTTCT
AGTTACCAACAGTAAGATGGGGACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATC
ATCATGCCCCTTATGGCCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCGTCTACAAAGAGCAGCGAGCAGGTGACTGTAAGC
GAATCTCATAAAGGACGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGC
GGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAACCATGGGAGTTGATAATACCC
GAAGCCGGTGGCCTAACCGAAAGGAGGGAGCCGTCGAAGTAGATTG

表7

>2G4(SEQ ID NO.:6)

CGGCGCTGCTATAATGCAGTCGAACGAAGTTTCGAGGAAGCTTGCTTCCAAAGAGACTTAGTGGCGAAC
GGGTGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCATGTGTCCGGGATAACTGCTGGAAACGGTAGCTAAAACCGGATAGGTAT
ACAGAGCGCATGCTCAGTATATTAAAGCGCCCATCAAGGCGTGAACATGGATGGACCTGCGGCGCATTAGCTAGTTG
GTGAGGTAACGGCCCACCAAGGCGATGATGCGTAGCCGGCCTGAGAGGGTAAACGGCCACATTGGGACTGAGACACG
GCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATTTTCGTCAATGGGGGAAACCCTGAACGAGCAATGCCGCGTGAG
TGAAGAAGGTCTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTAAGTGAAGAACGGCTCATAGAGGAAATGCTATGGGAGTGACGG
TAGCTTACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATC
ATTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGTGGCGTACTAAGTCTGTAGTAAAAGGCAATGGCTCAACCATTGTAAGCTATGGA
AACTGGTATGCTGGAGTGCAGAAGAGGGCGATGGAATTCCATGTGTAGCGGTAAAATGCGTAGATATATGGAGGAAC
ACCAGTGGCGAAGGCGGTCGCCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAATAGGATTAGATA
CCCTAGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGAACTAAGTGTTGGAGGAATTCAGTGCTGCAGTTAACGCAATAAGTTCT
CCGCCTGGGGAGTATGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGT
TTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGCCTTGACATGGATGCAAATGCCCTAGAGATAGAGAGATAATTAT
GGATCACACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
CTTGTCGCATGTTACCAGCATCAAGTTGGGGACTCATGCGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA
CGTCAAATCATCATGCCCCTTATGGCCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCGACCACAAAGAGCAGCGACACAGTG
ATGTGAAGCGAATCTCATAAAGGTCGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAAGTCGGAATCGCT
AGTAATCGCAGATCAGCATGCTGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAACCATGGGAGTCA
GTAATACCCGAAGCCGGTGGCATAACCGTAAGGAGGAGCCGTCGAAGTGACTG

表8

>2H11(SEQ ID NO.:7)

AGGGCGGCTCTTAAATGCAGTCGAACGGGGTGCTCATGACGGAGGATTCGTCCAACGGATTGAGTTACC
TAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGAGGAACCTGCCTTGGAGAGGGGAATAACACTCCGAAAGGAGTGCTAATAC
CGCATGATGCAGTTGGGTCGCATGGCTCTGACTGCCAAAGATTTATCGCTCTGAGATGGCCTCGCGTCTGATTAGCT
AGTAGGCGGGGTAACGGCCCACCTAGGCGACGATCAGTAGCCGGACTGAGAGGTTGACCGGCCACATTGGGACTGAG
ACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGGCAATGGGCGCAAGCCTGACCCAGCAACGCCGC
GTGAAGGAAGAAGGCTTTCGGGTTGTAAACTTCTTTTGTCGGGGACGAAACAAATGACGGTACCCGACGAATAAGCC
ACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGCG
TGTAGGCGGGATTGCAAGTCAGATGTGAAAACTGGGGGCTCAACCTCCAGCCTGCATTTGAAACTGTAGTTCTTGAG
TGCTGGAGAGGCAATCGGAATTCCGTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATACGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCG
GATTGCTGGACAGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGC
CGTAAACGATGGATACTAGGTGTGGGGGGTCTGACCCCCTCCGTGCCGCAGTTAACACAATAAGTATCCCACCTGGG
GAGTACGATCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGA
AGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCCACTAACGAGGCAGAGATGCGTTAGGTGCCCTTCGGGGAAAG
TGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT
TATTGTTAGTTGCTACGCAAGAGCACTCTAGCGAGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAA
TCATCATGCCCCTTATGTCCTGGGCCACACACGTACTACAATGGTGGTTAACAGAGGGAGGCAATACCGCGAGGTGG
AGCAAATCCCTAAAAGCCATCCCAGTTCGGATTGCAGGCTGAAACCCGCCTGTATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATC
GCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTCGGGAACAC
CCGAAGTCCGTAGCCTAACCGCAAGGAGGGCGCGGCCGAAAGTTGTTCAT

表9

>1E11(SEQ ID NO.:8)

CGGGGGCTGCTACCATGCAGTCGAACGGAGTTAAGAGAGCTTGCTCTTTTAACTTAGTGGCGGACGGGT
GAGTAACGCGTGAGTAACCTGCCTTTCAGAGGGGAATAACATTCTGAAAAGAATGCTAATACCGCATGAGATCGTAG
TATCGCATGGTACAGCGACCAAAGGAGCAATCCGCTGAAAGATGGACTCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGAGATAA
AGGCCCACCAAGGCGACGATCGGTAGCCGGACTGAGAGGTTGAACGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGGATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAAGGAAGAAGG
TCTTCGGATTGTAAACTTCTGTCCTCAGGGAAGATAATGACGGTACCTGAGGAGGAAGCTCCGGCTAACTACGTGCC
AGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGAGCAAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGTGCGTAGGCGGATCTGCAA
GTCAGTAGTGAAATCCCAGGGCTTAACCCTGGAACTGCTATTGAAACTGTGGGTCTTGAGTGAGGTAGAGGCAGGCG
GAATTCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCCTGCTGGGCCTTAAC
TGACGCTGAGGCACGAAAGCATGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGATGATTACT
AGGTGTGGGTGGTCTGACCCCATCCGTGCCGGAGTTAACACAATAAGTAATCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGT
TGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCT
TACCAGGTCTTGACATCCTGCTAACGAGGTAGAGATACGTTAGGTGCCCTTCGGGGAAAGCAGAGACAGGTGGTGCA
TGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGCTATTAGTTGCTACG
CAAGAGCACTCTAATAGGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATG
ACCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCCGTCAACAGAGAGAAGCAAAGCCGCGAGGTGGAGCAAAACTCTAAAAAC
GGTCCCAGTTCGGATCGTAGGCTGCAACCCGCCTACGTGAAGTTGGAATTGCTAGTAATCGCGGATCATCATGCCGC
GGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGCCGGTAATACCCGAAGTCAGTAGTCTA
ACCGCAAGGGGACGCGCCGAAAGGTGGAGTG

表10

>2D9(SEQ ID NO.:9)

CTGGCGGGTGCTACCATGCAGTCGAGCGAAGCACTTTTGCGGATTTCTTCGGATTGAAGCAATTGTGAC
TGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACCTGCCTCATACAGGGGGATAACAGTTGGAAACGGCTGCTAATA
CCGCATAAGCGCACAGTACCGCATGGTACCGTGTGAAAAACTCCGGTGGTATGAGATGGACCCGCGTCTGATTAGCT
AGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGACCGGCCACATTGGGACTGAG
ACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGC
GTGAGCGATGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCG
GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGT
AGACGGCATGGCAAGCCAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCCCGGGACTGCATTTGGAACTGTCAGGCTAGAGTGT
CGGAGAGGAAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCT
TTCTGGACGATGACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGT
AAACGATGAATACTAGGTGTCGGGTGGCAAAGCCATTCGGTGCCGCAGCAAACGCAATAAGTATTCCACCTGGGGAG
TACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTGGAAGC
AACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCCTCTGACCGCTCTTTAATCGGAGTTTTCTTTCGGGACAGAGGAGA
CAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCTT
TAGTAGCCAGCATTTAGGGTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAA
TCATCATGCCCCTTATGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGGGAAGCGAGCCCGCGAGGGGGA
GCAAATCCCAAAAATAACGTCTCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATC
GCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGTAACGC
CCGAAGTCAGTGACCCAACCGTAAGGAGGAGCTGCCGAAGTGTACTAT

表11

>2F7(SEQ ID NO.:10)

GAGTGGGCCGCTACCATGCAGTCGACGAGCCGAGGGGAGCTTGCTCCCCAGAGCTAGTGGCGGACGGGT
GAGTAACACGTGAGCAACCTGCCTTTCAGAGGGGGATAACGTTTGGAAACGAACGCTAATACCGCATAACATACCGG
GACCGCATGATTCTGGTATCAAAGGAGCAATCCGCTGAAAGATGGGCTCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGCGGGGTAA
CGGCCCACCAAGGCGACGATCGGTAGCCGGACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGGATATTGCACAATGGAGGAAACTCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGAAGACGG
TCTTCGGATTGTAAACCTCTGTCTTTGGGGACGATAATGACGGTACCCAAGGAGGAAGCTCCGGCTAACTACGTGCC
AGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGAGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTAGGCGGGGTCTCAA
GTCGAATGTTAAATCTACCGGCTCAACTGGTAGCTGCGTTCGAAACTGGGGCTCTTGAGTGAAGTAGAGGCAGGCGG
AATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCCTGCTGGGCTTTTACT
GACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATTACTA
GGTGTGGGGGGACTGACCCCTTCCGTGCCGGAGTTAACACAATAAGTAATCCACCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTT
GAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGATTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTT
ACCAGGTCTTGACATCGAGTGACGGCTCTAGAGATAGAGCTTTCCTTCGGGACACAAAGACAGGTGGTGCATGGTTG
TCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTATTAGTTGCTACATTCAGT
TGAGCACTCTAATGAGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGAC
CTGGGCTACACACGTAATACAATGGCGATCAACAGAGGGAAGCAAGACCGCGAGGTGGAGCAAACCCCTAAAAGTCG
TCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGTCGGAATTGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGG
TGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCGGTAACACCCGAAGTCAGTAGCCTAAC
CGCAAAGAGGGCGCTGCCGAAGATGGATT

表12

>1D1(SEQ ID NO.:11)

ATGGCGGCTGCTACCTGCAGTCGAACGGGGTTATTTTGGAAATCTCTTCGGAGATGGAATTCTTAACCT
AGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGAGCAATCTGCCTTTAGGAGGGGGATAACAGTCGGAAACGGCTGCTAATACC
GCATAATACGTTTGGGAGGCATCTCTTGAACGTCAAAGATTTTATCGCCTTTAGATGAGCTCGCGTCTGATTAGCTG
GTTGGCGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGGACTGAGAGGTTGAACGGCCACATTGGGACTGAGA
CACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCG
TGATTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGATCTTTAATCAGGGACGAAAAATGACGGTACCTGAAGAATAAGCTCCG
GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGAGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGCGCGC
AGGCGGGCCGGCAAGTTGGGAGTGAAATCCCGGGGCTTAACCCCGGAACTGCTTTCAAAACTGCTGGTCTTGAGTGA
TGGAGAGGCAGGCGGAATTCCGTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATACGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCC
TGCTGGACATTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGT
AAACGATGGATACTAGGTGTGGGAGGTATTGACCCCTTCCGTGCCGCAGTTAACACAATAAGTATCCCACCTGGGGA
GTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAG
CAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCGATGACCGGCGTAGAGATACGCCCTCTCTTCGGAGCATCGGTG
ACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTACGG
TTAGTTGATACGCAAGATCACTCTAGCCGGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCA

AATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCAGTCATACAGAGGGAAGCAATA
CCGCGAGGTGGAGCAAATCCCTAAAAGCTGTCCCAGTTCAGATTGCAGGCTGCAACCCGCCTGCATGAAGTCGGAAT
TGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGA
GCCGTCAATACCCGAAGTCCGTAGCCTAACCGCAAGGGGGCGCGCCGAAGTTACGT

表13

>1F8(SEQ ID NO.:12)

ATCGGGTGCTACCTGCAAGTCGAGCGAAGCGGTTTCGATGAAGTTTTCGGATGGAATTGAAATTGACTT
AGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACCTGCCTTACACTGGGGGATAACAGTTAGAAATGACTGCTAATACC
GCATAAGCGCACAGGGCCGCATGGTCTGGTGCGAAAAACTCCGGTGGTGTAAGATGGACCCGCGTCTGATTAGGTAG
TTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGACCGGCCACATTGGGACTGAGAC
ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCGACGCCGCGT
GAGTGAAGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCGGC
TAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTAG
ACGGTTAAGCAAGTCTGAAGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCCCGGTACTGCTTTGGAAACTGTTTGACTTGAGTGCAG
GAGAGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTA
CTGGACTGTAACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAA
ACGATGAATACTAGGTGTCGGGGGACAACGTCCTTCGGTGCCGCCGCTAACGCAATAAGTATTCCACCTGGGGAGTA
CGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAA
CGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCCATTGAAAATCCTTTAACCGTGGTCCCTCTTCGGAGCAATGGAGACA
GGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTA
GTAGCCAGCACATGATGGTGGGCACTCTGGGGAGACTGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAAT
CATCATGCCCCTTATGATTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGGGAAGCAAAGGAGCGATCTGGAG
CAAACCCCAAAAATAACGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCG
CGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTAACGCC
CGAAGTCAGTGACCCAACCGTAAGGAGGAGCGCCGAAGGCGAGGT

表14

>1C2(SEQ ID NO.:13)

CGGGGCTGCTTAAATGCAGTCGAACGGGATCCATCAAGCTTGCTTGGTGGTGAGAGTGGCGAACGGGTG
AGTAATGCGTGACCGACCTGCCCCATGCACCGGAATAGCTCCTGGAAACGGGTGGTAATGCCGGATGCTCCATCACA
CTGCATGGTGTGTTGGGAAAGCCTTTGCGGCATGGGATGGGGTCGCGTCCTATCAGCTTGATGGCGGGGTAACGGCC
CACCATGGCTTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGCGACCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTAC
GGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATGGAGGCCTTC
GGGTTGTAAACCTCTTTTGTTAGGGAGCAAGGCATTTTGTGTTGAGTGTACCTTTCGAATAAGCACCGGCTAACTAC
GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGTAGGCGGTTC
GTCGCGTCCGGTGTGAAAGTCCATCGCTTAACGGTGGATCCGCGCCGGGTACGGGCGGGCTTGAGTGCGGTAGGGGA
GACTGGAATTCCCGGTGTAACGGTGGAATGTGTAGATATCGGGAAGAACACCAATGGCGAAGGCAGGTCTCTGGGCC
GTTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGGTGG
ATGCTGGATGTGGGGCCCGTTCCACGGGTTCCGTGTCGGAGCTAACGCGTTAAGCATCCCGCCTGGGGAGTACGGCC
GCAAGGCTAAAACTCAAAGAAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGA
AGAACCTTACCTGGGCTTGACATGTTCCCGACGATCCCAGAGATGGGGTTTCCCTTCGGGGCGGGTTCACAGGTGGT
GCATGGTCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCCGTGTTGCC
AGCGGATTGTGCCGGGAACTCACGGGGGACCGCCGGGGTTAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAGATCATCAT
GCCCCTTACGTCCAGGGCTTCACGCATGCTACAATGGCCGGTACAACGGGATGCGACAGCGCGAGCTGGAGCGGATC
CCTGAAAACCGGTCTCAGTTCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGGCGGAGTCGCTAGTAATCGCGAATC
AGCAACGTCGCGGTGAATGCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGTCATGAAAGTGGGCAGCACCCGAAG
CCGGTGGCCTAACCCCTTGCGGGAGGGAGCCGTCTAAGGTAGGTT

表15

>1D4(SEQ ID NO.:14)

CGGGCGCTGCTTACCTGCAGTCGAGCGAAGCACTTGAGCGGATTTCTTCGGATTGAAGTTTTTTTGACT
GAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACCTGCCTCATACAGGGGGATAACAGTTAGAAATGGCTGCTAATAC
CGCATAAGCGCACAGGACCGCATGGTCTGGTGTGAAAAACTCCGGTGGTATGAGATGGACCCGCGTCTGATTAGCTA
GTTGGAGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGAACGGCCACATTGGGACTGAGA
CACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGCG
TGAAGGAAGAAGTATCTCGGTATGTAAACTTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCGG
CTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA
GACGGAAGAGCAAGTCTGATGTGAAAGGCTGGGGCTTAACCCCAGGACTGCATTGGAAACTGTTTTTCTAGAGTGCC
GGAGAGGTAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTT
ACTGGACGGTAACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTA
AACGATGAATACTAGGTGTCGGGTGGCAAAGCCATTCGGTGCCGCAGCAAACGCAATAAGTATTCCACCTGGGGAGT
ACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCA
ACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCCTCTGACCGGCCCGTAACGGGGCCTTCCCTTCGGGGCAGAGGAGAC
AGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCCTT
AGTAGCCAGCAGGTGAAGCTGGGCACTCTAGGGAGACTGCCGGGGATAACCCGGAGGAAGGCGGGGACGACGTCAAA
TCATCATGCCCCTTATGATTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGGGAAGCGAGACAGCGATGTTGA
GCAAATCCCAAAAATAACGTCCCAGTTCGGACTGCAGTCTGCAACTCGACTGCACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATC
GCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGTAACGC
CCGAAGTCAGTGACCCAACCTTATAGGAGGAGCGCCGAAGTCGACCT

表16

>1E3(SEQ ID NO.:15)

CGCGGGTGCTATACTGCAGTCGAACGCACTGATTTTATCAGTGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATA
AGTAACCTGCCCTCATGAGGGGGATAACTATTAGAAATGATAGCTAAGACCGCATAGGTGAAGGGGTCGCATGACCG
CTTCATTAAATATCCGTATGGATAGCAGGAGGATGGACTTATGGCGCATTAGCTGGTTGGTGAGGTAACGGCTCACC
AAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGGACGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA
GGCAGCAGTAGGGAATTTTCGGCAATGGGGGAAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGGGAAGAAGTATTTCGGTA
TGTAAACCTCTGTTATAAAGGAAGAACGGTATGAATAGGAAATGATTCATAAGTGACGGTACTTTATGAGAAAGCCA
CGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTTATCCGGAATCATTGGGCGTAAAGAGGGA
GCAGGCGGCAATAGAGGTCTGCGGTGAAAGCCTGAAGCTAAACTTCAGTAAGCCGTGGAAACCAAATAGCTAGAGTG
CAGTAGAGGATCGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGAC
GATCTGGGCTGCAACTGACGCTCAGTCCCGAAAGCGTGGGGAGCAAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACGCCG
TAAACGATGAGTACTAAGTGTTGGGGGTCAAACCTCAGTGCTGCAGTTAACGCAATAAGTACTCCGCCTGAGTAGTA
CGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAA
CGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATACCTCTAAAGGCTCTAGAGATAGAGAGATAGCTATAGGGGATACAGGTG
GTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCGCTAGTTA
CCATCATTAAGTTGGGGACTCTAGCGAGACTGCCTCTGCAAGGAGGAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCATCATG
CCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGACGGATCAAAGGGAAGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCGAAACC
CAAAAACCCGTTCTCAGTTCGGACTGCAGTCTGCAACTCGACTGCACGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCA
GAATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTTGGTAACACCCGAAGCC
GGTGGCTTAACCGCAAGGAGAGAGCTTCTAAGGTGAAT

表17

>1A9(SEQ ID NO.:16)

AGGCGCGTGCTACCATGCAGTCGAACGAAGCAATTTAACGGAAGTTTTCGGATGGAAGTTGAATTGACT
GAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACCTGCCTTGTACTGGGGGACAACAGTTAGAAATGACTGCTAATAC
CGCATAAGCGCACAGTATCGCATGATACAGTGTGAAAAACTCCGGTGGTACAAGATGGACCCGCGTCTGATTAGCTA
GTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGACCGGCCACATTGGGACTGAGA
CACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCG
TGAGTGAAGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCGG
CTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA
GACGGTAAAGCAAGTCTGAAGTGAAAGCCCGCGGCTCAACTGCGGGACTGCTTTGGAAACTGTTTAACTGGAGTGTC
GGAGAGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTT
ACTGGACGATAACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTA
AACGATGAATACTAGGTGTTGGGGAGCAAAGCTCTTCGGTGCCGTCGCAAACGCAGTAAGTATTCCACCTGGGGAGT
ACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCA
ACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCGATCCGACGGGGGAGTAACGTCCCCTTCCCTTCGGGGCGGAGAAGAC
AGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTCTA
AGTAGCCAGCGGTTCGGCCGGGAACTCTTGGGAGACTGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAAT
CATCATGCCCCTTATGATCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGAGAAGCAAGACCGCGAGGTGGAG
CAAATCTCAAAAATAACGTCTCAGTTCGGACTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCG
CGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGTAACGCC
CGAAGTCAGTGACCCAACCGCAAGGAGGAGCGCCGAAGGCGACCGT

表18

>2G11(SEQ ID NO.:17)

CGGTCTCGGCTTACCATGCAGTCGAGGGGCAGCATGGTCTTAGCTTGCTAAGGCTGATGGCGACCGGCG
CACGGGTGAGTAACACGTATCCAACCTGCCGTCTACTCTTGGCCAGCCTTCTGAAAGGAAGATTAATCCAGGATGGC
ATCATGAGTTCACATGTCCGCATGATTAAAGGTATTTTCCGGTAGACGATGGGGATGCGTTCCATTAGATAGTAGGC
GGGGTAACGGCCCACCTAGTCAACGATGGATAGGGGTTCTGAGAGGAAGGTCCCCCACATTGGAACTGAGACACGGT
CCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGGCGATGGCCTGAACCAGCCAAGTAGCGTGAAGG
ATGACTGCCCTATGGGTTGTAAACTTCTTTTATAAAGGAATAAAGTCGGGTATGCATACCCGTTTGCATGTACTTTA
TGAATAAGGATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGT
TTAAAGGGAGCGTAGATGGATGTTTAAGTCAGTTGTGAAAGTTTGCGGCTCAACCGTAAAATTGCAGTTGATACTGG
ATGTCTTGAGTGCAGTTGAGGCAGGCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCTTAGATATCACGAAGAACTCCGAT
TGCGAAGGCAGCCTGCTAAGCTGCAACTGACATTGAGGCTCGAAAGTGTGGGTATCAAACAGGATTAGATACCCTGG
TAGTCCACACGGTAAACGATGAATACTCGCTGTTTGCGATATACGGCAAGCGGCCAAGCGAAAGCGTTAAGTATTCC
ACCTGGGGAGTACGCCGGCAACGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGAGGAACATGTGGTTT
AATTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCCGGGCTTAAATTGCACTCGAATGATCCGGAAACGGTTCAGCTAGCAATA
GCGAGTGTGAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCGGCTTAAGTGCCATAACGAGCGCAAC
CCTTGTTGTCAGTTACTAACAGGTGATGCTGAGGACTCTGACAAGACTGCCATCGTAAGATGTGAGGAAGGTGGGGA
TGACGTCAAATCAGCACGGCCCTTACGTCCGGGGCTACACACGTGTTACAATGGGGGGTACAGAGGGCCGCTACCAC
GCGAGTGGATGCCAATCCCTAAAACCCCTCTCAGTTCGGACTGGAGTCTGCAACCCGACTCCACGAAGCTGGATTCG
CTAGTAATCGCGCATCAGCCACGGCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGGAG
CCGGGGGTACCTGAAGTGCGTAACCGCGAGGATCGCCCTAGGTAATGA

表19

>2E1(SEQ ID NO.:18)

CGGCGGCTGCTTACCATGCAGTCGAACGAAGCATTTAGGATTGAAGTTTTCGGATGGATTTCCTATATG
ACTGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGGAACCTGCCCTATACAGGGGGATAACAGCTGGAAACGGCTGCTAA
TACCGCATAAGCGCACAGAATCGCATGATTCAGTGTGAAAAGCCCTGGCAGTATAGGATGGTCCCGCGTCTGATTAG
CTGGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGGCTTGAGAGAGTGAACGGCCACATTGGGACTG
AGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCC
GCGTGAGTGAAGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAACAGACGGTACCTGACTAAGAAGCC
CCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGTG
CGTAGGTGGCATGGTAAGTCAGAAGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGACTGCTTTTGAAACTGTCATGCTGGAG
TGCAGGAGAGGTAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCG
GCTTACTGGACTGTCACTGACACTGATGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGC
CGTAAACGATGAATACTAGGTGTCGGGGCCGTAGAGGCTTCGGTGCCGCAGCAAACGCAGTAAGTATTCCACCTGGG
GAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGA
AGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCCAATGACCGAACCTTAACCGGTTTTTTCTTTCGAGACATTGG
AGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTAT
CTTTAGTAGCCAGCATTTAAGGTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGACGACGTC
AAATCATCATGCCCCTTATGGCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGGGAAGCGAAGTCGTGAGGC
GAAGCAAATCCCAGAAATAACGTCTCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTA
ATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGTAA
CGCCCGAAGTCAGTGACCCAACCGCAAGGAGGGAGCTGCCGAAGTACGAG

表20

>1F7(SEQ ID NO.:19)

TTTGTGGCGAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGTGAAGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCA
GCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGG
GCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTAGACGGCGAAGCAAGTCTGAAGTGAAAACCCAGGGCTC
AACCCTGGGACTGCTTTGGAAACTGTTTTGCTAGAGTGTCGGAGAGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAAT
GCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTACTGGACGATAACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGG
GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCTAGGTGTTGGGGGGCAAAGCCCTTC
GGTGCCGTCGCAAACGCAGTAAGCATTCCACCTGGGGAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGG
ACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCTCTTGA
CCGGCGTGTAACGGCGCCTTCCCTTCGGGGCAAGAGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGA
TGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTAGTAGCCAGCAGGTAAAGCTGGGCACTCTAGGGAGAC
TGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGATTTGGGCTACACACGTGCT
ACAATGGCGTAAACAAAGGGAAGCAAGACAGTGATGTGGAGCAAATCCCAAAAATAACGTCCCAGTTCGGACTGTAG
TCTGCAACCCGACTACACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTC
TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGCAACGCCCGAAGTCAGTGACCCAACTCGCAAGAGAGGGAGCGC
CGAAGTCGTCAT

表21

>1D2(SEQ ID NO.:20)

CTGGCGCGGCTACCATGCAGTCGAGCGAAGCATTACAGCGGAAGTTTTCGGATGGAAGCTTTAATGACT
GAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACCTGCCTCATACAGGGGGATAACAGTTAGAAATGACTGCTAATAC
CGCATAAGCGCACAGTATCGCATGATACGGTGTGAAAAACTCCGGTGGTATGAGATGGATCCGCGTCTGATTAGTTA
GTTGGCGGGGTAAAGGCCCACCAAGACGACGATCAGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGAACGGCCACATTGGGACTGAGA
CACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGCG
TGAGTGAAGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGTACCTGACTAAGAAGCCCCGG
CTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGTA
GACGGCAATGCAAGTCTGGAGTGAAAACCCAGGGCTCAACCCTGGGAGTGCTTTGGAAACTGTATAGCTAGAGTGCT
GGAGAGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTT
ACTGGACAGTAACTGACGTTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTA
AACGATGAATGCTAGGTGTTGGGGGGCAAAGCCCTTCGGTGCCGTCGCAAACGCAATAAGCATTCCACCTGGGGAGT
ACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCA
ACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCTCCTGACCGGTCCGTAACGGGGCCTTTCCTTCGGGACAAGAGAGAC
AGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTT
AGTAGCCAGCAGGTAGAGCTGGGCACTCTAGGGAGACTGCCAGGGATAACCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAA
TCATCATGCCCCTTATGATTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAACAAAGGGAGGCGACCCTGCGAAGGCAA
GCAAATCCCAAAAATAACGTCCCAGTTCGGACTGTAGTCTGCAACCCGACTACACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATC
GCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGCAACGC
CCGAAGTCAGTGACCCAACTGCAGGAGAGGGAGCGCCGAAGTCGGGCT

序列表

<110> 国立研究开发法人理化学研究所(RIKEN)

国立大学法人东京大学(THE UNIVERSITY OF TOKYO)

学校法人麻布兽医学园(SCHOOL CORPORATION, AZABU VETERINARY MEDICINE
EDUCATIONAL

INSTITUTION)

<120> 用于诱导TH17细胞的组合物及方法

<130> 092332

<150> US 61/978,182

<151> 2014-04-10

<160> 26

<170> PatentIn版本3.5

<210> 1

<211> 1419

<212> DNA

<213> 多枝梭菌(Clostridium ramosum)

<400> 1

ggggcggctg ctataatgca gtcgacgcga gcacttgtgc tcgagtggcg aacgggtgag 60

taatacataa gtaacctgcc ctagacaggg ggataactat tggaaacgat agctaagacc 120

gcatatgtac ggacactgca tggtgaccgt attaaaagtg cctcaaagca ctggtagagg 180

atggacttat ggcgcattag ctggttggcg gggtaacggc ccaccaaggc gacgatgcgt 240

agccgacctg agagggtgac cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg 300

gaggcagcag tagggaattt tcggcaatgg gggaaaccct gaccgagcaa cgccgcgtga 360

aggaagaagg ttttcggatt gtaaacttct gttataaagg aagaacggcg gctacaggaa 420

atggtagccg agtgacggta ctttattaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg 480

cggtaatacg taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagag ggagcaggcg 540

gcagcaaggg tctgtggtga aagcctgaag cttaacttca gtaagccata gaaaccaggc 600

agctagagtg caggagagga tcgtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata 660

tggaggaaca ccagtggcga aggcgacgat ctggcctgca actgacgctc agtcccgaaa 720

gcgtggggag caaataggat tagataccct agtagtccac gccgtaaacg atgagtacta 780

agtgttggat gtcaaagttc agtgctgcag ttaacgcaat aagtactccg cctgagtagt 840

acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg 900

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatactc ataaaggctc 960

cagagatgga gagatagcta tatgagatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt 1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcgttagt taccatcatt 1080

aagttgggga ctctagcgag actgccagtg acaagctgga ggaaggcggg gatgacgtca 1140

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggatgg tgcagaggga 1200

agcgaagccg cgaggtgaag caaaacccat aaaaccattc tcagttcgga ttgtagtctg 1260

caactcgact acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat 1320

acgttctcgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagttgataa cacccgaagc 1380

cggtggccta accgcaagga aggagcttct aaggtggat 1419

<210> 2

<211> 1433

<212> DNA

<213> 假长双歧杆菌假长亚种(Bifidobacterium pseudolongum subsp.
Pseudolongum)

<400> 2

ctgcggcgtc taccatgcag tcgaacggga tccctggcag cttgctgccg gggtgagagt 60

ggcgaacggg tgagtaatgc gtgaccgacc tgccccatgc accggaatag ctcctggaaa 120

cgggtggtaa tgccggatgt tccacatgag cgcatgcgag tgtgggaaag gctttttgcg 180

gcatgggatg gggtcgcgtc ctatcagctt gttggtgggg taacggccta ccaaggcgtt 240

gacgggtagc cggcctgaga gggcgaccgg ccacattggg actgagatac ggcccagact 300

cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc 360

cgcgtgcggg atggaggcct tcgggttgta aaccgctttt gttcaagggc aaggcacggt 420

ctttggccgt gttgagtgga ttgttcgaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg 480

cggtaatacg tagggtgcaa gcgttatccg gatttattgg gcgtaaaggg ctcgtaggcg 540

gttcgtcgcg tccggtgtga aagtccatcg cttaacggtg gatccgcgcc gggtacgggc 600

gggcttgagt gcggtagggg agactggaat tcccggtgta acggtggaat gtgtagatat 660

cgggaagaac accaatggcg aaggcaggtc tctgggccgt tactgacgct gaggagcgaa 720

agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtggatgct 780

ggatgtgggg ccctttttcc gggtcctgtg tcggagctaa cgcgttaagc atcccgcctg 840

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca caagcggcgg 900

agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggcttgac atgtgccgga 960

cgcccgcgga gacgcgggtt cccttcgggg ccggttcaca ggtggtgcat ggtcgtcgtc 1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gccgcgtgtt 1080

gccagcgggt catgccggga actcacgtgg gaccgccggg gttaactcgg aggaaggtgg 1140

ggatgacgtc agatcatcat gccccttacg tccagggctt cacgcatgct acaatggccg 1200

gtacaacggg gtgcgacacg gtgacgtggg gcggatccct gaaaaccggt ctcagttcgg 1260

atcgcagtct gcaactcgac tgcgtgaagg tggagtcgct agtaatcgcg gatcagcaac 1320

gccgcggtga atgcgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcat gaaagtgggc 1380

agcacccgaa gacggtggcc taacccttgt ggggggagcc gtctaaggta gtg 1433

<210> 3

<211> 1428

<212> DNA

<213> 乳酸发酵梭菌(Clostridium lactatifermentans)

<400> 3

ctgccggctc taccatgcag tcgaacgaag atagttagaa tgagagcttc ggcaggattt 60

ttttctatct tagtggcgga cgggtgagta acgtgtgggc aacctgccct gtactgggga 120

ataatcattg gaaacgatga ctaataccgc atgtggtcct cggaaggcat cttctgagga 180

agaaaggatt tattcggtac aggatgggcc cgcatctgat tagctagttg gtgagataac 240

agcccaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gatcggccac attgggactg 300

agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag 360

cctgatgcag caacgccgcg tgaaggatga agggtttcgg ctcgtaaact tctatcaata 420

gggaagaaac aaatgacggt acctaaataa gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc 480

gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggaattactg ggtgtaaagg gagcgtaggc 540

ggcatggtaa gccagatgtg aaagccttgg gcttaacccg aggattgcat ttggaactat 600

caagctagag tacaggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata 660

ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg aaactgacgc tgaggctcga 720

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc 780

taggtgtcgg ggaggaatcc tcggtgccgc agctaacgca ataagcactc cacctgggga 840

gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca 900

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatcc cgatgaccgt 960

cctagagata ggacttctct tcggagcatc ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc 1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ttcagtagcc 1080

atcattcagt tgggcactct ggagagactg ccgtggataa cacggaggaa ggtggggatg 1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggctacacac gtgctacaat ggctggtaac 1200

aaagtgacgc gagacggcga cgttaagcaa atcacaaaaa cccagtccca gttcggattg 1260

tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgcgaatc agcatgtcgc 1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggaagcac 1380

ccgaagtcgg tgacctaacc gtaaggaaga gccgccgaag taggggat 1428

<210> 4

<211> 1422

<212> DNA

<213> 布劳特氏菌属菌种犬口类143 (Blautia sp. canine oral taxon 143)

<400> 4

cggcgctcta ccatgcagtc gacgaagcga tttgaatgaa gttttcggat ggattttaaa 60

ttgactgagt ggcggacggg tgagtaacgc gtgggtaacc tgccccatac agggggataa 120

cagttagaaa tgactgctaa taccgcataa gaccacagcg ccgcatggtg caggggtaaa 180

aactccggtg gtatgggatg gacccgcgtc tgattagctt gttggcgggg taacggccca 240

ccaaggcgac gatcagtagc cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac 300

ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat 360

gcagcgacgc cgcgtgagtg atgaagtatt tcggtatgta aagctctatc agcagggaag 420

aaaatgacgg tacctgacta agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata 480

cgtagggggc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag ggagcgtaga cggctgtgca 540

agtctggagt gaaagcccgg ggctcaaccc cgggactgct ttggaaactg tacggctgga 600

gtgctggaga ggcaagcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga 660

acaccagtgg cgaaggcggc ttgctggaca gtaactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg 720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaatg ctaggtgtcg 780

gggagcaaag ctcttcggtg ccgccgcaaa cgcaataagc attccacctg gggagtacgt 840

tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt 900

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aagtcttgac atccccctga ccggcaagta 960

atgtcgcctt tccttcggga caggggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt 1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctcagt agccagcagg 1080

tgaagctggg cactctgtgg agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggacgacgt 1140

caaatcatca tgccccttat gacttgggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg 1200

gaagcgagag ggtgacctgg agcaaatccc aaaaataacg tctcagttcg gattgtagtc 1260

tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagcat gtcgcggtga 1320

atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtcagc aacgcccgaa 1380

gccggtgacc taaccgcaag gaaggagccg tcgaagtcgt cg 1422

<210> 5

<211> 1425

<212> DNA

<213> 参见梭菌属菌种MLG055 (cf. Clostridium sp. MLG055)

<400> 5

cggcgctgct atactgcagt cgaacgaagc gaaggtagct tgctatcgga gcttagtggc 60

gaacgggtga gtaacacgta gataacctgc ctgtatgacc gggataacag ttggaaacga 120

ctgctaatac cggataggca gagaggaggc atctcttctc tgttaaagtt gggatacaac 180

gcaaacagat ggatctgcgg tgcattagct agttggtgag gtaacggccc accaaggcga 240

tgatgcatag ccggcctgag agggcgaacg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac 300

tcctacggga ggcagcagta gggaattttc ggcaatgggg gaaaccctga ccgagcaatg 360

ccgcgtgagt gaagacggcc ttcgggttgt aaagctctgt tgtaagggaa gaacggcata 420

gagagggaat gctctatgag tgacggtacc ttaccagaaa gccacggcta actacgtgcc 480

agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagggtg 540

cgtaggcggc tggataagtc tgaggtaaaa gcccgtggct caaccacggt aagccttgga 600

aactgtctgg ctggagtgca ggagaggaca atggaattcc atgtgtagcg gtaaaatgcg 660

tagatatatg gaggaacacc agtggcgaag gcggttgtct ggcctgtaac tgacgctgaa 720

gcacgaaagc gtggggagca aataggatta gataccctag tagtccacgc cgtaaacgat 780

gagaactaag tgttggggaa actcagtgct gcagttaacg caataagttc tccgcctggg 840

gagtatgcac gcaagtgtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag 900

tatgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga accttaccag gccttgacat ggtatcaaag 960

gccctagaga tagggagata ggtatgatac acacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc 1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtttc tagttaccaa 1080

cagtaagatg gggactctag agagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac 1140

gtcaaatcat catgcccctt atggcctggg ctacacacgt actacaatgg cgtctacaaa 1200

gagcagcgag caggtgactg taagcgaatc tcataaagga cgtctcagtt cggattgaag 1260

tctgcaactc gacttcatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt 1320

gaatacgttc tcgggccttg tacacaccgc ccgtcaaacc atgggagttg ataatacccg 1380

aagccggtgg cctaaccgaa aggagggagc cgtcgaagta gattg 1425

<210> 6

<211> 1431

<212> DNA

<213> 无害梭菌(Clostridium innocuum)

<400> 6

cggcgctgct ataatgcagt cgaacgaagt ttcgaggaag cttgcttcca aagagactta 60

gtggcgaacg ggtgagtaac acgtaggtaa cctgcccatg tgtccgggat aactgctgga 120

aacggtagct aaaaccggat aggtatacag agcgcatgct cagtatatta aagcgcccat 180

caaggcgtga acatggatgg acctgcggcg cattagctag ttggtgaggt aacggcccac 240

caaggcgatg atgcgtagcc ggcctgagag ggtaaacggc cacattggga ctgagacacg 300

gcccaaactc ctacgggagg cagcagtagg gaattttcgt caatggggga aaccctgaac 360

gagcaatgcc gcgtgagtga agaaggtctt cggatcgtaa agctctgttg taagtgaaga 420

acggctcata gaggaaatgc tatgggagtg acggtagctt accagaaagc cacggctaac 480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tatccggaat cattgggcgt 540

aaagggtgcg taggtggcgt actaagtctg tagtaaaagg caatggctca accattgtaa 600

gctatggaaa ctggtatgct ggagtgcaga agagggcgat ggaattccat gtgtagcggt 660

aaaatgcgta gatatatgga ggaacaccag tggcgaaggc ggtcgcctgg tctgtaactg 720

acactgaggc acgaaagcgt ggggagcaaa taggattaga taccctagta gtccacgccg 780

taaacgatga gaactaagtg ttggaggaat tcagtgctgc agttaacgca ataagttctc 840

cgcctgggga gtatgcacgc aagtgtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag 900

cggtggagta tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggc cttgacatgg 960

atgcaaatgc cctagagata gagagataat tatggatcac acaggtggtg catggttgtc 1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcgcat 1080

gttaccagca tcaagttggg gactcatgcg agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg 1140

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat ggcctgggct acacacgtac tacaatggcg 1200

accacaaaga gcagcgacac agtgatgtga agcgaatctc ataaaggtcg tctcagttcg 1260

gattgaagtc tgcaactcga cttcatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc agatcagcat 1320

gctgcggtga atacgttctc gggccttgta cacaccgccc gtcaaaccat gggagtcagt 1380

aatacccgaa gccggtggca taaccgtaag gaggagccgt cgaagtgact g 1431

<210> 7

<211> 1428

<212> DNA

<213> 圆环梭菌(Clostridium orbiscindens)

<400> 7

agggcggctc ttaaatgcag tcgaacgggg tgctcatgac ggaggattcg tccaacggat 60

tgagttacct agtggcggac gggtgagtaa cgcgtgagga acctgccttg gagaggggaa 120

taacactccg aaaggagtgc taataccgca tgatgcagtt gggtcgcatg gctctgactg 180

ccaaagattt atcgctctga gatggcctcg cgtctgatta gctagtaggc ggggtaacgg 240

cccacctagg cgacgatcag tagccggact gagaggttga ccggccacat tgggactgag 300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgggcaatg ggcgcaagcc 360

tgacccagca acgccgcgtg aaggaagaag gctttcgggt tgtaaacttc ttttgtcggg 420

gacgaaacaa atgacggtac ccgacgaata agccacggct aactacgtgc cagcagccgc 480

ggtaatacgt aggtggcaag cgttatccgg atttactggg tgtaaagggc gtgtaggcgg 540

gattgcaagt cagatgtgaa aactgggggc tcaacctcca gcctgcattt gaaactgtag 600

ttcttgagtg ctggagaggc aatcggaatt ccgtgtgtag cggtgaaatg cgtagatata 660

cggaggaaca ccagtggcga aggcggattg ctggacagta actgacgctg aggcgcgaaa 720

gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atggatacta 780

ggtgtggggg gtctgacccc ctccgtgccg cagttaacac aataagtatc ccacctgggg 840

agtacgatcg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt 900

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg gcttgacatc ccactaacga 960

ggcagagatg cgttaggtgc ccttcgggga aagtggagac aggtggtgca tggttgtcgt 1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattgttagt 1080

tgctacgcaa gagcactcta gcgagactgc cgttgacaaa acggaggaag gtggggacga 1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcctgg gccacacacg tactacaatg gtggttaaca 1200

gagggaggca ataccgcgag gtggagcaaa tccctaaaag ccatcccagt tcggattgca 1260

ggctgaaacc cgcctgtatg aagttggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg 1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgagagtc gggaacaccc 1380

gaagtccgta gcctaaccgc aaggagggcg cggccgaaag ttgttcat 1428

<210> 8

<211> 1409

<212> DNA

<213> 瘤胃球菌属菌种16442 (Ruminococcus sp. 16442)

<400> 8

cgggggctgc taccatgcag tcgaacggag ttaagagagc ttgctctttt aacttagtgg 60

cggacgggtg agtaacgcgt gagtaacctg cctttcagag gggaataaca ttctgaaaag 120

aatgctaata ccgcatgaga tcgtagtatc gcatggtaca gcgaccaaag gagcaatccg 180

ctgaaagatg gactcgcgtc cgattagcta gttggtgaga taaaggccca ccaaggcgac 240

gatcggtagc cggactgaga ggttgaacgg ccacattggg actgagacac ggcccagact 300

cctacgggag gcagcagtgg gggatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcaacgc 360

cgcgtgaagg aagaaggtct tcggattgta aacttctgtc ctcagggaag ataatgacgg 420

tacctgagga ggaagctccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggagc 480

aagcgttgtc cggatttact gggtgtaaag ggtgcgtagg cggatctgca agtcagtagt 540

gaaatcccag ggcttaaccc tggaactgct attgaaactg tgggtcttga gtgaggtaga 600

ggcaggcgga attcccggtg tagcggtgaa atgcgtagag atcgggagga acaccagtgg 660

cgaaggcggc ctgctgggcc ttaactgacg ctgaggcacg aaagcatggg tagcaaacag 720

gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acgatgatta ctaggtgtgg gtggtctgac 780

cccatccgtg ccggagttaa cacaataagt aatccacctg gggagtacgg ccgcaaggtt 840

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcagtgg agtatgtggt ttaattcgaa 900

gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctgctaa cgaggtagag atacgttagg 960

tgcccttcgg ggaaagcaga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga 1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgctatt agttgctacg caagagcact 1080

ctaataggac tgccgttgac aaaacggagg aaggtgggga cgacgtcaaa tcatcatgcc 1140

ccttatgacc tgggctacac acgtactaca atggccgtca acagagagaa gcaaagccgc 1200

gaggtggagc aaaactctaa aaacggtccc agttcggatc gtaggctgca acccgcctac 1260

gtgaagttgg aattgctagt aatcgcggat catcatgccg cggtgaatac gttcccgggc 1320

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gccggtaata cccgaagtca gtagtctaac 1380

cgcaagggga cgcgccgaaa ggtggagtg 1409

<210> 9

<211> 1426

<212> DNA

<213> 活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)

<400> 9

ctggcgggtg ctaccatgca gtcgagcgaa gcacttttgc ggatttcttc ggattgaagc 60

aattgtgact gagcggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg 120

ataacagttg gaaacggctg ctaataccgc ataagcgcac agtaccgcat ggtaccgtgt 180

gaaaaactcc ggtggtatga gatggacccg cgtctgatta gctagttggt ggggtaacgg 240

cctaccaagg cgacgatcag tagccgacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag 300

acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc 360

tgatgcagcg acgccgcgtg agcgatgaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg 420

gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt 480

aatacgtagg gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggcat 540

ggcaagccag atgtgaaagc ccggggctca accccgggac tgcatttgga actgtcaggc 600

tagagtgtcg gagaggaaag cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg 660

aggaacacca gtggcgaagg cggctttctg gacgatgact gacgttgagg ctcgaaagcg 720

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg aatactaggt 780

gtcgggtggc aaagccattc ggtgccgcag caaacgcaat aagtattcca cctggggagt 840

acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg 900

tggtttaatt ggaagcaacg cgaagaacct tacctggtct tgacatccct ctgaccgctc 960

tttaatcgga gttttctttc gggacagagg agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc 1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt tagtagccag 1080

catttagggt gggcactcta gagagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga 1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgaccagg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa 1200

agggaagcga gcccgcgagg gggagcaaat cccaaaaata acgtctcagt tcggattgta 1260

gtctgcaact cgactacatg aagctggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg 1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc agtaacgccc 1380

gaagtcagtg acccaaccgt aaggaggagc tgccgaagtg tactat 1426

<210> 10

<211> 1407

<212> DNA

<213> 人肠道厌氧棒状菌(Anaerotruncus colihominis)

<400> 10

gagtgggccg ctaccatgca gtcgacgagc cgaggggagc ttgctcccca gagctagtgg 60

cggacgggtg agtaacacgt gagcaacctg cctttcagag ggggataacg tttggaaacg 120

aacgctaata ccgcataaca taccgggacc gcatgattct ggtatcaaag gagcaatccg 180

ctgaaagatg ggctcgcgtc cgattagcta gttggcgggg taacggccca ccaaggcgac 240

gatcggtagc cggactgaga ggttgatcgg ccacattggg actgagacac ggcccagact 300

cctacgggag gcagcagtgg gggatattgc acaatggagg aaactctgat gcagcgacgc 360

cgcgtgaggg aagacggtct tcggattgta aacctctgtc tttggggacg ataatgacgg 420

tacccaagga ggaagctccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggagc 480

gagcgttgtc cggaattact gggtgtaaag ggagcgtagg cggggtctca agtcgaatgt 540

taaatctacc ggctcaactg gtagctgcgt tcgaaactgg ggctcttgag tgaagtagag 600

gcaggcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc 660

gaaggcggcc tgctgggctt ttactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg 720

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgattac taggtgtggg gggactgacc 780

ccttccgtgc cggagttaac acaataagta atccacctgg ggagtacgac cgcaaggttg 840

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagtgga ttatgtggtt taattcgaag 900

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgagtgacg gctctagaga tagagctttc 960

cttcgggaca caaagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1020

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat tattagttgc tacattcagt tgagcactct 1080

aatgagactg ccgttgacaa aacggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc 1140

ttatgacctg ggctacacac gtaatacaat ggcgatcaac agagggaagc aagaccgcga 1200

ggtggagcaa acccctaaaa gtcgtctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat 1260

gaagtcggaa ttgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct 1320

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt cggtaacacc cgaagtcagt agcctaaccg 1380

caaagagggc gctgccgaag atggatt 1407

<210> 11

<211> 1419

<212> DNA

<213> 链状真杆菌(Eubacterium desmolans)

<400> 11

atggcggctg ctacctgcag tcgaacgggg ttattttgga aatctcttcg gagatggaat 60

tcttaaccta gtggcggacg ggtgagtaac gcgtgagcaa tctgccttta ggagggggat 120

aacagtcgga aacggctgct aataccgcat aatacgtttg ggaggcatct cttgaacgtc 180

aaagatttta tcgcctttag atgagctcgc gtctgattag ctggttggcg gggtaacggc 240

ccaccaaggc gacgatcagt agccggactg agaggttgaa cggccacatt gggactgaga 300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcgcaatgg gggaaaccct 360

gacgcagcaa cgccgcgtga ttgaagaagg ccttcgggtt gtaaagatct ttaatcaggg 420

acgaaaaatg acggtacctg aagaataagc tccggctaac tacgtgccag cagccgcggt 480

aatacgtagg gagcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggcgcg caggcgggcc 540

ggcaagttgg gagtgaaatc ccggggctta accccggaac tgctttcaaa actgctggtc 600

ttgagtgatg gagaggcagg cggaattccg tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatacgg 660

aggaacacca gtggcgaagg cggcctgctg gacattaact gacgctgagg cgcgaaagcg 720

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg gatactaggt 780

gtgggaggta ttgacccctt ccgtgccgca gttaacacaa taagtatccc acctggggag 840

tacggccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc agtggagtat 900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc gatgaccggc 960

gtagagatac gccctctctt cggagcatcg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct 1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttacgg ttagttgata 1080

cgcaagatca ctctagccgg actgccgttg acaaaacgga ggaaggtggg gacgacgtca 1140

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta caatggcagt catacagagg 1200

gaagcaatac cgcgaggtgg agcaaatccc taaaagctgt cccagttcag attgcaggct 1260

gcaacccgcc tgcatgaagt cggaattgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa 1320

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg agagccgtca atacccgaag 1380

tccgtagcct aaccgcaagg gggcgcgccg aagttacgt 1419

<210> 12

<211> 1423

<212> DNA

<213> 哈氏梭菌(Clostridium hathewayi)

<400> 12

atcgggtgct acctgcaagt cgagcgaagc ggtttcgatg aagttttcgg atggaattga 60

aattgactta gcggcggacg ggtgagtaac gcgtgggtaa cctgccttac actgggggat 120

aacagttaga aatgactgct aataccgcat aagcgcacag ggccgcatgg tctggtgcga 180

aaaactccgg tggtgtaaga tggacccgcg tctgattagg tagttggtgg ggtaacggcc 240

caccaagccg acgatcagta gccgacctga gagggtgacc ggccacattg ggactgagac 300

acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgaaagcctg 360

atccagcgac gccgcgtgag tgaagaagta tttcggtatg taaagctcta tcagcaggga 420

agaaaatgac ggtacctgac taagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa 480

tacgtagggg gcaagcgtta tccggattta ctgggtgtaa agggagcgta gacggttaag 540

caagtctgaa gtgaaagccc ggggctcaac cccggtactg ctttggaaac tgtttgactt 600

gagtgcagga gaggtaagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag 660

gaacaccagt ggcgaaggcg gcttactgga ctgtaactga cgttgaggct cgaaagcgtg 720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt 780

cgggggacaa cgtccttcgg tgccgccgct aacgcaataa gtattccacc tggggagtac 840

gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg 900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acatcccatt gaaaatcctt 960

taaccgtggt ccctcttcgg agcaatggag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt 1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcctta gtagccagca 1080

catgatggtg ggcactctgg ggagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac 1140

gtcaaatcat catgcccctt atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa 1200

gggaagcaaa ggagcgatct ggagcaaacc ccaaaaataa cgtctcagtt cggattgcag 1260

gctgcaactc gcctgcatga agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt 1320

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtaacgcccg 1380

aagtcagtga cccaaccgta aggaggagcg ccgaaggcga ggt 1423

<210> 13

<211> 1423

<212> DNA

<213> 短双歧杆菌(Bifidobacterium breve)

<400> 13

cggggctgct taaatgcagt cgaacgggat ccatcaagct tgcttggtgg tgagagtggc 60

gaacgggtga gtaatgcgtg accgacctgc cccatgcacc ggaatagctc ctggaaacgg 120

gtggtaatgc cggatgctcc atcacactgc atggtgtgtt gggaaagcct ttgcggcatg 180

ggatggggtc gcgtcctatc agcttgatgg cggggtaacg gcccaccatg gcttcgacgg 240

gtagccggcc tgagagggcg accggccaca ttgggactga gatacggccc agactcctac 300

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt 360

gagggatgga ggccttcggg ttgtaaacct cttttgttag ggagcaaggc attttgtgtt 420

gagtgtacct ttcgaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag 480

ggtgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagggctc gtaggcggtt cgtcgcgtcc 540

ggtgtgaaag tccatcgctt aacggtggat ccgcgccggg tacgggcggg cttgagtgcg 600

gtaggggaga ctggaattcc cggtgtaacg gtggaatgtg tagatatcgg gaagaacacc 660

aatggcgaag gcaggtctct gggccgttac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg 720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacggt ggatgctgga tgtggggccc 780

gttccacggg ttccgtgtcg gagctaacgc gttaagcatc ccgcctgggg agtacggccg 840

caaggctaaa actcaaagaa attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta 900

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gcttgacatg ttcccgacga tcccagagat 960

ggggtttccc ttcggggcgg gttcacaggt ggtgcatggt cgtcgtcagc tcgtgtcgtg 1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgcc ccgtgttgcc agcggattgt 1080

gccgggaact cacgggggac cgccggggtt aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaga 1140

tcatcatgcc ccttacgtcc agggcttcac gcatgctaca atggccggta caacgggatg 1200

cgacagcgcg agctggagcg gatccctgaa aaccggtctc agttcggatc gcagtctgca 1260

actcgactgc gtgaaggcgg agtcgctagt aatcgcgaat cagcaacgtc gcggtgaatg 1320

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa agtgggcagc acccgaagcc 1380

ggtggcctaa ccccttgcgg gagggagccg tctaaggtag gtt 1423

<210> 14

<211> 1425

<212> DNA

<213> 瘤胃球菌属菌种M-1(Ruminococcus sp. M-1)

<400> 14

cgggcgctgc ttacctgcag tcgagcgaag cacttgagcg gatttcttcg gattgaagtt 60

tttttgactg agcggcggac gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tacaggggga 120

taacagttag aaatggctgc taataccgca taagcgcaca ggaccgcatg gtctggtgtg 180

aaaaactccg gtggtatgag atggacccgc gtctgattag ctagttggag gggtaacggc 240

ccaccaaggc gacgatcagt agccggcctg agagggtgaa cggccacatt gggactgaga 300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct 360

gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt atctcggtat gtaaacttct atcagcaggg 420

aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta 480

atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggaaga 540

gcaagtctga tgtgaaaggc tggggcttaa ccccaggact gcattggaaa ctgtttttct 600

agagtgccgg agaggtaagc ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga 660

ggaacaccag tggcgaaggc ggcttactgg acggtaactg acgttgaggc tcgaaagcgt 720

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga atactaggtg 780

tcgggtggca aagccattcg gtgccgcagc aaacgcaata agtattccac ctggggagta 840

cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt 900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaagtctt gacatccctc tgaccggccc 960

gtaacggggc cttcccttcg gggcagagga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg 1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatcctt agtagccagc 1080

aggtgaagct gggcactcta gggagactgc cggggataac ccggaggaag gcggggacga 1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgatttgg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa 1200

agggaagcga gacagcgatg ttgagcaaat cccaaaaata acgtcccagt tcggactgca 1260

gtctgcaact cgactgcacg aagctggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg 1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc agtaacgccc 1380

gaagtcagtg acccaacctt ataggaggag cgccgaagtc gacct 1425

<210> 15

<211> 1416

<212> DNA

<213> Coprobacillus cateniformis

<400> 15

cgcgggtgct atactgcagt cgaacgcact gattttatca gtgagtggcg aacgggtgag 60

taatacataa gtaacctgcc ctcatgaggg ggataactat tagaaatgat agctaagacc 120

gcataggtga aggggtcgca tgaccgcttc attaaatatc cgtatggata gcaggaggat 180

ggacttatgg cgcattagct ggttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag 240

ccgacctgag agggtggacg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga 300

ggcagcagta gggaattttc ggcaatgggg gaaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgagg 360

gaagaagtat ttcggtatgt aaacctctgt tataaaggaa gaacggtatg aataggaaat 420

gattcataag tgacggtact ttatgagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg 480

gtaatacgta ggtggcgagc gttatccgga atcattgggc gtaaagaggg agcaggcggc 540

aatagaggtc tgcggtgaaa gcctgaagct aaacttcagt aagccgtgga aaccaaatag 600

ctagagtgca gtagaggatc gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg 660

gaggaacacc agtggcgaag gcgacgatct gggctgcaac tgacgctcag tcccgaaagc 720

gtggggagca aataggatta gataccctag tagtccacgc cgtaaacgat gagtactaag 780

tgttgggggt caaacctcag tgctgcagtt aacgcaataa gtactccgcc tgagtagtac 840

gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg 900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatacctct aaaggctcta 960

gagatagaga gatagctata ggggatacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg 1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcgctagtta ccatcattaa 1080

gttggggact ctagcgagac tgcctctgca aggaggagga aggcggggat gacgtcaaat 1140

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggacggatc aaagggaagc 1200

gaagccgcga ggtggagcga aacccaaaaa cccgttctca gttcggactg cagtctgcaa 1260

ctcgactgca cgaagttgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg 1320

ttctcgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag ttggtaacac ccgaagccgg 1380

tggcttaacc gcaaggagag agcttctaag gtgaat 1416

<210> 16

<211> 1424

<212> DNA

<213> 共生梭菌(Clostridium symbiosum)

<400> 16

aggcgcgtgc taccatgcag tcgaacgaag caatttaacg gaagttttcg gatggaagtt 60

gaattgactg agtggcggac gggtgagtaa cgcgtgggta acctgccttg tactggggga 120

caacagttag aaatgactgc taataccgca taagcgcaca gtatcgcatg atacagtgtg 180

aaaaactccg gtggtacaag atggacccgc gtctgattag ctagttggta aggtaacggc 240

ttaccaaggc gacgatcagt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga 300

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct 360

gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg 420

aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta 480

atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggtaaa 540

gcaagtctga agtgaaagcc cgcggctcaa ctgcgggact gctttggaaa ctgtttaact 600

ggagtgtcgg agaggtaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga 660

ggaacaccag tggcgaaggc gacttactgg acgataactg acgttgaggc tcgaaagcgt 720

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga atactaggtg 780

ttggggagca aagctcttcg gtgccgtcgc aaacgcagta agtattccac ctggggagta 840

cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt 900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcgatc cgacggggga 960

gtaacgtccc cttcccttcg gggcggagaa gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg 1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattcta agtagccagc 1080

ggttcggccg ggaactcttg ggagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac 1140

gtcaaatcat catgcccctt atgatctggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa 1200

gagaagcaag accgcgaggt ggagcaaatc tcaaaaataa cgtctcagtt cggactgcag 1260

gctgcaactc gcctgcacga agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt 1320

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca gtaacgcccg 1380

aagtcagtga cccaaccgca aggaggagcg ccgaaggcga ccgt 1424

<210> 17

<211> 1426

<212> DNA

<213> Bacteroides dorei

<400> 17

cggtctcggc ttaccatgca gtcgaggggc agcatggtct tagcttgcta aggctgatgg 60

cgaccggcgc acgggtgagt aacacgtatc caacctgccg tctactcttg gccagccttc 120

tgaaaggaag attaatccag gatggcatca tgagttcaca tgtccgcatg attaaaggta 180

ttttccggta gacgatgggg atgcgttcca ttagatagta ggcggggtaa cggcccacct 240

agtcaacgat ggataggggt tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt 300

ccaaactcct acgggaggca gcagtgagga atattggtca atgggcgatg gcctgaacca 360

gccaagtagc gtgaaggatg actgccctat gggttgtaaa cttcttttat aaaggaataa 420

agtcgggtat gcatacccgt ttgcatgtac tttatgaata aggatcggct aactccgtgc 480

cagcagccgc ggtaatacgg aggatccgag cgttatccgg atttattggg tttaaaggga 540

gcgtagatgg atgtttaagt cagttgtgaa agtttgcggc tcaaccgtaa aattgcagtt 600

gatactggat gtcttgagtg cagttgaggc aggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg 660

cttagatatc acgaagaact ccgattgcga aggcagcctg ctaagctgca actgacattg 720

aggctcgaaa gtgtgggtat caaacaggat tagataccct ggtagtccac acggtaaacg 780

atgaatactc gctgtttgcg atatacggca agcggccaag cgaaagcgtt aagtattcca 840

cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg 900

gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct taaattgcac 960

tcgaatgatc cggaaacggt tcagctagca atagcgagtg tgaaggtgct gcatggttgt 1020

cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccttgttgtc 1080

agttactaac aggtgatgct gaggactctg acaagactgc catcgtaaga tgtgaggaag 1140

gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg 1200

gggggtacag agggccgcta ccacgcgagt ggatgccaat ccctaaaacc cctctcagtt 1260

cggactggag tctgcaaccc gactccacga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc 1320

cacggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgggagcc 1380

gggggtacct gaagtgcgta accgcgagga tcgccctagg taatga 1426

<210> 18

<211> 1428

<212> DNA

<213> 粪厌氧棒状菌(Anaerostipes caccae)

<400> 18

cggcggctgc ttaccatgca gtcgaacgaa gcatttagga ttgaagtttt cggatggatt 60

tcctatatga ctgagtggcg gacgggtgag taacgcgtgg ggaacctgcc ctatacaggg 120

ggataacagc tggaaacggc tgctaatacc gcataagcgc acagaatcgc atgattcagt 180

gtgaaaagcc ctggcagtat aggatggtcc cgcgtctgat tagctggttg gtgaggtaac 240

ggctcaccaa ggcgacgatc agtagccggc ttgagagagt gaacggccac attgggactg 300

agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac 360

cctgatgcag cgacgccgcg tgagtgaaga agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca 420

gggaagaaaa cagacggtac ctgactaaga agccccggct aactacgtgc cagcagccgc 480

ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg aattactggg tgtaaagggt gcgtaggtgg 540

catggtaagt cagaagtgaa agcccggggc ttaaccccgg gactgctttt gaaactgtca 600

tgctggagtg caggagaggt aagcggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt 660

aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta ctggactgtc actgacactg atgcacgaaa 720

gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta 780

ggtgtcgggg ccgtagaggc ttcggtgccg cagcaaacgc agtaagtatt ccacctgggg 840

agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc 900

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc ccaatgaccg 960

aaccttaacc ggttttttct ttcgagacat tggagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag 1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat ctttagtagc 1080

cagcatttaa ggtgggcact ctagagagac tgccagggat aacctggagg aaggtgggga 1140

cgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatggcc agggctacac acgtgctaca atggcgtaaa 1200

caaagggaag cgaagtcgtg aggcgaagca aatcccagaa ataacgtctc agttcggatt 1260

gtagtctgca actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgtgaat cagaatgtca 1320

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtcagtaacg 1380

cccgaagtca gtgacccaac cgcaaggagg gagctgccga agtacgag 1428

<210> 19

<211> 1082

<212> DNA

<213> 鲍氏梭菌(Clostridium bolteae)

<400> 19

tttgtggcga agcctgatgc agcgacgccg cgtgagtgaa gaagtatttc ggtatgtaaa 60

gctctatcag cagggaagaa aatgacggta cctgactaag aagccccggc taactacgtg 120

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg gatttactgg gtgtaaaggg 180

agcgtagacg gcgaagcaag tctgaagtga aaacccaggg ctcaaccctg ggactgcttt 240

ggaaactgtt ttgctagagt gtcggagagg taagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat 300

gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt actggacgat aactgacgtt 360

gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac 420

gatgaatgct aggtgttggg gggcaaagcc cttcggtgcc gtcgcaaacg cagtaagcat 480

tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca 540

agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa gtcttgacat 600

cctcttgacc ggcgtgtaac ggcgccttcc cttcggggca agagagacag gtggtgcatg 660

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta 720

tccttagtag ccagcaggta aagctgggca ctctagggag actgccaggg ataacctgga 780

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tttgggctac acacgtgcta 840

caatggcgta aacaaaggga agcaagacag tgatgtggag caaatcccaa aaataacgtc 900

ccagttcgga ctgtagtctg caacccgact acacgaagct ggaatcgcta gtaatcgcga 960

atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg 1020

gagtcagcaa cgcccgaagt cagtgaccca actcgcaaga gagggagcgc cgaagtcgtc 1080

at 1082

<210> 20

<211> 1426

<212> DNA

<213> Clostridium citroniae

<400> 20

ctggcgcggc taccatgcag tcgagcgaag cattacagcg gaagttttcg gatggaagct 60

ttaatgactg agcggcggac gggtgagtaa cgcgtggata acctgcctca tacaggggga 120

taacagttag aaatgactgc taataccgca taagcgcaca gtatcgcatg atacggtgtg 180

aaaaactccg gtggtatgag atggatccgc gtctgattag ttagttggcg gggtaaaggc 240

ccaccaagac gacgatcagt agccggcctg agagggtgaa cggccacatt gggactgaga 300

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct 360

gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg 420

aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta 480

atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggcaat 540

gcaagtctgg agtgaaaacc cagggctcaa ccctgggagt gctttggaaa ctgtatagct 600

agagtgctgg agaggtaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga 660

ggaacaccag tggcgaaggc ggcttactgg acagtaactg acgttgaggc tcgaaagcgt 720

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga atgctaggtg 780

ttggggggca aagcccttcg gtgccgtcgc aaacgcaata agcattccac ctggggagta 840

cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt 900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaagtctt gacatcctcc tgaccggtcc 960

gtaacggggc ctttccttcg ggacaagaga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg 1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt agtagccagc 1080

aggtagagct gggcactcta gggagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga 1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgatttgg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa 1200

agggaggcga ccctgcgaag gcaagcaaat cccaaaaata acgtcccagt tcggactgta 1260

gtctgcaacc cgactacacg aagctggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg 1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc agcaacgccc 1380

gaagtcagtg acccaactgc aggagaggga gcgccgaagt cgggct 1426

<210> 21

<211> 30

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 454衔接头序列

<400> 21

ccatctcatc cctgcgtgtc tccgactcag 30

<210> 22

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 修饰的引物8F的部分序列

<400> 22

agrgtttgat ymtggctcag 20

<210> 23

<211> 30

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 454衔接头序列

<400> 23

cctatcccct gtgtgccttg gcagtctcag 30

<210> 24

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 修饰的引物338R的部分序列

<400> 24

tgctgcctcc cgtaggagt 19

<210> 25

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物8F

<400> 25

agagtttgat cmtggctcag 20

<210> 26

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物1492R

<400> 26

ggytaccttg ttacgactt 19