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本发明的目的在于提供防止保存中的分解、可以获得保存稳定性优异的嘌呤核苷化合物结晶、特别是2,3-双脱氧肌苷结晶的制造方法。本发明提供附着在嘌呤核苷化合物结晶的磷酸根浓度为25ppm以上、保存稳定性优异的嘌呤核苷化合物结晶的制造方法,该制造方法包括:(1)调制含有磷酸离子(PO43-)及嘌呤核苷化合物的水溶液;(2)从上述水溶液中使嘌呤核苷化合物析晶。。