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本发明提供了一种消化内镜辅助介入机器人的控制方法与系统,属于医疗机器人领域。所述方法包括:提取操作者操作主端手柄的动作信息进行处理,根据设定的位置控制与速度控制工作模式得到机器人的运动指令;根据安装在执行器端的力反馈装置测量输送阻力与扭转阻力矩信息,经零偏与重力干扰去除后显示在人机交互界面进行提示,反馈至主端控制手柄提供给操作者力感知当阻力与阻力矩超出设定值,上位机报警,并通过局部自主调节输送力与。